BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-323L03.T7 (MSMg01no323_l03.b1) | MSMg01-323L03.TJ (MSMg01no323_l03.g1) |
ACC | AG442045 | AG442046 |
length | 1,231 | 1,243 |
length of high quality (start - end) | 658 (90 - 747) | 623 (136 - 758) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_l03.b1 PHD_FILE: MSMg01no323_l03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:32 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no323_l03.g1 PHD_FILE: MSMg01no323_l03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:07:32 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCCATTCNNNNNNNATCATTGGGCGCTAAGACTCCTATGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCCACTGTGGAGAACAGATTCTTTAATATTGTAAAGGCTTTG
AGCATGAACTATGACAGCCTAGATCTCTGGAGGGATAATATTCTGGAGTT
AAGCACATAGAAACAAGTATTCTGTGTCAATGTTGATTTCTATGGCAAAA
ATTCTTAGACTGAGTCACTTGTAAATAATCGAAATTTGCTAATGCTGCTA
CTAGAATTTAGATAATTCACCAATGAGGAGGTAATAGACTTGATATGTAG
TGTGGCTCATTCCTAGAATTGGGATAATTCTAGAAGGTGTTTTTTCTGTG
CCCTAACAAGGTAGGATTCTGTAAACATCCTGACATGCCTCTTGTAAAAT
TCCTATTCCTATTCAAAAGAACCCTTGACTTATAATGGAACAGTCCCCAC
CCCCACCCCCCAAAAAGGGCTGCTAATACTGCACTGGCGTAATAATTGCG
CTGGTGTCAGAATTTCATTATATGAACTTAGGACAGAAAGAAAGATTATA
GCCTAGTGTGACTATAGGAAAACATCCATCATAAGTAGCAAAGACAGGAC
GTTGGGGATTCTTCTCGACAAGGAATGTGCCAGCTCAATTCAGCACCATT
TGGTATCCTCATAGGTCTTTGCTTATTCTATTATATTAAATGTTAATTTT
TCTCTCTTGTTCTTTCTTAAAAGTTTAATTTGAATGTATGAATAAGACCC
CGCNCCATTTTGATTTATCCCCGACCCAATAAATTGAAGAACCTACTCAC
TGAGTAATATAGAACGATATGTGTGTATGCTACTATAGCAACGTTAATTA
TATATATATATACACATATATATATATATATATATACATATATATATATA
ATTTACCCTACTCATACANAATACCACATTATCGTTTCATATACCACAGT
GAGTAGTCTCTTCCATTTTTTCATTCAAAAAAACATCCCCTTTTTGGTAG
GTTTTTTTCTTCCTTCCAATTACATTTCAAAAAAGACCAGAGAGAAAAAT
TTTCTTTTTTATATAAAAAAACCCATACCTTTTTATAATCCCACGGGTCG
TATTTTTCTGTCTATTTTCTTTTGAAAAAAAAACCAGACACTCTCTTTTC
TCATTATGAGGATTTTTCTAAAATACAAACATAAAACTTTTTTCTCTTCT
TCCCTTTTTTATAAATTCTCTACCGCTTCTT
| NCCCAGTCTNNNNNNGATGATGGAGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTTAAAGTCCCCGCTGGGGAAC
GAGAGNACCAGGGAGTACCGTTAAACGAGCCCCCTCTGGTCTTGAACTTT
CTAAGGAAATTCAAGACAGTCTATCAGAAGTAAAGTGGAATATGTTTGGC
CTTGAATTTTTTCTGGTGTTAGGAGCCCTTTTGTTCCTTTTCACATGTTA
TCAAGTGATTAAGATAGGGCTGAAAATTCTAGAGGAAATTCAGGACAAGC
TATCAGAAGTAAAGCGGGGAGAGAGAGTAGGAACAAAGAGGAAGTATACA
GGCCTTTCCAAGGGTCTTGAACCCGAGGAAAAGTTAAGGTTAGGTAGGAA
TACCTGGAGTTTTTTTAGAAGAAAAAGAGGAAAAAGGGAAAAGAAGAAAG
ATCAATTAGCGGAGGTCTCTAGGAAAAGGAGCCTGTGCTCATCGCTGGAT
GGGCTCGGGGAGCCAGCTCTTAGTAGCTCTGAAGCAGGTGAAGAATCCTC
CTCTGAGGAAACAGACTGGGAGGAAGAAGCAGCTCATTATGAGAAAAAAG
GGTACCAGCCAGGTAAAGTGCTAGCTAATCAGTTAAGGAAGCCAAAAGCG
GCTGGCGAAGGCCAGTTTGCTGATTGGCCTCAGGGCAGTCGGCTTCAAGG
TCCGCCCTATGCGGAGCCCCCGCCCTGCGTAGTGCGTCAGCCCTGCGCAG
AGAGGCAGTGCGCAGACTCATTCATTCCCAGAGAGGAACAAAGGAAAATA
CAACAGGCATTTCCGGTCTTTGAAGGACCCGAGGGTGGGCGTGTCCACGC
TCCGGTAGAAAATTTACAAATTAAAGAAATTGCCGAGTCCGTTCGTAAAT
ACGGAATCAATGCTAATTTTACCTTGGTGGAGTTAGACAGGCTCGCCGGC
ATGCCACTAACTCCTGCCGACTGGCAAAGGTTGTAAAAACCGCTCTCCCT
AGTATGGGCAAAAATATGGAATGGAAAGCGTTCTGGACCGAATTTGCCCA
AGCCAAGCCCCAACAAACCCATTGTTTTTACTCCGAAACAAAAGATGGAA
TTTTTACCGTTTACGGTCAGGGAATTTTTCTGTTGAAAAAAAATTTCCTT
GGAGACTTTTCCCAAATTCTTCCCAGCATTATAGCCTGAAAGGCTCTTCC
ACCAGGGAAACTCTGGGTGTATCAACAAAATCCCCGGCTCCCT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 10 11 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 8 7 7 7 6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 11 13 8 8 8 11 8 8 8 21 19 18 22 18 22 22 42 42 47
