BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-380O09.T7 (MSMg01no380_o09.b1) | MSMg01-380O09.TJ (MSMg01no380_o09.g1) |
ACC | AG485166 | AG485167 |
length | 1,621 | 763 |
length of high quality (start - end) | --- | 176 (67 - 242) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no380_o09.b1 PHD_FILE: MSMg01no380_o09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:22:06 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no380_o09.g1 PHD_FILE: MSMg01no380_o09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:22:06 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | GCGCGCGGTCCGCGGCTCGCGGGCGCGCGGGGCATGTGGACGCGCGGGAG
AGGGAGAGTAAGCAGAGGATGGCAGGTACTATGACCGGGGCGCAGAGAGG
TGTGGCGAGGATGCGGTAGTGGCGACAGCGAGCGAGACATTANACATAAA
TATAACAAATATAAAGTTACCTCAACCCCAATGACAGAGCCGACTTGTGT
GACGACATTTATCACAAATGCTNCTATACACACGCTCCTTTACTCCAGTA
TTGGTAGGTGTTTGAGCGCGAGAGCCCACAGCGGGAGACACTAGCACATA
TATCAGATATATATTCTATTAGTAGCACCGCGCTGCTTCTCTGCGCGAAT
AGACAGCGCCTCTGCGCGGTGCTATCCTCCGTCAGCCTTTCCCTGCGCGT
ATGCGCTATGCGACGCCACGCTACGCCGCGCTAATACTATAATCAATTTA
TATATAAGTAGCTCGAGCAGTGAGATAAGCGCACTGTAAACGAGACGATA
CGAGGCTAGCTCGAATATTGGTCGATGTATAATATGTAGATAGGATTCGT
AGCACGAGTAGGGTGAGGGTGTGAGAGCCTCACACACTCTTGTCTACTAA
TCTCTCACAGCGCGCATCTGTGTTAGATCATGCTGCACGCCGCTCAGACC
ATCGATCAGACACAGATATAAAGTGTNAGCAGTATCGTGCTCTGACCCAC
CTCACATCTAAAAGTACTTATATTGATAGCACACAGAGACTCTGCAGTGG
AGATAACGAGAGATGCATTCTAGACAGTCTCGTTGGGTGGATGGGAGTAC
ATATGTGAGATANCCAATGGAGATAGTGAGATGGCNCAGTGTTTGAGTTC
TGTATGATAGCTATTGACAGCTATGATTATGTCATGAGCGACAGACGGAT
GAGTAATCACTCAACAGAGACATGGACTATAAGCTCAGAGTGANGATGTA
TATAACAGATANAGAGGAGAANCNCGCACGCTAGTCTGCGNCTGCGAGAG
AGTGANGATGTGAGATGACGACGTCACGTCCGCAGACTATACAGACCGGC
AACTTATGTNATAATATAGATATCGACAGCCTTCACAGTATGACAGTTGA
TATNACACNAGTATACGACATAGTATATANCTTTGAGCGAGCACNAGNAT
AGACTGCACTGCTGCGCTGGATATGAGTCACATATGTATANTATACATGA
CAAGGTTGATATAGAGATGAGCTAGTGAACATACGTCTATGTACTCCATA
GATAGCTGCGNGCGTCGCAGACGACACGACCACGCGGCGAGCATGCACTG
TATTATGGTGCATCACTGCGTCTTGTGTGACTGACTACTCGATGATTATG
TTACCAGCAGTGATGAGTCCCTAGCCCATCAGCACGCACCAAGAACTATA
TGACTCGTATGACCACAGACTCCGACGGCCCAGGCAGCTATAGATACTCC
GCGCGGACGATGTATCTCGCACGTACTATTTNCTCGATACGTCTGTGACT
TACACCGCGGAGACCGCGCTGTATGTGNGTTTGAGTGGCGGCTCCGCTCG
CTTCATGAGTGTCTCTGTTCTATATATACACGCTCTACGTATTATCACGC
GACTNCGGCGCCCAGCTCCCT
| CXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXTCATCAGGATGGATGAGGAAAATTCAGAATTGCA
TTCCACTTAAAATTTCCAGGTTGTTATGAAATAAAGTTGTGTGATTTTAA
CGGAAAAATATCACATATTCTTTCTTGCTTGACTAAATTTGTTTCAGTTG
ATGGAGCCAAACTCACTGGGGTGGACTGTTGGCTTTGGATAATATTTGGT
TTCCAGGACCCATGTCAGGTGGCTCATGACCAACTATAACTTCAGCTCCA
AGGGATTTGTATTTCTCTGGTCAATATAGATATTTGTACTCATGTGTCAC
ATCCATACATATATTCACCTACACAAACATACACATCACAACACACACAA
TCCATACTCATTTATATATATATTAAAAATTTTAAAGTATTTATTTATTT
TAAAGGGTAAATAAACTGTAAATAAGACTGGATTTTATGTGTTTATTATG
TGCTGAGTGCACCAGTTTTATCCTCATAATTGAAATGGTCTAGAATACAA
AGTTACTCATTTACTTTAGCCAGGTGTGTTAGATCAGTTCTGACATGGTT
GACCGTGTCTCTATTATGGTTGTGCACGTTTACTTCTCACAGTTACACAA
CATTTAACAAAACTGATTCGTTCACTCTTCCATCTCGACCTCAATTTCCC
GAACTACTTTTGCATCCTTATGCTTATTCCCAACACTTTTTTAGCCCCCT
TTTTTTACCGTCC
|
quality values | Open.Hide.10 10 10 10 9 10 10 9 10 9 15 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 7 7 10 16 12 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 14 10 10 10
