BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-392M15.T7 (MSMg01no392_m15.b1) | MSMg01-392M15.TJ (MSMg01no392_m15.g1) |
ACC | AG494241 | AG494242 |
length | 764 | 774 |
length of high quality (start - end) | 488 (74 - 561) | 244 (72 - 315) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_m15.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_m15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_m15.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_m15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:37:26 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | NNATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCG
CGGAATTCCCAGTTTTTCAGTTGTAAAGAAAATGACTGATAAAGTGTCAT
TCATAGTATTAGAAGAACTATCTTGTTGCTGCTTCATAACTGTAAATCTG
CTACTGCTATAAATCATAATGTAATATCTGATATGCAGGATAGCAGACCC
CAAGAGGATCACTACCCACAGGTTAAGAATCTAGGATTTTCAAGTGTCCA
CTAGCTGACAGCAATGCCCACCAAATGACTGTCTCAGCTACAAAGAAATG
GATACACGCCCGGAGAATGTTTCTGGACAAAGACCCCTATCATAGCTAGC
TTCAGTTGTCAACTTGGCACAAGCTTGGAGTCCCCTGAAAGGGGGAACCT
TAACTAAAGAACTGCCCCTATCAGATCGGCCAGTTGTCATGTCTGTGGAA
GAAACATTTCTTAATTTCTAATTGGTGCGAGAGGGCTCAGACCACTGTAG
GCAGTGCCAACCTTGGGCACATACTCCTGGGCTGTATAAGACAGCTGTCG
GAGTGAGCCCCATAGAGCAAGCCAGTAAACATTCCTCCATGGTCCTTGTT
TCCATTCCTGCCCCCGTGTTTCCAGCCTTGACCTCTTGCCCAAGCTTCCT
TTGATGGTAGACTTTGACCCCCACCCCAATTAATCCTTCCCCCCCCCAAA
CTGNTTTTTTTGAGGAGCGGTTTTACCCCCGGACCCAAGGAGCCCACCTT
CCCCCTCCACCCCC
| TGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGCTCTGTACCCCATTTTTAAT
AGGGTTATTTGGTTCTCCAGAGTCTTAACTTCTTGAGTTCTTTGTGTATA
TTGGATATTAGCCCTCTATCCGATGTAGGATTGGTAAATATCTTTTACCA
ATCAGTTGGTTGCCATTTTGTCCTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTTCTAT
AAGCTTTGTAATTTTGAGGTCCCATGTGCCAATTCTTGATCTTAGAGCAA
AAGCTAATGGTGTTTNNGTCATTATAATTTCCCCTGTGCCCATGTGCTCC
AGGCTCTTTCCCACCTTCTTTTCTATTAGCCTCAGTGTATCTGGTTTTAT
GTGGAGGCCTCCCCCCCATGTGGACTTTACCTTTATTAAAGGACACCCGA
CTGGATCCCTTCGCATTCTTCTGCTCGCTACTCTCCCGTTGAACCATCTC
CCCCTGTTGAAAACGTTCCCTTCTTCCCCCCGCATGCCTCTCAGCTCCTT
TTTCTCCTACCCTCCTTACCCTCCGCCCGCCTCCCTTCTCCTCCGTGTTC
TTTCCTCCGCCTTCCCCCCTTCCCCCTGCTCTTCCTCTCCCTCATCTCCC
CCCTCCTTTCTCTTCTTCTTTCTCCCGGCTCCCGTCCTTTTCCTCTCCCC
CTTGTTTCTCCTCTCCCCCTACCTTCCTCCCCTCTTCTTTCCCTCCCACT
CCCCCTCCCCTCCCTTTTCCCCTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 7 11 12 15 13 13 14 14 20 35 43 33 32 25 21 11 12 14 23 13 13 10 15 9 9 9 9 15 15 13 7 12 12 10 9 9 10 9 12 12 15 15 19 18 18 24 28
37 39 28 23 23 30 32 33 21 18 9 9 9 12 12 10 9 9 9 9 9 12 15 18 15 30 32 59 59 36 35 30 35 35 36 48 48 48 48 48 53 57 57 57 53 42 42 19 21 21
29 22 21 20 32 41 57 57 57 57 57 57 57 59 59 37 41 32 39 39 44 48 37 37 37 37 44 43 41 46 41 41 29 27 18 18 20 30 33 36 39 36 41 37 33 32 31 29 29 34
34 39 46 43 43 43 39 39 47 48 48 48 43 39 39 39 39 42 42 46 43 36 36 43 42 48 50 48 48 48 53 53 68 57 57 48 43 43 57 57 57 57 44 43 43 43 43 44 44 57
44 43 43 57 57 51 48 50 47 42 42 43 46 46 47 47 43 43 43 50 50 57 59 68 68 68 68 57 43 43 43 50 35 50 50 68 68 57 57 57 37 37 37 48 59 59 42 42 42 42
31 32 20 20 32 34 44 57 47 43 43 47 47 57 57 59 48 54 54 48 48 47 48 48 54 59 59 59 59 59 59 59 48 42 42 35 35 43 43 42 43 43 39 44 59 57 57 57 57 57
57 59 43 43 36 36 36 43 47 48 46 40 40 36 24 17 12 11 11 9 9 9 9 9 10 15 24 30 34 41 41 48 50 50 48 57 59 59 57 57 48 43 43 43 43 57 57 48 57 48
47 48 47 42 54 54 59 47 37 39 39 43 43 47 59 47 59 43 43 46 48 54 57 57 57 59 54 59 59 59 42 44 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 48 44 44 44 54 57
