Query= MSMg01no237_c02.b1 MSMg01no237_c02.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no237_c02.b1 PHD_FILE: MSMg01no237_c02.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
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(687 letters)
>mm_chr8_69381864_69382949
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Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 212 ggaattctccttgagctctgcttctgatcctaactctttattgattgcttgtcttgtatc 271
Query: 72 tttaaatttcccctctggcattttcaattgactacgatgtttttttctgagtcaatttta 131
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Sbjct: 272 tttaaatttcc--tttagcattttcaattgactacgatgtttttttctgagtcaatttta 329
Query: 132 aacagtcattagcattttt-caacttctccagttttacaggtgtcttagtcagggtttct 190
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Sbjct: 330 aacagtcattagcattttttcaacttctccagttttacaggtgtcttaatcagggtttct 389
Query: 191 attcctgcacaaacatcatgaccaggaagcaagttggggaggaaagaatgtattcagctt 250
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Sbjct: 390 attcctgcacaaacatcatgaccaggaagcaagttggggaggaaagaatgtactcagctt 449
Query: 251 acacttccatactgctgttcatcactaaaggaagtcaggactggaactcaagcagatcag 310
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Sbjct: 450 acacttccatactgctgttcatcactaaaggaagtcaggactggaactcaagcaggtcag 509
Query: 311 gaagcaggagctgatgcagaggccatggagggatgttagttactggcttgcttcccctgg 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 510 gaagcaggagctgatgcagaggccatggagggatgttagttactggcttgcttcccctgg 569
Query: 371 cttgctcagcttgctttcttatagaacctaagattactaccagcccagag-atggcacca 429
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Sbjct: 570 cttgctcagcttgctttcttatagaacctaagattactaccagcccag-gcatggcacca 628
Query: 430 cccacgaggtgtcctcccccctctaccactaattgagaaaatgtcttaaaactggatccc 489
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Sbjct: 629 cctacgaggtgtcctcccccctgtatcactaattgagaaaatgccttaaaactggatccc 688
Query: 490 atggaggcatttcctcctttctctgagataactccagcttgtgtccagttgacacaaaac 549
||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
Sbjct: 689 atgaaggcatttcctcctttctctgagataactccagcttgtgtcaagttgacacaaaac 748
Query: 550 cagcaagtacaatagataacatcaacttctttgttctttcctaggtcacaaattttctag 609
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 749 cagcaagtacaatagataacatcaacttctttgttctttcctaggtcacaaattttctag 808
Query: 610 taccttgttaaggtcttaagattttgaattgtcatttattctacctcattgacttaaccc 669
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Sbjct: 809 taccttgttaaggtcttaagattttgaattgtcatttattctacctcattgacttaaccc 868
Query: 670 ctagtttagactgcaat 686
|||||||||||||||||
Sbjct: 869 ctagtttagactgcaat 885
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
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Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
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Number of extensions: 2
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Number of sequences better than 10.0: 1
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Effective length of database: 1076
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Effective search space used: 728452
X1: 8 (15.9 bits)
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X3: 517 (999.5 bits)
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S2: 8 (16.2 bits)
| Query= MSMg01no237_c02.g1 MSMg01no237_c02.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no237_c02.g1 PHD_FILE: MSMg01no237_c02.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 20:54:52 2005
(172 letters)
>mm_chr8_69498525_69499096
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Query: 1 atttctgtttctcactgcttcctagtttaagatgcatacatcatgcagagtgagtttcct 60
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Query: 61 taaggtctctgtgtaggactcatataccaattctgctgtcatat-atatatatatatata 119
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Sbjct: 240 taaggtctctgtgtaggactcatataccaattctgctgtcat-tcatatatatatatata 182
Query: 120 tatatatatatatatatatatatatat 146
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Sbjct: 181 tatatatatatatatatatatatatat 155
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Strand = Plus / Plus
Query: 101 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 142
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Sbjct: 155 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 196
Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
Identities = 42/42 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 103 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 144
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Sbjct: 155 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 196
Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
Identities = 42/42 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 105 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 146
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Sbjct: 155 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 196
Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
Identities = 42/42 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 107 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 148
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Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
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Strand = Plus / Plus
Query: 109 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 150
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Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
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Strand = Plus / Plus
Query: 111 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 152
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Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
Identities = 42/42 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 113 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 154
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Query: 115 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 156
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Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
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Query: 117 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 158
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Query: 119 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 160
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Query: 121 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 162
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Query: 123 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 164
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Sbjct: 155 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 196
Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
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Strand = Plus / Plus
Query: 125 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 166
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Sbjct: 155 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 196
Score = 81.9 bits (42), Expect = 2e-20
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Query: 127 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 168
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155 atatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 196
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 67
Number of extensions: 56
Number of successful extensions: 56
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 44
Number of HSP's successfully gapped: 19
Length of query: 172
Length of database: 572
Length adjustment: 8
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Effective length of database: 564
Effective search space: 92496
Effective search space used: 92496
X1: 7 (13.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
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S2: 7 (14.3 bits)
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