10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 10 10 10 10 10 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 10 11 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 10 10 10 8 6 6 6 6 8 10 8 8 9 3 0 3 8 8 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 13 10 8 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 10 10 8 8 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 10 10 3 0 3 10 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 14 15 13 10 8 8 8 8 8 13 10 10 10 10 8
8 8 8 8 8 8 10 8 8 10 10 18 11 8 6 6 6 6 6 6 10 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 10 11 11 10 10 8 8 8 7 7 7 8 10 8 8 8 8 8
8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 10 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 6 6 6 6 11 11 10 10 10 10 10 10 9 9 9 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 6 8 6 6 6 8 8 8 10 10
10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 10 9 9 9 9 10 10 10 8 7 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 9 9 10 10 10 9 9 10 10 10
10 7 9 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 11 12 8 10 6 6 6 6 6 8 13 17 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 8 8 6 10 6 6 6 6 8 10 8 9 10 10 8 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 11 10 10 10 10 10 6 6
6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 11 16 9 9 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6
6 8 9 10 10 8 8 8 10 11 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 9 10 10 10 10 6 6 6 6 8 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 11 10 8 6 6 11 7 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 11 9 3 0 3 8 8 8 10 10 10 10 10 10 13 15 11 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6
8 8 11 8 8 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 10 10 11 10 6 6 6 6 6 6 10 13 13 10 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 9 7 6 6 6 6
8 8 8 6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 11 11 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 7 6 6 6 6 6 8 7
7 8 10 10 8 6 6 6 8 8 10 3 0 3 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 6 6 6 6 7 6 6 3 0 3 9 8 8 7 7 9 9 9 9 7 6 6 8
6 6 6 6 10 6 6 6 6 6 6 10 7 7 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 9 8 9 9 10 9 9 10 10 8
8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 10 11 7 9 7 10 10 7 6 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 9 9 11 8 8 8 6 6 6 3 0 3 8 7 7 7 13
12 10 10 10 8 8 6 6 8 6 3 0 3 6 6 6 8 6 6 6 3 0 3 0 3 6 8 8 6 8 8 9 8 6 8 6 6 8 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 10 3 0 3 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 9 17 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 13 12 8 8 8 8 3 0 3 6 8 6 6 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7 7 8 15 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 9
9 8 3 0 3 6 8 3 0 3 8 10 8 13 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 15 10 8 8 3 0 3 8 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 11
10 10 10 9 9 9 11 11 11 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 10 10 10 10 10 10 13 10
10 12 8 8 6 8 6 6 6 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 7 8 6 6 8 6 10 10 10 13 10 10 9 8 8 6 6 8 8 6 6 10 8
