BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-062L05.T7 (MSMg01no062_l05.b1) | MSMg01-062L05.TJ (MSMg01no062_l05.g1) |
ACC | AG288613 | AG288614 |
length | 1,204 | 1,190 |
length of high quality (start - end) | 766 (100 - 865) | 665 (137 - 801) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_l05.b1 PHD_FILE: MSMg01no062_l05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no062_l05.g1 PHD_FILE: MSMg01no062_l05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:06:34 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCATTCTTGTNNNNNAACAGTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCCAGTTCCAGAGGATCCCTATAAATCTTCTAGGNTCT
GTAGGCACCAGACATGCACCCTTTGAAGACACATATTCTAGTAAAATAAG
CATAAAGCACACCAAAAAATCTAAAAATGAAAAAAAGTACAGCCACAGAC
TCAAGAACTAAGCACCGTGCTGAAAACAAATGCATCTTCCCAGGCATCTT
CAATGTCTTATGCTCTGTAAAGTTTCTTAATGAACCAAACGTAAGACAAT
AGAATAATCCTTGAAGACATCAGTGTATTTCACTATGTGTTTGTGTTTGT
GTGCATGTGTTTGTGGATGTTTGAAAGGATGGGCATTGGTGTGTGTGTGC
ACATATTGTGTGGGAGTTGTCATACATGTTGAGCCCCAAGGATGACATTT
GATTGTCTTCCTTAATTGCTTTCTATCTTACATATTTAGAGTCTCACTTG
AACCCAAGCTTCCCATTGAACTAGCCTAGCTGCACTTTGCCTCCTGACCC
TGCTCCCCTCACTCCTTAGGAACTCTTACTCTGGATTTTTTTGTATGACC
TAAAATAGTGAAAAAGTACCCTAAAACTATTATCTTTGTTCTGTACTGAT
GTCATTGCCAAATGTTACATATTGTATGCAGCTTCTTGATTTATAGAAAG
GGAGATTTGTTTTCACTTTTTGTAGCCACTTGCTAATATATGAGTTAAAA
TATCCCACATAAATTTTTAAACCACCTTAAAATTCAGAATCTTCACTTTC
TGAATGTTTAGTTTCGCATTATTTTTATATATACTATCCCTAACATATAA
GTCAAGCTCATTTGGCTACACTTCACAAATCTTTCACAGAAGTTAACTTT
AAGCTATTTATTTTCATATGATCAAATATATTTCTGATTCATGGCAGTTT
GTAAATGATATCGTTTATATTAAAATTCCCTAATATGAAAATCAAAGTCT
TTGAATAAATGGTTACCTGAAAATTGAAAAAATAATCTTCCTAAAAAAAG
TAAGGGCTTTAAAGGGTTTTTTTTTCTTTTTTAAAGGGAGGAAAAAATTC
TTCCTAAGGGGGCTTTTTTATAACCTTCTTTTATAAAAAAAATTTTCTTT
TTTTTAAATTTTCTAAAAGCAATCCCTCAAAAGGATTCCTATAACCCCTC
CCCC
| CCTCCTTTTNTNNNTACCATGGTAGNCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAAAGCGCCGCGGGGTAGGG
GGATTTCTCTGGGAACCGTTATTCTTGTTCTGGTCATTTTTCTGAGAACA
GCTCATTTTGTTCTGGCAGCTGTAGACTTAGTCGTCTTGACTGCTATGTT
TTTGAAAGTCCCTTCAGAGGGGAAGGGGCTGGGTGGTCTTGAACTTATTT
TGGATCCTACAATACCACACACACACACATTACTAAAAAATTAAAAATTC
GTGGTAAAAAATGCCAAACTATGATAATATACAAATAATCCACACGAAAC
CTTTTCCTGGTTGAGCAGAAATTCCTGTGCTTTTCAGAAGTGTTTAAACC
ACTTGCACGTTCTTTTAAGACAAGGTAAATTTAACAATTCATTGTTGATG
AGTATACTATAAAATGAACAAAGGAAAAATAGTTGAGGGACTTGACCATG
TCACCCATTCTTTTCCATAAATGGGCAAGATTAATCGTCAGTAGAAATCA
AATATTCCTCTTAATATTGTGCAGTGAAAACAACACTCTACCACTTCAGA
CCTCTTTACACAGTCTTTAAAACCTAAGGCATTTCAGTTTTAGAGGACAT
CTTATAAATGCCCTTGGAACCACTACATGCAATGAATTTCTTGGGAGGCA
ATACCAGAACAGATATGGGAAACTACTGGGAAAACAAATGGCTTTGTGTC
TTTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTGTTTTTGTTTTGACACATCCTATAATG
ATGTAAGATATGGCAAAAGCCACCAGAGGGATCTGGATTCTTCTAATGAT
TGGAGAAAAACTATATTATGTGTGCCTCTAACTGCAAAATGTAAAATAAA
ATATATTTTAAAAATAATTGCTTTATTTGNAAACACATTATGACAGAGAA
TTTAAGTTTGTTTTTGTTTCCTTGGACAGCATCCTTTTCCCAAACTTGGT
