Query= MSMg01no177_f20.b1 MSMg01no177_f20.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no177_f20.b1 PHD_FILE: MSMg01no177_f20.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 19:49:55 2005
(335 letters)
>mm_chr8_101460329_101461063
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Identities = 321/334 (96%), Gaps = 8/334 (2%)
Strand = Plus / Plus
Query: 5 gaattcatcatagcttttgaacatttatatccatcacaagatgccagaagatattaaagc 64
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Sbjct: 205 gaattcatcaaagcttttgaacatttatatccatcacaagatgccagaagatattaaagc 264
Query: 65 gttttttgattgcacaattatatcaccatgaagggcactatctcaagaggggaaagagaa 124
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Sbjct: 265 gttttttgattgcacaattatatcaccatgaagggcactatctcaagaggggaaagagaa 324
Query: 125 gaaatgaaatcttaggacttggtaatataagaattaaaggttcaataaaacaaacaaaca 184
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Sbjct: 325 gaaatgaaatcttaggacttggtaatataagaattaaaggttcaataaaacaaacaaaca 384
Query: 185 tgaactctttaagattcagaagatccttgttgtagatatatgtacacttgtagaaggata 244
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Sbjct: 385 tgaactctttaagattcagaagatccttgttgtagatatatgtacacttgtagaaggata 444
Query: 245 cacacacacacacacacacacacatatattt-----acatatatatatatatatatatat 299
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Sbjct: 445 cacacacacacacacacacacacacaca---cacacacacacatatatatatatatatat 501
Query: 300 atatatatatatatatatatatatatatataaag 333
||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 502 atatatatatatatatatatatatatatataaag 535
Score = 95.5 bits (49), Expect = 4e-24
Identities = 49/49 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 281 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 329
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 484
Score = 95.5 bits (49), Expect = 4e-24
Identities = 49/49 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 279 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 327
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 484
Score = 93.5 bits (48), Expect = 2e-23
Identities = 48/48 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 278 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 325
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 484
Score = 93.5 bits (48), Expect = 2e-23
Identities = 48/48 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 283 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 485
Score = 91.6 bits (47), Expect = 6e-23
Identities = 50/51 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 273 tttacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 323
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 534 tttatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 484
Score = 80.0 bits (41), Expect = 2e-19
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Strand = Plus / Minus
Query: 269 tatatttacatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 317
||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 532 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 484
Score = 78.1 bits (40), Expect = 7e-19
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Strand = Plus / Minus
Query: 268 atatatttacatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 315
|||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 114
Number of extensions: 48
Number of successful extensions: 48
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 29
Number of HSP's successfully gapped: 12
Length of query: 335
Length of database: 735
Length adjustment: 9
Effective length of query: 326
Effective length of database: 726
Effective search space: 236676
Effective search space used: 236676
X1: 8 (15.9 bits)
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X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
| Query= MSMg01no177_f20.g1 MSMg01no177_f20.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no177_f20.g1 PHD_FILE: MSMg01no177_f20.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 19:49:55 2005
(282 letters)
>mm_chr8_101574940_101575621
Length = 682
Score = 514 bits (266), Expect = e-150
Identities = 278/282 (98%)
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Query: 1 tttatttctggaagtacattagcactgcaataccacaaccatgttgcacaaaaatatata 60
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Sbjct: 332 tttatttctggaagtacattagcactgcaataccagaaccatgttgcacaaaaatatata 273
Query: 61 ataattcataaatttgtaaggaaagaattaaacatatctataagaaaaatcatagtttaa 120
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Sbjct: 272 ataattcataaatttgtaaggaaagaattaaacatatctataagaaaaatcatagtttaa 213
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Query: 181 ctaggctggcctcaaatttatagacaactaccagcctatgcgcccagtggtcagattaaa 240
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Sbjct: 152 ctaggctggcctcaaatttatagacatctaccagcctatgcgcccagtggtcagattaaa 93
Query: 241 ggtatgtattgtcatatacatatttgtcagtgatttcaaaga 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 92 ggtatgtattgtcatatacatatttgtcagtgatttcaaaga 51
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 12
Number of extensions: 1
Number of successful extensions: 1
Number of sequences better than 10.0: 1
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Number of HSP's successfully gapped: 1
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Effective search space used: 183729
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|
