BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-111J19.T7 (MSMg01no111_j19.b1) | MSMg01-111J19.TJ (MSMg01no111_j19.g1) |
ACC | AG324238 | AG324239 |
length | 1,079 | 1,077 |
length of high quality (start - end) | 273 (56 - 328) | 270 (58 - 327) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_j19.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_j19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:16:09 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_j19.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_j19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:16:10 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | CCTAAAGGCCCCCGNANTTGAAAAAATGTTCAANATNNTCCCTTTAAAAG
CCCCTGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCTCACACCAGTCAGAAT
GGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCAGATGCTGGCGAGGATGTGGAG
AAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGGGAGTGCAGGCTCGTACAACCA
CTCTGGAAATTAGTCTGGCGGTTCCTCAGAAAACTGGACATAGTACTACC
GGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGCCCCAA
CAGGTAAGAAGGACACATGCTCCACTATTTTTTTAGCAGCCTTATTTATA
ATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCTAGATGCTTTTTATCACACGAATGGAT
ACAGAAAATGTGGCACATCTACACAATGGAGTACTACTCAGCTATTAAAA
AGAATGAATTTATGAAATTCCTAGCCAAATGGATGGACCTGGAGGGCATC
ATCCTGAGTGAGGTCACACATTCACAAAGAAACTCACACAATATGTATTC
ACTGATAACTGGATACTAGCCCCAAACCTAGGATACCCAAGATATAAGAT
ATAATTTGCTAAACACATGAAACTTCAAGAAGAATGAAGACTGAAGTGTG
GACACTATGCCCCTCCTTAGATTTGGGAACAAAACACCCATGGAAGGAGT
TACAGAGACCGAGTTTGGAGCTGAGATTGACAGGATGGACCATGTATAGA
CTGCCTTATCCAGGGATCCACCCCATAATCCGCATCCAAACGCTGACACC
CTTGCATACCCTAGCAAGATTTTTATTGAAAGGACCCCCAAGCATCTGTC
TCCTTTGTGAGACTATGCCCGGGGCCCCGCAAACACAGAATTGGATGCTT
CCCGTCCGTCTCATGGTTGGGATCATATGGTCCCCCCTTGGTAGGACCTT
CAGAAAGCTTTCCCCGGAAGCTTAAGGGGATCCTGCCACCCCTTTAGGGG
GGTAAACACCCTTTTGTAGCCTTAACCCGTTACCCCCCGGAATCTCTTGG
ACCCCTTGGCTTCCCAATATAATTCCAAA
| TATTCAAGAGGCCTCAGCCTCCTCTATAGTAGGCACCACTACCTGTTAAA
GGCTGGNACTGAGGGCAGCCAGTTTCTCCATAGAGCTCTCAGAGTCCAAT
GCATATGTGTTCTCGCTGATCTTTGTCTCTGCTTGGACTTGATATTCAAG
CTTTGGTGGGTAGTGAAGGTTGAGTGACTGGTAGAGACAGAAGTTGACAA
AGCCCAGAAGTGTGGTATAAAACTCAGTGAAGGTGGCCAGGACCCTGTAG
TCCACATCATGATCATCTTTTGGATGATCATGGGAGAAAGCATAGGGTGC
AATCCATACAATGGGCTGACCCAGCTCTTTTTTTTGATAATAAATGCCTT
TAATGGACAGGAAGACCTTGCGCACGGCTCGTTTTTTGCCCACCTAGTGC
AGGAACTCCACAGTGAGCCGGGGGCGGCACAACTGAAAGGTCTGCACGTG
ACACTTGCCAGTCCGAATGAAGGTGGAGAAGAGGAAGCACATTGACAGGG
CATCATCGAGGTCCTGCAGAGCATCGATAAATGTCGGGTACCGCTCCTTG
ACAATGTGGTCAAGTTTGCAGCAGGTTTTATTGTCCTTCAGGCGCTCCAT
AGCATTCCATTCGCTCTTTCCATGGGCTTTGCTGAGCTTCGGAACAAACA
CCTTTGTACTCTCGGAACTTGTTGACGATGGTCTCATGTAGGATGAATTT
ATTGTCTTTGATAAGGTAAAATGTCCAGGCTGCTGTGGAACCCTTGTTAA
CTTTCTTCTTATGCTTGGGTTCGTGAGGATAAATTCCTTTTTAGGATGTT
CCTTCTCCCTGAATTCTGTTAGGTTTTTCTTGCTTTTCTTTCTGGGCCTT
GTTTTTGTTTGATATATTTGTTGGCTAGATCCTAATTCCTTTCTTTCTTC
TTTTCCATACCTTCCTATAACTCCTGGTTGAAAAAATTCATGGTTACTCC
ATGATCAACCCAATCCTTTTGTTCCTAACTGCTGAATAAAACCCCCTTTT
GTGATAATTGTCCCCCTTCAATTGTAGGTTATCTTTAGGTTTGTTTATCG
GTTTCCGAAATTTTATTTTATTTACCC
|
quality values | Open.Hide.12 12 10 10 9 9 9 9 11 12 12 9 8 3 0 3 0 3 21 21 37 37 59 50 33 31 30 28 25 23 21 23 3 0 3 3 0 0 3 9 10 10 13 12 11 11 11 8 8 8