AATTTCCGATTTTAAAATTTGACTCCCTCCTTGCACTGACAAAATTTACT
AACCATTGATGGTATTTTGCTCGTGGCCAAAATAATTCTACCAGTTACCT
TTCCTTGTTTAAAACAATTTTGTTCTCGTGGTTGTTTAAAATTCCTTTTT
ATCAAAATGCTGGCATCCCCCTTATATTCCCCTGGGTCCA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 11 11 11 11 9 8 6 6 3 0 0 0 0 0 3 12 9 9 7 7 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 15 15 14 24 19 19 22 24 24 28 28 35 36 36 36 36 36
36 40 47 47 50 43 47 47 47 37 42 42 53 50 35 35 35 35 35 31 33 33 33 31 37 33 24 19 10 10 12 9 9 9 11 11 10 13 15 17 15 10 22 17 21 3 0 3 18 19
24 25 28 30 37 50 50 53 53 57 50 50 44 44 39 37 37 25 27 18 17 14 12 17 11 11 12 15 15 28 24 28 33 33 36 32 33 19 18 18 21 25 42 43 57 57 57 57 57 50
50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 68 57 59 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 44 44 43 39 31 26 23 23 12 28 39 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 68 62 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57
57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 59 59 59 59
57 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 50 50 47 43 59 41 37 31 31 37 39 41 59 59 59 59 59 59 50 50 57 57 57 53 59 50 50 50 50 57 57 59
59 59 57 50 50 47 47 47 47 48 33 33 33 33 37 37 39 39 39 37 41 37 34 39 39 39 19 11 11 11 11 18 13 12 19 16 25 31 31 30 37 37 37 30 30 30 37 37 41 39
39 43 36 31 35 36 37 39 39 39 32 29 32 34 37 37 39 37 37 37 32 32 28 32 37 37 37 37 34 28 28 28 34 34 39 41 41 36 37 39 30 26 12 12 11 12 15 23 23 37
32 36 35 36 36 34 34 23 24 24 23 14 14 9 8 8 8 19 13 8 10 10 17 16 30 24 17 12 15 12 12 14 22 19 14 16 16 21 19 18 10 10 8 12 9 13 15 8 8 8
11 11 10 10 10 15 16 11 15 15 18 19 22 23 14 14 14 16 18 21 16 18 22 19 16 11 14 14 13 13 20 20 14 22 10 13 8 8 8 8 10 19 23 25 28 28 13 14 10 8
8 8 9 9 11 18 16 16 14 10 12 10 11 19 18 19 18 20 14 14 11 9 12 9 9 9 9 8 17 11 8 8 8 8 11 12 16 14 11 9 9 9 9 10 10 9 9 9 9 12
13 16 13 16 8 8 8 8 8 8 9 9 14 14 12 12 12 15 14 15 11 11 8 8 8 11 15 28 32 21 17 9 9 9 9 9 9 9 8 6 7 6 6 8 11 10 11 9 8 10
10 13 11 9 8 8 8 8 8 12 12 14 12 9 10 10 12 10 12 14 16 17 11 8 7 7 8 22 22 19 12 12 10 13 10 9 7 6 6 8 8 10 11 11 10 10 10 10 12 11
15 11 11 11 11 11 8 8 8 13 8 9 10 10 10 22 25 19 17 8 8 6 6 6 8 11 8 10 10 15 10 8 8 6 6 6 9 17 19 9 9 9 9 9 12 10 10 10 15 19
16 17 12 15 10 10 11 10 11 15 13 9 9 9 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6 10 9 9 10 8 13 8 8 8 8 9 9 9 11 10 10 9 9 9 9 10 8 8 8 8
9 15 19 16 | Open.Hide. 8 8 8 6 8 8 6 11 3 0 3 0 0 0 3 6 6 6 6 9 8 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 8 8 13 8 8 9 8 9 8 16 18 20 25 21 26 26 29 22 19
12 12 19 26 30 35 37 37 37 36 36 36 36 50 36 36 33 44 39 37 37 41 27 23 9 9 9 9 7 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 13 25 30 33 33 33 33 33 53 53
