BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-217C01.T7 (MSMg01no217_c01.b1) | MSMg01-217C01.TJ (MSMg01no217_c01.g1) |
ACC | AG396761 | AG396762 |
length | 1,254 | 1,276 |
length of high quality (start - end) | 420 (29 - 448) | 333 (506 - 838) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_c01.b1 PHD_FILE: MSMg01no217_c01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_c01.g1 PHD_FILE: MSMg01no217_c01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:27 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCCGCATTGGGCCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCT
TTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAATAGGGTTATTTGATTTTCTGGAG
TCCATCTTTTTGAGTTCTTTGTATATACTGGATAGTAGTCCCCTATCTGA
TTTAGTATTGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTTTTGTCT
TATTGATAGTGTCTTTTGCCTTACAGAAGCGTTGCAATTTGCCTGGCAAA
TACAGAAGTGGATGTTCACAGTCATCTATGGGATAGAACACAGGCCCCCT
AATAAAGAAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAACTGAAAGAGTCTGCAACCC
TATAGGAGGAACAACAATATGAACTCACCAGTAGCCTCTAGAGCTTGTGT
CTCTAGCTGCATATGTAACAGAGGATGGCCTAATTGGCCATCAATGGGAT
TTTTTGTCCCCCCCCCCCCGAAGATCATATGCCCCAGTAAAAAAAAAGAG
GGGGGCCAGGCAGTGGGAGAGGTTGCGTTGAGGAGCAGGGCGGGGGGAGG
GTATAGGGGACTTTCAGGATAGCATTTGAAAAGTAAATGAAGAAAATAAC
TAAAAAAAAAGAATAAAATATGATTGTATCAACTCCCTCATTTTCTATCT
TCACCTCAATCCTCCCAGAACATCTTCATTTTCTCTTCCCCACTCCTCTT
CCTTTGACTCTTGGTTCCTTATGCTCTATATCTGACCAAGTCCAATTAGA
GCTGCTTATACACATGGGTGTGGAACTATCCTGCCAGAGCACCCTGTAGA
CTCCTATCAACTGCCAGTGACACCTCAGTTAGAAGTGGTCCCCACGAGTC
CCTCCACAATCCCTTCTGCAACTTGTGCTGGCTTGATTCCCCCCAGGTCT
TACGTAGGCAGCCACAGCTGCTGTTGAGTTTTTGATTGCATTAGTACATC
CTGTCCATAAGGCATTTTCTAAGGTTTTTTCTCTGGCCTTGGTTTTTCTT
TCCAAACTCTTTTCCAATGTTCCTTTGTGTGGTCCTTTTTTTAAAAAAAT
ATCCCCTTTTTTTTTGATATCCTTCTTTTTATGCTTTTATTTCCATCATT
ATTACTTTAATAAATCTCTTCTAATTAAATCTTGCCAAATAAAAAATATC
TTCTCTATATTTTGGTATAATATTATCAGGCTCACTATTTCCTTTCACAT
TCCTCCCCTCCTAATAAACCCCCTCCCCTTCTCCTTAATAAATAATTTTT
TGTT
| NNTTTTACATGGTATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATATTTCATAACATCAACAAACCAGATGAA
CCTCATCCACTTAAAGCGGAGAACAGCGAAAAGAACAAATGTCTTGTGAA
GAGTGGAAATGAGAACAACGTGTCTGAGGTTACCCAGTGGAAATAAGCTG
CGGATGTTGTGCATGAGGTAATTATTTCTGTAGTGCCGTTTCTGCATCTA
GTTTATAAGCATGTCAGGGTGTGCAATCCAGGCATATTTCAAGGAAAGAA
ATACCCATCTACACGATGTGGGGAGAAGCCAGTCACAGACTCAGCGAGCT
CCACAAAAGTCCTAATAAAACTTAAGCTTGGAGCAGAATGCCCCACAGGC
CATATTACATAGAAGCTGGATGTTCCTGTCAGTCACTTTGTTCCCCTGCA
AGCTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCTTCTTTAACTATTTGAAAACAAAAAAA
AAGTGTGTTAAAGAACAAACCAAAGCAATGCAGAACAAAAGAAAGCAGCA
GCAACAACAACAACAACAAAATACACTCAGAATGAAAGTAAGTTCCTATG
AAATTAATTCAACAAAGAGGGATAAATATGCCCTAATTATTATCTAGGCT
GATTCACCTCTTCTGGGAAATTTCCATGGAAGTTAATGATGTATTAGATG
ATGCATTAATGTTAAAGATACAGTGAGAAATCTTACTTTTTCCTTTATAT
AACTTTCCAAAGTAATGAGTTGACACAACCAAAGAATATGTAGGTGTTTA
ATCATGCAGAGATATTATAATGGCCTTGCAAAAATAAGAAAGCATATATT
TATAAATTATTTTAAATAATAAATTATTTAATTTATTTAATCAACTTAAG
TCACAGTAGCTCAGGCAGATGAAGTACCAGCACAAAGCCAGATATTGTTA
AATTCAAAGCCTCACTACTCAGTTTAGAGTCCATTCTTTGTAAATAATGA
ATCTGAAATTACTGGTAAACTCCTGTTGTCCCCTTTCAAAAGACGGGAGG
TATGAAAAATGGGAAATGGATATTTCCCGTTTCTTTTCCGGGACGGGGAT
AATAATCCCGGAACAATAATTGGTATAAAATAAAGGTTTTTTTTCCCCCT
TTAAAGACTCCTTTTCTTTTTCGGAAAACCACGGCGCTTTTCCTTTCTCC
CCCTCTCTAAAACAGGTCGGATGGTTATTAAAATTTAGGGTATCTCTCTT
CTATTTGTAAAAACCCCTAATCTCCC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 11 9 9 9 9 9 8 8 10 10 8 8 8 10 15 9 8 8 8 8 8 15 21 37 37 37 34 36 36 42 42 47 53 53 57 48 43 47 47 51 68 54 57
