BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-217E22.T7 (MSMg01no217_e22.b1) | MSMg01-217E22.TJ (MSMg01no217_e22.g1) |
ACC | AG396879 | AG396880 |
length | 1,253 | 725 |
length of high quality (start - end) | 432 (29 - 460) | 229 (130 - 358) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_e22.b1 PHD_FILE: MSMg01no217_e22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_e22.g1 PHD_FILE: MSMg01no217_e22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:44:47 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGCTCATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CATTTCATTGTGATCAGAGAGTAGGTATTGTACAATGTCTACCCCATCAA
ATGTATCCATCCTTTTATGGTCCATGACACGGTCTAATGTGGAGTACTCT
ATCCACTCCTATGAGAAGCGTGTTCTGCTGCCCCGTGGATACCTGCAGAG
TTTCCTTGATTTATTGTGGTGCTCAGGTGGAGTCTTGCCTTTCTACCTTG
TTATTCCAGATGGTGATGGAAGGGTGTCCTTAGCCTTTCCAGCTGATTCT
GTTGTTTCCACTGTGTTTTCTGTGTTAGCTTCTGCCAGTTTTACCTCATG
CAGTTGGTACCCTGCCATTTGATACATACATGCTTGTGACCATTCTGTAT
TTTTGTTACCCTGGCTGCTTCATATTTCTTAAATGTTTATTGATGGTTTG
TTTTTTTTTCCCCCCCCCGNNAANANNAANATAGATAAAAAAAAAAGGGG
GGNNNNNNNNAANNNNANANNNANNNANNAGANATTTTCTTTATATANAT
TTNAAATGGTATTNNAAAAGTNTTTTATATTTTCNTTCTGNTTTGTTCTC
CTACCCACCCACTTCTACTTCTTGGCCCTGGCATTCCCCTGTACTGGGGC
ATATAAAGTTTGCAATACCAAGGGGCCTCTCTTCCCAGTGATGGTCGACT
AGGTCATCCTCTGCTACACATGCAGCTAGAGATATGAACTCTGGGTGTAT
TGGTTTAGTTCATATTGTTGTTCTACCTATAGGGTTACGGACCCCTTCAG
CCCCTTGGCTGCTTTCTCTTAGTTCTCCATTGAGGGGCCTGTGTTCCATC
TTATAGATAGATGACTGTGATCATCCATTTCTGTATTTGTCAGGCTTTGG
TTTATTCTTTTTTTTATACGTTTATTACGGGTTCCTTTCAGTAAATTTTT
TTGTCTTATGCAATAGTGTTCGGTTTTGGTGTTTGATTTTTGTATGTATT
TTTGGTTTGTTTATTTTCTTGTTATATACCATCCTTTTGTTTTAATTTCT
AATTTTTTCATGTGAATTCTTTTATTGGGTAATTTCTTCTCTTCTTTTTT
TGTGATTGTTATTTTTCTTCTTTTGTTTTTTCTCTTTATTATTTTTACTT
CTTTGTTTTTTTTAACATTCTTTTTCTTTAATCATTTTTCGCTATTTTTT
TTCTTCTTTGTTTTTCTTGTTTAATTATATTTATATTTCATTTTTTATAC
TCT
| GCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXTTGCCCAATTCAAAATCAAGAAGACTGTGTAGATTTCACGA
TTTTAAATTTCTTATTCTAACAAATCAATGTTATAAAATTTACCTGCACG
GTGTAATTTTGCCTGATCAACTGGTGGTGCTTCTCTTGGAAAAGAATCTC
TCTCTTCAATGGGAAGCTATAGAGTTTTTGAAAGAAGGTATTCAGTAACA
ATTGTGTGTTTCAAACAGCACAATTTTAATAACTCGGGTAATATATAAAC
TTATTACCTTCAATTGATTATATTCCTTAGGACAGTCTAGAAAAAAAATC
AGAGATACTTATTATTAATATCGCCCCCCCCCACAAACTTGACCACACTT
TTATAATTATGGTCAAAATATTCTTTATAAAATAAATTTATAATGATTGT
ACTAATTTTGGAATTGTGGCAAATTTTTACTTTTTGTTTCGTTCTTGAAT
GAAATATCTACTGAAAAACTAATAAACTACATAATTTTCATTAAACTTGA
CAATTTTCAAATTAACATTATGAGCTCAGAGAATTTTTCTTTTAAACAAT
TTATGTGATTTCATTAAGGTGGCATTTCTAATGGGTTCGAGAATAAAATG
TTTCTAAAATTTCAGGATAAAATCACGAAACCAGGATAATATTTCAATAG
TCAAAACTGATTATACCATGTGACA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 7 6 8 8 10 12 15 13 9 8 10 12 8 8 19 19 9 8 8 8 10 8 22 23 42 40 36 40 40 42 42 48 43 43 48 42 57 57 43 43 43 42 47
41 43 43 42 42 41 41 41 48 57 68 68 68 57 48 37 37 30 32 27 27 21 12 12 24 34 48 57 68 43 43 32 30 30 39 30 37 32 42 42 50 47 57 57 57 57 57 57 57 47
