| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-108P20.T7 (MSMg01no108_p20.b1) | MSMg01-108P20.TJ (MSMg01no108_p20.g1) |
|---|
| ACC | AG322287 | AG322288 |
|---|
| length | 1,704 | 718 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 477 (76 - 552) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no108_p20.b1 PHD_FILE: MSMg01no108_p20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no108_p20.g1 PHD_FILE: MSMg01no108_p20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:01 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CTCTGTTTGTTGGGTTNNCGGTTGTGTCGCGNCGCGCGCCGCGCGCTTCC
GGCGGTTCGATGTCTCTTACTACTCTGTTGAAGTATGTGTCGCTGCGCNG
CGGTGTCGTTGCCGCGACGACGTCGTGCGCGCGCCGATCACTGCNAGGCG
AGGACAGGTAGNGAGCTGAGATAGCGAGANCGNCAGGNCGCGCGCGCGTT
ACTATACATCCGCAGCCGTGTGTCGTGCGCTGCGACTCTACGGCGCTGAT
CNCATCCTGTATTGAGTCGTAGAGACGCCCAACCNACAGCGCACGATCGC
AGAACATCATAACACGCGAACCACAGCGAACGTGAGCGCACGAGCGNCGC
GTAGACGGAGAGTAAGCCGCGTGGAGGACTATATAACGCGCAGGCCGTGG
TTCTGACGCGTTGTGCGCATCGCTGTACGCTGTGTCGACGTCTGACAGCT
GAGTAGCANGACGTGTCGTATGAGCGTACTCTACTATAGTATATGACGCG
CGNTGCTAAGCAACGCTAGATTATAGACGTACCGCACGCGAGCAGCATCA
CGAATGCGCCAGTATACGCCACGCTCACGTGCTTAGCAGCGCANAGATCG
CGGCGCAGGCGCAGNAACGTACACGTATTATATATTGTTCTATGCGTGAG
TCTCGTGCTCACCTATTCGAGACATCAGCTATCTCGCGCTACCGACGCCA
TCTCTAATATCGCGTAGCGCTCGTCACTCATCTCTCTCTCATCTGCCCAC
GATCACCACACTACATAACACACACACGATACATACGACTGATCGATTAG
TTAATACGATCAATNTATATAGTCGTAGCGANAGCGCGAGCGCAGTTCTC
GTGTGGTATAGTGTTGAGTGTAGTGCTCGTTCGATGTTGTTCGTCTACTC
GTTGTCTAGTCTGTGCTGTGCGATCTGACTCTACCGTATTNTACTCCACT
CGCATAATATAATACTCTTGTGACTCGCGCTCCACTACGATGCTGCACAC
ATCATTAGGTGNATCGCCTGCGCTTGCACGCGCGCATGTACACGTTCATC
CGCCGCGGTGCGTCGCAGTGTAGTACAGAGCGACTGTGCGCGCTGNCTCA
CAGGCGCTTGCAGATACTATAATAGAAGATCGTTCCCACACTACGCACAC
ATGCCGATACACGATCCACGTCTGCTACTCTCTGTACGTGCGCTCGTCGT
ATATATCATACACGGCTTCGAACANTCATCTATATACTATACTTATACGC
TCTCATGAGTGTCGNTGATCNCGCGANATTATCTCTTATGTGTCGCCTAC
GACGAGATGCAGTACTCGTCTGCAGNATNACAGTGCGTGACACTCATGCT
GGACAGCCAGCTGTCNCCCGTAANGAACGACATGATGCGNAGTCGTCAAG
CATGTATGATGTCTGACGTGTAAGTCATTCGCTNCNGCCGTGCGAGTGTA
GTCTAATAGACGCGNACTCTNTGCGTATGTGATAGCTAGACGTTGATGTG
CTGATACGATGCNTCTTANTTACAGTCGTACACTGCCGAGTCGCGCGCTA
NCGTATGATGATCTCACNCAAGTAGCGTGCGTGACAGTCTCTCACATCTA
GAGTCTGCTACGCTNCGTAGCGATCAGAGTANATAAGTATGATTTGCGAT
GAGAGNCGGATGCGAGCGTGCTATGATGCGCACGCAGCAGAGATATTACT
AGAG
| AAACGATGCAGTGTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGAGGACCAGAAGAATAAATAGAA
TTATGTAGCAGTGGAAGGTTTAGAATGGGGGAAGCCACTAGAAAGCCCTA
GACTCCGGGTATGCAAGAGGCTCCCAGGACCCAGTGGTGATGACATTAGC
TGAAACACCCAACAGAGAAGAGATAGACCTTGAAGAGACCAACTTAAATA
GATAGACATGGCACCCATTTGAGGGAAGGTACTACTCTCATCTCAAATTT
TTAACCCAGAATTGTTCCTGTCTAAAGGAAATGGAGGGACAAAAAATGAG
CAAAGACTGAAGGAAATGCCCTACATTGGGATCCACCCCATTTGCAGACA
CCACACCATGACACTATTGCTGATGCCAAGAAGTGTTTGCTAACAGGAGC
AAACTGTTTTTTAACCCAAGATATTATTATTGAAAAAATTATAATAAGCC
TTTAAATTATTCGTCTTAGCACTGAGTCACTATACCTATTGAAAATATGG
TATAAATGCAGACCAGACTACTTGCATATTTAGATAAAATTCATATAGCT
TGTATGATGCCCATGTATAACTGCCAACTAGACTACATCTAGAATTAGGT
AAAACTCAAATGTCTGGGTATAACTCAGTGATTTGTTTTAATTAAGACCT
TTTTAACTAAGAAGATAC
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 3 6 8 8 6 6 8 6 6 10 9 10 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 9 9 10 8 7 7 7 7 7 6 6 6 6 6 6 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 3 0 3
