BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-444I09.T7 (MSMg01no444_i09.b1) | MSMg01-444I09.TJ (MSMg01no444_i09.g1) |
ACC | AG533670 | AG533671 |
length | 768 | 742 |
length of high quality (start - end) | 171 (75 - 245) | 240 (73 - 312) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no444_i09.b1 PHD_FILE: MSMg01no444_i09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:12:27 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no444_i09.g1 PHD_FILE: MSMg01no444_i09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:12:27 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAGTACTTACTCGGCGGAAT
TCTTCATATTTTGCATTATTGTGTAAACTCGAAATTGTGCCAAAACAAGA
GCCTCCTAAGTCCTCTGCACCGGGGGAGGGCCAGCAGTGTCCCCTCTTTC
ACAGCAGGTGAAAGCATCTGCTGAGATCAGCTGGCTGCCAGTCTCCTGTG
TGAAGGAGTGGCCTGAGTCTCAGTGCTGAGGTGACAAGTGGCTTATTTAT
ATTATCTGCCAGCAGATGGTTAGGGACCCCTGCTCCACACAAGTGTTGAA
TCGTCCTTGTCCTTTTTTTTTTGCTCCGNCCANCCCTGTTACCACCCAGA
GTCAAACTCTTATTAGCTCTGCGTCATCCTGCTGTCCTTGCCTTGGATTT
GTGGTCCATCTCAGCGGTCGAGCCGTGTCTCCGTCTTCTTATATTTTGAG
TTTCGTCTGCTGATTGGTTTCCCGTTTTACTTCACACACACCTTTCTTGT
TCCCCCAGACTCTAGCATTTTTCTCCCCTTTTTCTCTTTTTTACCCTCCT
GAACCTTTAGGTCATTGCCACTTAATCCGCTTTTCCCCTTTTCGACTTAT
CTCCTTTACTCCCCTTTTCTTACTTTTCTCCACTTACACAAGTTTTCCTC
ATTTTTTTCTCCTCTTCCCTTTAGATTCCCTCTGCCTTTTATTTTATTCA
CACCTCTTTGCTCCTTTTTCCTTTTTTCATTCTCTATTTCCCCCCCCATC
TTCCGCCCCCCCCCCCCT
| CCCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTACCGCAGAAATCACTCTATCCTGGAACTCACTCTGTAGA
TCAGGCTGGCCTCTGCCTCTGCCTCCCACGTGCTGGGATTAAAGATGTGG
GCTACTATGCCCTGCTCCCTCTCCGCTGTACTTGTGGCTCAATATGAGCA
TTGAGCTTTTTTTTTTTCTTTAAATATTTATTTTATGTATATGAGTACTC
TGTCTCTGTCTTCAGACAGCACCAGAAGAGGGCATCAGATCCCCATATAC
AGATGGTTGTGTGCCTCCTTGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCAGGACCTC
TGGAATAGCAGCCAGCGCTCTTAACCCCTGAGCCATCTCTCCCGCCCTGG
ACACTGAGCTTCTGCTCCAGCTGCCAGGTCTGCTTCTTGCTGCAACACCT
TCCTACCATGATGGATTCCCTACCCTCTAGAGCCACAAGCCCAAATTAAT
TCTTTCTTCCATAAGTTGCTTGGGTCAAGCTGTCTTACATCAACAGAAAA
GAAATTGATAACGTTTATTAAACAACTTACAGAGGTAGCTGGTCTGTGTT
GTTCAATACCTTTTATCTTGCTACTCCGGCAATGAAAGTCTATTTTTTTT
TTGCCCGCTCACGGCTAGTCCTGGTCCACTTGGCCATGCTCTATTACCCT
TTTGAGTCCCTCTTATCCCCGTCTTATTTACCCCTTCCCCTN
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 9 11 25 32 37 37 37 31 31 41 23 24 25 28 28 28 48 39 28 16 19 8 8 8 9 9 9 7 7 6 6 6 6 8 8 12 12 9 12 9 21 21 25 28
31 31 33 33 21 21 10 10 12 10 8 6 6 6 6 9 9 12 11 13 11 11 11 16 15 23 31 32 39 39 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 48 57 57 57 57 50 53 53 53 59
59 57 59 59 59 59 59 48 48 47 47 23 25 12 18 16 20 15 15 9 9 9 11 18 23 28 32 37 22 23 11 11 11 18 22 32 43 43 44 57 59 59 59 59 59 59 59 53 57 57
68 68 68 68 43 43 22 18 11 12 14 15 18 23 23 11 11 11 34 34 57 48 57 47 47 47 57 47 54 54 54 48 54 54 59 54 57 57 57 54 54 54 54 57 59 59 59 59 47 43
43 46 46 46 43 36 39 39 42 39 39 40 39 43 42 36 36 36 43 43 39 35 35 35 39 39 37 37 28 28 28 32 31 37 28 32 31 37 37 39 22 17 10 10 10 12 12 11 11 11
9 9 9 9 19 23 39 39 32 32 23 23 23 23 23 32 37 43 43 43 40 37 37 32 32 30 37 25 30 12 12 12 12 12 12 22 24 28 25 25 25 25 29 33 30 30 28 28 34 39
37 39 34 34 25 28 28 26 18 13 11 10 10 12 15 20 14 27 13 10 10 8 10 15 9 9 9 3 0 3 27 3 0 3 27 23 37 32 32 20 15 18 14 14 14 27 25 28 18 14
