BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124C06.T7 (MSMg01no124_c06.b1) | MSMg01-124C06.TJ (MSMg01no124_c06.g1) |
ACC | AG333570 | AG333571 |
length | 1,256 | 1,246 |
length of high quality (start - end) | 338 (37 - 374) | 583 (124 - 706) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_c06.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_c06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:50 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_c06.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_c06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:34:50 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTCCCCCCGGCTCTCGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGC
AATTCACTTTACAGACCAAGCTAGTTGATCTTGAACTCACAGAGATCCAC
ATGTCTCTGTCTCCTGAATGCTGGGATTAAAGGTGTGCACTGCTGAAGTG
AAAACTTAAGGGTTCTTCAGAAAGTCTGTTGTATTGCATGGTGTTTCCAT
AACGTGGACTCGTGAAGGAACTTTTGGCTGAAGCAGACACAGGTGAAAGG
ATGTTCTGCTAAAGCAAGCAGTTAAAAGCACATATGATGAAGAATTCTTT
GATAATTACAAGCATCTATTGGTCTGCCTTAAAATGTATAGCTGAGCTTC
ATTTGTTTGGACTCCACAGAGAGAAACGCACCAAAAAAAAAAAAATTCTG
ATGGTTTTTTTCATGCTGCTTCCATGGTCTGATTGGCCGAGTGATGTCAA
CTTTTTTTTTTTCCCCCCCCGAGGCAAGACCCTTGCCCCCTCAAAAAAAA
GGGGAAGGGAGTATAAACACGACTCCACAGACAGTGATGGTGACTGGTCT
TGCTGGTAGAGCGTCCTGAGAAATGCTTGTTGGTCCCTTGTCTTTGCTGA
GCTTCACTTTGCTGAGAGAGGCACAGTGCAGAACTTCTCCTGGTGTCCCT
CCTGGTCTCTCCTTGGTCACTCACACAGAGGCCTGGTTGTCTCTGCTAGG
CTATGCCCCCCCTGCCCATCCATGTTTGCTATCCTGACTCCTCTGAACTG
CAACTGCTGTCGTATTCCTGATCTGTTTGCCAGTGTATCCATTCTGCCCT
TTGTTACTTGTGATCTGTACTGCTGATTTTCCAAACACCCTTTACGTTTG
TTTGCTCTTTATAACCATTTCCTCACCAGCTCCCCTTTCCCCTGTACCTC
CTTTTTACCTTTTCCTCCTGTGTCCCCATGTCATCACGCCAATCTTAATG
CTTTTTAATACCCCCCCTTTTCCACTGTCTCCTTGTCCCCCCTCCCTCCT
TCTCCTTTCATTTTCTTCTTCTTTCTCCTTCTCTCTTTCCCCCTTCTCCC
TCTTATCCACATTCCCCTTCCCCACCCCTCTCTTTTCTCCATTCCTTCCC
CCTCTTTTCTTTTATTCTCTTCCCTCTCTTCTCTTCTCTTACTCTCTTCT
CCAATTTTCCCTACTCTCTTATCTCTCCTCTTCCTCTCACCTTACTTCAT
TTCTTCTCTATCCTTCCCTTTTTTCTCCTTCTTCTCTTTTTAACTCCTTT
CTCTTT
| TCCTCTTTAAACATTGGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAGACCATGCTTTTCAAGGGATC
CCCAAAGAATCCCCCCTTAAGTGGCACCAAAGGTGTGGAGGGAAAACCTG
GGCAGGAAGTACAGTGCCCTTGGCCCCTAAGAAGCTGCCTTGATAGGGAC
AGAACACAGAACAATTAACCAGTTGATCCTAACAAGACCCTGGGGAACAA
GCCAGGCAATGAGGACAGAGGGTAAGCTGTGCTCTGCCAAGGCCTTGCAC
AGACTTTTGTAGGGACAGAAAACTGCCTCACGCGTCACACTCTGTCCAGG
AGCTTTTCCCAAGAAGAGCTGGCTTACCTCCCACCAAGCATCCCAAGGCC
AGAATCTTACCTTCCATAGGTGAGTAAAGTCGGGGGTTGGGGGGAGTAAG
GGGGCCACATCAGGCAGTGAGCCTGGAGGGTATAGCCAAGCCTACTGTGT
GACCTGGGACAAGTGGCTTTGCCTTTCTGGGTCTCACTTAAGTTGTGTCT
ATTTAAAAAAAAAAAAAAGATGCAAGAAAATGGGCAGTTCTGCCAAGTAG
TGAGTATCTGGGTCCTGCGTGTCAGGCTTGCTTCTGAAACAAGGTCGTAT
GTAGCCCTGGCTATTCTGGAGCTTGTCATCCTCCTGCTTCAGCTTTCTGA