8 8 8 8 8 9 8 6 6 6 6 8 10 12 10 10 8 8 6 6 8 13 8 10 8 8 9 9 9 9 11 12 9 9 9 9 9 9 11 11 11 11 9 3 0 3 9 9 9 8
8 8 8 6 8 6 6 6 7 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 9 3 0 3 3 0 3 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 8 10 9 8 8 6
8 6 6 6 7 15 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 7 9 8 8 6 6 6 7 10 10 10 10 10 10 10 11 11
3 0 3 8 10 8 10 8 8 8 9 9 10 9 9 11 11 11 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8
6 6 6 7 6 8 7 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 6 6 6 8 7 7 7 8 11 11 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 10 3 0 3 8 6
6 6 7 10 6 6 6 6 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 10 10 10 7 7 7 7 7 6 9 9 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 6
6 6 6 6 8 6 6 8 8 9 9 9 10 9 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 12 14 10 8 6 6 6 6 10 6 9 11 12 12 12 10 9 10 8 8 8 6 6 6 6
6 8 8 10 10 10 10 3 0 3 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 11 11 9 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 11 6 6
6 3 0 3 6 6 10 7 6 6 6 7 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 9 7 7 7 7 6 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 8 6 6 6 6 8 13 6 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 13 13 9 9 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 10 11 11 10
10 10 10 8 8 6 6 6 7 10 9 10 10 3 0 3 6 6 6 6 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 10 10 10 9 11 10 11 9 9 9 10 8 8 8 8
8 8 6 6 8 7 7 8 6 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 12 14 15 11 10 9 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8
8 8 10 8 8 8 7 6 6 6 6 6 9 10 10 10 10 10 10 9 9 10 11 11 8 8 6 6 7 8 9 9 9 6 6 6 6 8 7 6 8 8 8 8 7 6 7 6 6 6
6 6 6 9 9 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 10 6 7 7 8 9 14 11 21 12 12 8 7 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 9 7 10 8 6 6 6 6 6 6
6 6 9 9 9 9 10 11 10 8 6 6 6 3 0 3 9 6 6 6 6 8 6 7 6 6 8 8 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 6 6 6 6 8 8 6
6 6 6 8 6 6 6 13 8 11 11 10 10 15 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9 13 6 7 7 7 8 10 10 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6
7 8 6 8 8 8 7 9 7 7 7 10 8 8 8 8 10 14 9 9 7 7 7 7 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 18 17 11 8 8 8 8 8
8 10 9 8 8 8 8 10 10 8 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 10 13 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 9 7 8
6 6 6 8 8 6 6 6 7 6 3 0 3 14 10 10 8 6 6 6 8 8 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8
8 8 8 9 9 8 7 7 8 13 8 7 7 7 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 8 10 8 8 8 8 11 12 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6
6 8 6 9 10 10 10 11 10 9 9 8 8 6 8 8 8 10 10 8 10 6 6 6 7 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 10 9 7 10 10 8 6 6 6 6 6
6 11 9 9 11 11 11 10 10 10 10 11 12 10 8 8 8 6 8 8 7 6 6 6 9 11 11 11 9 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 16 15 10 8 6 6 6 6 6
