BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-062D19.T7 (MSMg01no062_d19.b1) | MSMg01-062D19.TJ (MSMg01no062_d19.g1) |
ACC | AG288258 | AG288259 |
length | 1,177 | 1,155 |
length of high quality (start - end) | 697 (134 - 830) | 680 (135 - 814) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_d19.b1 PHD_FILE: MSMg01no062_d19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:05:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_d19.g1 PHD_FILE: MSMg01no062_d19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:05:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCAATCTTTTNTNTNATCAGTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCAGGAGGGGAAAGAACCTTATAAAAATATGTTGTATAAA
ATTCTCAAATAATCAATCCCTCTACTTTTAGACCCCCAAAAGTTCAAATA
CAGAAACAAACACTGAATTGTTTAATAGTATCATGTTTATAAACATGGGG
GGGTGTTGTGTGTATGCTCATGTATCTTTTATTGTGATCATAAAATACTT
TGGTGGAATGATATCTAAAACAATTTAATCTTTTCATACTAATATCCTTG
TACTAAAACAGGTTCATTGATGTCTCTTCTGCACCCATATTTTCAGATAA
GTTCAAAGAGGAATGTCTACAACCTGCTATTGAATTGGTTATTACTTAAC
AATAATAAAAATACTATCAGTTAATTGATACCTCATCTTGTTCCACAAAA
TAGACAGAACTTAATTGAGGGCATTATTGAGGGCATTGCTAGTCATGTAT
ATAGGAAGCTACTCTGCCAGGCAAACACCCTTACATGTATCTCCCCCCCC
CCAGGTACATTTTAACTACATTTCCCAGTACTCATATTCACTTTAGATGT
GAATTATTTTTCAAAATGATATATGATTTTTACACTTGGAGCTAAGCCAA
TAGTGGAGTCCCAGGCTCTGTGTATCATCTTACTTTTTTATATAGATTGG
TTCGGATTACAATGGCCTATGAGCTGGGCAGAACATGGGGAAGAACTAAT
TCTAAACACTCTTAAAATGCAGATGGCACAGACAATGAGAAAAGGCAAGT
TTCCATTATATTGAGAGACTTTTATTGTTTTATTTGGCACAATATAGCTT
CTTCATTTGGCATTATTGTTTTGTATTATTTGTCTCTAAAGTACTCTCTA
AATGAAATTTATGGGTTAATGAATTTATCTGGGAGATGAATCTGGGAAGT
GTAAAAATGCCTTGGAGTATGGAGAGAAAGGAGACCTTACTTAAAACAAT
GTTTGCTTTTAAAGTGGGGGTTTTACTTTTTAAGGGCCCAAGGAAAAATA
TTTCAAGGGGGTTATATGCATTTTTTCCTTTTATTTAGCAACCCCTTTTA
AAAAGTTCCCTTGTGTGCTATAATTTTTGTTAAGTCCCCACCCTTTTTAA
CCCTCTTTGTTTCTCCCAAATAAAATT
| NCCGACCTTTTTTNNTCACATGGGATGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAATAAAAACTGAGGAATATNGA
AGGGNAGAGAAGNACCTCCTTAAAAGATTCCCACCCTTAATCATCAGGGA
AATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAATGG
CTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAA
AGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGTCTTGTAAAACCACT
CTTGAAATCAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGG
AGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCGAACT
GGTATTATGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCTTATTTATAAT
AGCCAGAAGCTGGAAAGAACCTAGATGCCCCTCAACAGAGGAATGGATAC
AGAAAATGTGGTACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAAG
AATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATCAT
CCTGAGTGAGGTAACACATTCACAAAGGACACTCACACAATATGTACTCA
CTGATAAGTGGATATTAGCCCAAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGATA
CAATTTCCTAAACACATGAAACTCAAGAAAAATGAAGACTGAAGCGTGGA
CACTATGCCCCTCCTTAGAAGTGGGAACAAAAAAACCTTGGACGGAGTTA
CAGAGACAAAGTTTGGAGCTGAGATGAAACGATGGACCATGTAGACACTA
CCATATCCGGGGATCCATCCCATAATCAGCATCCAAACGCTGACACCATT
GCATACCCTAGCAAGATTTTATCGAAAGGACCCAGATGTAGCTGTCTCTT
GTGAGACTATGCCGGGGCCTAGCAAACACAGAAATGGATGCTCACAGTCC
GCTAATGAATGGATCACCAGGCTCCCAAGGAAGGAATTAGAAAAAGTACC
CAAGAACTAAAGGGTACTGCACCCCTATAGGGGATTAACTTTTTGAACTA
TCCCTTACCCCGGAATTTTTTGACCTTGCTGGATATGTAATCAAAAATGT
CCCAT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 7 8 8 9 9 17 3 0 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 9 10 8 8 6 6 6 6 8 10 15 8 8 8 12 13 18 21 21 35 30 28 28 28 33 33 36
47 47 50 50 50 50 50 47 37 37 57 53 35 35 35 35 35 31 31 39 37 37 25 25 12 9 9 9 9 9 9 11 12 15 18 18 16 19 12 13 12 19 23 31 36 38 38 53 53 53
57 53 38 38 36 36 36 36 33 33 33 33 33 26 23 11 9 9 8 8 8 8 8 15 16 21 28 24 27 15 13 9 11 11 14 33 27 47 47 47 59 50 50 53 50 57 50 50 53 53
53 50 59 59 57 57 59 57 53 53 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 51 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
39 39 8 8 8 8 8 14 36 44 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62
62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59
68 68 54 54 54 54 54 54 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 50 50 48 48 46 46 46 41 39 39 39
39 39 44 43 44 47 47 47 59 59 59 48 48 48 48 57 57 59 57 57 48 48 48 48 42 47 42 39 39 41 38 24 24 21 22 21 28 28 40 41 43 39 39 40 43 43 57 48 48 48
