BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124G14.T7 (MSMg01no124_g14.b1) | MSMg01-124G14.TJ (MSMg01no124_g14.g1) |
ACC | AG333773 | AG333774 |
length | 1,263 | 1,245 |
length of high quality (start - end) | 413 (42 - 454) | 679 (78 - 756) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_g14.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_g14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_g14.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_g14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:35:29 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGAGCAGTGGGCGCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CCTGATTTGATTTAAGTAATCTTAGGAAGGAAGCTTTAAGAGATGGTTTT
AATTGTTTTGCTAGAAATATATAATAAAAGTATAACCATACATAGAATTG
CACCCTCCTCATAAATAGTAAGTAAAAGCTGCATAATAAGAAATACAATA
AGCTTTCATAAATTACACTAAAAGGAGATATAGGCTTGGGACAAATTTGT
GTTCAAGGAAAATCATTAAGGCCAAGGATGAGGCCACAGGTATGCACTAT
GATAAGGCAAGGCCATGTAAAAATTGTTGCTTTGAACAGAACAAAAGACT
GCTTTCAACCTGTTAGTGATATCTTTCTGTTACTCTCCTTTAATGTAACA
CTCTATCTATGAGGTAATTTCTTTTTTACATAGAGGACTTTTTGTCCAAA
AAATTTTTTTCCCCCCCAGCAATAAAAGGGGGGGCATTCACAGAATCATT
CAGTGTGTGTGTTGTCTATGTGAGTGACTTCTTTCCTTTCCTTTCTTTTC
TCTTTGGTTCAAAAAGAGTTGACAAGCTCCATGCCTCTTACCTGGCCAGT
GAGCGACTTCTGGCTAATTCGACAAAGACAGGAGCAATAGCAATAAAATC
CTTTTCATAATTCCCCAGCACGTATTTAAGTGCAAAGAGTTTAAGTTTCC
CCAGTGCTTATTCAAGCACAGAGAGTTCAAGAGAAAAGAATCTGGTGGTT
TTCAGCAACAGACTAAAGCAAGAACATGTTAAGTTTCCAGAAGCTACTAG
CTTCTAGCCCTCGGTCAGAGAGAGTTACAAGGCTGGAGGTGTCAGTCCTT
TTGGCTTCCATCCAACTTTGTATCCCACCTCAGCTTTCAACCCTAAAAGG
CCGGGGCCGCCCTCGGGCATTTTTACTCTCCTTCCTACCCCACCAACTTT
CTCATGAGCCCCCTCACACTTTCCTCCCATAATCAAGGCCTTTTCTTCCT
TTAACTTTAATGGTTACGCCCCTACTTGGGCATATTTTTCGTTTATAGAC
CAACCTCTAATCTCCGCCTTATTACTGGGAGTTCCTAACTAAAGCTTGGC
ATTCCCTTTTGGAATTTCCCCCTTTAATTAAGAATTGTCTAATTATATTC
GATAAGTTTCCTGCTTTTATTTCTAACACGTCTACATCTAACCTCTTTTC
CAACTTACCTCTTTCGTAGAGCTTTTTCTACTCTCTAACTTTTTCATATT
AACACCCGTTTTG
| TTTTTTATCAAGTGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXCCCTTTAAGTTCATCTAGTTGTAACTGAAACT
TTCCTAGTTTCTTTTTATTGTTGTTAGTGATTTAATACAATTGCTTTTTA
AAATCTATCTAAGTTGCTTATTTCATTTATTTATCTATTTATCTATTTTA
GTATATCTACATATTCAGAAATTTATTTCTTTTTAGATTTCCCTGTTTGG
TGAAAAACATCTCTTTACCGTATAGTCTAATATTTTTTTCTGAATTGAAT
TGGGATCTCATGTTGTTAATCTGGTGTGTGTGTATGTGTTTGTGTGCATG
CATATCTGCCTGCATGCATGCATGTGTGTGTGTGCATATGTGCATGCTAA
TACTTCATCAACAATGCTCATCTCTCAAACAACCTACTTTTGGTTCATTG
ATTATTTATAATTTTTACTTCTATTTTATTAATTAATTCTGATCTTAATT
ATATCTTTTCATCTACTGCTTCTGTGTTTGACTTGTTCTTGTCTTTTCAT
GGCACTAAGATATATTTTTAAGTTACTTATCTTAGATCTCTCTGACATAT
TAGTACAGGCATTTGTGGCTATCAATTTACCTTTTTTATTATCTCACATA
TATTTGCATAAGGAATGTTTTTATTTTCACCAGATTCTTAGAGAATTTCT
TCTTTATTTATTTATTCAGTGAATTGCCAATCATTAAATAATGTGTCTAC
CCCATAGTTTCTCATGTAACTGGTTTTCTAGCTTTGACCCACTATCACCA
AGGATAAAGGAAGAAGTTACCTTATTTTTCCTATATTTTCAAAATCTTTC
CTGCAGTTTTATTATTGATTTTAGAGAACAGTTTCTGGGTCCACTGAAAA
TATGTCCATTCTGTATTGTTTGAATAGAATATATTGTAAAAGTCTGTTAG
GTTTATTAAATCAATGTCCTTCAACTTATAAATTTCCAAAAATTTTGTTT
GCATACTCTGTTTATACATAGATTGGATAGCTTGGCTTTTCCTCCTAAGT
ATGCTTTCCTTCCTACTCCTGTGAACTCGTCTAGCTCAACATTGTGGTTT
TATTAATTGGGTTTTACCCTTGGTTCTTGGCTACCTTTTTTTGCTATTAT
CACCCCCTTTTGTGGATCTTGTTTTCCACTTAGATACAATCCCTTCTCTT
CTCTTCAACCTCTCTTTATTTCTTAAATAAATTTTCTCATCCTTA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 9 9 12 10 16 17 19 10 10 10 8 8 12 15 17 10 8 8 11 12 18 28 29 35 36 33 33 33 36 33 33 33 33 37 37 39 39 30 28 28 32 37
