BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-107C23.T7 (MSMg01no107_c23.b1) | MSMg01-107C23.TJ (MSMg01no107_c23.g1) |
ACC | AG321065 | AG321066 |
length | 1,217 | 1,297 |
length of high quality (start - end) | 334 (132 - 465) | 329 (129 - 457) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c23.b1 PHD_FILE: MSMg01no107_c23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no107_c23.g1 PHD_FILE: MSMg01no107_c23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:08:42 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCGAATCTNNNNNNTCGCATTTGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTCACCTGAGGAATACCCCCTTAAAGAGAAGCACCTGAA
AAAATGTTCAACATCCTTACCCTTCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCC
TGAGATTCCATCTCACACCTGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGT
GACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCTTCCATTG
TTGGTGGGATTTCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCGGT
TCCTCAGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCCGCAATATCTCTT
CTAGGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGTAATAAGGACACATGCTC
CACTATGTTCATATTTTCCTTATTTATAATAGCCAGAATCTAGAAAGAAC
CCAGTTGCCCCTCAACATAGGAATTGATACAGAAATTGTGGTACATTTAC
ACAATTGAGTACTACTTAGCCATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCT
AGGCAAATGATTGGACCTGGAGGGCATCATGCTGAGTGAGGTAACCCAAT
CACAAAGGAACTCACACAATATGTACTCATGGATAAGTAGATATTAGCCC
AGAAACTTAGGATACCCAAGATATAAGATACAATTTGCTAAACTCATGAT
ATTGAAGAAGAATGAAAACCAAAGTGTGGACACTTTGCCCCTTCTTAGAA
TTGGGAACAAAACACCCTTGGAAGGAGTTACCGAGACAAAGTTTGGAGCT
GTGACGAAAGGATGGACCATCTAGAGACTGCCGCATCCAGGGATCCCTCC
CATAATCAGCTTCCAAACACTGTAACCCTTTGCATACCCTATCAATATTT
TGCTTGAAAGGGACCCATATATACCCTGTTCCCCTTGTGAGTCTAATGCC
GGGGTCCCTAATTAAACACTAAAACGGTATTGTTTTACTGCCCAATTTAT
TGTAAGTGATTCCCAGTGTCCCCCCTAATGTAAGGAAGCTTATACAAAAG
TTACCCCCAAGGTAACCTAAAAGGGCATTTGGTAATCCCCTATTAGTTGG
GAAACATACATTTTTATGGAAATTATTTTCATAATTACTCCCGCGAATTT
TCTCTGAATCCCTTAGGGTGTCCTTTAGTGTCCTCCACAAAAAAGTTCCC
TCTATATACCTCTTCCC
| NCCAGATTTNNNNAAACATGGTAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTTAAGTCCAAACACTGAGTCT
TTTAATTGATAAATATCCTTTTAAGTTTTCTTTTCAAAACTTTCTCCACA
GGTTTAGAACTGAAAACTGTCTCACTAGAACTCTCTGGATGGTTTGCATC
TGTCTGCTGCGGTAGCTGGCACTCCACTTTGATGATCCAAAAGTGCACTG
CTAATACAGACAGAAGTGAGCAACCTGCTGCCAAATATTTCAGTCCACTT
ATTAATACATAGCAGTGGCCTCCAGGGACCCAGCACTGTCTACATCCTCA
GACTACATCTCTGTTAATACATGTAGCTCTTTCTGGCCAACTATGTCTCA
GGTTTTGTTTTTGTTTTGTTTTTCCTTGCTGACTGTGGTCCCCAAGATTT
CAGTAAAATGTTTAATCCCCCCCCAGAAACTAATCATATCTGTCATGCTT
CCAACTACAAGTGACTAAACCTTCAAAGTTTAATGTCTTCTGTGATGTCA
GCTAGATTGTCCGCTGGCGACCTTTAATGGATTGTGGGATAGATTTTAAT
CATGAGCCGATTTTTCAGTACCTGTCGACTCTGTTACCGTGTTAATAGAT
GAAGTCCCTGAACTTAAACTTTAATCCTATCGGTGTCCTTTTATGTGCTT