43 43 42 47 47 47 47 42 43 43 32 32 32 30 28 28 29 29 31 31 33 33 33 21 21 8 7 6 6 8 6 8 8 10 15 15 17 18 13 18 18 23 37 48 57 57 42 38 38 42
42 38 38 42 38 38 36 36 31 31 31 31 33 37 22 14 8 8 8 8 9 9 10 21 25 33 33 30 21 19 12 13 13 13 18 30 35 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 47 47 47
51 68 68 68 68 47 47 47 47 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 51 51 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 44 43 35 43 43 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62
68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 62 68 68 68 62 62 62 68 68 68 62 68 68 62 62 52 52 52 62
62 68 62 62 52 43 43 38 38 26 38 29 29 15 19 34 34 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 39 39 43 43 43 35 35 35 44 43 62 43 43 52 62 62 62 62 62 57 57 52
52 52 52 45 45 52 52 52 43 43 41 42 43 52 52 57 57 44 44 22 18 13 13 12 38 27 45 45 43 44 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59
52 57 52 57 52 52 52 57 41 41 18 24 24 44 44 44 44 32 37 37 57 57 57 57 54 57 57 59 57 57 68 68 68 68 57 57 43 43 37 39 43 44 57 57 57 57 57 59 59 35
35 35 37 44 46 46 57 57 68 68 68 68 68 68 59 57 54 54 57 57 48 59 39 37 37 44 43 54 54 54 54 59 46 43 43 43 44 43 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57
48 59 39 39 35 36 33 33 36 33 33 48 47 47 39 30 28 28 34 29 36 39 37 37 37 37 37 37 48 43 43 48 57 59 46 43 48 57 57 43 40 28 28 28 40 40 48 57 59 43
39 35 35 39 39 57 43 48 48 48 47 47 42 28 25 10 10 11 14 22 32 44 47 47 50 50 50 59 59 59 59 41 37 28 28 21 21 30 34 47 37 31 31 43 36 41 44 59 59 59
59 47 47 47 47 47 39 39 37 31 36 41 43 43 41 37 37 30 27 28 32 32 32 32 41 44 41 41 44 39 37 28 22 22 28 30 30 30 37 24 25 27 39 41 21 17 6 7 6 9
9 15 3 0 3 8 8 9 10 10 10 10 9 9 12 9 9 9 11 11 25 8 8 8 8 8 15 21 32 41 31 28 30 28 28 26 26 10 10 9 10 10 11 19 41 30 30 17 17 15
23 25 30 37 27 30 22 32 22 24 13 28 21 31 32 39 39 39 39 39 35 35 30 31 30 30 30 39 39 48 48 48 48 48 37 37 20 22 11 11 11 18 15 17 17 26 26 28 32 37
37 59 47 42 50 50 50 50 50 29 25 10 10 8 8 9 22 27 22 22 22 34 32 43 43 43 43 43 48 48 48 48 48 30 34 14 14 15 27 29 39 33 36 33 33 33 33 33 27 23
14 15 9 11 12 9 9 8 8 10 7 9 8 9 9 9 9 3 0 3 12 12 11 9 9 9 9 10 10 10 8 8 10 10 10 8 8 8 10 13 11 8 9 9 11 11 11 15 11 11
11 18 22 22 11 12 12 8 8 8 8 8 8 12 15 18 18 11 12 12 15 13 10 10 9 11 14 11 10 19 8 8 8 8 11 11 13 10 10 11 11 12 10 17 8 8 8 8 16 11
12 15 10 10 10 8 13 8 9 9 8 11 8 6 6 6 8 10 12 8 12 8 8 8 10 8 10 8 8 10 12 12 14 16 13 8 8 8 11 8 8 8 8 8 10 10 8 10 15 10
10 8 8 10 17 23 24 11 10 8 10 8 8 8 9 16 10 10 10 11 8 8 10 12 10 8 8 8 10 8 8 10 13 10 10 8 8 7 6 8 8 9 8 8 8 8 8 10 12 8
8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 9 10 11 11 10 12 14 10 10 10 19 19 17 14 14 11 13 9 8 10 8 10 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 6 8 10 10 8 8 8 8
8 8 10 10 10 8 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 11 12 11 11 12 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 11 11 10 10 10 14 11 11 8 8 8 11 12 10 10 10
9 9 9 19 26 23 30 32 13 12 10 10 10 11 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 7 | Open.Hide. 0 3 7 6 8 9 11 9 3 0 0 0 0 0 0 3 7 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 8 7 8 8 8 12 11 8 6 9 8 8 8 14 15 22 10 10 10 11 13 10 12