59 59 57 53 50 36 35 31 31 31 30 28 33 19 19 8 8 8 8 8 17 16 20 23 23 21 22 22 22 18 23 23 15 10 10 10 15 22 39 37 37 37 39 41 48 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 54 54 54 50 48 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 68 68 68
59 59 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 59 59 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59
59 54 54 54 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 57 57 68 68 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59
59 59 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 54 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 40 40 40 43 43 57 50 59 59 59 59 59 59 36 28
23 12 12 11 15 11 11 15 24 32 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 53 50 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 43 43 30 39 30 44 44 48 48 48 48
40 43 43 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 54 57 59 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 57
57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 57 57 59 59 59 57 54 54 54 59 59 68 68 68 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 57 54 54 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 54 42 42
42 42 48 59 59 59 59 59 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 59 59 41 41 41 25 23 11 11 11 27 27 41 41 46 46 48 43 46 46 57 59 59 59 59 59 59 43
47 47 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 48 54 54 47 59 47 43 43 47 41 41 17 17 19 34 40 48 57 57 48 48 39 41 37 57 59 59 59 59 59 48
47 47 43 47 37 32 39 25 28 33 39 21 21 15 15 15 23 22 33 30 37 37 43 43 43 39 32 41 34 48 57 44 43 48 48 48 48 48 48 48 48 59 50 50 41 41 37 36 36 32
30 30 37 37 37 27 28 12 12 12 25 23 23 12 13 13 27 28 39 37 30 26 26 27 31 33 33 33 33 41 48 48 27 26 21 18 11 17 15 31 31 43 43 39 28 13 7 6 6 7
15 22 28 28 28 14 15 8 8 8 12 15 18 24 25 24 20 22 19 18 11 10 10 11 13 10 10 17 18 14 18 8 8 8 8 8 8 9 9 14 11 19 21 17 16 12 11 12 25 21
21 13 13 18 16 20 23 24 26 17 19 12 9 8 8 8 15 12 17 27 30 25 15 11 8 8 8 13 15 11 11 11 23 21 33 30 29 22 25 21 18 22 19 24 20 22 16 14 9 8
8 8 8 8 10 12 11 19 14 17 14 11 8 11 8 8 8 12 7 8 10 10 28 16 16 14 12 13 3 0 3 10 10 10 11 10 10 7 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 16
16 15 10 8 8 8 8 10 10 9 9 12 15 23 25 25 19 9 10 10 8 13 15 7 7 6 6 6 8 9 8 10 9 8 8 8 12 10 8 8 8 10 7 7 7 8 11 8 11 10
11 9 14 10 11 14 10 10 10 10 9 12 10 11 16 11 12 9 8 13 10 8 8 10 10 8 8 8 8 6 7 10 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 13 9 9 10 6 6 6
6 8 8 10 10 9 13 13 12 9 8 8 8 10 10 18 14 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 15 13 13 8 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12
13 14 12 12 9 9 9 12 12 18 16 12 11 10 8 8 10 15 13 12 10 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 10 12 12 12 10 10 10 10 10 12 13 14 18 10 8 8
8 8 8 11 12 10 8 7 6 8 8 11 8 10 10 10 12 13 14 10 7 8 6 6 6 6 6 8 9 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 7 |