BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-267D01.T7 (MSMg01no267_d01.b1) | MSMg01-267D01.TJ (MSMg01no267_d01.g1) |
ACC | AG407980 | AG407981 |
length | 2,082 | 738 |
length of high quality (start - end) | --- | 293 (76 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no267_d01.b1 PHD_FILE: MSMg01no267_d01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:05:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no267_d01.g1 PHD_FILE: MSMg01no267_d01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:05:11 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GTGCTGCAGATCGAGTTATCCTGACTTNNTATCACCACCAGCACTCATCT
ACGCGTACTGCTGTTCGTTACGTNCTCACAACACACGATATGATATATAT
CTGCGACTGTAGCGCTCAGACGTATATCTACCATCGAGACGACGTAGTCT
GCTGTATATCATAGTGTAANCATCTAGCGCGTGCGAGTACGGCGCGTGTA
GTCAGTTTTCACCGAGGCGTGTCCAGTCTATACGCAGGAGAAGCAGATAC
AGACTATACGACCAGGNCGTCATACACACACGCGCGCATGATGGTACTNA
TCTTCACTCATTTTGGCGCGTTCTTNGTAACGCGGCGTACCGCAGCTATA
TGCGCTCGTACTACACGTTACGCACGACGCCTGACATAGCATATGATCAG
ACATTATATACTCACTATCTTATNTANCGTGCGCGACNTCAGGCGCGCAC
TGACGCGATGTGCACGCACACGAACACAGTGATCATTGCTACTCTCATCT
NTACGCTCTACTACCACGCATGACANAGTCTCACACGCGCTGCGTCCCAC
TCGACTCGCGCTANACTTACTGATCAGTACTCNCGTCNAGGTCGAGTCTA
CTATATACACGCGATCACGTCTATATCTCACTATCTCATCTCGTCGCCTC
TATATATCNTCTATNANTACTATTACGTAATCGATACACCAGCCGTCGAC
TACGATCGCTTTACTTCCACGCTCCNATCATCATTACCGTGATAGTTATC
ATGTNTATGTATAACTATCANTGGCGATCCGTCTATGTATNTCGCGCGNA
CTCACNTGCTAGCGACGTACCTATTATGCTCGACGCACCCCCATCGTGGC
TGGATGTCATCAGCATCGCGANCGCCTGCCTGANANANTANTCACATAGT
ACGANGACTNATGTAGGCTCGGATCGTGCACGACTAGGAGAGTCGCGATA
TTGTCGAAGTCNCTCGNACACGTCATCAGTCGTAGCGTATNCTATATTTA
TTGTTGATGTNCNGTGACGAGTGTGCGCGACGAGCGCGTCACATCGACAC
TACGTAACGATGNTCACTGATNGNAGGACGGANANTGGTCNGCGAGAGNA
GCGAACGTNGTANATGAAAATNGATAGCTANCGACTGATATGACATGCAT
TGCNGCNTGNACTACCGCACCCACGCNAGACGAGCGTCGTATTANTACTA
TCGACGCTACGGTACAACTNAGCATCACATGACCGTCGAGTATAGTGCAG
AGACGATCATCGATCGCATGAGTCAGACGTCGCCCGACACGTCGGCAGCC
GCAGCGGACGAGACNACTATCGTCGAAATCAACTACGTCGCAGAAGNGTA
GCGCTGGTGCTCGTGACTGCAGCATCGCACACGATCAGACGACACTGAGC
TCTNAGNTACTGTNACTGTCATCAGCGTAGCTCGTTNCGCAGCCCNTAGC
ACAGTTGTATCTACTGCTATATGACTGTATAGCAGATGCTNCGAGTNGTA
AGCTTACGAACAAGACAGCATGATCATAATATATGTATGCTCATAGTCGT
ACTACGACTANTCGCATGGACGAGNCATGTACGCTCAACGTATATATAGA
CGAGAGAGATCACGAATATACGAGCTCGACGNTCTATCGATAAAAGCAAT
AATGAACGCTACTGGTACACACTTCAGNTACACACACGACCTAGCTGNAT
CAGANGTTGATATANGTGTGTATAACTTATATCTAATCACNGATATCACA
GACTAGACTAAGGTGAGTATGATATAGAGTACATCGCAGCGCAATACTGA
TCGAGACTCGTTTAACACTTACTATCGAACACAGCTCAGGTATACTGTCA
GGATCAATTGCGACAAACGTCATAGCATACATCTTNGTATATGATCNCGC
GTNGCTGTCGCGATCGCGCGGCAGATGACATATACGTACTATACGACTTN
GCTGTCTCATACCGACGTCTTATCACANCAACACGCACAGTCTGTATCAC
GTGGTNCGATCGTGGNATCTAGCCGCGCGCGCGATGAGCAGTAACTGGTA
TAGTATATCTGATCGATAATCGACAGCAGAAN
| CGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAGGACTTGGGAGGCTGAGGCAAG
ATGGCAGAGACTTCAGAGGCAGCTTGAACTGTATAGTTAGAGGCTTTCTC
GAAATAAATAAATAAATAAATAAATAACTCAAGTAGCGCATTCAATGACC
AATGGGTAAATAAATAAATAAATAAATAGAAGGAAATGTCTGAAAAACTA
CAAGTGCGATTTAATACATCAGACTCACTAACCATGAAAAGTATAAGTTG
ATGGAAAGGAAGCATTGTCCAGGTCTTGACAGGACCCTTCAAACATTTTC
ATGAGTCTTCCCACCCTTTTTTATTGCACACCCCCCTAACTTGGCTTAAG
CAACGAGCAACATACTGAGGAGGCACTGGGTGAAGATCCTGGAGCTTATA
TTAATTGGGAGCAAAGTAAACAGGGAGGGAGGCTACTTAGGAAATTATGC
CCATAGTGAAAATGTAGGGGTGGCTGATGGACCTAGATAGTAGAACAATT
AGAATGGGGACAGGCAGGATAGTCTCTCTCAGCAAGTGTAGAAGAGACAG
ATAAGGATGCTTATTGGTTAAATTGTGGGTCTATTTGCCTAGAGCTGCAA
CAAGGAGAAGTCAGCGTCATAGTTTAAAAGCCGTGAGTTTTCCCTTTTTT
