BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-217I13.T7 (MSMg01no217_i13.b1) | MSMg01-217I13.TJ (MSMg01no217_i13.g1) |
ACC | AG397032 | AG397033 |
length | 1,308 | 1,281 |
length of high quality (start - end) | 347 (473 - 819) | 331 (70 - 400) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_i13.b1 PHD_FILE: MSMg01no217_i13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:45:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no217_i13.g1 PHD_FILE: MSMg01no217_i13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:45:09 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (42,415,648 - 42,415,978) | (42,263,685 - 42,264,013) |
---|
sequence | NNNCCCACATTGGGCGCATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CATTGACAGAACATCTCCTTTTTCAAAGTAGGCTTAGATTTTCTAAGAAG
TAATAGTATATTTTCAAAAACTAAACTGGCAAGATCATGATTTTTCAATA
TAAAATTAAAATTGGTAACTTTTACCAGGTTCCCTCAGTATCTGAGAATT
TCCAGCTAATTCTTCTGTCTGCATTTCACATATTTCACCAGATAAATGGT
TTTTCTGTTCTTCTTCTATCATTTTCTTCCTTAGCTCTTCCTTTAGAACA
AAAATTAAAAATATAATTTTCATCTCAGTATTTGTTATAAAGGCAAGCTT
AGTTGAAGAGAGCCCCATACCTCTGAATAGACTGTCAGTTTGAGCGGCAA
ATCTTCAACTTTCACAAAGTCTTCTTCATCCGACTTTTGACTTATGTTAC
CTTATTTTGCTCCCCCCCCCCTAAGTTAGAGATAATGAAAAAAAAAAATA
ACTACGGAACAAAACAAAAATCACAGCATGAGAGAACAAATTCCTGCAGG
TCTCCGACCTTCACACACAATAGGACACTTGTATGTACATGCACACTCTC
GACTAATTAATTAAATAAAATAAAATATTTTTGAAAGGGGTTGGAGAAAC
GACTCAGTAGTTAACCTCACTGGCTGCTCTTCTAAAGGACTCAGATTCAA
TTCTCAACACGGTGGCTCACAGCCATCTGCAACTCCAATTCCAGGGGAAT
CCAATGCCCACTTTTGACTTATATGGGCTCAGGACACATTCACATAAAAT
AAATAAATATTGCAAAAATGTTTTAAAGATTAAATCAAGCAATTTCAGAT
CTTTGAATACTTAAATGTACACAGCAGGAAAATAAAGCCATTTAAAAGTG
TAAGTTTCGGGGCTGGGGAGATGGCTCAGTGGGTAAGAGCACCCGACTGT
TCTTTCGAAGTCCAGAGTTCAATTCCCACCAACACATGGTGGCTTACAAC
CATTCGTAACAAGAATTGACTCCTTCTTCGGGGGGGTCTGAAAAAAGCTA
CAGTGTAATTACTATTAAAAAAAAAAAAAAATCTTTAAAAAAAAAAAAAA
GGGAAAGTTCTTCGGGAGGGTTTTGAAAATTCCCCTTTTTAGAAAACATA
AAAATTGTTTATTTGAAAAACATTCAAAAAACAATTCTTTTTATTTTTTT
TAAAAGATGTGANGGCCCAAGGTGGGAGGACTAACGACCCCGCGATGTGT
GTGGTCTATTCCTTCCATATGTGCCCCCCCCCCCCAATTTTAGAACCTCC
AATCAAAC
| NNGGATCACGAGAGGCTGGGGCGCCGGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTAGTTCAAGCTGGAAAGGTCTTTGATAAT
GCTAAGTGTTGAATATTACTGTCATAGGTGCAGGTGGAAGCAATGTTATA
GAACACTGCTATAATTAGAAAGACCTAGAAACTGGTGCCAAACCCCTCCG
AGTTACATTTTGGAAGGGGATCCTCTGTGCCATTTTCTCCCTGGGACTCA
GTCAGCTTTTTTGTTATGACTGAATACTTAATTCCCTCTTTTATCTCCCT
TGAAAGGTTGGAGCTTGTCTTGGACTTGCCTCTGGTGGAGTGTAGTTTTT
TACTGGGTGGATGTGCTTTTCCAGCCAAGGTTTAAAATGAAGAGCCGGTA
TGTTTCAGAACACAGAGTACACGTAGCCTTAGGTTTGCAATGACGGTTAA
TTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCATGAAATCCCGGTGCCCAAATAAAAAGAG
ATCTCAAAAAAAGCAGATAAGTTCTTGATGTGTAAGATAGAGTAGCTTCT
TTCAGAGATAAGGGCTTTGTGTTGTCCCTCAAACAAAACGCAAAAGGTCG
TGTGAAACCAAAGTACATAAAAGAGATTAAAAATGGAGCCGTGGTTTAAG