10 10 8 8 6 8 6 6 8 3 0 3 8 8 8 8 8 11 11 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 9 9 10 9 12 9 11 11 15 13 11
11 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 9 9 9 10 11 11 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6
6 6 8 6 6 6 6 8 6 8 8 6 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 12 10 8 10 10
6 6 6 6 8 6 8 8 8 9 9 8 8 6 6 7 6 6 6 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 7 6 6 6 8 10 9 9 9 12 11 10 9 6 6 6 6 6 6 8 8
12 16 13 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 12 16 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 9 9 12 3 0 3 10 10 13 13 12 10 10 12 8 8 8 8 6 6 6 6 6
8 6 6 6 8 10 10 7 6 6 6 6 6 8 12 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 8 3 0 3 8 9 8 8 6 6 6 6 7 6 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8
8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 10 13 10 10 10 10 10 10 6 6 6 6 6 6 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 7 6
6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 7 7 7 7 7 7 10 10 10 11 9 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 9 23 29 23 26 14 14 15 22 13 12 15 12 10 8 7 7 7 8 7 9 9 8 8 8 9 14 12 23 18 19 25 24 24 24 24 36 37 41 33 27 13 13 8
11 8 13 15 11 17 16 12 12 12 8 8 8 10 13 23 31 33 33 24 24 19 32 32 47 47 36 34 30 34 32 32 43 37 37 28 28 26 26 20 20 22 19 18 20 30 30 31 37 30
30 33 33 33 33 33 30 37 30 30 22 20 30 28 25 20 20 19 14 19 20 28 28 37 28 39 43 43 43 47 47 47 42 36 36 36 34 34 34 39 39 36 36 42 42 48 42 43 39 28
28 24 24 30 42 26 34 11 11 11 11 23 25 48 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 57 47 47 57 50 50 47 47 47 47 48 48 46 44 32 25 19 20 19 32
32 43 36 36 36 43 42 39 32 36 39 37 42 39 39 33 29 22 17 23 23 15 14 17 25 30 37 43 43 43 31 31 20 23 28 32 26 30 28 17 14 9 9 9 14 19 27 12 10 10
16 22 26 31 22 22 31 33 28 28 28 31 22 24 19 15 14 14 13 18 13 13 13 21 28 33 39 39 37 29 29 20 20 23 32 43 43 48 48 32 28 21 12 12 12 15 15 30 28 30
24 24 24 16 19 23 13 9 9 9 10 8 12 11 11 11 12 12 23 16 23 32 28 28 28 21 28 26 13 13 20 23 14 12 12 24 24 40 36 36 35 42 42 32 31 20 20 20 32 30
34 28 30 28 28 23 23 17 17 19 23 24 10 10 10 10 28 30 57 46 46 43 43 43 44 26 27 11 12 11 26 24 30 15 19 10 10 9 10 15 13 14 14 18 18 21 19 19 11 11
15 30 19 28 28 33 24 24 14 14 14 32 32 44 21 17 10 17 13 27 27 43 43 43 43 37 39 32 32 39 47 44 39 30 30 33 31 31 20 25 21 31 30 30 30 39 39 57 43 43
43 30 30 28 28 18 13 13 15 25 32 30 30 24 28 28 30 23 25 18 12 12 16 22 18 21 19 30 25 17 17 17 25 34 37 37 33 33 25 23 23 20 18 23 25 28 28 33 39 25
24 12 12 12 22 15 18 18 22 16 20 19 24 15 19 28 30 31 21 23 11 11 11 17 20 21 21 14 17 18 26 19 16 14 15 13 14 14 17 21 21 12 18 11 11 11 19 23 21 18
10 10 10 11 15 21 24 18 18 18 18 17 13 10 9 9 12 9 10 11 13 10 10 10 13 14 9 10 11 11 11 11 12 22 19 12 11 12 11 12 13 15 10 11 9 9 10 11 12 11
10 10 8 8 8 8 8 19 19 22 15 11 9 9 9 8 11 8 11 11 11 13 10 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 6 6 8 8 8 8 9 9 9 11 11 16 10 9 9 8 10 8 6 6 6 8 10 9 9 9 10 10 10 9 9 9 9
10 10 10 9 9 9 9 9 11 11 6 6 8 8 8 8 9 9 9 9 10 10 10 6 6 6 6 8 6 12 8 8 6 6 6 8 10 12 12 11 17 12 9 9 10 8 8 12 12 14
12 12 17 14 8 8 6 7 8 8 10 12 9 |