48 48 48 59 59 59 59 59 59 47 44 44 44 28 28 17 17 23 23 22 20 32 32 39 32 32 39 39 37 37 37 40 40 48 37 36 36 33 33 31 37 37 39 34 33 27 27 19 21 23
31 31 31 20 31 31 57 57 48 48 47 37 37 37 37 30 37 20 22 19 18 17 17 37 32 34 30 29 17 21 22 17 13 11 21 16 16 17 17 24 28 24 24 12 21 11 22 17 23 15
11 11 11 10 19 10 9 8 9 8 8 8 19 17 30 28 34 23 17 9 9 9 9 9 9 18 22 22 22 12 16 11 23 12 22 16 23 20 12 12 9 9 9 15 16 22 22 21 18 18
30 34 41 41 31 19 15 11 8 8 8 8 8 11 12 11 12 12 18 24 20 18 12 12 12 16 24 18 15 10 8 8 8 10 8 8 10 15 13 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 11 8 9 9 9 10 9 9 10 13 12 13 12 13 9 11 13 13 12 10 13 16 16 14 10 10 8 8 8 8 10 13 12 9 9 12 17 22 22 12 10 10 10
10 10 10 10 10 10 10 11 13 15 14 15 10 8 8 8 9 8 9 13 15 13 8 8 8 8 8 9 17 11 11 10 10 10 13 10 10 10 12 12 12 10 10 12 22 22 9 10 6 6
8 10 15 12 11 9 9 9 11 11 8 8 8 8 7 7 10 11 15 14 18 17 24 19 15 9 9 9 9 10 13 9 7 7 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 12 10 9 10 10
23 19 13 12 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 15 10 12 8 8 10 8 8 6 6 6 7 11 14 8 8 8 8 10 14 16 9 8 10 8 8
8 6 7 7 6 8 6 10 10 11 11 9 9 9 12 9 9 9 12 10 10 10 8 8 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 8 8 11 15 14 3 0 0 3 7 7 7 8 8 9 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 19 11 11 7 8 8 8 8 19 15 20 15 19 9 10 10 15 19
19 12 12 24 30 37 36 36 33 35 35 35 35 28 33 36 44 33 39 37 37 37 23 27 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 11 10 10 10 10 9 10 12 25 28 21 23 3 0 3 23
12 12 12 3 0 3 27 27 39 27 27 3 0 3 21 9 9 9 9 10 9 10 18 7 7 6 6 11 10 10 10 10 11 12 16 27 26 36 36 50 42 57 57 57 57 57 57 57 59 59
57 57 59 59 59 57 48 48 50 53 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 50 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 48 48 57 57 57 57 57 48 57
57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68
57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 57 57 54 54 54 57 57 57 47 44 35 35 35 42 44 44 59 59 59 44 44 42 48 44 57 43 39
35 35 42 48 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 50 59 59 50 50 47 41 41
23 23 11 10 8 8 8 7 8 9 21 28 34 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 44 39 39 39 46 59 59 48 37 37
23 23 23 44 44 43 39 37 35 35 39 44 43 39 39 39 43 43 44 47 44 44 57 57 57 44 44 57 57 57 57 47 47 42 59 44 48 42 48 48 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 54 59 59 57 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 52 54 50 46 38 38 38 46 46 57 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 59 57 52
52 52 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 54 54 59 59 59 57 59 59 47 47 47 59 48 68 48 48 44 57 57 57 46 48 48 57 57 57 57 57 57 41 41 41 43 42
41 43 41 48 43 48 47 42 32 41 17 17 17 34 34 54 54 57 54 48 48 48 43 43 36 43 43 43 43 37 37 36 36 29 29 25 25 25 34 34 39 43 30 22 22 22 22 18 18 34
37 37 41 59 59 46 48 48 48 46 46 47 43 43 28 30 15 17 17 26 26 28 22 20 30 28 34 34 59 59 59 59 37 32 32 37 37 29 37 31 32 37 37 31 35 35 37 37 39 39
39 32 37 33 35 35 35 31 31 27 18 11 9 9 9 15 18 29 32 21 23 11 19 10 15 15 16 25 12 11 10 17 17 15 18 24 37 30 28 28 16 16 19 18 13 11 11 15 30 30
31 29 33 28 34 27 22 18 21 21 27 27 20 28 28 18 18 14 11 10 8 9 9 12 10 12 10 11 19 12 15 15 17 17 17 22 13 13 8 10 13 14 12 9 9 9 10 10 13 25
18 13 13 11 15 10 9 9 15 9 15 13 13 11 11 11 21 25 33 33 25 25 13 13 13 17 21 22 15 15 11 10 10 10 8 8 9 12 13 9 9 9 11 11 11 11 11 8 8 9
9 12 12 12 9 8 8 8 10 10 13 11 11 12 25 27 19 14 7 8 6 6 6 8 10 9 11 11 11 21 21 19 13 12 15 15 15 15 21 21 22 26 13 19 15 15 8 6 6 6
8 8 8 11 8 8 9 10 8 13 8 9 11 10 8 8 6 6 6 7 6 11 11 13 11 15 13 12 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 11 9 14 14 16 15 17
14 14 14 15 13 12 13 12 14 17 18 13 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 10 15 12 12 9 11 10 12 10 9 9 9 8 8 10 10 8 9 16 16 8 12 9 8 8 10 10
10 9 9 8 8 8 8 11 17 17 18 18 8 8 8 8 8 10 13 17 12 10 10 10 9 8 6 6 8 8 8 8 10 9 12 11 12 11 8 8 8 8 15 15 15 12 7 7 6 6
8 8 9 9 9 |