AGAGGAGCTGTGATGAAAGGGAGTTTTTCTGATCCCTGAACGGACCCTGA
TGCATGTGGCCTGAGCCCAAGGCTCCTTGACCACTGTTACCAGATAATCC
CTAAAGCGCATTTTGTCATCAAACCATCAAGTATTTTAGATGTCAGTGAC
ATTAAAGACCCAGGCTGCCTCAGGGCTCCTGTCAATAGTGTTTACCCAGA
CTCGGTTTCATTTTATATGCTCTCTTCCATCCTCTGTCTTCTGACATTTT
CAGTCATGCTCAGGGCCACATAGCACGTTGTTACACTATTTCCTCTGTCC
GCACCGTCTTCCTTTGCAAATCCCATCATCACAGTCAGTTTTTCCGGAAG
TGCTAACAGAATGCACGTGCCGGGGTAAATCTTTGCGCCCTCGAAGGCTA
ATATGCTAATAACAAATCTTCTTTGTTTTCTCTTGAAACCCTTGGGTAAA
ACTTGTTAAAACCTTGTTAACTCCCCCCACCCCATATGGTAAATGTTAAA
CCCCAATTTCTGATGTTTACTTGTTAAAAAAAACCGAAGCTTCCGGTGAT
TTTTTGCGAAATTGGGGGTTATTTCTTCTCCGCCGACTCTGTATTCCTCT
GGTAGAGTCCCTTTTTNTATATCTATTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 8 9 9 9 10 13 15 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 15 24 24 24 37 33 26 28 24 24 24 33 33 36 36 47 47 48 36 36 41 41 48
42 42 47 50 41 36 36 23 28 28 43 32 32 39 39 39 37 41 30 32 32 27 19 10 8 8 8 9 9 12 18 18 36 28 38 28 30 28 28 30 39 39 39 30 30 24 19 20 24 32
32 39 42 57 42 42 19 24 21 24 32 37 32 44 48 57 47 57 44 41 36 36 20 20 22 44 25 25 12 12 12 21 27 37 36 32 37 37 43 59 46 54 54 46 42 33 33 33 42 42
42 43 43 43 43 43 48 48 48 48 43 47 37 31 25 25 22 37 33 39 33 33 33 28 24 23 23 23 22 17 17 11 11 11 12 9 23 23 37 37 37 41 37 37 30 30 30 39 36 59
43 43 39 39 39 48 48 48 48 57 48 46 46 46 47 47 54 42 42 33 30 30 42 44 44 43 43 37 43 43 43 43 47 44 48 57 57 57 44 40 40 46 57 47 54 54 46 46 43 42
42 42 44 57 44 40 32 28 28 33 38 42 47 47 47 47 47 47 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 43 44 32 32 20 20 38 44 59 59 54 54 43 43 43 28 28 43 38 50
43 43 43 52 52 57 57 54 57 57 59 44 59 41 35 35 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 44 50 43 41 38 43 50 57 54 54 57 57 59 44 44 32 27 31 32 38
32 38 17 32 38 44 36 43 42 44 43 35 35 35 59 59 48 44 44 43 43 43 57 57 57 54 46 46 43 43 43 57 57 48 42 42 33 33 33 42 44 47 57 46 46 43 25 24 12 17
20 12 12 12 15 12 13 30 34 48 57 48 54 54 59 59 59 59 59 59 59 43 43 48 48 48 48 59 48 57 48 57 48 43 43 43 43 43 43 43 43 40 43 43 59 39 36 26 19 10
8 8 7 8 10 12 23 11 10 10 10 10 14 12 21 25 20 18 9 9 9 10 10 21 28 39 59 39 39 36 43 43 48 48 48 43 43 43 46 46 46 59 59 34 30 15 14 12 12 15
11 11 12 15 19 32 34 39 34 28 28 28 28 34 32 39 39 47 47 59 59 59 57 48 48 48 48 48 46 57 43 39 39 32 32 43 43 43 46 43 59 48 48 48 47 59 59 59 43 43
43 47 48 48 47 42 39 35 35 42 47 47 44 47 43 41 37 42 42 44 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 48 48 48 57 48 57 59 57 57 44 44 43 57 43 42 37 42 42 42 30
44 37 39 39 57 59 59 57 57 57 57 57 54 48 59 48 48 48 48 57 59 48 48 43 43 46 48 54 57 54 57 57 57 54 54 44 43 36 36 39 43 47 48 59 48 48 50 50 50 50
50 50 50 48 48 43 47 35 35 31 31 37 59 41 37 37 43 59 37 36 35 37 59 59 46 46 46 48 59 59 57 57 57 48 48 48 47 47 42 42 39 36 39 35 35 34 30 37 30 30