37 39 42 42 42 48 50 50 50 57 50 50 50 36 37 29 29 22 28 33 40 42 42 43 48 50 57 57 68 68 59 57 57 57 50 50 53 53 50 50 43 48 46 43 43 43 44 48 57 57
57 57 57 57 57 44 36 28 28 23 18 20 27 27 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 50 50 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 52 52 52 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 45 45 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68
68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 52 43 43 39 34 33 27 27 28 44 44 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 54 54 54 54 57 57 57 57 54 57 57
57 59 59 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 59 59 57 50 50 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 28 29 12 14
14 21 30 30 44 42 48 48 57 44 48 47 48 48 57 57 59 59 59 54 54 57 59 59 57 57 57 48 48 47 43 43 43 43 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 47 47 32 22
15 12 12 15 21 21 11 11 10 8 8 8 8 11 9 9 9 10 14 13 28 28 41 41 43 59 59 59 43 43 40 40 40 39 34 32 23 24 12 11 11 11 10 10 10 11 19 19 22 26
21 25 32 37 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 27 27 12 12 12 23 23 47 59 57 54 54 54 54 54 68 59 59 57 44 43 28 28 28 43 43 68 68 59 59 59 54 54 59 59 54
54 54 59 59 57 46 43 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 44 43 43 37 43 43 43 35 43 43 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 52 43 38 32 20 20 38 38 50 52
52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 52 52 57 57 57 57 44 43 32 32 43 43 52 57 32 32 13 13 13 38 38 37 38 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57 50 50 50
50 50 50 57 57 47 47 47 57 57 57 43 44 43 43 43 43 37 37 37 32 32 18 18 22 41 32 44 43 43 44 43 43 43 44 43 43 39 42 42 47 47 42 42 39 43 39 42 39 39
39 37 37 39 39 35 33 33 32 32 33 37 32 30 30 28 28 28 28 28 28 28 30 20 25 19 19 14 14 27 24 30 30 30 28 28 25 25 20 32 28 32 31 34 28 20 15 13 8 8
8 13 10 12 16 12 8 8 10 11 17 10 12 12 21 24 33 31 31 30 31 22 12 9 9 10 17 15 10 10 10 14 16 25 28 28 30 23 28 23 11 10 10 11 13 21 23 19 10 10
10 10 19 21 26 19 17 15 15 20 22 23 21 21 12 10 8 8 8 13 10 15 15 22 19 19 24 21 20 13 15 16 16 14 15 19 11 11 11 11 13 15 18 16 11 11 12 13 10 10
12 23 11 10 10 8 7 7 7 7 8 12 11 14 11 12 12 12 15 9 9 8 8 8 8 10 10 20 28 23 31 20 14 11 13 8 10 12 16 14 10 13 10 10 9 15 11 12 9 9
9 9 11 13 15 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 13 15 17 17 17 28 15 13 10 10 10 8 8 9 9 13 10 8 8 10 10 20 20 26 20 22 18 12 10 10 12 9 9 12
14 14 18 17 12 11 11 12 20 22 15 15 8 8 8 8 9 10 9 9 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 12 10 10 10 11 12 10 11 11 13 21 21
19 15 13 16 16 11 13 10 10 11 21 21 11 14 9 8 8 6 6 7 9 8 8 8 8 10 10 9 11 8 8 9 9 9 9 13 8 8 6 6 8 8 10 10 10 13 12 12 15 13
12 10 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 17 15 14 18 16 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 9 11 11 10 10 10 12 10 11 14 16 9 8 10 8 8 8 14 8 9 12
12 8 8 8 10 10 9 9 10 10 10 10 10 13 9 9 9 9 9 9 14 15 15 13 9 8 6 6 8 8 6 6 10 11 11 8 8 8 8 11 11 11 9 8 8 8 8 8 9 9
8 8 8 7 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 13 8 8 8 8 10 12 12 12 9 6 8 8 12 8 8 6 6 8 10 14 10 10 8 8 10 12 8 8 8 12 10 12 12 9 9
8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 7 10 10 8 8 6 6 6 8 13 10 10 10 8 10 10 9 10 10 9 9 9 9 10 11 12
