BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-188M09.T7 (MSMg01no188_m09.b1) | MSMg01-188M09.TJ (MSMg01no188_m09.g1) |
ACC | AG379684 | AG379685 |
length | 752 | 776 |
length of high quality (start - end) | 311 (57 - 367) | 286 (77 - 362) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no188_m09.b1 PHD_FILE: MSMg01no188_m09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:04:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no188_m09.g1 PHD_FILE: MSMg01no188_m09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:04:32 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NCCCCCATTTTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXCGCGGAATTCTGCACTGGATCCATCTGGCCCTGAGCTTTTCTGG
TTGGGAGACTTTTAATTACTGCTACTGTTTCACTGGGGGGTTATGGGCCT
ATTTAAATTGCTTATCCTATCTTGTTTTACCTTTGGTGAATTATATATAT
CAAGAATTTCATCCATTCCCTTTAGGCTTTCCCATTTGATGGAACACAGA
TGTTTGAAATATATCATTATGATTCTCTGAATTTCCCTGTTTATTTTTTA
ATGTGTCCCTTTCATATCTAATTTTACTAATGTGAAACTTTTCACTCCAT
AGTTTAGTTCATTTGTTTTTTGTTTCCCCACCCCCACTCATATCTTCCAA
GAGTAAATTCTTCATTTCTCTGACTCTTTGTATTTATATTGTTGCTATTG
TTTGTTTCTCTCATTGATTTCTGTCCAGAGTATGATTATATTTTGTAAAA
TACTCTTTTTGGTTATTATTTATTCATTTTGTTCAAGCACTTTCAGGTGT
ATTTCTTATTTTCTGATATGATTACTTTCCAGCCCGTTTTTGATATTGGT
ATGTATTGCTATGCACCCGTCTCCATATGTCCTCCCCCTGTGTTTTTCAG
GTTCCTATTCGTCGCATTTCCTTCTTACTCTATTCTACTCCCTTAACTTC
CCCCCCTCCCTTTCTTTTACCTCTTTTTTTTTCTTTCTTTTAATTTCATT
CT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATCAAAAAAGTTAAATTTATGTA
TAAAAACTATTGTACAGAGATTACGTGGAGGGTACTGTACTGTGTCCTTT
CTGCTCAATGTTTCTCTAAGCATCAAACTGCTTTAATGAATAAACTTAAT
GATAAAATGCTTTTCAATGTCACTGGTTTTGATTTTCAAATCTCAAGTCA
GTTAATAAACCATATTGTTTCAGTTTGGATACTCATTAGCGTTCACTTAA
TACACTATATTTAATTATTATTTTTTAGATTGTTAAGGTGAAATACATTT
TAGGTTTTGTTTTTTTTTATGCCCCACGCCAGCTGACATCTCTAAAACTC
ACAAGGAATTTGAAAGCCGTAATGAAGTACTTTACCATCCTACAGCACAG
GCATTTATTTTTTGCCATTGCCGTTTGTCTGCGCTACATTCCCATTGTTA
CCTAGGTTAACTTTGAACTCTTGATTTTAATTGATGTTCATATCTCACCC
CCTCATAAATCCCGTCTGCCTGTTCCCGCCTCTTCTTCCCCTTACCTTTT
TTACTAATCTTATCCTTTTACACTTCCACCCCCTTTTCCTTATTCTTATT
ATCCCTCCCCTTTCCTCTCCCCTATTATTTCCCCTTCCCCTTCTCTTCCC
ATCCTTTTAACTCCTTATTTATCTCTTCCCCCCTCCCCCTCACCCTCTCC
ACTTCTTTCTCCTCCTCTCCTCATTN
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 6 6 6 7 10 10 10 13 13 11 17 11 10 14 13 24 32 37 37 37 37 41 47 47 36 36 42 42 36 37 48 43 28 26 23 23 23 37 43 48 43 39 39 42 42 48
50 36 42 23 28 28 42 41 68 68 40 40 40 40 48 48 53 68 68 68 68 50 50 50 46 50 50 50 50 50 51 59 59 59 59 59 57 50 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 68 57 57
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 57 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 57 57 57 59 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68
68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 46 43 43 46 59 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57
57 48 48 48 59 48 48 48 41 41 47 41 34 32 20 13 11 12 13 16 12 12 12 23 24 23 12 10 9 7 7 8 11 10 8 10 10 11 11 23 23 40 41 47 59 41 47 39 39 39
47 59 59 48 48 48 48 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 31 31 14 12 12 11 11 16 23 26 21 24 12 12 11 12 12 12 12 12 15 16 18 15 21 24 32 37 43 48 41 37 30