6 10 8 10 10 9 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 8 7 7 7 9 11 11 13 11 10 8 8 8 8 8 8 9 12 13 16 15 12 12 11
11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 3 0 3 6 6 6 3 0 3 10 10 10 3 0 3 6 7 6 9 10 10 10 9 11 10 10 10 9 6 6 6 6 6 6 6 8 6
6 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 3 0 3 8 8 8 6 7 9 9 9 9 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 8 8 3 0 3 7 6 6 8 8 9 9 10 11 10 10 8 8 3 0 3 9 10 9 9 9 8 8 8 8
8 8 10 13 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 12
14 19 12 10 8 9 8 8 8 8 6 8 8 3 0 3 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 10 10 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 11
11 9 9 8 7 7 7 8 8 11 11 3 0 3 8 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 9 9 13 11 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 9 6 6 6 6 8 3
0 3 8 7 6 6 8 6 6 6 6 6 10 10 9 9 3 0 3 8 6 6 7 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 10 15 10 9 9 9 8 8 8
8 10 8 8 9 8 8 6 8 6 6 6 6 3 0 3 8 8 8 10 11 11 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 8 7 6 6 6 6 6 6 6
6 6 8 11 3 0 3 7 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 6 6 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 11 13 11 8 8 6 6 6 6 6 6
6 6 10 7 | Open.Hide. 6 6 8 8 8 8 12 12 10 9 9 15 9 9 9 9 19 17 30 26 30 41 41 30 30 30 28 28 32 41 47 47 27 27 11 9 12 12 17 15 15 15 15 11 15 16 23 21 22 17
17 17 20 31 23 33 33 33 33 33 30 21 21 8 8 8 8 9 9 9 9 17 17 22 28 30 31 31 31 47 48 57 50 50 50 50 50 50 50 43 43 48 48 42 42 42 42 42 40 40
50 42 42 47 47 47 42 42 50 50 50 50 50 50 57 47 48 47 50 50 50 57 42 42 37 37 37 37 39 47 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 41 50 50 50 50 52 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 57 57 57 57 57 57 62 62 62 52 52 52 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 39 43 43 43 62 62 62 62 62 62 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68
57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 59 59 52 52 52 57 43 38 38 27 41 28 32 32 43 43 52 52 52 52 43 43 35 50 43 43 42 43 43 43 43 37 37
37 37 39 41 50 50 50 50 50 42 35 35 42 42 44 40 40 28 28 28 37 36 40 36 28 28 36 28 28 32 32 42 44 39 41 41 43 59 57 59 59 57 48 46 43 48 46 40 37 26
25 30 40 37 43 43 43 43 43 43 43 48 40 40 37 37 43 43 43 48 48 48 48 48 47 36 28 25 25 28 32 37 37 35 35 35 35 24 22 11 11 11 23 19 23 23 32 28 28 28
28 30 32 39 39 35 37 35 37 36 32 39 30 39 37 43 43 43 43 42 42 33 36 39 36 30 30 30 25 25 25 25 20 31 28 32 30 28 30 28 28 21 28 19 19 19 18 18 25 25
25 28 36 36 35 35 35 39 39 46 44 36 23 23 23 34 32 41 39 39 32 32 33 33 25 36 36 25 25 25 37 29 35 35 35 39 39 43 39 39 35 35 35 32 37 30 30 32 32 18
17 10 10 10 18 23 21 22 13 13 13 21 25 18 8 8 6 6 6 13 13 17 17 10 10 10 17 17 10 10 10 10 12 11 21 21 19 20 22 25 25 24 30 17 18 15 10 9 10 10
15 15 11 15 16 16 11 10 10 8 8 8 8 13 9 12 15 22 24 15 15 10 10 10 16 17 23 28 26 21 13 13 18 16 27 11 11 11 11 11 15 19 15 18 15 15 14 13 13 16
16 16 13 19 10 13 10 12 10 14 19 17 12 12 15 14 14 20 21 22 18 11 11 11 19 16 14 12 9 12 12 9 9 9 9 11 19 20 9 9 9 10 10 8 9 10 10 14 15 22
22 28 15 15 13 13 11 11 13 11 11 11 10 10 10 10 10 10 |
|---|
