BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-279K09.T7 (MSMg01no279_k09.b1) | MSMg01-279K09.TJ (MSMg01no279_k09.g1) |
ACC | AG416955 | AG416956 |
length | 740 | 738 |
length of high quality (start - end) | 689 (47 - 735) | 282 (77 - 358) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no279_k09.b1 PHD_FILE: MSMg01no279_k09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:20:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no279_k09.g1 PHD_FILE: MSMg01no279_k09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:20:18 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CAATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCAGTTTATTCTAGCCTTGATCAACATAACTTCTTACTATAATGCT
TTCTGAACTAAGTGATAATCTGTAGGTTTTGTTGTAAAATCAACATATTT
TAAGACTAAAATTAATATTTCTTTCTTTTTTATGCTTACATGATAAGTGT
AAAATATTTTGCTTCTTTTATATATAACTAATTAAAGGTTTAAAGACAAT
GCCACTCTTTCTGGAAGGCTATCCTGAACCTGAATCAATCATATACCAAA
GTGCAAAATAAAATGTTTGAATGATTTAAGACTGTAACTGTAATAGAATA
CAAACACCCAGAGTTCTTGAGACCTGAGACGCTTTCTGGTCTCCATTTGT
TAAAAGGTCTCATTAGTCCACGAGACTAATCATTTAGCCCTTAGTGCACA
AATGATGATCTGAATTAAATCCCCGTGCACATGATGGAAGGAGAGAACTC
ATTCACAGAGGTTTACCTATGGCTTTATGCTTGTATTCCTAAACATATAT
GTGTGGATACACACACATACACACATACACACATACACAAACGTCAACAA
CAATATAGGTACGTTAAAAGTACGCATGTCTCTTTACAACGAGAAAATAG
AAATGAGCAAAAGTAGTATTTATTAGGCAGTTTGTAATACTAATGATAAG
GGACATCGCAATGTTTCTTAATACATTTTCTATCAAACAC
| CGATGACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATTTTCTTAACAACTGAATTATGA
TCCATTGTGTAAATGTAGAATATTTCTATCATCTACCTATCAGTTGACAG
ACATCTTTTTGGCTTCATTATCTTGGTCATTGTGAGTAGAGCAGCAGTGA
TCATCATTGAGCAACCATCTTTGTAGTAGCACATAAAGTCTCTGTGGTAT
GCGCCTAAGAATGAGATAGCTATACCATGTGCTCAATAATTTCTAGATTT
TGAAGGGAAAATTACATGAATAATGTGGTGGCTGCATCTGCTACATCCTG
TAGCCAGGTTTGACTTGCAGCGGAGGGATAAGGACACCAACCCACTCACA
AAATCTTTGATCCCCAATTTGTCCTGCCTACAATAAGTCCAGGGACAAAA
ATGCAGAAGAGACTGAGGGAAAGGCCAACCCATGAGTGGCCCACATAGAG
ACCCGTCCCATAGGCAAGAACAAATCCCTGTCACTATTAATGATACCTTG
TTATGCTTGTAGGCAGGAGCCTAGCATAACTGTCCTCTGAGAGGCTTCAC
CCAGCAGCTGGCCAAAACACATGTAGATACCCACAGCCAAACATTAGAAA
GAGCTCAGAGAGTCCTGTGGAAGATTTGGAGGAAGGATTAAGGGACCTGA
GGATAATAGAAACTCCACATAAAGACAAACAAAGTCAA
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 9 13 28 37 34 33 32 32 28 28 30 30 30 30 33 37 37 37 37 46 26 22 19 16 15 12 22 12 6 6 6 8 10 19 31 59 30 28 22 24 24 35 41 57 57
38 38 42 42 42 47 47 47 26 26 23 23 22 11 11 11 11 18 27 43 57 68 68 47 50 50 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 50 50 50 33 43 21 21 18 38 44 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68
68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 48 57 57 57 57 57 59 59 48 48 48 57 57 57 57
57 57 57 57 59 68 59 59 57 59 59 57 48 48 50 50 50 57 57 57 57 57 57 59 48 59 59 59 48 48 46 46 42 41 37 37 32 29 29 37 43 44 47 47 47 50 48 48 48 48
48 57 57 57 57 57 48 48 57 57 57 50 47 47 48 48 48 48 47 41 47 59 59 43 35 31 31 43 43 44 41 36 43 41 41 41 41 41 42 48 48 48 42 47 47 47 41 41 41 37
34 34 31 37 37 37 37 37 32 31 31 41 43 47 47 59 41 41 41 34 31 37 37 37 39 59 59 59 42 41 41 31 17 9 9 9 9 15 12 9 | Open.Hide. 6 6 6 13 14 9 11 10 10 23 17 28 28 32 37 31 31 44 37 37 37 37 37 39 50 50 50 50 39 36 36 32 32 32 39 39 37 43 37 33 36 36 37 42 57 68 68 68 57 48
50 50 50 50 50 68 68 44 44 37 36 23 23 36 36 41 48 59 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 57 57 68 68 57 57 51 50 50 50 50 50 68 51 50 51 51 51 51 68 68 68
50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 28 21 21 21 32 37 37 50 57 57 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 54 54 54 54 54 54 59 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 41 37 32 25 21 13 11 10 10 10 13 15 23 30 31 21 15 10 10 10 10 11 15 12 15 16 26 26 30 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 57 57
57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 48 47 41 42 43 43 46 46 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68
68 68 57 57 59 59 59 59 68 59 59 59 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 57 57 59 68 68 59 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 54 54 47 57 57 54 44 44 32 32 32 42 39 57 59 59 54 54 54
57 57 54 54 57 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 57 59 57 57 48 48 48 57 57 47 59 43 47 47 41 41 41 41 41 39 41 37 36 41 39 41 41 41 34 34 25 25 34 41 34
48 48 48 48 37 37 21 28 14 23 23 37 37 47 43 39 32 32 25 29 32 25 28 15 21 21 27 28 41 41 41 37 31 30 24 22 25 22 20 28 30 32 24 24 25 24 21 28 37 30
25 25 32 37 37 37 39 39 39 39 31 26 35 28 21 13 13 12 22 22 36 36 37 25 25 11 11 11 25 28 32 31 40 28 23 12 11 11 |