47 57 47 47 57 48 44 35 24 24 18 14 14 13 27 27 57 57 57 57 57 44 36 19 24 24 17 14 26 24 37 37 34 34 34 42 42 47 47 47 57 47 42 43 48 48 42 42 48 48
48 48 50 50 50 50 50 50 50 50 53 48 48 43 47 39 43 36 43 44 53 44 44 39 37 42 39 27 27 18 9 9 11 9 9 11 12 18 26 41 34 39 35 33 28 28 23 23 28 34
39 47 50 50 50 50 57 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 42 37 35 32 39 44 48 48 48 48 48 54 54 54 54 54 48 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57
57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 59 59 50 43 43 50 50 59 59 57 57 57 57 57 57 57 41 41 20 20 20 41 41 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 59 68 68
68 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 54 32 32 13 13 13 32 34 59 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57
57 57 57 44 57 43 43 43 46 46 57 44 59 35 35 35 59 42 59 57 54 43 43 44 57 59 59 59 59 48 48 48 59 48 59 57 57 57 57 57 53 53 59 41 37 17 22 10 9 9
15 12 12 17 11 11 16 25 28 36 39 37 39 39 43 43 40 40 41 59 47 59 59 59 59 59 59 59 59 47 35 35 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 24 19 9 7 7 6 6
9 16 16 26 39 34 26 20 20 15 14 17 19 19 18 20 13 12 3 0 0 3 3 0 3 0 0 3 3 0 3 12 11 11 9 13 13 16 12 12 9 9 9 10 10 7 6 6 6 6
6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 3 0 0 0 0 3 0 3 0 0 0 3 0 0 0 3 0 0 3 23 3 0 3 25 27 59 59 59 59 59 59 59 59 27 27 3 0 3 27
27 3 0 3 16 17 9 9 9 9 14 17 3 0 0 3 27 18 21 8 3 0 3 8 8 9 9 9 8 6 6 6 7 3 0 3 7 6 6 3 0 3 9 10 10 8 8 8 8 8
10 16 32 28 35 35 39 35 36 39 43 32 32 28 28 28 32 32 41 23 23 28 34 29 20 20 20 31 30 30 30 37 37 34 28 31 30 30 31 44 44 44 21 21 13 15 12 22 18 28
28 32 34 28 23 23 31 31 43 24 24 11 11 11 16 27 18 23 23 24 24 23 18 15 15 15 15 12 12 13 28 25 22 19 16 16 21 24 28 39 34 23 18 11 11 11 20 20 31 34
23 18 18 18 25 29 28 28 28 28 31 28 23 23 23 30 28 14 14 11 18 11 11 12 23 25 15 27 22 30 30 37 37 39 32 28 14 13 11 13 10 10 10 10 12 13 12 12 10 12
12 14 15 31 32 28 22 22 22 28 28 37 37 37 37 59 38 34 15 16 9 9 9 10 10 12 12 14 24 18 21 21 15 10 9 11 12 17 33 31 30 30 27 27 27 25 22 24 25 21
18 18 17 16 18 23 12 11 11 11 11 11 10 11 11 9 11 12 8 10 8 8 9 9 9 15 11 26 32 28 28 13 8 8 10 8 8 8 12 10 19 18 18 16 16 12 12 11 13 19
21 21 18 12 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 19 12 12 8 8 10 11 14 10 11 12 14 17 10 10 10 13 15 20 20 9 8 8 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 6
8 8 8 6 6 8 8 10 15 16 10 10 9 8 8 8 6 6 8 8 12 10 9 8 8 8 8 8 9 9 11 12 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 17 10 13 12 12 9
13 12 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 8 7 7 8 10 10 8 8 8 9 17 10 9 9 9 9 11 8 8 8 8 8 8 11 15 16 11 9 9 8 8 6 6 8 6 6 8
