BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-173B11.T7 (MSMg01no173_b11.b1) | MSMg01-173B11.TJ (MSMg01no173_b11.g1) |
ACC | AG368804 | AG368805 |
length | 729 | 729 |
length of high quality (start - end) | 320 (46 - 365) | 569 (77 - 645) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_b11.b1 PHD_FILE: MSMg01no173_b11.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:42 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no173_b11.g1 PHD_FILE: MSMg01no173_b11.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:43:42 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CAATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTCACCTGAGGAATACCGAATGGCAGAGAAGCACCTGAAAAAATGC
TCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATT
CCACCTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGCA
GATGCTGGCGTGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATTGTTGGTGG
GATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTGGAGATCAGTCTGGCGGTTCCTCAG
AAAACTGGATATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCA
TATATCCAGAAGATGTTTTTTTCTGCCCCCCCCCCCACATGCTCCACTAT
GTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAGGAACCCAGAT
GCCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAGATGTGGTACATCTACACAATG
GAGTACTACTCAGCTATTAAAAAGAATGAATTTATGAAATTCCTGGCCAA
ATGGATGGACCTGGAGGGCATCATCCTGAGTGAGGCAACACATTCACCAA
GGAACTCACACCATATGTACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCCAAACC
TAAGATACCGAAGATATAAGACACCATTTCCCTAAACACATGAACACTCC
AGAAAAATCGAATAATGAACTTGCGACCT
| CGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAGCCATTTCTGAAATGGCCCTA
AACATGTGAAATCATGTTTTCACCATTTATATTTATAAAATAAGAATATG
GAAATACTTTAAAAATCATTGGCAGTTTGAAGCCAAAATGAATGCTTTTC
GTAGAAGCAAATGTACACGTTTCTTAGCTTAGATTTCCTTAAACTCTACT
TTTAAAAATGTTTTTTTTTTTAATGCTTTAACCTCCCTTCTAGTCCACTA
CCCACCAGAGGTAGTGGACAAGAAAGGTTATAGGATACGGGGGAAGTGGA
CCTGTTTAGAATTGTATTTTTTGCAGTAAATTTCATCTGTGTTGTCAGGA
AATAAGCAGTTCTGTTCACAAAATCAGCAGTTTAGCTCATAGGATTCAGC
AGCAGCAGCTTGATCCACTTGCAACCACTTCACGAATATACCAGCAGTCC
AGTTCAGTGGTGTCAGGATAGTAAACACGAATCAGTGGCATGACCTAACA
GAGGCAGCCAGGCCTCAGCCTAATGGCAGGAGTCATCAGGAGCAACTATG
CCCAGCAGGTGTGCTAGGAGAAGCTCTCTGCTGTGCCTCCCTCCAAGAAA
TGAAGATTAAGGAAGACAAAGAAGCAAAGAAGTGTGGCTAAGCTAGCTAT
GTAAACAAGCCTCTCTCACAGTCCATTGC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 10 13 25 34 32 37 37 37 32 31 39 39 30 30 33 33 33 33 48 46 31 24 24 24 24 35 43 53 53 48 48 48 48 57 57 37 37 33 32 32 29 32 32 34 29
47 47 42 50 48 57 54 57 57 47 48 48 48 48 40 46 46 46 50 48 57 57 57 46 42 42 44 44 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 51 50 68 68 68 68 57 48 50 50 50 50
50 50 51 51 51 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 50 50 57 50 50 50 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 52 57 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 57 57 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 59 59 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 57
57 52 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 54 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59 59 59 57 57 59 57 57 59 57 57 57 57 54