25 25 33 40 40 48 48 48 57 43 43 43 43 32 41 28 23 23 32 37 30 30 25 36 36 36 36 23 23 23 30 32 33 33 30 30 30 42 43 59 48 42 34 26 17 17 26 29 33 29
31 33 22 22 23 23 23 34 28 23 18 11 12 12 22 20 14 14 19 26 25 24 20 20 23 22 28 37 37 37 31 31 18 15 14 14 14 21 21 28 28 28 24 19 19 19 15 18 21 21
24 28 33 24 19 14 14 20 20 32 27 34 17 14 14 23 19 22 22 30 29 33 39 43 41 47 48 43 34 29 12 10 10 10 10 14 24 30 29 31 14 10 10 8 11 8 11 11 11 13
15 10 10 10 9 9 16 15 13 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 13 10 13 10 10 10 15 15 16 21 21 18 10 9 9 9 9
9 10 10 10 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 10 10 15 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 12 10 9 9 8 8 8 8
8 8 13 14 12 14 14 21 13 13 11 18 15 11 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 7 9 12 11 17 14 15 12 12 12 12 12 12 15 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 | Open.Hide. 6 6 6 10 11 8 8 6 8 17 23 26 14 14 19 27 33 48 47 53 57 57 57 57 43 43 43 43 48 43 43 42 48 48 48 48 54 43 36 29 36 36 41 42 48 48 48 46 42 42
42 47 47 47 48 44 44 40 48 48 44 27 30 36 30 36 29 30 30 32 24 30 33 27 41 41 32 32 30 38 42 47 57 59 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 46 50 50 50 50 50 52 43 43 50 52 54 50 50 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 45 57 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 44 44 57 57 43 59 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 45 45 52 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52
52 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 59 50 48 48 57 50 57 43 43 57 59 59 54 44 44 44 44 48 48 48 48 32 34 24 33 28 44 44 57 57 57 57 57 59 48 48
44 44 43 43 43 57 44 48 48 57 57 47 59 43 43 43 43 43 47 47 59 59 59 59 34 32 20 20 20 32 34 43 43 39 42 35 35 35 35 35 47 47 48 48 48 48 48 48 48 59
59 43 41 41 41 28 30 19 25 18 10 12 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 9 9 9 9 9 11 11 11 11 22 25 30 22 22 22 26 28 39 31 34 26 32 39 37 43 43
43 48 48 48 48 48 48 48 44 41 34 34 20 17 10 10 9 9 9 10 15 23 17 13 10 10 10 9 10 11 12 12 12 10 11 11 13 11 11 12 13 13 13 15 15 11 18 18 24 20
14 14 14 19 30 28 36 35 35 39 39 33 33 34 33 28 22 28 24 24 12 12 12 13 24 23 23 23 28 31 28 15 16 10 10 10 13 13 19 12 15 17 30 30 32 24 19 13 10 10
15 15 15 11 10 10 11 16 15 17 18 18 12 12 12 12 19 15 24 24 15 14 14 15 18 18 17 17 22 26 24 20 20 13 10 10 10 10 10 12 10 10 13 12 12 11 12 12 18 24
28 21 18 11 11 11 10 10 12 10 11 13 15 15 15 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 10 10 13 16 10 10 13 18 13 13 12 11 10 8 8 8 8 8 8 12 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 11 10 11 11 12 10 10 6 6 8 8 8 9 11 14 11 10 8 13 10 7 7 8 8 10 22 24 17 18 14 10 9 9 8 8 8 6 6 6
6 6 11 15 10 11 18 23 22 22 28 19 13 8 8 8 10 10 24 13 11 8 8 10 8 8 8 9 12 15 11 9 10 10 13 9 19 14 15 15 16 15 15 19 24 25 18 15 10 10
8 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 10 11 9 8 8 8 8 10 10 10 8 11 6 6 8 8 10 11 11 10 9 12 10 15 14 11 6 6 6 6 6 9 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 10 10 8 9 8 8 8 3 0 |