CTATGATCACTCATCTTCATGTTCTGTAAGAACTTCTTGCTTCTCGTTCA
TAAATGACACCCGAATTGTTATTTTTTATTTTTAGCGTCTTTGTTTTTTA
CTGTGCCACTCCAAAAGTTGATTTTGTCCCTTCTCCTCCATTTTCCCCTA
GATATTTTCCCGTTTAAACATTCGCCTACTGTTTTCTTTCTTCCTTTAAA
TTGTTTTGTTAAACAAAATTAATTTAATTCTTTAAATTATGTTTTCTTCA
TTTGATTTATATAAAATATTTTACTTTTCTTGCCATAAAGTTTCTGTGTT
TCTTTGTTCTCCTTTAGTTTTCCTTATCTCTTAAAATGTGTTCTATTAAA
TTCTTCCTGATATCAATCTTCTTCTCTCCCTAGAGACAATTTTTTAATAG
TCCCCCTTTTGTTTTATTACTCTTCCTGTGGCTTCCTCNATACGTGTATC
TTTTTCTTCCTCTTTCTTCCTATCATCCTCTTCGTGGAATCTCTTTATCT
TCGATATTACGCCTTAATAATATTATTACTATGTGGCATCTTCTTCATAT
CCTTTCTTTTATCTATCTATCATGTCTTATTATCTTCCATCTATTTA
|
quality values | Open.Hide. 0 3 8 8 8 8 9 3 0 0 0 0 0 0 3 9 6 6 7 7 6 6 8 10 13 15 8 8 8 8 8 8 19 19 9 8 8 8 10 12 19 19 35 36 33 33 33 36 33 33
37 37 37 37 39 39 39 39 28 32 37 30 30 33 28 28 28 28 28 29 28 29 37 37 37 28 25 13 15 12 14 11 11 9 11 13 13 10 10 10 10 11 18 23 21 24 24 28 34 34
47 59 57 57 53 50 50 50 53 53 33 33 33 33 33 23 19 10 10 9 11 9 14 12 18 12 12 12 18 19 23 23 23 26 26 36 39 39 39 39 39 37 43 30 30 39 43 42 48 48
48 48 54 57 57 57 48 48 48 47 42 48 48 54 57 57 48 47 42 46 48 42 47 47 57 57 57 57 68 68 57 40 44 23 23 23 37 36 43 43 43 44 44 46 47 43 43 41 44 44
47 57 57 57 47 43 41 37 35 43 43 50 50 44 44 43 43 43 50 50 52 57 52 43 44 29 29 43 44 52 52 52 43 43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 45 52 45 52 52 59 44 52 52 57 57 57 57 57 47 43 35 35
39 44 62 62 62 43 44 35 43 43 45 43 44 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 44 44 62 62 62 62 52 43 43 39 43 43 62 62 52 52 52 45 45 45 62 62 62 62 52 52 52
62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 39 39 43 43 45 43 43 39 39 39 62 62 43 39 39 43 43 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 52 43 43 24 24 14 14 14 10 10 10 12 39 43 62 52 52 52 62 62 62 52 43 43 62 43 52 52 52 52 52 62 43 43 43 21 21 27 38 39 62 62 62 62
62 62 62 43 43 35 43 43 62 62 43 38 18 15 11 11 12 13 13 13 12 12 12 12 12 12 11 15 16 32 38 43 43 39 39 39 57 47 43 43 26 26 26 43 43 39 43 43 44 43
42 42 43 39 39 42 43 39 42 39 39 57 57 57 57 38 38 12 12 11 15 18 26 38 33 27 27 38 38 38 43 47 38 37 43 50 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 47 43
35 31 31 38 43 43 52 52 43 44 43 43 35 37 37 43 44 43 23 23 20 24 20 23 23 36 38 37 37 37 43 43 37 40 37 39 37 44 43 47 42 42 32 32 37 42 37 35 39 39
44 39 36 30 25 25 25 36 36 43 46 57 44 42 41 41 41 39 39 39 39 39 39 39 36 39 39 37 37 33 28 23 20 19 15 13 13 15 13 21 21 32 32 28 28 12 12 11 19 19
11 11 12 14 14 23 22 22 12 12 15 28 28 34 32 32 25 28 28 32 36 39 39 34 31 22 23 23 32 34 35 35 39 43 34 39 32 32 28 17 12 12 12 14 10 15 13 19 9 9