30 39 39 41 41 34 31 41 39 39 39 39 32 32 30 30 35 39 47 47 34 34 23 23 32 34 37 48 48 41 40 40 41 39 39 39 31 31 34 28 28 28 34 30 31 36 26 29 30 37
37 37 39 39 39 32 31 31 37 37 33 31 31 31 29 29 32 32 28 31 39 43 43 32 30 31 32 37 28 37 30 25 25 32 30 32 30 30 34 34 22 22 24 28 28 34 34 37 39 37
27 29 31 35 22 20 22 14 18 16 19 19 30 39 39 25 24 16 18 18 17 17 18 19 11 11 11 17 23 16 10 8 10 10 18 18 36 36 28 28 15 20 16 22 21 32 30 30 30 37
39 27 24 15 18 12 10 10 20 20 14 21 14 20 20 27 30 30 27 22 22 20 28 28 31 28 22 26 22 23 22 30 24 20 18 17 14 12 12 13 19 9 8 12 22 22 20 22 20 21
15 12 10 10 15 15 25 28 17 17 11 11 9 15 11 9 8 10 10 10 11 25 14 18 23 19 25 15 10 10 9 9 10 10 9 9 9 9 11 11 15 11 10 12 15 10 9 9 11 10
12 10 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 13 15 15 15 16 17 13 17 10 12 10 12 12 9 9 11 11 16 13 11 10 10 9 9 9 9 9 12 9 8 8 8 8 8 10 16
17 21 8 8 8 8 10 13 9 9 9 10 13 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 9 9 14 16 18 15 10 11 11 12 11 14 17 15 14 12 10 8 8 9 10
11 11 9 9 10 8 8 13 13 14 12 8 8 8 8 8 8 17 17 15 12 12 12 20 24 34 28 24 22 17 15 10 10 8 9 8 9 9 9 21 18 31 32 23 28 28 23 21 18 17
15 15 12 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 11 10 11 13 11 8 8 8 8 19 10 11 11 21 17 11 11 10 8 8 8 8 14 14 14 7 6 6 6 8 8 13 6 6 6 6 6
10 12 16 12 12 12 12 10 10 8 8 8 10 8 8 9 10 17 13 8 8 6 8 6 6 8 8 15 7 7 6 6 6 8 10 8 10 10 11 12 12 8 8 8 8 8 9 9 9 9
10 15 11 15 11 11 9 6 6 6 6 3 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 11 10 10 10 11 11 11 12 6 6 6 6 7 7 15 9 7 6 6 8 8 8 6 6 6
6 8 6 7 6 6 6 6 6 10 12 8 8 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 12 10 8 10 10 10 9 9 9 7 6 6 6 8 8 18 8 6 6 6 6 8 7 7 8 10 6
6 6 6 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 7 7 27 29 18 12 8 8 8 19 21 31 21 21 9 9 10 13 19 23 11 11 9 23 19 28 28 30 30 33 29 28
14 19 20 32 29 39 43 42 41 41 37 40 40 42 42 32 31 37 32 32 27 32 25 25 22 32 42 41 41 41 44 44 41 41 40 43 39 44 37 32 21 24 24 32 32 44 36 39 35 35
35 39 44 43 38 30 19 16 24 24 43 43 44 50 50 50 50 50 50 50 37 37 37 32 30 24 24 20 28 43 43 43 43 43 41 38 42 44 43 59 54 57 57 52 52 52 52 43 43 28
28 28 43 43 57 57 57 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38 38 35 43 39 31 43 44 57 39 39 39 57 44 57 52 52 52 62 62 62
62 62 62 62 62 39 39 39 62 62 62 62 62 52 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 43 39
39 33 43 43 57 57 57 57 57 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57
57 57 54 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 47 47 39 59 43 47 47 57 47 48 48 48 57 44 44 44 30 30 42 42 43 48 48 48 48 48 57 59 59 68 57