GTGTTGGCGTGGCAGATGAGCCCACCATGCTCAGCTTGTATAGTATGGTA
TTAAGAGGTTTGGAACAAGACAGATTGTGAAGTATGGGGCCCTTGATAAT
TTCCTGAGTCCCCTTGTGTATGAATGGAAATAAAAGCCTTACCTGGAAAT
GCTGAGTGTGATGCACGGGGCCTCCACCCCCTCTTTTGTAAGGAGCTTCT
CATGGACCTTATCTATCCATCTATAATAGCAGCTTTCCCCGGACCCAGGG
CACAGGGAGCCAGTGCAAAATATTCTTACAGCCAGAAGTCGTTCCCTCTT
CCCTTGTTCAGGTCACCTTATTAAAATTAATCCTGGTACCCTGGGATTCC
CTGGAAGGGTCCAATCGTAAATGCCACTCGTATGGAGGTAACCCTGTGTT
TGGAATATCTCTTGTCGGTCTCTCCTCTATATCTAGGATGCTCTAGCTCC
GCCCCCCTTTTTAAGGTGTACTTCCCTTTCCCCAAAATCAAACGCTTTAC
GGTGGGGGTCCACTTATATATATCTGGTCCCTTCCCTCCCAAATCC
|
quality values | Open.Hide. 7 11 15 15 13 9 9 9 9 8 7 7 7 7 8 8 8 12 12 19 15 8 6 6 8 10 17 9 8 8 8 13 12 22 23 28 28 20 24 24 33 34 42 26 23 12 12 10 8 8
8 23 22 42 29 29 29 40 42 42 41 41 41 47 43 42 36 32 24 27 15 15 10 10 10 10 23 27 42 41 41 46 57 46 47 57 57 47 47 47 48 57 57 50 50 32 32 20 17 17
30 30 42 42 41 41 42 42 36 36 23 22 28 30 24 17 15 11 12 11 18 21 32 37 43 52 57 57 57 68 68 68 57 57 52 57 43 43 37 43 43 43 43 52 50 50 43 42 42 43
43 52 52 52 57 57 57 57 52 52 52 44 38 43 43 43 28 19 11 11 27 29 57 44 44 28 39 28 43 39 57 57 44 40 15 15 10 8 10 14 24 38 43 43 24 24 14 14 14 10
8 8 8 8 19 21 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 45 62 43 43 23 23 20 27 36 34 23 31 31 39 39 43 43 39 39 39 43 43
57 43 52 52 52 43 43 28 43 44 57 38 38 17 17 17 32 34 38 29 28 28 43 43 52 52 44 43 23 23 28 32 43 43 43 52 52 52 38 43 27 27 27 44 38 52 52 52 52 57
57 54 57 54 52 52 43 43 31 28 24 28 28 28 25 28 21 27 15 15 12 32 19 29 43 44 43 43 42 44 33 33 33 42 42 39 39 42 44 42 42 33 26 30 15 15 15 32 34 43
43 57 59 57 54 54 57 57 43 43 43 42 42 42 28 25 24 31 25 25 24 18 19 15 20 20 23 23 23 20 18 15 13 13 22 24 19 17 17 18 24 28 32 33 43 47 48 25 25 11
11 11 11 11 11 14 13 15 16 24 27 30 32 28 28 31 37 37 43 43 43 43 40 43 37 29 28 25 25 40 28 33 19 19 12 12 12 19 15 21 20 16 17 17 17 12 11 19 19 17
18 18 11 11 10 12 10 8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 14 15 10 11 9 11 11 16 18 18 18 18 24 21 12 11 11 15 12 17 12 16 12 12 12 11 12 16 18 24 9 9 7
7 8 8 9 9 9 12 16 22 17 16 16 32 23 23 20 15 19 13 13 12 19 24 23 24 19 15 18 13 13 17 21 21 23 23 23 23 21 14 14 15 21 24 31 29 22 19 11 11 11
11 11 11 18 12 12 12 12 12 11 11 11 12 19 10 13 13 18 11 13 15 28 28 37 39 35 39 43 43 42 41 30 17 13 9 9 9 17 18 16 16 16 21 29 31 37 37 26 26 21
15 17 24 24 15 15 17 30 30 33 33 25 16 16 12 11 11 12 12 10 10 10 12 10 10 12 13 22 25 12 12 11 17 17 21 22 14 14 12 11 15 16 12 14 21 21 22 24 24 33
34 32 32 23 28 23 33 37 37 40 32 32 19 19 10 10 9 9 9 9 10 15 11 14 12 18 11 14 8 8 8 8 8 10 11 10 13 16 13 13 20 16 16 19 16 15 16 11 9 9
