BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-096N23.T7 (MSMg01no096_n23.b1) | MSMg01-096N23.TJ (MSMg01no096_n23.g1) |
ACC | AG313445 | AG313446 |
length | 740 | 751 |
length of high quality (start - end) | 321 (42 - 362) | 200 (72 - 271) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no096_n23.b1 PHD_FILE: MSMg01no096_n23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:53:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no096_n23.g1 PHD_FILE: MSMg01no096_n23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:53:24 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAGAGAATCCGCGGAA
TTCATTAAGTTCTTCCCTAAAATATACTTATGGAATAAACCTACATATAT
TTACTAGCCAGAAAACTTCAATATTAAAAAATGTGCCTTTTAATTGCAAA
AAATGTATTATGATTTTCTCCCTTAATATTATATTCTTTCCATAATGTAT
AATTGCAAGCACTTCCTCCATACTATCATACAGTCTACCTTCTGTGCAGG
ACTTAAATACAGACTTAGACAATTCCTTTTATACAGAAATATAACTATAG
ATTTTCATACTACTCTCTAAGAAGCATATGTCCAAGCTTGTGTGTTCACT
TATGGGAGAATCCATGACATGGATTGGCAGCCATTAGCATAGTGGTTGGA
ATAAAATGAACATTCACAGAAGAAAATTTTATTATTCATTCCTAAAACTC
AGTGTCATACGTAAATGCTATGCTATCTTACCTCTTGCATTTGCAATTGA
TTTACTTGTGATACAAACTAATTCTCAGCATGCTCTCCGTTTCCTGACAA
TAACAAGGGAAAGCATGAACAGGGAAGTTTGTTATTTACCACCCACAGCT
CAATGCCCCATATAATCAAATCTTTTTGTCAGAGCATCCTGCCACATAAT
CAGATCGTGTGAATTTGCCCATGCAATTTTACTAATATACACTCCTTTAA
AGCCTCAGTAACCCTGCTATATCCCATTCTTCTCTCCTGA
| TGATAGCGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXACTCTCGCACCTGCGTACAAGGCTTGTTT
ACTAGTTAGGCACAGCGGAGGCCCGCGCCATCTTATAATGGCGATTGCTG
GCGGCACGCACGGCTCTCCTCAGAGATTACTGGCGGCACGCACGCGATTG
CTCGCAGCATGTACTGGCTCTCCACATGCCTTCATCACAGACACACACAC
ACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACACTTACACCC
ATAGACGAGTTTTGAGACCTATCTGAACATGAATCCTCACAAACAAAGCT
ACATACTCCTATTATTTTTCACATACGCACACAGGCACACACACATTCAC
AACACACATATACCTCCCACCAATACGGACTTTAAATATTCCATTTACCT
TCACAAATAATCACGGTTCATACTTGATTACAAAACTAACTATCCACTTA
CTCCTAATAACCTTCCCTAACATTCCAATTATTGTTTTAGGCAGTGTTTA
CCCACCTTATTAAAACTCTCAAATTCCTATAAAAACGACCCCCCGGCCAT
ACGTATACAGATGCTACCCTCAAGTACCCTAACCGATCTTTTCCGATCTT
ACGCTTCCCACTTCCCAGACCCGTTTCCACCGGCGCCTGCATCCCCCGCC
TCCCTACCTGCTTCCCCATCCCACATTTACCCACCACTCGCTTCCTCCTC
N
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 11 15 34 34 25 24 24 28 25 20 27 28 31 33 33 34 34 24 24 19 15 12 11 11 17 22 30 20 22 12 12 13 10 9 10 9 9 14 19 19 25 34 34 28 21 21 29
29 33 33 37 37 37 43 44 27 17 9 9 9 9 13 12 9 12 20 11 14 14 20 25 32 39 41 47 50 50 59 59 53 53 53 53 23 23 11 11 11 23 23 47 47 50 57 57 57 57
57 57 57 42 42 30 29 29 19 22 28 36 44 57 57 48 43 43 37 37 37 48 48 57 57 54 57 46 46 39 39 41 38 38 42 37 35 42 44 57 57 57 57 57 57 47 47 47 44 44
41 41 41 42 42 46 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 52 43 43 50 50 54 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 52 52 27 23
9 9 9 23 23 57 68 68 68 68 68 59 59 57 52 52 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 44 41 27 20 20 28 41 43 57 57 57 57 57 57 57 52 52 43 36 29 29 44
43 43 43 50 43 43 43 43 44 43 28 28 28 44 34 44 33 32 27 38 38 46 57 50 54 54 59 59 59 57 57 57 44 36 23 23 23 37 37 48 57 32 44 28 28 37 32 32 44 44
57 57 44 57 47 43 43 57 57 57 57 57 40 40 25 28 24 24 23 13 18 13 12 12 14 28 28 46 57 43 43 43 33 33 30 30 30 37 40 37 37 39 43 43 43 47 39 39 39 39
43 34 28 28 24 35 37 37 25 27 21 13 12 12 11 15 11 12 12 12 15 15 19 26 20 10 10 10 10 10 18 30 39 32 32 20 20 20 34 34 36 36 43 59 59 43 43 41 36 36
