BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-116F23.T7 (MSMg01no116_f23.b1) | MSMg01-116F23.TJ (MSMg01no116_f23.g1) |
ACC | AG327770 | AG327771 |
length | 721 | 701 |
length of high quality (start - end) | 641 (51 - 691) | 292 (56 - 347) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no116_f23.b1 PHD_FILE: MSMg01no116_f23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:22:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no116_f23.g1 PHD_FILE: MSMg01no116_f23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:22:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NNAATATCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCCTGGGTCTGCACGCTGACCAGCGGTTCCAATGGTTGTAGG
TGCTTTAGTTTGCTCCTCTGTTCCTGTGATAAAACACTCATCAAAAAAAC
AACTTAGGAGAGGGAAGGATTAATTTGGGTTGTGGGTCACAGTCTACCAT
CAAAGGAAGCTTGTGCAAGAACTCAAGGCTGAAAACACAGAGGCAGGAAT
GGAAACAAAGACCATGGAGGAATGTTTACTGGCTTGCTCTATGTGGCTCA
CTCCGACAGCTTTCTTATACAGCCCAGGAGTATGTGCCCAAGGTTGGCAC
TGCCTACAGTGGTCTGAGCCCTCTCGCACCAATTAGAAATTAAGAAATGT
TTCTTCCACAGACATGACAACTGGCCGATCTGATAGGGGCAGTTCTTTAG
TTAAGGTTCCCCCTTTCAGGGGACTCCAAGCTTGTGCCAAGTTGACAACT
GAAGCTAGCTATGATAGGGGTCTTTGTCCAGTTCCCTTCTCCGGGCGTGT
ATCCATTTCTTTGTAGCTGAGACAGTCATTTGGTGGGCATTGCTGTCAGC
TAGTGGACACTTGAAAATCCTAGATTCTTAACCTGTGGGTAGTGATCCTC
TTGGGGTCTGCTATCCTGCATATCAGATATTACATTATGATTTATAGCAG
TAGCAGATTTACAGTTATGAA
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXTCAGCTGTAAAAGAATCCAGATGTTCTAAGATGATTTGGGGGGGA
TGCCCCAAGGATGCCAGATTTTTACAAAGACCTGCCAAGTCTTGATGTGT
GCTCCTTAGGAACCATTCTGGAAGAGATGCTGGGAAGTGCCCCCCCCGCC
ACTCCCCCTCCACCCCCCCAAGCAAGATATTCGTGAGAAAGGGAGGAAGA
CAGAGTTGGGTGGACAGAGGAGCTGAGCCTCAATGTAGTAGCCACTGAGG
TCTCTGCCAGTTCTACAGGAGCTGGGGAGGCTCCAAACTGTGATTATGTT
GTCCCTCACCACCACCTGTGTCAGCTTTACTCACTACAGGCTCTCATCTA
AGACAGTGGCTGAAGTTTTAACACAGCTCCTCCTGTTGTGAGGACTCTCA
ACCATAAAATTATCTTGTTGCAGTTCTCTCGACAGCTGTCCCTCTTTATA
AGTTGGCACTCCGTAAGGATGAAGCCATGTTCAGCTCCAGTGCCAAGACT
GTGAAGCCAAATGGGGAGAACCCGGATGAGTTCCAAGTCTGGTATCTCTC
ACGTGCTGCTCGAGCTGGAGATGAACGCACATGTCCAGTTTCTGCTGCAG
GAAGTCTCCTTCCCCCCTACCCAAGCAATATGTATTTGCGCGGTGCTCCC
A
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 8 8 10 8 17 13 13 17 25 30 30 20 18 18 15 13 17 10 10 10 22 22 33 48 44 30 24 24 20 15 22 10 9 9 9 9 9 10 17 18 22 22 28 24 26
28 37 39 44 50 50 36 36 50 31 39 37 37 25 25 10 10 9 8 7 8 8 8 10 16 30 28 29 31 31 31 36 47 57 57 36 36 34 28 23 28 33 37 37 47 47 47 42 47 50
51 51 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 57 57 68 57 48 43 36 36 42 42 42 44 48 51 51 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 59 59 50 50 50 50 50 50 57 50 50 50 50 50 51 50 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 62 62 47 47
47 62 62 62 68 68 68 68 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 47 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 39 39 29 29 39 39 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 47 52 45 45 45 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 52 43 43 35 44 44 62 62 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 62 68 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 57 57 68 68 57 57 54 54 54 54 54 57 57 57 44 44 32 32 32 44 44 52 52 52 59 57 57 43 43 37 57 57 47 44 44 32 32 32 43 43
