BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-455K04.T7 (MSMg01no455_k04.b1) | MSMg01-455K04.TJ (MSMg01no455_k04.g1) |
ACC | AG542129 | AG542130 |
length | 737 | 1,155 |
length of high quality (start - end) | 567 (66 - 632) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no455_k04.b1 PHD_FILE: MSMg01no455_k04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:27:12 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no455_k04.g1 PHD_FILE: MSMg01no455_k04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:27:12 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCAAAGAGGATCCGCGGAAT
TCTGATTCCCGCCGGAAGCTGTTGGAAAGTTGTCAGCTGACTTGCCATAT
GACGTTGGCTGCAGAGTGTAAAAGGCACTGCTGCAGCTCACGATAAGAAG
CAAAGATTGCACATGAGAAGTGGTAGAGCAACCTCACAATACTGTTCTTC
ACCAAAGAACCTAGACCCTAAGCAGGTTCCTGCTGAAATCCAGTGAGTCA
AGTCTAGAACACTGAAAGTGCCTGCAGCTGGTTTTCACTCACAAATAGAA
TCATCATAGCTTTGGAGTATCATGATTCCACTGTGTTCAGAATTGTGAGC
TCTGGAAAGATGCATCTTGACCCATCTGTCTTAAGTGTACCATGTAGAAG
CACTGTGAGATTTGTGAAAAATGTTAACAAGAGTCTAACCCTAAGCCATG
GAAAATTTATTGGTGAAAATGGTTCGTGATCCACTTTGTGTTCATGCCGG
CACTCGGGGCAGAACCCCACAAGAACATGTCACAATGTCAGTCTAGGTCA
GGATAATGGCTCAGCAGGTAAAACTCTATGTCACAAAAGCCCAACGATCT
GAGTTTGATCTTAGAGAACCTCGTTAGAAAGTTAAACAACAATAAAAGCC
AAAGCAGATGTGAACATCTCTAATACTAGCACTGCCACTGAGAGGTGCAG
ACACAGGGCAATCACCCATAAGCTTGTGGGCCAGCTN
| CCTTCCTCCTGCGGTCATACCAATAATACTACAGTGTGTTTTTTTGTTCC
TTTCATACTTTTATCTTGATCGTGTAGGAAGACGCGCGGGCGCCCTTTCT
CCCCACAAATATCCCTGAAACCCATGGCGTTCCTTCTCCACTCTCGTCAT
GATCTCAGGTTATGCATTTTTCTTTCTGTGTCTGAAACTTTTGACTTCTA
TATTATTGCTATATTAAGCTGATAATCTCCATATTATAATTATTTATATA
ATTCAGCCTATTTTAGCCTCTCTCCAATTATTTTTTATTACAATAACTCC
AGCTATAGATAATATAGATACCACTAGAGATTATTATGCTAAATATCGGC
CGCTTATGTGTTGATGAGCGGTGTTTTATTAGGTGTGTGGTCATCTCTTT
GCCCATCGATCCTGCCCCCCATATTATGTTGTTACGTTATATTCGCTATG
TTCAGTACGCGTAGTGACGACACGTGCTATTGTGCCCGGCGACAAAAATG
TTGTGTTCTGGCTGTTCTAGGGTAGCTTTTCTAGTTTATTCAGTCAATAT
AACACTCATTTCCCACGTTAGTGTACTGTGGGAGCGGGTGACGACCGGAT
CCGGCAGAGGGTGCGGTGTTGATGCACTCGATGTACAACGATATCACGCC
GTACCATTATTCATTAGATCATAGTGACGGCGGCCCCGCCCGTTCATCAA
CTCCGTGTATACTTACGCGACGCGCTTACGCTTAAGGTATGTATACCTAA
TAATTTTCCATATTATTTAGCTCTCTCGTTATGTATTTTGTGGGGGCGCA
TCTTCACTACCCCCATAAGACAAGATGTCACTTCTTACATCGCGCGTCCG
CCGCCTCCCATTTATTATAGTATGCAATGTTGATTGAATAGTGCGTTTGA
TCTCGTTTTGCCCTCAAATACCTGACCAGATTATGTAGTTGATGCGTGTA
CATCACGCTTCTCTCATCTCTCATTATATCTTAAACCGCTAGGATCCCAC
ATTTACCCTCTCTATTTATCTCCGATCCCGATTGTTGCTTTATTTTATAG
TATGTGCCTTGTTTGGCTTTTCGCTGAGCAGAGAGTGTTAAGATTGTATC