54 54 54 41 42 41 41 41 48 48 51 50 50 50 51 68 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 50 54 54 54
54 57 57 57 50 50 43 48 52 57 44 57 57 57 57 68 57 57 57 50 50 50 36 36 14 12 10 10 10 12 19 38 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 35 43 31 35 38 43 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 57 54 59 59 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 57 47 43 43 43 43 43 43 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57
68 59 59 57 54 54 54 54 54 57 59 59 59 59 54 54 54 59 57 57 57 48 57 57 57 48 48 59 57 48 48 48 48 48 59 59 59 59 50 50 50 50 50 39 41 30 30 15 15 12
12 11 15 12 18 16 32 41 41 50 48 53 48 57 59 57 57 57 48 48 48 48 48 48 48 53 48 48 47 59 47 40 41 43 41 57 48 48 53 59 59 59 47 47 34 22 16 9 9 8
8 9 9 9 6 6 6 6 6 6 9 12 16 28 28 19 12 9 9 9 9 18 25 35 41 42 50 59 59 39 40 40 39 25 22 11 11 11 12 12 13 20 11 11 8 7 6 6 6 6
6 6 15 23 23 43 46 46 46 48 48 48 41 41 28 28 28 37 43 47 48 48 57 59 59 59 59 48 48 48 54 48 48 48 46 46 43 43 43 43 43 41 41 30 30 28 36 32 39 32
37 37 59 59 57 48 48 48 48 48 48 46 46 47 37 35 35 39 42 46 43 43 59 59 59 57 48 48 43 43 43 47 47 47 35 35 35 39 37 39 37 35 35 35 35 43 39 39 46 59
30 23 12 11 11 21 24 37 41 32 32 20 23 23 23 23 30 37 37 43 59 48 48 48 59 57 57 57 57 57 43 46 46 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 53
53 50 57 57 57 59 48 59 59 59 48 47 47 59 59 59 59 44 39 39 44 44 39 47 47 47 47 48 48 48 48 50 50 50 57 59 59 59 59 59 57 48 48 48 43 43 30 32 39 43
39 57 57 57 39 39 39 37 37 37 37 37 37 37 37 32 32 32 32 32 34 34 28 28 37 37 27 26 11 11 13 26 25 41 35 35 30 31 31 38 39 39 41 42 42 37 37 30 30 30
39 39 48 57 36 36 33 33 33 30 19 14 14 18 21 17 15 15 25 27 33 31 29 23 24 24 37 32 30 30 37 22 20 20 18 12 12 12 12 12 16 24 34 33 37 22 20 12 11 11
17 15 18 18 17 18 16 17 17 22 22 16 18 18 24 19 13 13 12 15 11 16 12 14 15 13 9 9 9 9 9 10 10 10 10 12 8 8 8 8 8 9 13 15 11 11 11 11 12 19
19 23 23 17 14 17 9 10 9 9 11 8 8 8 8 8 9 9 9 13 10 13 8 8 8 8 8 8 11 10 8 11 8 8 8 10 8 8 8 21 19 10 10 14 10 15 11 10 9 8
8 8 8 8 8 10 12 11 13 11 11 10 10 12 12 12 12 11 14 13 14 16 19 22 14 12 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 10 12 12 11 12
12 15 10 12 10 9 9 10 8 9 12 8 10 8 8 8 8 13 8 8 8 8 8 8 7 8 8 6 8 8 8 8 6 6 6 6 14 17 22 19 14 12 11 11 17 12 10 10 9 10
9 9 10 10 10 10 10 10 10 8 13 8 8 8 10 10 9 9 10 19 13 19 10 13 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 15 15 14 13 10 12 12 10 11 17 8 8 8
8 8 8 14 10 14 12 14 11 11 15 15 10 8 8 8 8 8 10 18 15 18 18 15 11 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 13 13 10 8 6 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 8 7 8 7 6 8 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 6 6 8 8 8 8 6 7 10 11 6
6 8 8 10 8 8 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 10 10 9 9 9 10 8 6 6 6 8 10 8 8 9 10 10 10 8 13 8 8 6 6 8 8
8 8 9 13 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 12 15 10 19 19 20 15 13 8 11 11 13 17 9 9 8 10 12 12 10 8 13 10 10 8 8 8 8 16 15 13 13
11 11 11 11 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 8 7 7 8 7 7 6 6 6 6 8 8 7 7 13 8 8 8 15 9 7 9 8 12 10 19 19 19 9 9 10 21 19 22 12 12 19 21 19 10 10 12 24 21 37