59 59 59 54 57 50 59 59 68 59 59 57 57 57 59 44 44 35 35 32 27 27 24 35 50 59 59 57 47 42 33 36 28 44 44 48 44 48 48 48 44 44 27 31 20 41 41 68 68 68
68 59 42 38 47 47 47 47 47 54 43 43 59 59 48 47 47 43 43 43 59 43 59 59 59 41 32 28 28 30 43 43 59 59 48 43 43 39 30 28 33 33 30 39 36 37 23 30 30 37
37 37 37 37 30 23 21 11 13 14 30 28 37 34 32 30 35 34 34 34 37 37 37 39 34 34 18 16 12 21 21 35 37 28 31 28 28 28 19 13 7 7 7 13 13 32 20 21 21 25
33 30 37 39 39 37 24 11 11 11 10 12 12 11 12 9 12 12 19 19 19 32 31 35 37 22 21 20 21 22 30 30 24 22 19 14 14 10 8 6 7 7 7 6 8 9 15 12 14 12
17 14 12 10 10 11 14 12 13 16 12 10 13 9 9 9 9 12 16 12 15 9 9 9 9 12 9 10 8 10 6 6 8 8 10 8 8 8 8 10 10 11 10 9 9 9 9 11 9 8
13 19 15 16 16 15 12 12 10 8 8 11 8 11 11 24 15 12 9 9 9 9 12 11 9 10 10 14 15 15 12 15 13 21 13 17 21 28 23 17 18 12 12 11 10 10 11 10 10 10
9 9 3 0 3 23 16 18 18 30 14 12 10 8 8 8 11 9 10 12 12 12 8 8 10 12 22 15 17 8 9 9 8 13 19 15 12 12 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 13
15 28 13 13 7 6 6 6 9 10 13 14 14 11 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 7 7 9 9 15 15 30 25 34 18 23 23 3 0 3 3 0 3 21 21 12 13 9 9 6 8 8 9 10 9 16 18 22 22 21 13 15 28 25 33 33 33 33 33 33
37 37 30 18 18 6 6 6 6 6 6 11 13 11 12 10 10 10 11 18 18 28 21 27 24 43 44 53 48 48 36 36 36 37 36 44 44 57 47 57 48 48 48 57 57 57 54 57 50 50
48 48 54 54 68 68 68 68 68 68 68 57 44 44 36 36 37 31 31 35 42 42 48 37 42 42 42 42 47 38 38 39 41 39 44 59 68 57 57 48 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57
57 57 50 38 38 50 50 50 57 44 43 43 33 43 42 47 44 44 44 44 47 47 44 57 44 57 59 57 39 46 57 57 57 57 68 68 57 57 68 57 57 68 68 57 59 57 48 44 43 37
37 43 47 48 48 59 59 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 48 48 59 59 59 57 53 48 48 48 48 48 57 59 46 46 48 59 59 59 59 59 25 21 9 8 8 6 6 6
8 11 15 27 41 59 59 48 48 48 48 57 57 57 59 59 48 48 59 48 46 59 46 48 48 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 57 59 48 37 40 40 37 43 43 43 43 43
39 43 43 48 47 43 39 29 28 24 14 12 23 12 3 0 0 3 6 6 9 9 10 9 9 10 15 26 39 41 50 50 50 50 53 48 57 57 41 41 32 32 32 43 43 59 59 57 57 57
57 57 23 24 11 23 23 34 20 15 15 12 16 19 32 34 43 43 39 32 30 28 28 28 30 37 22 18 9 9 9 10 10 13 10 11 12 18 28 34 34 25 24 13 19 19 27 27 29 24
18 14 14 14 13 18 13 10 12 9 9 9 11 12 12 15 17 18 18 19 24 12 12 11 11 11 10 10 10 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 15 25 25 28 12 12 9 10 10 8 8
8 10 8 9 21 37 30 23 17 10 10 10 11 11 15 13 27 10 11 11 16 19 14 11 8 8 8 8 9 11 11 12 15 14 11 11 10 16 16 13 19 13 8 9 8 8 10 10 16 11
12 10 10 10 16 15 26 28 12 12 11 8 8 8 8 10 8 8 8 7 8 7 6 8 8 12 12 11 10 10 8 6 8 6 6 8 8 8 8 11 10 8 8 8 8 11 11 9 10 12
12 9 8 8 8 8 10 8 9 12 15 19 16 14 11 11 11 11 10 10 12 15 15 10 9 8 6 7 7 7 8 13 10 10 9 14 15 15 10 8 8 10 15 8 8 8 8 8 8 6
7 10 13 9 9 8 8 6 6 6 11 14 16 14 14 12 23 27 17 16 12 12 11 11 12 12 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 17 15 12 8 6 6 8 6 9 10 10
15 21 16 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 8 13 10 8 8 8 10 10 10 10 10 12 9 8 8 8 10 9 8 10 8 9 10 19 15
7 6 8 8 8 9 8 10 10 10 7 7 10 12 13 19 15 8 13 6 6 8 11 10 12 10 11 11 9 8 8 11 11 16 21 13 11 11 11 15 13 8 8 8 8 12 9 9 9 15
15 22 22 24 30 22 22 9 11 11 10 13 10 14 10 12 10 10 16 13 10 8 8 8 |