BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-294K16.T7 (MSMg01no294_k16.b1) | MSMg01-294K16.TJ (MSMg01no294_k16.g1) |
ACC | AG422780 | AG422781 |
length | 712 | 711 |
length of high quality (start - end) | 318 (45 - 362) | 289 (75 - 363) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no294_k16.b1 PHD_FILE: MSMg01no294_k16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:30:24 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no294_k16.g1 PHD_FILE: MSMg01no294_k16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:30:24 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (115,323,643 - 115,323,957) | (115,367,484 - 115,367,769) |
---|
sequence | TGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCCTAATAACTTGTAAGGAAACAATGTTATTCTTTCTAAGAGAGGCAG
AGAAACTGACAACAGCTACAAGTGCAACCATAAAGCAAAACAACACACAG
AACCACTGTGAGGTTGAAAAACCTCCAAATGTAGATTTGTCTTGCAAGTT
ACAGAGAGTAAATCTCTCTAGAGAGATTTAAAGGTTTGGCTGCCACCCAC
CCTCTGGGGTAATTAAAATCTAAGGATTTGTGACCTCCCTGATACAGATT
TGTTACATTCCAGAGCCACAGTTCTTCTCACTTTAGGGAGGGGGAGGGGG
AGAGTCATCCTGTATAAGACCTGCATCTCACTAGTCAGAGCTCTTGTCTT
GGGATTCTGCTGCAGCGCACACACACAAGTGCATCTGACAGTGCCATGGC
TTGTGAGAAACTGGAATGTGAGAAACCTCAGCTGTTAAGGTTCCCTGTGA
GAAACGGTTCCCAATAAGGAGTACTTCCAGGTCAGTTAGGACAGGTAGGT
AGGTAAGTAGATGACAGTAGTAAAAGACAGGTCAGTACTTGATAGATGAT
AGATGTATAAATAGTAAATGAATGTGTAATTGATGACAGATAGATGATAG
ATACATAAATGATAGATTATGAATGTGTAGATTAGTGATAGGTAAATAGG
ATGATGCCCTTT
| AATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAGAGATATCTATGTCCATTTCCTGA
CGGAGCTTCTAGTATGGTATTAAGAGAAAAGTTATATATTTCTTCCAAGT
CTACTTTATGGTTTCTCTACTCTTAAATAAGTCAACTGAGTGGCCACAAG
TCTGTGAGTAGAATATCTATCAGGGTGCTTTCGTTGTGGAAGCTATTCAT
TAAATTTGTTTTCAGGGAAAGAATAAATAATGAAAATAATGAGGACATAA
ATTTATTAGAGACCTAAATATGTCTTTGTCAAATATGTCACTAGCAAGCT
CATTTCTTTCTTTTTTTAGATGCTCCCCACATTGTTAGGCAGCTAAAGGT
GTAAGTGGGGGGGGGAATAGCCGAAAAAATTTGTTCTAAGTATAGCCATT
AGAAATGTCTGGGTTATAATTTCTGATAATTTATCATTTATCCTGCCTCA
TCATGTCTCTGAGTCTTTGTTTACATTAAAATGTATGAGCAGGGATCAGA
TAAACGATAATCCTTGAACTTCATGGTCTGTAACATCTGCAAAAGTAATT
AGCAAAGATGCAAAAGAAAATGGAACCCATGGAGAGGGATTCCAGCCTGG
TGCCCAGCAAACACTGAGTCAATGGACATTGTAAAGTAAATTATCAGAAG
AGCACAGATAA
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 8 9 17 41 59 43 37 37 37 31 31 30 30 30 30 33 33 37 39 39 43 31 24 28 28 28 35 43 53 50 50 50 57 57 57 59 42 42 32 33 33 42 41 68 68 47 47
47 42 50 48 57 57 54 48 48 48 47 47 43 46 43 47 59 48 48 48 57 48 47 47 47 47 42 44 43 43 43 57 57 57 57 57 57 54 44 42 32 32 33 42 35 43 43 50 50 57
57 57 57 57 57 57 57 57 50 52 52 52 52 52 52 52 52 50 36 32 20 27 27 35 42 42 52 52 52 54 57 57 54 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 52 52 45 52
43 44 43 52 52 57 59 52 52 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 43 44 43 57 57 57 62 62 62 62 57 57 43 43 35 43 43 57 57 57
57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 52 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 52 52 52 57 52 57 59 52 52 52 57 57 68 57 59 57 57
57 57 57 52 43 43 43 43 52 57 52 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 43 43 43 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 48 48 48 57 59 59
57 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 57 54 54 54 54 59 59 43 43 43 42 43 43 43 43 43 43 40 43 39 43 43 48