8 8 8 10 15 15 12 11 8 10 12 11 11 8 8 8 11 11 11 15 9 10 8 11 8 10 14 16 28 27 22 21 21 15 15 15 19 13 11 9 9 10 10 11 17 17 17 14 13 11
9 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 9 10 12 9 10 13 11 11 8 8 6 6 8 6 9 10 9 9 9 9 9 10 11 11 13 11 10 9 9 10 12 13 12 12 12 10 10 8
8 9 8 8 8 10 10 10 11 11 11 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 13 11 12 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11
12 16 11 9 9 9 10 8 8 8 8 9 9 10 10 10 11 12 23 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 10 15 10 10 10 8 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8
8 9 8 8 8 8 8 10 15 19 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 11 10 10 9 10 10 8 10 9 8 8
6 7 11 8 10 10 8 8 8 9 9 9 18 12 12 11 13 13 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 13 13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 10 12
8 8 8 11 6 6 8 8 6 6 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 13 11 8 8 10 8 11 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 12 12 12 10 10 10 8 8 9 8 8 8
8 8 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8 10 10 8 8 8 14 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 10 19 15 15 19 12 10 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 10 6 6 8 8
8 8 8 7 7 8 8 8 8 10 10 8 9 9 8 10 7 7 8 8 10 8 8 8 10 10 10 11 8 10 8 8 6 6 8 10 6 6 8 8 8 8 10 10 7 6 8 8 8 8
8 6 6 8 8 9 10 10 10 9 9 9 9 9 10 12 10 10 6 6 6 6 6 8 10 10 9 11 11 11 10 8 8 8 12 12 8 8 6 6 11 8 10 10 8 8 11 7 6 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 8 10 10 6 6 8 8 8 10 8 9 9 9 9 9 10 8 13 8 8 8 8 10 12 10 12 18 18
9 9 10 10 10 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 15 15 8 6 6 6 6 6 7 7 7 8 10 8 6 6 6 7 10 19 10 9 13 8 8 9 8 9 12 18 14 13 9 9 10 19 22 28 20 20 20 24 28 35
35 37 37 37 35 28 23 23 32 36 36 50 50 50 46 46 41 23 23 9 9 7 7 8 8 8 8 12 8 10 10 18 16 19 20 28 30 30 33 35 53 50 50 42 42 57 50 50 53 53
53 53 59 59 50 50 47 33 33 21 21 11 11 11 11 8 8 8 12 8 8 8 10 12 12 28 28 59 59 50 53 53 50 50 50 50 47 48 48 59 57 57 57 57 57 50 48 48 48 54
54 57 54 48 48 48 48 42 43 47 50 50 41 47 47 47 48 47 50 50 53 57 57 57 57 42 42 36 38 32 36 32 27 24 8 8 8 8 8 19 21 46 48 54 57 44 42 37 35 42
42 43 43 50 50 50 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 52 52 52 57 52 54 57 57 57 57 57 52
52 52 57 57 59 52 52 52 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59 57 57 54 57 57 57 59 43 43 52 50 50 57 57 57
50 50 43 52 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 48 54 48 57 57 57 43 43 43 44 47 48 54 57 57 57 57 59 57 57 57 43 43 37 43
