BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-178E04.T7 (MSMg01no178_e04.b1) | MSMg01-178E04.TJ (MSMg01no178_e04.g1) |
ACC | AG372400 | AG372401 |
length | 713 | 770 |
length of high quality (start - end) | 373 (45 - 417) | 267 (77 - 343) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no178_e04.b1 PHD_FILE: MSMg01no178_e04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:51:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no178_e04.g1 PHD_FILE: MSMg01no178_e04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:51:01 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCGCTGAATCTCTTCTGATTAATTATTCACCAGCACTCAGAACTTTTC
ATGACACTTTGTAGACTCCATGAAGCTCTAATGTATTCTATGCATGGTAT
AGAAATTAGGAAATCCATACTTTTTCACAGGAAAAAAATAAAATTACATC
TTCCTTTTGATTCCTTCAGTGACCTGGTAAGTGACAAATCACAGAAGTCA
CAGCATAACAGTGATTGACATTGCTTTCATTCTCAGCTCTCTCTAATCAG
TCACCACGCTTAGCACACAGACCTCTTTCTAAATCTCATGACTTGGCGCA
TTCACCACGAAGCACGCATACCATGATCTCCAAAAAGATGTATGCTCTCT
TAATGATTTTCAAGGCCACTAAAAAGATGGTCTGCTTTTCTTTGAAATGC
TAAACCATTTATTTTACACATTTAGGCATATGTTGGGAGGAAGGTAGTAA
AACTGTACATTTTAGGATTTCATGACAGGACACCATATTAAGAGCCTCTG
ACCTGGTGTTTTTTATATTGACTCGCCTGCCCGCCGAATACGTTTGATTT
CTGTCACTATCTCTCCTGGATCCACTCATGTTTCCCATCCAGTTGCAATG
GATTTTAGTCACTTGCCGTACCTTCGAAGTTAATGCATTTTTATAGGTAT
TATTTTCCCCGTG
| ACGATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAGACTTATAGAAACCTCAAGGGC
TTCTGCCTTTATCAAAAGTTTTTCCTTTTAAAATTTATGTGTATGGGTGT
TTCCCCCCCATGTAAGTCTGTAGAACAAAGTCCAGAAGAGGGTCTCAGAT
CCCCGATAACTGGCGTTACAGATGGTTTTGTGGTGCCATGTAGGTTCTGG
GAATCAAAGCCAGGCCCTCTGGAAGAGCGGCCAGATCTGTTAACCACCAA
GCCACCTCTCCAGCCCCAGCATCTAGTCTCTGTAGGTAAAACAAAAATCA
ATAAGAGGTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCCTAGGTTATCTATT
GTTATTTTTTATTGATTTTTTCCCCCCCATTAAGATAAAAAAGCACTCTT
CTGTTGTGGAATTTAATGCCTACACCTGACGTTTGTTCCATTTCCCCGCT
TGTCCCTTCTCATCTCTCCTCTGTTTGATTCCTATCTTAATTTATTTATT
GATCACTTTTTTTTTTCAATATTATATCTTTACGCCCATTATTATTCCCT
CCCCTTACAATTTTACGTTCTCACGCCCCTAATAATCCATTTCACGCTCT
TTTCCTTTTTACTTCCTTCCCCACCACTCCTCCCAATTTTTACGAAATTA
TCTATATTATTCTACCTCCCCCTTTTCTTATTATCTTTTCAAATCTCTTT
TAATTAACCTCACTTATACC
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 14 16 35 39 34 23 22 19 17 17 30 25 23 10 10 10 21 21 41 28 28 30 27 19 17 7 7 6 6 6 6 16 20 13 11 11 11 19 19 29 32 37 48 35 30
28 28 31 28 47 39 30 23 14 10 10 11 11 11 11 11 16 22 29 37 37 39 41 41 47 53 53 36 36 36 36 42 37 50 50 53 53 53 57 57 57 57 48 57 57 57 57 50 50 50
47 47 47 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 41 41 37 47 44 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
50 54 50 50 50 50 50 50 50 48 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 52 62 62 52 43 43 35 43 43 57 57 57 57 43
43 43 42 42 43 57 43 52 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 59 59 59 57 57 57 54 54 57 52 52 52
59 52 43 43 38 33 33 43 43 59 59 52 43 43 38 38 24 24 14 14 14 18 18 43 44 57 59 59 59 43 41 33 33 43 42 42 43 43 44 44 57 57 59 47 41 35 42 42 35 35