48 48 44 59 39 25 25 12 15 15 11 10 8 8 8 8 8 10 15 23 12 12 12 11 11 11 12 15 12 14 12 23 18 28 32 39 59 59 41 41 39 43 47 43 43 39 43 43 32 32
20 32 32 57 57 44 43 39 35 32 28 34 28 23 23 23 32 32 34 34 31 31 32 32 23 21 14 13 13 13 13 13 13 31 30 46 39 43 59 59 34 25 21 13 13 13 19 26 30 30
36 41 43 28 28 14 15 14 30 27 37 37 28 28 28 37 37 30 28 30 25 28 28 40 40 48 39 32 28 23 23 23 37 33 43 36 36 20 20 18 20 23 37 37 40 40 35 37 37 32
28 28 37 37 39 43 36 36 36 43 39 40 40 39 37 37 31 36 29 33 30 30 32 37 34 47 37 35 28 37 28 30 28 28 28 25 22 18 18 17 25 29 42 42 42 30 30 30 40 40
43 43 43 43 37 43 31 31 25 29 29 44 42 47 47 47 36 36 23 25 23 36 30 44 22 19 15 15 13 25 25 47 28 32 12 12 15 21 24 24 34 32 30 29 29 29 29 42 27 22
12 11 12 25 24 28 28 18 18 13 11 11 10 17 17 28 31 31 33 29 25 19 19 14 12 12 13 12 14 16 22 30 36 31 20 23 11 11 11 20 12 12 12 21 15 18 17 17 14 18
18 14 12 9 9 10 11 19 17 14 7 6 8 8 10 10 11 11 13 13 21 17 13 13 8 8 8 8 8 10 10 11 9 12 9 9 8 8 8 8 11 12 20 19 19 23 18 15 16 15
11 14 14 8 8 8 8 8 9 11 11 11 | Open.Hide. 6 6 8 8 6 6 8 15 17 28 30 32 41 32 32 44 37 37 37 37 37 39 48 50 50 50 57 53 48 48 48 48 48 57 48 43 33 32 36 36 42 42 57 68 68 57 48 48 50 48
50 42 47 50 50 48 48 48 50 42 48 36 36 41 48 59 68 68 50 50 50 48 48 37 35 35 35 35 35 42 42 41 50 47 47 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 59
57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 57 36 38 27 10 8 8 8 19 22 43 23 32 43 50 52 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 45 57 52 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 45 57 43 57 52 43 44 35 35 35 43 43 52 52 52 57 57 57 57
52 57 57 52 52 52 57 43 43 39 28 28 43 43 57 57 57 57 57 57 57 52 52 45 52 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 43 52 52 52 59 59 59 59 57 52 52
57 52 52 54 52 59 57 54 54 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 48 48 48 48 54 59 57 48 48 48 57 57 57 59 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57
47 47 47 59 59 57 44 37 23 23 36 44 48 48 59 48 54 57 47 59 47 48 48 48 48 59 59 59 54 54 54 59 57 57 57 57 48 48 48 53 48 53 53 50 50 57 59 59 59 59
59 59 47 47 47 59 31 31 14 14 13 19 15 15 12 11 11 11 11 11 12 12 12 12 11 12 11 10 10 10 10 12 21 28 32 59 59 59 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 36 36 39 39 33 26 21 12 10 9 9 9 9 10 10 9 9 10 12 21 28 30 23 13 8 8 8 10 10 15 13 13 13 13 12 21
12 15 26 32 43 48 48 48 48 57 57 57 59 48 57 57 57 57 57 59 48 48 48 48 48 54 57 57 59 59 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 54 54 59 59 68 68
68 68 57 57 57 59 59 59 57 43 43 36 43 43 43 59 59 59 59 57 57 57 57 48 57 57 57 59 48 48 48 48 48 48 48 46 46 46 47 43 43 39 37 37 39 39 39 47 47 47
59 48 59 59 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 39 39 41 42 47 47 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 59 59 48 43 43 43 43 48 48 48 48 44 43
36 37 43 43 59 47 47 37 34 30 24 25 34 36 41 41 36 39 41 39 39 37 31 37 32 28 28 32 37 37 37 37 41 41 41 37 22 29 28 28 27 24 29 39 39 34 32 39 31 31
37 37 31 29 34 30 30 33 36 31 37 41 41 39 41 41 46 34 34 33 33 36 37 31 31 35 37 37 31 24 25 24 18 20 22 22 22 24 22 23 20 14 18 13 17 13 18 15 20 26
30 34 32 35 32 32 28 22 26 18 18 |