19 28 30 35 36 36 37 37 37 34 35 38 38 38 36 53 41 50 50 50 47 37 23 23 9 10 9 10 8 9 9 11 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 21 21 25 33 37 39 37 37
37 37 23 23 3 0 3 27 19 22 9 9 9 9 19 16 13 14 9 10 10 10 10 10 12 16 12 11 12 12 14 13 12 12 12 19 23 27 37 37 39 44 44 53 53 53 57 57 57 38
42 42 42 47 47 57 57 57 59 57 57 50 54 54 54 54 50 50 50 43 43 47 50 50 50 57 57 57 54 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 54
54 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57
57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 47 47 47 47 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68
59 59 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 54 54 59 59 57 57 57 57 54 54 54 54 68 68 68 68 53 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 53 53 50
50 50 50 47 43 30 18 11 9 9 10 10 10 12 12 27 23 41 46 46 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 48 48 48 32 32 30 24 27 28 32 34 41 41 44 44 57 57 54 54 57 59 59 59 59 43 43 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 43 42 41 42 50 50 46 46 57 57 44 44 23 23 23 44 44 57 57 59 57 59 59 59 59 59 52 57 57 50 50 37 37 37 50 59 57 57 57 57 57 68 57 50 50 52 52 52 59
59 59 57 57 57 52 57 57 68 68 68 57 57 43 43 42 43 44 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 57 48 44 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68
59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 59 59 68 59 59 59 57 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 48 48 48 57 57 59 59 59 41
34 25 25 28 34 34 42 41 39 39 41 32 32 41 41 41 47 59 47 47 37 41 47 47 37 37 41 40 40 37 37 37 30 19 19 22 23 23 33 40 46 46 43 43 43 36 36 41 41 41
36 32 34 28 25 25 36 43 34 43 30 30 15 15 15 17 13 11 12 12 23 27 32 31 39 43 37 37 37 37 37 37 37 29 28 23 28 29 28 24 29 26 32 37 37 43 34 34 19 19
19 24 24 39 39 27 23 11 11 11 23 23 41 16 16 11 16 16 28 28 32 24 16 16 20 20 25 34 31 28 30 37 37 41 31 24 25 25 27 23 23 32 37 20 18 18 16 25 24 19
14 23 23 30 24 23 21 11 11 11 21 13 19 13 9 8 8 8 10 10 21 17 15 8 8 8 10 9 9 8 9 9 18 12 18 15 17 17 18 18 23 23 13 13 11 10 10 10 13 13
21 22 16 15 12 24 13 12 8 8 8 8 10 22 19 20 20 19 10 6 6 6 7 10 14 11 10 10 9 14 16 12 18 16 14 9 9 11 8 8 9 12 13 16 10 10 11 11 10 10
8 8 8 9 15 13 17 22 22 18 18 15 22 22 19 20 17 18 22 18 19 19 22 17 13 12 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 10 10 9 9 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10
10 13 9 9 9 9 11 12 15 22 9 8 8 8 10 8 9 11 9 9 10 8 9 8 8 8 11 8 8 8 9 9 11 11 12 17 10 10 10 11 8 8 8 8 8 8 10 14 17 17
9 9 9 9 9 9 15 14 24 17 12 12 10 10 10 9 11 8 8 8 10 6 8 8 6 6 6 8 8 8 10 9 9 7 8 8 8 8 8 9 11 10 9 9 12 11 15 9 8 8
8 8 8 11 11 11 18 22 15 17 17 18 14 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 7 6 7 6 6 6 8 15 10 10 10 10 9 9 12 12
15 17 20 15 12 8 8 8 9 9 9 13 11 12 12 12 11 9 15 11 10 10 10 10 13 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 15 10 12 10 10 10 6 6 6 6 8
6 7 7 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 11 8 10 9 8 8 8 10 11 8 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 8 11 11 12 10 15 12 17 11 10 10 8 8 8 8
6 6 8 10 9 9 11 13 15 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 15 14 10 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 8 8 6 |