42 44 44 48 32 32 20 20 15 19 13 13 13 13 24 24 39 39 43 43 43 43 43 43 43 37 37 43 37 48 48 54 54 43 40 29 35 28 40 37 48 48 59 48 48 48 59 59 50 48
36 36 25 25 25 34 34 48 40 34 31 22 21 10 10 8 8 8 8 10 11 24 24 23 14 14 12 23 23 36 33 32 28 15 14 14 24 28 39 40 43 43 39 37 35 39 39 36 25 25
27 24 25 35 37 37 37 32 32 32 37 37 37 35 32 28 32 32 36 36 24 23 12 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 10 8 19 15 15 15 15 18 19 17 15 9 9 9 9 9 11
10 13 8 8 8 10 15 10 13 9 8 10 8 10 8 8 6 6 8 8 11 12 15 12 12 11 15 8 8 6 6 8 8 9 10 10 9 10 10 14 11 9 9 9 8 8 8 9 17 17
26 21 15 11 9 9 8 8 8 8 10 8 8 9 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 11 10 10 8 8 8 8 13 15 15 11 10 10 8 8 8 8 15 19 19
23 19 8 8 6 6 8 8 12 8 11 8 8 8 8 10 10 13 12 11 11 9 9 9 9 10 9 8 12 7 6 6 8 12 8 8 6 6 6 7 7 8 8 8 8 10 8 8 9 9
10 10 9 8 8 8 8 8 8 6 6 7 13 10 8 8 7 6 6 7 8 8 9 11 11 11 15 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 11 11 16 10 9 9 10 8 8 7 8 6 6
8 8 15 11 13 9 8 6 6 8 8 8 6 | Open.Hide. 6 6 6 6 8 8 6 6 8 15 17 29 32 36 37 41 41 47 42 48 50 50 48 48 37 37 37 37 37 37 25 23 10 10 10 16 18 25 20 24 25 25 29 30 53 50 57 53 36 36
36 37 37 42 47 48 48 48 43 43 42 29 32 36 36 36 40 42 54 57 42 47 47 50 50 51 57 57 54 54 54 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 57 57 59 57 57 68 50 50 50 50 50 50 57 57 57 50 50 43 44 47 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57
57 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 45 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 43 38 32 20 20 38 38 50 57 50 50 35
35 35 44 44 38 33 33 29 29 29 43 43 44 33 33 33 43 43 57 50 43 35 35 31 35 27 28 24 13 13 13 15 24 28 35 42 42 48 46 57 43 43 43 44 46 57 57 43 43 39
37 37 35 37 37 42 44 57 57 40 28 21 14 14 15 28 32 31 28 15 13 8 8 8 8 15 22 43 43 34 32 20 20 21 28 31 32 33 35 32 32 21 16 15 11 12 14 19 19 16
19 19 19 19 12 13 12 12 12 9 9 12 11 14 13 14 10 9 12 10 12 12 9 22 15 17 17 21 19 18 11 11 11 14 12 9 8 10 8 8 8 8 8 8 9 12 16 15 14 8
8 8 8 8 9 19 11 7 6 6 6 6 7 11 14 13 15 10 12 15 9 10 10 15 15 15 14 10 9 9 9 10 11 11 9 11 10 22 15 19 11 11 10 11 8 13 8 8 8 10
16 8 8 8 10 10 12 13 11 10 10 9 10 10 8 8 8 6 6 10 8 8 8 10 8 8 6 8 8 8 8 8 13 12 11 10 15 15 10 10 10 16 19 15 13 8 6 6 8 12
15 13 12 10 8 8 8 8 11 10 10 10 9 9 11 9 9 8 6 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 7 9 13 10 9 12 12 9 9 9 9
8 8 9 8 8 10 10 13 9 11 13 17 28 22 14 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 8 8 8 10 10 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 10 12 10 19 18
19 10 8 8 8 6 6 8 8 10 11 17 10 8 6 6 6 6 8 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 10
8 8 10 9 9 10 10 13 13 10 10 10 9 10 12 12 14 14 12 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 20 15 13 10 9 8 7 7 8 10 8
10 8 8 6 7 10 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 10 19 11 11 12 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 13 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 22
8 8 6 6 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 |