11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 | Open.Hide. 7 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 8 9 10 19 11 8 8 8 8 11 12 21 19 19 10 10 10 21 21 33 30 30 35 35 36 36 36 37 37
37 47 47 42 42 47 48 53 53 50 50 50 50 42 39 21 12 8 6 6 6 7 9 6 10 15 13 19 24 32 33 33 33 35 35 35 35 34 28 34 43 43 43 53 53 47 47 48 48 48
50 44 33 33 31 21 21 10 9 9 9 10 10 11 11 16 16 21 21 24 32 37 31 32 30 36 35 29 32 37 37 39 43 43 53 53 53 53 50 57 57 50 54 54 54 68 42 51 51 51
47 47 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 53 57 57 57 51 50 50 50 68 68 51 51 51 51 51 68 68 57 57 57 41 44 39 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59
57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 68 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 31 31 35 44 44 62 62 62
62 62 62 44 44 39 39 43 62 47 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 39 39 29 17 17
17 17 29 27 39 39 45 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 39 29 41 39 62 62 62 62 62 52
43 43 43 43 43 43 43 29 23 17 17 17 23 29 35 43 43 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 43 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62
62 62 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 68 68 68 68 68 44 43 33 33 33 43 43 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52
62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 43 43 22 22 18 33 33 31 31 43 44 59 52 57 57 57 59 59 52 52 52 59 44
59 43 24 24 27 24 35 43 39 39 39 57 28 28 11 11 11 15 15 13 21 12 10 10 23 28 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 59 59 57 52 52 52 52 52 52
57 57 57 57 57 57 52 57 43 43 22 22 14 27 21 32 46 46 50 50 57 57 57 57 50 43 42 37 37 42 42 32 35 14 19 10 10 10 23 24 42 33 37 32 42 37 37 44 57 44
48 48 48 48 48 57 57 59 48 48 48 48 48 48 43 39 31 36 31 30 30 40 40 43 43 35 35 28 31 23 28 23 40 40 43 28 28 28 37 29 28 28 33 33 37 35 32 37 37 37
37 17 13 8 8 8 8 8 10 21 15 18 20 22 22 30 30 39 32 32 28 22 22 24 18 24 29 29 29 28 35 35 28 26 15 20 20 13 11 13 15 17 18 28 33 30 24 24 25 25
24 11 9 10 10 10 15 30 39 30 29 17 12 14 12 12 14 20 18 15 18 13 19 13 20 12 19 17 14 10 12 20 20 23 24 30 16 14 16 8 8 8 13 15 20 20 20 37 36 36
18 23 9 10 11 13 10 12 10 16 19 22 12 12 9 9 11 11 9 9 9 17 10 10 10 8 8 8 13 8 8 9 8 8 8 8 6 7 7 6 8 8 8 8 10 11 8 13 10 9
10 10 11 14 9 10 10 13 13 24 26 30 23 20 12 9 9 9 9 11 22 9 11 10 17 10 10 10 15 8 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 11 10 10 10 10 11 11 15
12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 11 8 8 8 8 10 10 8 10 8 12 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 17 18 20 14 9 9 8 11
8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 10 12 11 11 11 11 15 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 12 15 12 12 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9
12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 11 10 10 10 10 9 9 13 10 12 10 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 12 10 10 10 10 10 10 9 11 10 10 10 10 6 7
7 7 6 8 8 9 10 10 12 9 9 9 7 6 6 6 8 8 8 10 10 11 11 10 13 12 10 8 8 8 8 8 8 8 9 13 10 14 14 15 10 8 8 8 8 8 10 6 8 9
9 11 11 27 27 33 22 22 7 7 6 6 6 8 9 6 6 8 8 6 6 6 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 11 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8
10 8 6 6 10 6 6 8 8 9 9 10 8 8 8 15 8 9 9 14 10 10 10 10 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 |