TCTGGAGAACAGTCTACTAAGTGAAGTTTAAAAGAAGT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 10 10 6 6 6 6 6 6 7 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 9 9 3 0 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 7 8 6 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 8 3 0 3 10 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 11 9 9 9 9 7 7 7 6
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 9 10 8 8 8
7 7 9 8 6 6 6 6 7 6 8 10 8 8 8 8 8 8 3 0 3 8 10 7 7 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 10 8 8 8 8 6 6 6 6
6 6 6 6 6 10 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 6 6 6 6 6 6 6 6
8 6 8 6 8 6 6 8 6 6 6 8 6 6 6 3 0 3 9 8 6 6 6 6 8 8 12 12 11 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3
8 8 8 13 14 11 12 8 8 8 8 8 6 10 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 10 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 7 7
7 9 9 9 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 9 9 11 9 7 8 7 6 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7
8 8 6 8 8 8 6 7 8 8 8 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 6 8 8 10 13 18 13 11 3 0 3 6 6 8 8 8 11 9 8 6 6 6
8 8 10 10 9 9 9 10 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 13 11 9 9 10 8 8 8 6 7 7 6 8 6 9 9 9 9 11 11 11 9 9 3
0 3 6 8 8 11 9 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8
8 8 7 9 9 8 6 6 6 8 6 8 3 0 3 6 6 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 9 3 0 3 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 9 9 9 6 6 6
6 6 10 11 11 10 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 10 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 7 6 6 8
7 7 7 8 8 8 8 3 0 3 9 9 12 3 0 3 0 3 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 9 9 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 10 10 8
7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 11 6 8 8 8 11 9 9 10 9 8 8 6 8 3 0 3 7 9 10 11 6 6 6 6 6 10 15 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 9
11 12 9 3 0 3 8 8 8 11 8 8 6 6 6 6 7 6 6 3 0 3 6 6 6 10 11 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 6 7 3 0 3 9 6 6 6 6 3 0 3
6 8 6 6 3 0 3 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 7 7 8 6 8 8 8 8 8 11 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 9 3 0 3 8 8 8 10 9 9 9 9 9 3 0 3 0 3 0 3 3 0 3 9 9 9 7 8 8 8 8
6 6 6 3 0 3 9 9 3 0 3 7 6 8 6 6 6 6 9 10 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 12 12 15 12 12 11 11 9 9 9 12 14 12 8
8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 9 9 3 0 3 10 10 10 10 11 11 9 7 6 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 12 3 0 3 10 10 8 8 8 9 8 8
8 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 13 12 14 8 8 8 8 8 8 11 12 15 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 11 11 11 9
9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 6 3 0 3 0 3 8 8 8 6 6 6 3 0 3 0 3 9 9 9 3 0 3 8 6 6 6 6 3 0 3
16 10 8 8 8 11 8 3 0 3 10 3 0 3 8 6 6 7 7 6 3 0 3 6 8 6 6 6 6 3 0 3 16 12 10 9 9 10 12 10 8 8 8 8 10 10 8 7 6 7
6 9 3 0 3 3 0 3 3 0 3 6 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 3 0 3 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 7 3 0 3 6 6 7 15
8 7 7 8 8 10 8 8 8 6 6 7 8 8 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 8 6 6 6 8 10 6 6
6 6 8 10 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 15 11 11 10 8 8 10 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 9 9 9 8 11 9 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6
8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 10 3 0 3 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 9