44 43 54 54 54 54 54 43 42 30 30 30 25 29 17 18 18 11 11 11 12 16 18 28 28 43 43 43 43 43 39 39 21 15 9 9 9 15 20 27 20 19 25 28 32 39 36 32 28 24
12 12 12 21 21 37 37 39 43 39 40 33 43 33 39 43 39 43 39 42 39 35 35 39 32 32 35 35 32 43 40 48 48 48 40 32 28 20 20 24 25 18 11 11 11 15 16 28 31 30
30 28 28 28 28 26 28 20 20 32 29 34 32 23 23 24 25 28 33 28 30 28 37 33 23 24 12 12 12 24 28 37 47 48 48 39 43 41 41 37 37 35 28 28 32 30 30 24 17 17
17 18 24 15 15 12 22 15 17 15 23 15 20 20 28 24 32 23 21 18 15 15 12 12 9 10 10 10 8 8 10 15 18 24 24 30 30 30 20 17 14 9 9 10 10 12 11 11 11 10
11 11 12 12 13 14 22 20 22 23 23 23 21 15 14 19 14 14 15 19 13 9 8 9 9 12 12 14 16 16 12 10 8 8 8 10 8 8 11 10 22 19 16 16 20 20 23 24 16 14
10 9 9 11 17 11 8 8 8 8 8 12 14 15 10 10 11 9 8 10 9 9 9 9 9 9 10 19 15 19 9 9 9 12 13 12 11 8 8 8 8 11 11 11 13 15 12 10 10 15
11 11 11 12 13 11 11 11 11 11 10 10 10 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 8 8 8 15 9 9 9 10 10 11 16 13 | Open.Hide. 6 8 8 6 6 8 8 10 9 9 10 19 19 30 28 22 19 11 19 21 21 21 12 17 14 13 19 12 18 12 10 12 12 11 12 13 13 22 18 34 34 33 36 37 25 25 13 13 13 25
25 23 18 9 9 11 19 19 19 10 8 8 9 11 9 10 15 17 18 22 22 24 24 29 39 43 28 28 33 37 37 37 59 43 43 36 32 43 32 35 22 28 20 24 16 26 23 30 30 37
44 27 27 17 19 19 36 36 37 37 28 28 28 32 32 25 24 24 36 36 47 44 59 36 32 28 24 28 38 38 40 44 46 57 57 68 68 57 57 57 44 37 28 32 43 43 36 24 24 17
24 27 23 17 14 24 21 24 32 32 43 43 52 43 43 32 33 37 43 38 42 28 28 25 32 32 37 37 42 47 35 35 33 42 33 35 33 33 33 35 35 35 33 36 25 25 25 44 40 48
47 46 43 36 36 40 36 43 44 59 59 43 43 43 47 46 40 44 27 41 27 29 19 20 31 31 37 34 32 15 14 14 14 19 27 30 35 43 43 43 43 40 30 30 17 17 17 26 19 20
20 32 32 39 39 37 37 22 21 11 11 11 21 22 30 30 30 28 24 18 13 13 15 19 15 14 17 24 23 24 24 19 23 15 21 22 32 25 33 33 33 33 33 42 42 26 26 14 15 14
19 28 36 27 27 27 27 28 23 23 12 12 11 11 11 11 21 15 18 18 24 28 28 18 21 12 12 16 16 24 22 21 12 12 12 15 15 12 18 15 14 15 15 26 26 14 14 14 21 18
18 12 22 22 34 32 39 30 30 21 21 10 10 10 10 13 16 15 11 10 10 16 21 14 15 9 9 9 12 10 10 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 13 10 18 12 15 11 16 16 20
20 18 22 15 15 15 18 12 12 10 13 15 15 15 19 19 19 19 24 17 13 12 10 8 8 8 8 11 10 18 15 12 12 9 9 10 8 8 8 10 10 11 11 12 10 16 10 10 10 10
9 9 9 11 10 12 13 16 13 13 21 12 12 11 10 12 14 26 18 23 23 23 24 20 20 23 13 14 14 13 12 11 10 10 10 13 11 8 11 10 10 13 15 21 15 20 15 15 13 16
11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 13 15 12 11 11 12 18 12 12 11 11 11 12 12 11 11 11 12 15 18 21 25 32 21 15 15 13
11 8 8 8 8 17 15 19 10 10 10 10 9 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 14 10 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 11 18 19 21 19 19 17 14 9 9 9 8
8 8 8 6 7 6 6 6 8 8 13 11 10 9 9 9 10 13 10 13 15 10 10 10 13 11 11 16 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 9 9 13 12 9 10 12 12 12 12 9
9 9 9 9 9 12 9 9 9 9 9 10 10 15 11 11 10 10 10 10 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 15 10 11 10 9 11 12
12 12 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 15 10 12 12 8 10 8 8 8 8 9 9 10 15 6 9 6 6 6 6 8 6 8 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 3
0 |