30 30 37 43 48 48 50 53 57 68 68 68 57 34 28 19 16 21 24 19 19 29 36 48 41 41 43 41 43 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 42 28 28 35 44 42 57 50
50 50 50 47 47 47 57 47 47 41 42 41 41 50 54 59 59 47 47 43 57 50 41 36 14 12 10 10 12 13 41 44 59 59 68 59 57 54 54 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57
57 59 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 38 21 10 10 10 10 10 28 26 43 43 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57
59 57 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 57 59 57 57 68 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 68 57 57 52 57 52 52 52 57 57 57
57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 44 46 47 48 44 44 44 44 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 43 43 46 46 57 57 57
57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 59 59 48 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 50 59 50 50 50 47 41 30 25 15
11 12 11 11 12 15 12 11 15 18 27 30 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 47 46 30 25
12 11 12 12 33 33 37 10 9 9 9 9 9 11 14 19 19 16 37 31 20 20 11 11 13 19 33 34 59 59 59 59 59 59 59 43 39 39 36 25 25 11 11 11 15 17 27 22 16 12
12 12 12 12 11 18 18 32 32 59 48 57 57 48 57 48 59 48 48 57 59 59 59 59 59 59 48 48 54 43 43 43 43 43 47 47 54 48 48 48 47 47 46 46 43 43 39 41 41 41
41 30 39 39 43 43 47 47 47 48 48 48 48 48 48 44 57 43 43 44 57 44 46 43 44 57 59 57 57 43 43 57 57 57 68 57 57 59 59 54 57 57 57 59 59 59 68 68 57 57
57 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 48 57 57 57 57 57 68 68 57 59 54 54 54 54 54 54 50 50 46 46 41 47 48 57 57 57 54 57 57 46 44 39 36 36 43 43
48 57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 48 57 57 57 48 48 48 43 43 40 47 37 30 30 27 25 24 27 29 37 34 34 35 35 35 39 39 50 50 50 57 44 44 37 37 30 37 37 41
50 47 47 44 44 32 28 18 20 16 22 24 30 30 30 40 41 40 43 37 43 37 37 28 22 22 18 18 28 32 32 37 39 39 35 31 39 39 39 34 34 22 22 22 28 34 28 28 23 23
18 28 28 39 35 30 24 16 16 18 18 17 11 11 12 27 27 41 36 31 32 17 16 16 16 19 24 24 13 18 19 32 27 31 21 12 11 11 17 23 30 19 13 6 6 6 15 15 20 16
9 11 10 11 22 17 17 10 10 12 25 23 41 31 24 14 13 12 11 13 18 12 14 11 12 24 28 34 34 25 25 20 30 31 39 39 39 39 31 24 28 23 20 16 22 12 13 10 10 10
12 16 16 19 15 13 13 11 11 11 10 10 10 11 9 11 11 13 14 19 23 16 10 9 9 14 12 20 18 19 13 15 15 26 22 28 24 18 18 10 13 6 8 8 11 15 15 11 8 8
8 9 10 17 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 10 10 8 10 10 15 12 10 14 10 10 9 11 12 10 8 8 8 8 10 11 9 9 9 11 16 16 15 10 10 10 9 9 9 11
11 15 18 15 12 10 10 10 13 10 8 8 8 8 7 7 10 10 14 16 10 9 10 8 8 8 10 7 9 9 9 11 10 8 8 10 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 11 8 8 8
10 10 8 8 8 10 15 12 14 16 11 9 11 11 14 10 16 13 14 10 10 8 8 8 8 9 9 9 10 8 10 6 7 12 8 10 10 13 12 8 9 9 11 11 11 17 17 12 12 10
11 10 9 9 8 10 8 10 13 13 8 10 8 8 8 6 6 6 8 8 9 11 10 10 8 10 10 11 16 13 14 12 15 10 12 11 18 28 21 15 13 10 10 10 8 10 10 10 10 10
16 16 12 9 10 10 10 12 12 11 8 12 7 10 6 6 6 8 13 10 11 11 11 13 15 24 19 19 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 10 12 13 10 10 8 9 9 9 10 10 12
8 10 6 6 8 8 11 10 12 16 11 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 8 8 8 10 10 9 10 9 10 8 9 10 10 10 9 14 14 15 16 19 9 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 8 8 10 6 9 9 9 9 9 12 10 9 10 9 10 9 9 9 9 9 11 12 12 12 |