9 12 12 23 22 12 12 11 12 12 12 13 17 13 11 11 11 12 15 14 13 11 18 19 19 22 22 15 12 11 12 11 21 27 37 37 37 37 28 28 32 34 28 25 16 16 10 11 9 10
9 10 10 10 15 18 28 25 28 22 20 18 16 16 14 21 14 10 10 13 13 19 19 13 10 10 15 12 10 8 6 6 8 9 10 11 10 13 10 10 10 12 21 25 12 12 11 12 12 12
12 12 10 13 10 10 10 10 10 10 10 12 19 16 10 10 10 10 10 12 18 17 11 11 11 13 11 18 16 10 11 11 13 13 16 19 18 16 18 13 10 10 10 10 9 12 12 12 16 21
24 21 22 22 28 19 24 14 12 12 15 12 14 10 12 12 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 15 15 9 9 10 10 10 15 15 12 8 8 10 12 8 9 10 13 19 19
15 11 11 11 10 11 19 19 13 12 10 10 9 12 19 13 13 9 7 7 13 8 8 8 9 13 18 19 22 13 15 9 10 10 10 19 13 10 10 8 8 8 8 8 9 10 10 10 12 12
12 12 19 19 17 23 16 15 10 9 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 11 8 8 8 8 8 8 13 10 12 10 8 9 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6
6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 8 9 11 12 21 24 23 15 8 8 8 8 8 7 7 7 8 9 10 10 9 9 9 9 9 9 11 13 15 14 17 16 14 11
11 10 10 9 11 15 14 13 12 11 10 10 9 9 9 11 10 11 12 12 12 18 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 9 9 9 16 12 12 11 10 10 10 10 9 10 10 11 13 15 14
12 12 12 11 8 8 8 8 8 8 9 12 24 22 15 13 11 11 10 10 13 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 11 16 15 11 10
8 8 6 6 6 8 8 10 6 6 8 8 9 9 9 9 8 6 8 8 8 8 11 11 10 12 8 8 6 6 8 12 9 10 12 8 10 11 10 11 10 19 13 9 8 8 8 8 9 10
11 9 8 8 10 10 8 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 | Open.Hide. 0 3 8 8 8 9 9 9 3 0 0 0 0 3 7 7 7 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 15 9 7 9 3 0 3 17 19 13 8 8 8 15 15 17 10 22
22 35 35 35 35 37 37 36 28 28 33 31 36 36 36 33 33 39 37 42 41 27 19 8 6 6 7 7 9 9 10 10 11 11 10 11 11 12 12 24 25 33 33 33 33 33 33 33 33 36
34 42 47 47 47 53 48 48 48 47 42 35 25 32 18 17 11 12 12 10 12 10 10 10 10 11 14 18 22 22 25 25 33 37 28 28 25 22 33 36 43 57 47 50 44 40 39 36 36 42
42 48 48 42 42 35 35 32 43 43 57 57 54 59 57 47 43 43 43 43 47 46 48 41 29 30 28 28 35 47 47 48 59 57 39 39 37 44 39 43 37 37 37 43 43 44 47 47 47 57
57 47 47 41 47 47 47 47 43 44 28 28 28 43 43 43 57 59 47 47 52 52 57 50 50 36 36 43 50 57 52 52 52 52 52 50 50 43 50 37 37 35 43 43 52 52 43 43 32 24
24 43 43 57 57 57 43 43 42 43 39 39 39 43 43 43 43 43 35 35 42 43 52 52 52 57 57 57 52 52 43 57 35 35 43 43 52 43 43 43 39 31 39 43 43 43 43 52 52 57
52 57 57 43 39 39 43 42 38 38 17 17 15 19 14 36 36 24 35 43 43 57 57 43 39 39 42 43 43 43 43 43 39 39 39 57 57 52 43 44 24 24 18 38 38 57 57 50 50 35
35 32 43 43 52 52 52 54 59 59 43 43 35 35 43 43 52 57 57 54 57 57 57 44 38 20 20 32 32 44 57 57 50 44 35 32 32 29 35 35 37 37 59 44 57 57 57 57 57 43
