BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-182N05.T7 (MSMg01no182_n05.b1) | MSMg01-182N05.TJ (MSMg01no182_n05.g1) |
ACC | AG375599 | AG375600 |
length | 802 | 714 |
length of high quality (start - end) | 356 (106 - 461) | 280 (71 - 350) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_n05.b1 PHD_FILE: MSMg01no182_n05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:56:41 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no182_n05.g1 PHD_FILE: MSMg01no182_n05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:56:41 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCCTTCTCCCTCACACTTTGTTTTCTTCCCTCCCNNNNNNNNNTTTATTA
NAANAAATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCACAGGCATGCTACCTAGTTTTCCTTTCTTTCTTTTT
TTTTTTTTTTTTTTTTTGACATGAACTGCAGTGGTCCTAAGGCCAGTGTT
TTGTGGCATGGGAAAGGGAGTGGCTGAGAATAAACAGTCCAGATTGAGGG
CATTGCTGCTCGACCGGAGTCGCTTAGTTAACGTTTATTTATCACATCGG
TATTTATGAAACTTGAACTGTCAGAGAATACATACAAATATGCCTCCAGG
AGGTATTCCTATCTGCAAGACCTGAAATTTTATGTGAGCCCCAGTAGGCT
GCTCCGCTTGAATAGACAGACAGTGCCATCCCTGGGTGGGCCTGGGAATT
AGTATTGCTGTCTGTACTCATCCCCCCCCAAATGAACAGTGTGGTCCTTC
CGCCTCTCCTCTTCCTCCCCACTGCACTTCCAGAGGCCGGTAGTTCACAG
ATGATATAAGGTTTTATACGCCTTGGAACTGGAGACTCCCTTTTAATGTT
GTATTTTGGTAGGTGGTTGTCTATTAATCCTCTCCTCTCTCGCTTGTCCC
CCTCTATCCGAGATTTTTTTCTTTCGGTAATACTTCTTCGCTCACCAACA
TGGAAATTGATTATCCGGGAATGAATTGTTAAAAATCATCCTTTATCCCC
CTTACTCTTTTTTCCGCCCCTCCCCCTTTCCTTTCTCCCCTTTTTTTTTC
TA
| ATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGGCTCAATTCATCAGACCTGGGCAAGCT
TAAATATCTTACTGGTTTATGGCATTATATTTTTAGTTTCCTTCCTTCCT
CCCTCCGTCCCTCCGTCCCTCCGTCCCTCCGTCCCTCCGTCCCTCCGTCC
CTCCGTCCCTCCCTCCCTCCCTCCCTTCCTTCCTTCCCTCCCTCCCTTCC
TTTAAGCTTTCAATATCCTTACATTTTTGTTCTCTTTAACCTTTGGGTTC
TTCTCTTAAGAAGGTTGCCATAATTGGCTTCATTTCTAATGTTGTTGTTA
TATTTATTTATCTGCCCTGCGGCTGCACCGCCCTTTTCAACCTAATGGGG
CTCCCGACGCCCCCCGATTTCTATTCTGAATTTCTAGAATCTGTATCTCC
ACACATCTCTGCAGCATCTATCAGTGGTGCATCTTCACTCATAAAAGACT
TCCTTAGTTGGTTCTCTATTCTCATATGACCACTTGGATTTCTGAACCTT
GTTTCCAGCCTATCGTTTTCTTCTTTTGTAATGTATAATTTTTTCTTGCC
CTTCCCCCCCTACCCAACTTTTTCATTTCCCTTTTTCAACCCTTTTTGTC
AGCTTCTTTCTTCTTTATCGTTTTGACATTTCCACTTTTTCCTTCCATCT
TACCCAGTCCCCTG
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 9 7 7 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 10 11 11 11 10 10 19 13 6 6 7 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 9 10 9 10 9 3
0 3 3 0 3 9 9 9 15 19 9 8 8 8 10 11 22 26 37 37 28 22 22 24 27 27 23 22 32 22 23 30 30 28 26 33 30 30 21 21 8 8 8 8 8 11 10 20 20 19
19 12 14 14 21 23 24 21 35 35 28 37 34 34 42 42 33 42 19 23 13 15 24 31 33 35 47 40 43 43 43 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 54 46 46 50 57 57 47 50 43 35 35 33 33 33 43 33 33 43 43 44 50 50 43 35 35 43 43 43 52 52 52
57 59 52 52 52 52 52 43 43 43 43 43 52 57 57 57 57 57 57 52 43 43 37 38 38 44 39 39 39 57 57 57 57 52 43 43 57 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 52 52 52 43 43 35 39 39 44 43 52 52 57 62 62 39 39 43 62 44 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 52 62 62 43 43 35 44
44 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 45 45 45 52 57 52 52 52 57 57 57 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 44 43 33 33 42 42 27 43 44 50