43 48 48 57 59 59 59 46 47 37 36 30 40 40 43 43 43 46 46 54 54 54 54 57 59 47 48 48 59 57 57 48 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 57 48 48 48 48 41 41 36
32 23 15 13 9 9 9 9 9 12 15 26 30 32 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 43 48 57 47 47 43 39 39 37 35 35 41 41 59 59 57 48 47 46 43 43 43 48 48 59 48
48 48 43 41 28 19 21 15 11 11 11 12 18 19 28 23 23 23 27 32 35 42 47 47 59 59 59 59 47 43 43 47 59 44 57 43 43 43 43 43 43 43 43 43 28 28 20 20 20 32
32 43 52 43 43 38 50 50 50 42 46 52 52 43 52 37 52 52 57 57 57 43 43 43 42 43 44 38 50 57 57 57 43 57 57 57 57 57 57 59 39 39 39 57 43 52 52 59 52 57
57 57 57 43 35 35 47 43 57 57 52 52 52 43 43 31 31 28 28 28 38 38 33 33 33 27 33 33 39 43 43 28 16 21 15 14 12 11 16 32 32 43 43 52 43 32 26 25 32 24
28 38 43 50 43 43 43 43 36 38 23 38 38 43 41 43 33 24 19 11 11 11 24 18 11 11 12 12 27 36 43 47 43 43 43 44 42 42 35 32 32 36 32 24 24 28 28 28 30 27
26 19 15 15 22 40 44 44 43 43 43 39 44 44 43 37 37 37 37 34 34 33 31 31 28 30 30 29 29 33 33 37 47 39 48 48 48 34 34 34 28 29 31 32 32 39 39 31 32 20
25 28 34 28 26 13 13 13 17 19 15 12 12 11 11 11 23 16 10 10 10 19 14 24 24 24 16 21 26 23 13 15 13 15 15 24 22 24 26 24 24 23 25 15 15 18 16 13 22 22
19 19 8 8 8 11 12 21 28 26 26 10 12 9 9 9 10 16 11 11 11 17 12 12 21 28 15 12 10 13 10 10 11 24 30 24 10 14 12 9 8 10 13 17 14 8 8 8 13 16
31 34 34 28 19 22 16 16 22 19 17 21 22 21 20 10 10 9 15 15 10 10 10 11 14 11 18 28 20 20 27 27 28 30 20 20 15 19 13 15 20 18 18 16 11 10 10 10 10 12
15 15 10 12 8 8 8 8 10 17 19 17 13 11 9 10 10 8 8 8 10 12 12 16 11 11 11 13 10 10 11 13 17 19 22 19 13 12 13 13 24 28 28 22 24 19 19 16 15 19
11 10 10 8 8 8 9 9 10 10 8 6 6 8 6 6 10 8 10 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 11 12 9 8 7 8 8 8 15 20 14 10 10 11 10 10 8 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 14 12 14 12 10 7 7 7 8 6 6 6 8 10 8 8 10 10 10 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 12 12 19 13 15 12 11
11 10 10 12 10 8 8 8 10 12 10 10 10 8 8 9 9 10 9 9 8 8 8 8 9 10 10 10 10 12 11 19 12 12 12 11 13 10 10 13 10 10 10 10 11 8 8 6 6 8
8 10 12 12 9 10 9 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 12 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 10 11 11 11 8 8 8 9 8 8 8 10 10 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 6 8 7 7 8 8 8 9 8 10 6 6 8 10 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 7 7 8 8
10 9 10 31 19 19 13 10 8 8 17 13 13 13 15 10 8 8 8 8 8 8 6 6 10 12 12 13 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8
8 10 8 8 8 10 11 11 10 8 8 7 9 11 10 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 9 9 10 13 10 10 8 8 8 12 10 8 10 10 10 10 9 9 9 |