BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-377I08.T7 (MSMg01no377_i08.b1) | MSMg01-377I08.TJ (MSMg01no377_i08.g1) |
ACC | AG482582 | AG482583 |
length | 777 | 782 |
length of high quality (start - end) | 405 (71 - 475) | 403 (79 - 481) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no377_i08.b1 PHD_FILE: MSMg01no377_i08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:17:43 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no377_i08.g1 PHD_FILE: MSMg01no377_i08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:17:44 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCGAGAGGATGCGC
GGAATTCCTATATTCTCATCAGGATTTTCTATATTGACCATGTTGACTGG
AAACAAGGCATTCTTTTCCCCAATAAGAAAACGTAACTTCTCAAGAGCCA
GGCATAGTGGTAGCATCCTTTCATCTTAGAACATGGGAAGCTGAAGAAGA
GGACCATGAGCTTGTTAACCTGAGCTTTATATTATCTCATAAAGTAAAAA
TATCAAAAACAAACAAAAATAACTTTTGGGATGTGCTTTCAATATACTTC
TGTGCTGTATTAACCTTATTTTGTTTTAGAAAAAATCTGCTTTAAAATGA
AAGTTTACCCTTGTTTATAATAAAATTGACTCCCTTGGCTGTCCATACCT
TCATGTGTATTGACAGAACCCTTTATACTTAGAATATCAATATTCACACA
CACACACACACACACACACACACACACATACATACATTCACACACACACT
ATTACTCTCTCTTATTGAGAGAGAGAGAGAATCTCCTTTGAAGTACACCT
TCATAATTACCCCTATTATTCACTGCTGATTCTAATTCCCTCTATCCCCC
ACATCTTATTACCAAAAATCCCTTTTCGAACTACAACCTGGCCCCCTTTA
TTCGTCTTGTTCCTTTCCTTTTGCCTTCCTTCTGTTTAACTCTCCGTTCC
TATTGTCCCCCTCGTTTCCCCCCCCCCTTTCCTCTCGGCTTCCTTTCCGC
TCCCCTTTCCCACTCGCGCCCCCTCCG
| NCCCCGATGCAATGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTATGGACAAATTTCTAATCA
TCTAGAAACACTTAAATAAATATCCAAAGTCCCTAGTCATTAAGGAAATA
CAAATCAAAAGGACTCTGATTGCCACCTTACACCATGAGATTTGCTAAGA
TCAAAAACCCAAGGGAAAGCACAAGTTGCTGAAGATGTGGAGAAAGGTGG
ACACTCCTATGTTGGGGGGAAGGGCAATCTTTTACAGCCACTCTAGAAGT
CAATTTGGCAGCTTCTCAGAAAAAAAAAGGCAATAATTTTACCTCAAGAC
CCAGCTACACTCAGTAGATGCTCTACCATCCCATAAAGACACTTGCTCGT
CTACATTCATAGCAGTCTTGTTTTTAAAAGCCAGAAATTGGAAATGACCC
AGATGTCCCTCAACTGAAGAATGGACACAGACAATGTGGTTCATTTACCA
AATGAAATACCCCCAAGCTAATGAAAACAAGGACATAATGATTTTTTGTA
GCAAATGAATAGGAAATATTATTATAAAATAATATTCCGGAGGGAGGGGA
CCCAGAAATAAATGGGATGTACTCCCTTATTAATAAAAGGTGTCTTAAGG
ACCGAAAAATCTGGGGTTAAATTTTTAGCCCACCGCAAGGTTTTAAAAAG
TGCCCTCCAAATTTTTTTTGGTATCTTTTTCCCCCCAACTATTTGATTCG
AATTTTTTTATCTATTTTCGTCCGCCTTTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 6 6 6 9 9 9 15 22 22 27 43 37 17 15 9 9 9 18 21 28 24 22 32 28 23 17 18 20 22 19 21 8 8 8 9 8 8 9 19 22 17 12 8 8 8 8 12 22
32 29 23 23 28 32 33 59 34 27 13 6 6 6 6 6 6 9 9 19 17 22 28 33 33 33 33 48 48 48 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 53 53 59 59 53 53 50 54 54 54
57 48 48 54 54 43 43 48 50 50 50 48 57 59 59 48 43 37 28 27 24 27 37 39 48 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 42 42 37 36 43 43 48 44 43 43 44
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 62 62 57 57 57 57 57
47 44 43 27 20 35 41 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59
68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 59 59 68 68 59 34 38 18 20 18 38 27 50 35 35 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 47 47 47 57