52 57 52 52 28 29 19 31 31 43 44 38 32 32 38 32 52 52 43 43 37 37 52 52 57 57 54 57 38 23 14 8 8 8 12 27 43 44 43 43 47 44 39 35 35 39 36 37 41 41
35 32 35 31 31 20 31 31 57 57 57 57 57 43 43 37 42 28 24 13 13 13 28 28 32 28 20 20 20 31 32 36 30 18 17 24 22 27 21 15 13 13 26 28 25 31 31 31 30 32
19 31 31 43 28 32 20 15 15 11 11 11 18 12 12 13 15 19 18 12 11 11 10 14 16 10 9 8 8 6 9 9 9 11 27 20 24 24 15 15 12 19 11 11 11 23 25 43 48 37
37 30 25 25 28 31 32 32 32 32 39 43 48 43 43 37 32 28 24 24 19 16 16 21 21 28 33 33 43 39 37 37 39 28 24 20 28 24 26 15 12 12 12 10 11 19 19 29 28 28
22 23 12 11 11 15 21 19 18 22 24 24 11 13 15 19 15 26 12 12 8 12 18 25 18 12 12 18 18 22 18 22 16 19 17 19 15 16 21 21 24 20 18 15 11 11 14 20 21 10
8 8 9 8 10 10 13 10 10 9 9 8 10 8 12 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 11 11 10 12 10 10 6 6 8 8 6 6 6 8 10 13
16 17 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 12 26 17 16 12 9 9 10 11 10 10 8 8 8 11 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 10 8 8 6 6
6 6 9 11 16 16 22 21 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 11 9 9 9 11 11 11 11 10 10 10 13 9 9 9 12 12 10 10 10 8 6 8 8 8 19
21 15 12 10 10 10 10 10 15 19 19 16 13 17 10 9 9 9 9 9 10 10 16 21 17 17 14 12 13 12 12 8 10 6 6 8 10 11 22 14 9 9 9 13 13 17 16 13 7 6
6 6 | Open.Hide.15 19 8 8 8 8 18 12 19 10 10 10 16 28 37 37 47 47 39 39 39 37 37 44 44 39 41 40 34 37 28 33 22 21 11 11 11 21 21 57 57 57 34 25 12 11 11 21 21 53
53 68 54 54 57 42 41 41 41 41 42 46 57 57 41 41 42 48 48 41 47 47 48 57 47 50 47 47 47 47 48 47 47 47 47 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 57 44 38 23 17 17 32 32 38 38 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 59 59 52 52 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 52 52 57
59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 57 57 43 43 57 57 57 68 59 59 57 47 47 57 57 68 59 59 59 57 57 57 59 59
68 68 68 68 68 59 34 31 20 20 20 24 24 30 33 42 42 48 48 43 48 48 42 47 42 35 35 40 40 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 48 48 43 37 37 30 30 30 30 22 23
12 13 12 23 10 10 9 16 11 11 11 16 12 14 18 21 12 11 11 11 9 9 9 15 11 11 20 20 37 30 30 30 39 39 48 39 36 33 28 25 23 29 29 17 17 21 18 18 19 15
13 12 12 15 11 12 12 12 11 9 11 11 14 10 9 8 8 8 10 12 15 21 29 28 28 36 32 33 28 31 35 59 59 43 33 28 22 22 22 24 26 24 23 23 32 32 43 39 39 29
26 21 15 12 12 15 25 32 43 40 28 19 13 13 15 19 31 37 39 32 27 15 13 12 11 10 10 10 10 10 12 21 23 19 13 11 11 12 20 12 14 13 15 13 14 14 14 14 23 28
28 37 20 20 20 16 16 12 17 11 10 10 11 20 15 15 17 30 30 33 28 28 12 12 11 16 16 12 12 10 13 10 10 10 10 7 7 8 10 13 10 9 9 9 9 9 10 15 11 8
8 8 9 8 10 8 9 9 9 10 8 8 10 12 12 10 16 14 17 15 16 10 10 12 14 15 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 11 11 19 10 10 10 14 10 11 11
11 11 10 10 12 15 24 21 16 10 10 9 8 7 6 8 8 10 17 16 14 10 10 10 10 10 12 16 10 11 10 9 8 8 9 9 10 11 11 12 12 8 8 8 8 10 8 10 12 10
8 6 8 8 8 11 11 14 14 16 30 26 17 12 8 6 6 6 8 10 18 18 12 9 8 8 8 8 8 8 15 15 10 7 7 12 11 12 12 12 10 12 10 8 8 6 6 8 8 8
10 10 8 8 6 6 8 8 9 10 9 9 9 9 |