46 44 43 43 44 43 43 37 43 43 44 43 48 44 59 47 47 43 43 37 37 43 44 57 59 57 54 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 42 30 30 30 37 32
32 39 59 42 48 43 59 47 48 48 43 43 37 37 39 39 43 36 34 24 24 24 33 33 41 41 47 41 41 41 39 29 24 24 19 19 20 23 34 34 37 35 35 47 37 47 40 33 33 30
32 30 30 30 26 23 27 30 37 39 37 37 32 29 29 32 39 43 43 34 28 20 12 16 14 16 14 19 22 24 24 31 30 24 22 22 21 24 23 32 28 25 24 24 25 23 21 19 30 30
28 30 23 12 10 10 13 13 19 15 28 28 33 37 46 43 39 33 30 30 25 28 29 32 30 32 16 18 18 29 29 32 28 28 28 33 33 22 20 18 14 11 9 13 16 18 13 11 11 22
24 29 29 28 30 30 23 27 11 12 12 10 10 8 8 8 15 14 15 11 11 | Open.Hide.26 28 30 30 30 28 24 24 39 39 34 27 16 6 6 6 6 11 6 8 8 8 19 21 30 18 18 17 15 15 14 16 20 27 22 30 28 25 19 19 9 9 11 11 13 11 15 16 12 11
14 23 23 33 33 28 28 28 35 35 36 50 53 53 50 42 40 40 40 40 42 42 42 42 42 42 42 48 48 48 48 57 57 50 40 37 37 37 36 36 36 36 50 50 50 48 59 40 37 37
37 25 27 15 14 14 14 16 28 25 28 28 28 28 33 36 36 38 57 59 59 59 43 43 36 36 40 40 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 50 42 50 50 50 47 47 47
47 48 57 57 68 57 57 57 59 57 57 57 57 47 47 47 50 57 57 57 57 57 57 57 41 40 40 40 40 46 57 57 54 54 47 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 59 59 59 54 54
57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 50 59 59 59 57 57 57 57 54 57 57 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 47 42 39 36 37 43 44 44 43 43 47 47 35 42 42 44 43 43 43
43 39 37 35 35 35 40 37 37 30 30 32 44 44 54 54 54 46 46 43 43 43 43 39 42 37 43 43 47 47 33 32 30 30 32 32 32 23 23 23 28 34 32 32 35 39 39 39 35 36
34 23 17 8 8 8 8 8 15 18 24 41 41 47 43 36 36 39 43 39 39 32 32 28 23 23 28 32 37 37 40 39 39 39 39 37 37 33 39 33 32 19 15 12 11 11 11 11 11 11
16 16 17 10 8 8 8 8 8 8 10 11 19 18 29 33 37 30 37 37 41 41 59 59 59 47 47 47 47 47 47 47 47 50 47 57 48 37 42 32 32 35 42 47 54 57 54 57 47 59
35 28 28 24 21 19 15 15 12 12 11 11 11 13 13 13 14 21 32 26 32 23 20 20 17 19 19 30 27 37 37 44 38 39 35 35 42 35 35 42 42 40 40 25 30 30 42 38 46 43
39 37 37 37 43 46 44 42 35 41 41 41 36 25 19 19 19 24 18 18 12 13 16 19 19 24 26 28 32 24 28 28 28 25 25 25 34 37 30 35 39 39 43 48 48 47 37 37 33 26
24 19 18 18 20 20 31 34 39 41 33 33 27 21 19 14 14 14 19 19 16 14 19 21 17 19 16 23 28 32 30 39 37 20 15 17 16 10 11 13 9 13 13 21 22 12 15 11 13 13
11 11 16 22 22 22 25 24 24 20 18 18 14 12 12 12 12 19 15 12 12 12 12 13 13 12 12 12 11 10 16 19 15 14 19 19 17 17 18 28 28 17 13 13 12 21 18 10 10 8
8 8 8 10 10 12 16 21 26 25 28 24 24 17 16 21 11 10 8 8 8 11 12 10 14 10 10 8 10 8 9 13 15 17 10 10 9 9 9 9 12 13 18 14 14 13 17 12 11 11
15 16 22 23 13 8 8 8 8 8 9 13 17 24 15 16 14 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 11 10 10 8 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 8
8 |