9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 9 9 9 6 13 6 8 8 8 8 6 6
6 6 3 0 3 3 0 3 11 11 11 11 3 0 3 7 8 10 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 6 6 7 3 0 3 6 6 6
10 11 10 10 15 11 9 9 9 9 9 9 9 6 8 6 6 6 6 10 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 7 7 3 0 3 8 8 8 3 0 3 8 7
6 6 6 7 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 8 6 6 6 6 6 7 8 6 6 6 8 8 9 8 15 8 8 8 9 9 9 11 9 7 7 7 8 10 8 8 6 6 6
6 8 8 6 6 6 6 8 6 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 9 9 6 6 6 6 6
6 8 8 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 9 12 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 9 12 12 9 9 7 7 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 8 8 7 10 9 11 8 8 6 7 6 6 6 6 8 8 9 9 9 7 7 8 3 0 3 8 8 8 8 9 9 11 8 8 6 6 6 8 10 9 10 9 3 0 3 8
8 8 11 3 0 3 6 6 6 6 10 11 11 3 0 3 13 11 11 9 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 8 8 6 6 6 6 10 10
10 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 10 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8
10 8 6 6 6 8 9 9 8 8 7 6 6 6 6 6 8 10 8 7 6 6 6 8 6 6 6 7 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 8 10 10 11 11 11 11 9 9 3 0 3 8 8 8 6 6 6 6 8 3 0 3 7 8
8 3 0 3 6 6 6 9 11 9 8 6 8 8 10 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11 9 9 9 9 9 10 10 10 11 11 9 10 15 17 23 18 11 6 6 6 6 8 3 0
3 11 9 11 10 10 10 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 10 11 11 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13 19 9 8
6 6 6 8 3 0 3 8 8 8 6 7 7 8 3 0 3 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 8 9 8 8 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6 8 8 8 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 11 12 3 0 | Open.Hide. 7 7 7 8 11 11 9 8 7 7 9 9 18 19 37 37 43 39 39 41 42 42 42 48 48 48 53 57 50 53 53 53 53 34 27 23 15 11 11 16 22 28 29 27 19 11 11 21 23 43
48 54 54 54 34 21 10 10 10 21 21 33 26 24 33 33 37 44 39 35 41 48 48 50 48 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 68 68 57 59 57 57 44 43 42 37 37 43 44 43 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57
57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 68 59 59 57 59 50 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 47 59 44 44 43 36 36 43 43 48 54 54 54 54 54 50 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57
50 53 53 57 57 57 59 59 59 50 50 47 39 37 21 23 12 12 12 12 14 12 12 11 12 9 11 13 8 8 8 8 21 25 18 12 11 6 6 6 8 15 17 43 46 50 50 48 59 48
48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 59 59 50 47 41 34 28 23 19 23 11 11 11 15 15 18 21 12 13 19 30 34 59 59 59 59 59
57 47 46 43 43 43 43 59 43 57 57 57 50 50 59 59 59 50 47 47 44 41 39 37 37 43 43 44 59 59 50 50 48 48 48 48 59 59 59 59 59 47 47 50 50 50 53 57 57 57
48 48 48 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 46 46 43 48 40 43 37 46 46 57 57 54 54 54 48 47 48 48 48 43 43 57 57 59 59 59 59 59 59 57 43 43 47 50 48 43 39
35 30 39 39 41 39 37 37 37 37 37 37 37 47 44 39 30 30 37 37 25 28 13 13 19 28 34 43 28 30 21 32 37 47 47 59 59 37 34 23 21 21 28 30 37 37 37 37 37 37
59 41 39 39 21 21 19 19 28 34 41 59 59 39 37 31 31 37 37 44 47 47 41 41 36 36 36 43 59 48 47 59 59 59 59 59 41 37 32 43 31 31 31 28 28 22 22 17 28 28
41 43 44 32 32 23 23 23 32 32 36 39 43 43 43 40 40 40 37 37 30 30 25 11 9 9 9 9 9 25 31 32 22 16 11 12 11 19 27 37 37 41 39 41 41 39 39 39 39 39
37 35 35 28 28 25 21 18 19 24 24 30 28 36 39 37 41 32 29 31 32 37 37 37 37 41 37 37 41 31 25 25 20 25 20 29 25 22 |