8 10 13 10 13 12 11 11 11 12 10 16 10 9 9 12 12 11 11 18 18 18 18 12 10 10 10 9 9 9 9 9 9 10 9 15 15 12 12 12 13 13 18 9 9 9 9 12 10 13
10 12 12 22 12 13 13 10 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 10 10 11 12 8 9 9 10 12 8 8 8 15 10 10 17 11 10 8 10 7 9 10 11 9 9 9 13 13 10 10 9
10 10 12 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 12 14 10 10 10 13 13 14 15 13 6 6 8 10 17 11 10 8 8 8 7 7 12 10 15 10 8 8 8 8 8 8 16 19 10 11 10
12 12 12 9 8 8 13 15 20 22 22 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 17 10 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 11 13 15 15 12 9 10 6 6 6 6 10 10 19 21 21
21 12 9 9 7 7 7 13 10 10 10 10 10 9 8 8 8 11 9 6 13 7 6 8 8 9 9 9 9 10 10 10 6 6 6 6 10 8 8 8 8 10 13 11 11 10 9 10 10 8
8 8 8 | Open.Hide.11 11 9 9 23 19 34 28 28 33 37 40 41 39 39 44 44 47 47 47 50 50 59 59 53 57 57 27 27 9 15 11 17 13 10 10 19 17 25 12 28 30 43 42 42 42 38 50 53 48
48 48 46 47 33 23 9 9 9 9 9 10 10 10 8 15 8 9 13 15 16 26 30 37 39 44 41 47 47 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 47 50 43 43 37 37 37 42 36 50 59
59 59 59 59 50 50 50 50 42 41 33 27 11 9 9 9 7 7 7 9 9 9 9 9 12 10 8 8 8 10 15 32 39 41 41 41 41 53 53 53 53 59 59 59 57 57 57 57 57 59
59 59 59 47 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 54 54 54 54 57 57 54 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 50 50 50 50 50 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 48 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 52 52 54
57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 41 34 24 19 10 10 10 10 10 19 31 59 59 68 59 59 59 48 48 43 44 57 48 48 59 59 59 48 48 34 34 41 43 43 48 48 37 37
32 32 33 22 22 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 9 12 9 9 10 10 8 8 9 11 12 13 10 8 8 8 11 9 11 11 18 23 36 37 37 37 37 37 47 48 57 59 59 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 43 39 39 43 43 41 30 28 20 20 20 20 24 30 18 11 8 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 10 18 24 30 34 46 43 43 43 43 39 39 30
30 39 39 43 43 48 57 57 59 48 47 47 43 40 36 28 31 37 37 46 47 47 57 54 54 59 59 59 59 54 54 54 57 57 54 54 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 48 48 48 47
47 48 59 59 59 59 59 57 57 57 44 44 44 44 43 43 43 43 47 43 47 47 59 59 57 57 57 44 43 37 44 35 37 37 43 43 46 48 48 48 47 57 48 54 54 54 59 48 48 43
43 43 48 48 54 48 57 48 48 42 40 40 30 30 30 39 39 43 32 34 21 21 14 28 28 32 32 20 20 20 28 28 39 32 31 37 37 37 37 37 37 37 30 28 16 19 19 15 15 16
36 41 41 41 41 46 46 47 48 47 59 36 36 36 34 31 23 18 18 20 24 26 32 36 37 47 39 39 35 31 28 34 32 25 30 30 34 36 30 30 30 24 26 30 25 27 30 33 33 33
33 33 33 30 30 37 32 18 18 23 24 24 24 22 13 13 21 19 19 19 15 15 15 19 10 12 12 15 18 24 20 18 22 28 28 37 16 11 9 10 10 15 12 12 10 10 10 16 12 11
19 10 10 10 15 22 33 33 40 40 40 32 32 19 19 17 26 18 10 8 8 6 8 7 7 |