43 43 43 32 32 24 32 32 47 41 34 15 13 13 28 26 37 28 28 30 37 37 46 47 42 42 31 30 30 31 32 35 39 39 30 26 18 18 18 28 30 43 43 43 43 43 43 44 43 37
32 23 18 18 15 15 12 12 11 11 11 13 13 11 10 10 10 10 11 12 21 16 12 12 12 12 15 21 18 23 28 31 31 36 36 36 32 34 28 32 32 39 32 28 18 15 14 14 12 15
12 12 18 21 28 28 31 30 20 18 18 22 30 25 31 28 30 26 17 17 22 30 23 23 20 32 32 41 39 39 37 32 32 32 39 39 48 43 43 20 19 17 22 29 33 39 36 32 39 30
30 30 32 28 30 24 32 28 32 28 28 28 30 30 29 23 23 28 32 37 39 37 39 37 32 26 19 25 17 17 12 15 15 13 18 16 16 11 11 15 12 11 16 23 30 31 34 23 23 23
23 23 25 27 23 15 14 15 15 23 32 32 43 32 29 18 17 21 24 24 24 31 30 27 27 13 12 13 14 14 22 36 28 32 24 26 22 22 18 22 16 11 8 8 10 11 8 8 10 12
22 18 11 11 11 18 18 30 37 30 22 14 12 13 11 9 8 12 14 15 23 20 13 11 10 10 13 13 10 10 9 8 8 10 8 10 15 19 19 14 18 11 11 11 9 8 8 8 8 13
13 12 12 10 19 13 14 11 16 19 22 14 14 22 18 16 9 13 12 13 10 10 10 8 15 12 8 10 11 11 11 13 10 12 10 10 19 19 10 9 9 8 8 8 8 8 8 17 11 12
9 10 8 8 8 8 8 8 9 10 12 12 12 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 11 12 20 20 28 23 15 10 10 11 10 8 8 8 10 8 11 10 9 9 10 10 14 11 10 10 8
8 8 11 14 10 10 11 11 11 9 9 9 12 10 10 9 10 10 10 11 11 11 11 11 10 10 10 9 9 10 10 12 9 9 12 12 12 14 10 11 11 16 12 12 11 11 19 16 11 8
8 8 8 8 8 8 17 13 13 12 9 10 10 18 13 8 8 10 10 10 8 8 13 15 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 13 13 12 12 15 13 12 12 11 16 13 10 10 10
10 10 10 10 12 10 8 8 8 6 8 10 10 10 10 10 10 10 9 10 9 9 8 8 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 11 10 12 10 8 8 8 11
8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 10 12 13 10 10 6 6 8 8 8 15 17 18 11 8 11 13 10 10 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 10 10 13
14 14 12 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 9 9 9 9 13 8 8 8 10 10 10 13 13 10 10 8 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 11 8
8 6 7 10 11 13 15 8 8 6 6 8 8 8 8 10 11 17 13 10 10 10 9 8 8 6 7 10 10 10 12 9 11 8 8 6 6 6 11 10 11 10 11 11 9 12 7 6 8 8
8 8 8 6 6 6 6 8 6 9 9 9 9 8 10 6 6 8 8 6 6 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 7 3 0 3 8 9 9 6 6 6 8 8 8 9
11 10 15 16 13 16 18 18 14 12 12 12 10 11 14 12 12 13 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 6 13 8 6 6 6 6 8 6 8 6 6 8 8 18 19 16 12 12 14 10 10
8 8 6 6 6 8 8 10 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 9 10 10 8 8 9 8 6 6 6 8 8 9 9 13 8 8 7 7 6 6 8 10 8 6
6 6 6 8 14 9 9 12 12 13 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 10 9 10 12 10 10 7 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 6 6 |