54 57 48 57 48 48 47 47 57 57 68 57 59 68 59 59 59 59 59 59 39 36 28 23 20 20 20 28 37 34 43 46 44 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 53 53 50 48 37 28 19 11 8 10 8 9 9 9 11 8 8 11 10 10 10 14 14 14 15 12 12 12 17 12 16 11 12 12 27 27 47 59 50 50 50 50 50 50 57 57
59 59 59 59 57 57 57 57 43 43 43 59 59 59 59 57 44 39 31 28 25 25 22 25 25 32 32 32 24 21 21 11 11 11 15 12 15 26 31 30 25 25 25 20 22 24 37 37 34 34
37 37 37 37 39 39 39 39 47 48 59 48 48 48 39 39 31 31 22 22 23 30 30 25 25 25 32 25 25 34 30 26 16 16 15 27 27 34 28 32 37 24 24 12 12 12 25 21 24 17
17 25 24 23 28 34 37 37 28 27 12 11 11 16 23 32 32 29 21 21 21 21 24 24 18 19 20 28 25 27 32 37 37 37 37 37 31 31 31 30 32 37 34 19 11 9 9 9 9 9
19 28 25 31 35 39 29 29 30 32 30 27 18 18 12 13 8 8 8 10 12 10 18 17 30 30 33 33 28 28 28 30 15 15 10 10 9 9 15 15 10 12 11 18 13 13 11 14 15 18
10 11 8 9 10 10 10 15 15 16 12 10 10 10 11 20 12 12 18 10 10 10 10 10 10 11 14 17 18 19 17 14 17 15 17 18 20 15 14 10 10 10 8 11 10 10 8 12 6 6
8 9 9 9 9 9 9 10 10 11 11 13 11 11 15 15 13 22 11 11 8 8 8 8 8 8 17 18 15 16 11 10 12 11 10 24 23 21 12 11 10 10 10 13 10 9 9 12 10 8
8 8 8 14 23 15 10 7 6 8 6 9 8 8 8 10 8 14 12 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 | Open.Hide. 8 8 8 13 15 9 11 9 13 7 9 9 9 15 19 40 41 47 42 41 48 48 53 48 48 40 40 41 37 30 23 11 10 10 11 11 11 12 15 15 28 28 28 29 39 48 48 57 44 36
36 36 33 33 33 37 37 34 25 13 15 12 10 10 11 11 17 23 30 34 33 33 33 33 33 36 59 59 59 47 42 47 47 47 47 59 57 57 57 48 53 57 57 57 57 47 43 47 47 59
43 43 43 50 50 36 59 59 53 53 53 41 37 37 37 37 47 47 18 18 9 9 9 9 10 15 26 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 50 50 47 47 47 50
50 42 47 42 42 42 47 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 54 54 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68
68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 57 62 62 62 62
62 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 44 38 29 18 12 12 12 13 14 20 30 43 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 43 43 43 35 35 33 43 62
62 62 62 62 62 62 44 43 27 21 43 43 43 39 39 43 39 39 27 27 15 14 11 11 11 11 12 14 39 39 62 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 62 62
62 62 62 62 52 52 52 62 52 52 62 62 44 62 39 39 43 43 52 52 52 62 52 43 43 35 35 35 43 43 45 44 43 35 35 39 43 43 52 52 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62
62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 62 62 62 57 59 52 52 52 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 43 43 39 43 43 45 57 57 57 57 43 39 33 35 33 39 27 27 27 43
43 45 45 57 44 52 43 43 43 27 22 22 43 43 52 52 43 43 43 37 35 43 43 43 43 35 35 35 32 32 32 32 43 43 28 28 29 33 29 29 32 43 38 50 26 26 14 15 15 27
27 32 36 33 33 35 35 42 42 43 43 43 42 42 36 32 23 28 25 29 25 28 28 44 40 48 48 44 44 39 39 30 30 30 36 36 25 23 23 36 36 36 28 30 30 37 37 43 43 48
46 48 42 43 37 37 30 28 25 22 17 17 28 30 43 43 39 39 28 24 14 21 21 31 34 23 23 23 34 32 39 39 41 41 34 30 24 31 31 37 37 26 22 17 24 16 22 15 19 17
18 16 18 11 13 11 14 14 12 14 14 14 28 24 21 21 14 15 15 21 13 15 11 11 11 11 11 13 21 9 8 8 8 10 11 10 10 9 12 9 9 10 10 10 19 13 13 10 10 10
10 10 11 8 8 8 8 10 21 23 28 34 24 24 13 13 12 19 10 12 12 12 13 14 10 10 12 12 10 |