9 8 8 9 14 9 23 23 47 42 50 50 50 53 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 48 48 40 43 42 43 39 43 43 43 43 39 42 43 39 37 29 30 25 44 40 48 48 59 57 57
57 54 54 48 59 48 44 44 46 44 47 44 46 44 48 44 42 42 37 37 42 42 42 42 42 42 33 33 27 41 41 59 47 47 44 43 43 43 43 50 50 57 57 59 57 57 48 48 48 57
52 57 57 59 54 54 54 50 50 36 36 37 43 52 52 50 50 37 37 37 57 52 54 57 52 52 52 57 57 57 57 59 57 57 43 39 39 57 43 52 52 57 52 52 52 52 52 57 52 52
52 57 57 57 52 59 52 52 52 43 43 52 52 43 50 43 52 52 52 52 43 43 35 43 43 38 27 13 14 30 38 50 57 57 57 54 54 57 50 50 44 43 43 44 42 43 44 48 47 48
47 47 47 48 32 32 18 18 12 19 24 28 41 42 42 47 43 48 48 57 57 54 47 44 39 59 44 44 43 43 46 48 57 48 42 37 37 31 37 39 32 32 41 41 48 43 42 43 43 43
48 48 48 48 43 43 43 59 43 43 43 43 43 43 43 40 40 40 43 43 37 37 37 22 21 12 12 11 15 12 11 9 9 9 9 10 25 25 36 35 47 47 48 48 59 59 57 48 43 43
39 39 30 30 33 33 28 30 35 37 37 37 43 43 48 48 48 48 48 43 43 40 37 39 33 22 22 11 8 6 6 8 8 16 11 11 11 8 6 8 8 6 6 8 11 16 23 34 41 37
37 28 23 23 23 23 23 23 30 24 12 10 6 6 8 15 17 28 30 28 32 26 28 34 34 43 43 43 43 43 48 48 47 40 43 43 39 34 28 23 23 23 32 37 43 54 42 42 30 41
32 41 32 20 20 20 32 32 48 48 48 48 42 43 35 35 35 39 39 43 36 36 28 24 24 20 20 23 37 36 32 26 14 18 15 30 30 47 42 42 37 37 37 32 32 25 23 23 25 25
24 28 28 28 28 32 15 14 14 21 30 24 27 14 12 15 18 18 36 41 42 42 30 30 30 30 23 26 18 20 20 20 20 27 18 14 13 13 21 21 32 42 39 43 32 32 20 18 24 13
19 17 31 28 33 21 21 16 18 18 16 14 12 12 10 12 19 12 12 12 21 24 14 14 15 23 29 28 28 20 18 15 17 10 10 13 19 12 13 19 18 22 29 29 29 21 21 16 16 18
18 26 33 43 43 43 32 32 19 17 14 24 24 14 14 14 18 16 26 21 13 12 15 21 17 22 11 12 12 12 12 11 11 10 10 10 13 10 10 10 11 10 10 10 10 17 13 22 22 20
20 20 12 12 14 15 15 12 20 20 24 27 33 32 25 25 20 20 12 10 9 10 10 21 17 24 12 8 8 8 8 10 9 10 10 13 8 10 8 8 10 11 15 22 21 11 11 11 11 10
11 11 11 11 12 11 18 11 11 11 12 12 10 9 17 14 11 11 11 15 15 22 23 11 11 11 13 13 17 11 11 11 12 12 29 24 18 18 15 18 14 21 21 22 17 10 10 10 13 15
13 17 14 15 10 10 9 14 9 9 9 10 10 13 18 15 15 18 11 11 10 11 11 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 12 12 13 19 17 13 10 10 11 14
17 22 15 12 11 15 15 30 12 10 8 8 8 8 11 10 7 8 8 15 13 9 8 8 8 8 10 11 12 8 8 8 8 8 8 13 10 10 9 9 10 9 9 8 8 8 8 10 9 10
9 10 12 12 8 12 8 8 10 10 10 10 10 10 16 15 12 8 9 7 7 8 6 8 8 9 9 8 8 9 11 12 12 10 10 10 10 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
13 15 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 15 10 8 8 8 10 10 15 16 15 12 8 8 7 7 8 8 11 10 11 11 11 8 9 10 10 13 8 8 8 8 8 8 10 10 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10 8 8 8 9 8 8 11 10 10 10 12 11 11 10 8 8 8 8 8 13 13 13 18 17 12 12 13 9 9 9 10 8 8
6 6 7 6 6 8 8 8 8 8 9 13 13 8 8 8 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 11 11 9 9 9 10 10 10 12 11 9 9 9 9 9 9
13 11 11 11 10 10 9 9 10 10 10 11 9 8 8 8 6 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 13 9 | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 9 9 21 23 37 33 33 33 33 33 36 47 50 50 57 50 53 50 47 47 33 33 33 37 37 29 26 14 10 7 6 6 6 6 6 6 8 15 13