57 57 57 44 44 39 39 41 47 47 43 47 43 47 48 57 57 59 59 57 48 46 46 43 43 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 48 48 40 40 40 37 25 23 11 9 9
9 12 12 14 17 15 11 12 18 28 41 48 48 48 48 48 48 48 57 59 59 48 57 48 48 48 48 48 57 59 59 48 47 47 43 47 43 59 59 48 48 48 46 46 46 30 24 15 12 12
12 17 15 15 16 16 11 10 10 15 18 19 30 28 22 31 16 12 9 9 9 13 25 30 47 41 41 39 39 39 39 39 33 33 30 31 31 37 22 17 9 9 9 12 12 16 10 10 12 12
12 11 12 15 15 15 19 24 37 37 47 39 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 43 57 48 48 48 48 43 59 59 59 57 57 57 48 57 48 48 48 47 44 39 30 30 41 44 48 54
59 44 59 57 57 57 57 57 57 57 48 59 59 59 59 59 59 57 48 48 57 57 59 59 59 59 44 44 43 47 43 39 39 43 59 47 54 54 54 59 59 57 57 59 48 48 39 43 35 39
39 47 47 48 48 48 43 43 39 39 39 40 39 39 32 35 32 39 30 30 30 32 32 37 33 33 30 29 19 22 28 34 34 37 37 37 30 28 24 25 18 18 24 26 32 39 40 31 31 35
37 37 36 40 40 41 43 43 43 36 36 43 43 43 48 48 48 43 43 43 48 48 48 48 53 44 44 48 43 43 39 39 35 35 35 39 37 37 33 36 36 37 37 32 29 29 28 37 30 28
24 30 34 48 48 43 39 28 28 25 25 36 43 37 39 39 39 39 39 43 32 35 35 35 42 42 48 48 42 40 28 28 30 32 32 37 36 36 39 33 28 34 34 22 31 31 39 36 36 36
33 33 37 36 42 42 37 37 30 30 37 37 37 42 32 32 15 13 11 9 9 10 12 16 17 25 39 19 17 11 11 13 26 27 33 27 30 13 13 12 19 17 19 24 19 32 28 30 23 19
8 8 8 17 21 28 25 16 14 12 18 19 28 28 30 24 30 30 33 34 34 37 32 29 20 14 13 9 9 9 14 19 25 21 24 25 19 17 15 10 11 10 17 16 19 13 10 8 8 8
8 10 9 12 11 14 10 10 10 13 13 19 16 24 20 16 13 13 12 15 13 16 17 20 30 23 20 18 18 12 13 21 21 20 15 14 13 12 11 13 17 17 14 14 12 13 14 16 21 22
18 22 21 13 15 8 8 6 6 8 8 8 7 16 17 20 17 17 14 13 10 8 8 8 10 15 15 17 14 12 12 11 8 8 7 8 8 6 6 6 8 8 8 10 16 10 10 15 15 15
13 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 9 15 14 17 14 9 9 12 9 8 8 8 8 8 8 9 11 11 10 13 10 10 10 8 9 9 9 9 11 14 11 12 12 16 14 11 8
8 8 10 10 10 11 10 8 8 8 8 8 8 10 11 10 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 9 10 8 8 8 8 6 8 6 7 7 10 10 10 11 10 9 9
9 9 8 8 11 16 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 8 10 10 10 10 10 18 10 10 10 8 8 8 13 12 8 8 8 10 8 13 11 11 11 11 18 13 14 23
12 8 8 6 6 8 8 11 15 14 15 13 13 12 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 13 18 18 8 8 6 6 6 6 9 11 9 11 11 10 10 15 13 8 8
8 8 7 9 7 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 11 10 10 13 10 10 10 8 8 8 9 12 11 11 9 9 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8
8 14 24 18 10 8 8 6 6 10 8 10 8 8 9 9 10 10 12 10 8 8 8 10 9 9 12 10 12 9 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 8
12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 12 11 11 11 3 0 3 6 6 8 6 6 8 6 6 7 13 22 11 11 |