59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 59 59 54 54 57 57 57 57 59 59 57 54 54 54 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 47 47 43 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 48 48 59 59 57 48 48 48 48 50 50 47 43 59 19 14 6 6 8 10 14 23 23 32 37 43 48 34 41 59 57 57 57 57 57 57 48 48 59 57 43 43 39 35 35 42 42 43 43
43 37 36 28 28 30 43 43 47 39 32 32 28 28 30 37 37 39 36 36 33 24 19 14 14 10 10 15 16 14 12 9 9 9 9 10 12 12 11 8 8 8 8 8 8 22 10 13 10 9
8 10 8 8 8 17 17 22 17 10 9 8 8 8 7 8 8 11 12 12 15 13 12 11 12 10 13 10 10 10 11 8 8 7 7 13 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 10
15 6 6 6 8 8 9 10 12 18 24 23 23 13 10 12 12 10 10 8 8 6 9 10 10 10 10 8 8 8 13 13 9 6 8 8 10 10 11 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 7 7 8 8 10 12 9 11 13 15 11 11 11 12 8 10 6 6 8 7 9 10 9 9 10 10 11 13 10 8 8 9 8 8 9 8 8 8 8 8 8 13 25 22 22 12 10 9 8
8 8 10 10 12 11 12 11 11 11 10 10 13 9 8 8 10 8 8 8 15 12 14 11 13 9 10 12 12 10 17 8 8 8 6 8 8 8 8 8 13 10 8 8 6 6 6 6 6 6
6 6 10 10 10 10 11 11 15 9 6 8 6 6 8 8 16 22 33 34 18 18 14 15 9 9 10 10 8 8 10 10 11 9 10 8 8 8 8 10 11 12 20 20 18 10 9 9 8 8
8 9 12 10 10 12 15 9 9 9 9 8 8 8 8 6 6 6 8 12 8 8 8 7 7 7 7 | Open.Hide. 0 3 7 6 6 8 8 10 10 9 9 9 8 15 12 8 8 8 9 19 22 32 26 27 30 32 37 32 31 39 31 17 23 9 9 9 9 9 15 13 20 14 18 18 30 25 40 44 39 39
28 28 30 30 33 33 37 48 48 48 28 23 15 9 9 12 15 24 28 48 57 57 42 42 37 37 42 42 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 68 68 54 53 48 48 48
57 57 57 57 59 59 51 57 57 50 50 50 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 47 47 57 57 59 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 51 51 50 50 50
50 54 57 57 57 57 52 57 59 68 68 68 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 57 57 57 57 57 57 68 57 68 68 68 59 59 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 59 57 68 68 68 57 57 59 59 59 59 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 57 57 57 57 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 52 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 57 57 59 59 59 59 68 57 57 54 54 54 57 57 59 54 54 47 48 43 43
43 48 48 48 48 48 57 48 43 43 43 43 37 41 37 37 28 34 34 39 36 36 40 40 41 37 37 41 41 37 39 35 35 35 39 39 39 39 39 37 41 39 37 37 30 30 22 18 15 24
19 21 17 25 19 28 22 32 34 37 32 32 32 47 37 34 29 24 21 17 15 17 18 25 28 28 28 23 21 21 15 15 15 17 23 11 11 11 12 12 12 15 19 23 19 15 8 8 8 8
22 19 17 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 15 15 19 17 17 20 15 10 10 10 8 8 12 25 19 9 8 8 8 13 15 16 16 11 12 12 27 28 30 20 18 8 8 10
12 9 9 9 12 21 16 15 14 18 18 22 19 9 7 6 6 8 6 10 10 11 13 9 9 7 8 8 12 8 8 8 8 10 8 10 9 10 8 8 8 8 11 8 9 8 15 17 9 9
10 10 12 10 11 10 8 8 8 8 8 8 10 10 17 10 10 10 10 9 8 8 8 8 13 10 10 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 16 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 7 9 8 8 8 8 8 11 10 11 11 12 8 8 10 8 14 10 14 8 8 10 10 8 8 9 9 10 11 8 8 8 9 10 13 13 14 13 12 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 12 9 9 10 10 11 15 16 12 9 9 9 6 6 7 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 11 12 15 15 10 12 8 8
8 8 8 8 10 18 17 11 9 9 9 9 9 9 12 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 10 10 15 15 12 |