13 15 23 23 25 3 0 3 27 23 47 41 47 43 47 47 39 43 43 57 57 57 57 59 59 59 47 47 42 39 39 42 42 42 34 34 43 43 40 40 34 43 46 59 46 54 54 46 46 43
43 43 43 43 47 47 57 54 47 47 47 57 57 44 44 41 44 46 48 48 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 54 59 59 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 37
43 44 50 44 42 33 33 33 29 31 38 43 43 39 41 43 43 52 52 52 52 57 52 52 52 52 52 52 52 52 43 43 27 23 18 32 28 33 33 38 43 42 43 57 44 43 43 35 31 31
33 33 33 32 30 14 16 32 41 43 43 43 43 42 42 37 37 43 37 37 37 42 42 27 27 14 14 14 30 38 50 50 50 50 48 48 48 44 44 43 29 29 33 36 43 50 28 28 38 38
36 33 36 42 42 32 28 20 20 20 32 32 44 57 57 57 59 59 68 59 59 54 44 44 44 44 44 59 59 59 43 46 43 43 43 43 41 47 43 43 43 41 39 28 28 23 23 23 23 28
28 37 30 37 32 39 33 37 30 28 28 28 28 25 32 32 37 37 47 37 32 28 18 10 8 8 8 6 8 17 14 18 14 13 13 23 23 41 36 39 39 47 43 48 57 48 48 48 48 57
48 48 32 32 18 18 18 18 18 24 32 37 43 43 43 43 43 39 47 35 35 22 15 9 9 9 12 15 9 10 10 10 8 8 11 11 11 11 11 11 11 11 11 12 12 9 12 9 12 12
21 21 30 39 34 39 37 37 28 23 23 20 19 19 26 24 22 22 23 28 23 23 31 23 23 20 20 28 28 21 23 14 17 21 34 26 28 20 20 23 33 33 37 37 28 25 25 25 31 37
28 28 23 23 23 32 32 23 23 19 24 17 20 18 15 8 8 8 8 10 10 13 13 13 18 18 13 13 12 12 12 12 12 15 20 17 13 12 13 13 16 29 32 28 25 19 19 16 16 15
15 15 19 19 17 27 12 12 12 16 19 24 24 28 28 25 22 15 15 12 12 12 19 19 13 12 19 18 16 19 22 24 19 21 12 12 12 12 12 21 21 32 23 20 24 24 17 16 25 18
21 11 10 10 14 13 13 17 9 10 12 19 16 23 21 20 18 16 15 11 11 11 10 8 8 10 10 13 10 15 12 16 12 13 13 18 24 20 18 16 16 16 21 24 28 28 28 25 18 18
12 11 11 13 13 18 15 14 18 18 30 15 15 10 8 8 8 8 8 23 14 24 21 19 9 9 8 8 10 10 8 14 17 23 15 11 11 15 23 15 15 10 10 10 16 21 18 15 13 12
12 16 16 19 18 19 14 15 15 11 12 12 12 11 10 10 13 15 15 19 10 11 11 17 15 10 10 10 10 8 8 8 8 8 10 15 18 13 14 11 11 11 9 9 9 9 9 12 25 17
17 11 9 12 9 7 10 8 11 11 13 13 18 8 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 10 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 22 27 34 37 23 21 10 10
10 17 17 19 10 8 10 10 10 11 10 12 10 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 15 13 12 12 12 12 12 9 9 11 11 12 12 24 26 12 12 9 8 8 8 8 10 9 9
9 8 8 8 7 7 10 8 8 9 8 8 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 9 10 11 11 9 8 8 13 13 12 12 12 10 8 6 6 6 6 8 9 9 10 8 8 10 10 10
8 10 15 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 10 9 10 10 12 11 18 19 11 11 10 9 8 8 8 8 10 10 11 12 9 10 10 9 9 10 11 9 9 10 14 15 10 8 10 8 11
11 11 14 18 13 10 9 9 9 10 9 13 11 10 10 10 9 11 10 8 8 8 12 10 10 10 10 8 8 10 8 8 10 13 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9
9 9 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 8 10 8 8 11 10 8 8 6 7 8 8 8 8 10 8 8 8 9 10 9 9 9 9 10 9 10 10 10 17 9 9 10
10 8 8 10 10 11 12 12 11 11 15 11 11 11 11 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 12 11 11 10 10 10 15 12 10 12 13 14 8 8 8 8
8 10 12 12 8 8 6 6 8 8 10 14 10 11 10 8 8 8 13 13 12 11 11 11 9 9 9 |