19 18 23 11 9 9 9 8 8 8 6 6 6 6 8 15 15 25 15 13 12 12 12 12 15 15 12 10 10 11 23 27 31 20 20 20 26 24 21 12 12 15 25 26 13 13 13 15 15 41
23 24 17 17 15 15 10 11 11 21 19 12 11 11 8 8 8 8 8 8 11 11 8 8 8 8 8 8 6 6 9 10 10 13 11 18 20 22 19 12 12 12 25 21 22 16 16 11 10 11
11 12 12 11 9 9 9 18 21 20 20 20 19 16 16 11 11 11 18 17 15 8 8 8 8 11 13 13 12 8 8 8 8 10 10 11 11 13 10 10 9 9 9 9 11 11 10 10 10 10
11 15 30 20 23 12 11 9 9 9 8 10 8 8 8 6 6 8 8 8 10 6 7 7 13 6 8 8 10 15 18 16 14 13 12 12 12 13 9 8 8 8 8 8 8 12 10 9 9 12
10 8 10 10 14 9 8 10 8 8 8 8 8 9 16 13 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 15 12 15 10 10 10 14 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
11 15 10 10 8 11 6 6 6 8 13 8 8 8 15 17 10 15 10 12 8 8 8 8 19 15 15 12 8 8 8 6 6 8 8 14 11 13 8 7 7 7 8 10 12 12 13 13 10 10
8 9 15 19 23 25 25 13 8 8 8 8 8 10 8 10 8 9 14 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 12 11 10 8 8 7 7 11 11 7 7 8 8 8 6
6 8 8 8 9 8 8 8 8 9 9 19 11 15 17 15 12 12 11 9 8 12 14 13 19 15 11 10 11 11 11 9 8 8 8 8 8 10 8 10 12 10 9 12 10 10 8 9 8 7
7 8 7 6 6 6 10 10 23 23 24 30 21 12 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 6 11 10 12 11 9 9 25 15 10 10 10 14 13 41 37 37 41 41 39 39 44 39 39 44 29 28 18 12 17 6 6 6 6 6 7 7 9 9 10 10 12 12 23 23 11 11
11 26 23 42 41 25 25 9 9 9 9 9 9 7 6 6 9 9 9 10 10 10 12 12 33 33 44 50 53 59 57 57 57 57 53 53 53 53 57 57 53 53 53 57 57 57 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 37 37 39 35 35 36 40 31 32 30 39 44 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 41 41 29 41 41 48 59 68 68 68 50 50 50 50 50
68 68 68 68 68 57 57 50 48 48 48 57 57 54 54 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 48 50 50 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 44 44 19 19 11 15 11 12 15
32 41 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 54 48 48 59 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 47 47 24 27 12 11 9 9 9 9 9 9 9 9 16 11 12 27 24 47 47 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 57 48 48 48 50 50 57
41 37 24 21 13 13 13 12 18 21 21 25 15 15 14 14 14 26 29 35 34 34 40 47 48 48 48 48 57 57 48 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 43 43 43 47 42 39 39
48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 57 46 44 43 43 43 47 43 43 43 41 36 30 44 44 42 42 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 43 43
43 43 43 59 59 43 43 43 43 44 43 50 50 59 44 44 35 37 37 44 57 57 57 57 57 59 34 30 14 14 21 32 42 35 35 35 42 42 44 59 59 43 43 43 59 59 43 42 32 32
32 42 42 59 46 46 43 37 37 35 35 37 37 35 32 31 28 23 25 31 27 28 22 28 28 47 39 39 39 34 28 19 19 16 21 19 13 10 10 10 10 10 13 11 12 12 12 12 14 21
24 16 15 13 20 19 16 17 11 8 8 8 8 8 8 14 9 7 8 8 9 9 11 11 11 15 25 22 19 11 11 10 10 11 15 11 11 12 15 18 12 12 17 15 11 12 12 11 11 11
13 10 10 10 13 18 12 12 18 22 24 22 20 25 14 14 10 9 7 6 6 8 8 8 14 15 10 10 10 10 6 7 7 7 6 7 8 8 8 10 10 9 8 10 10 9 12 12 16 12
10 10 9 10 10 8 8 10 10 23 10 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 6 6 8 8 12 12 10 10 10 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 12 11 11 11
11 10 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 10 15 18 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 3 0 |