AAAACCAATAAATTAAATTACAGATATAATTAATTTCATAAACAAACTTA
TATAA
|
quality values | Open.Hide. 7 7 6 8 8 11 20 23 34 34 28 28 30 37 34 30 22 22 24 34 34 44 22 18 10 9 10 7 9 9 12 9 13 14 14 14 18 21 19 19 18 21 23 41 41 59 33 33 23 22
10 12 15 10 6 8 6 6 6 8 9 11 15 12 12 12 25 28 37 39 40 41 48 50 59 59 50 47 36 36 36 36 48 48 48 48 48 48 50 48 53 48 57 42 42 42 42 48 48 59
59 59 59 59 57 57 57 54 46 46 39 37 32 39 32 37 37 39 44 57 57 57 59 48 47 43 43 47 57 48 57 57 57 57 54 44 44 43 43 44 57 57 57 57 68 68 68 59 59 47
48 48 57 46 46 46 46 46 46 50 52 52 52 43 43 52 52 52 57 57 57 57 54 54 57 57 59 57 57 52 52 43 43 50 37 37 43 43 57 57 59 57 57 52 59 52 57 57 57 52
52 57 57 52 59 59 57 43 52 52 43 43 43 43 39 43 43 43 43 44 59 54 54 57 59 59 59 52 57 57 57 52 59 57 59 57 57 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52
62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 39 39 14 14 20 39 39 14 13 21 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 45 62 62 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 62
45 43 43 47 59 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 36 41 38 62 44 44 38
43 43 43 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 52 57 57 57 52 52 52 57 57 59 59 52 52 57 59 57 52 52 52 43 44 44 44 35 43 43 57 43
57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 57 43 57 57 57 52 54 54 54 57 57 59 57 52 52 52 52 52 52 52 52 50 57 57 48 50
50 50 59 43 43 41 43 43 43 44 44 42 38 36 32 37 39 35 35 42 42 59 57 57 46 46 48 57 46 57 54 54 54 57 57 57 44 43 39 39 47 32 32 39 31 31 40 30 30 32
42 42 54 46 57 46 46 43 39 42 25 30 17 24 30 39 48 57 57 57 57 57 59 59 43 48 48 47 47 37 35 35 35 37 37 37 37 34 30 23 20 20 28 32 37 37 37 30 30 30
34 34 48 57 57 37 32 37 30 36 22 23 23 24 25 25 25 28 22 25 26 30 24 30 41 37 39 41 22 22 12 12 12 11 22 23 22 16 22 16 12 12 15 24 26 22 21 18 12 16
16 25 26 34 28 19 19 12 19 12 15 15 26 26 36 33 20 24 25 28 24 24 23 23 34 28 37 28 32 30 28 28 37 28 28 28 28 20 22 27 16 16 17 32 28 28 24 29 17 15
15 12 12 13 18 23 15 14 14 10 10 12 12 12 12 15 11 11 11 12 11 13 13 16 13 11 11 12 11 11 12 19 17 18 12 3 0 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 10 6 6 6 6 8 15 11 8 8 10 10 10 24 15 19 9 6 6 6 7 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 6 6 10 8 9 8 6 6 6 9 6 6 8 11 21 11 8 10 8 10 9
9 13 12 13 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 6 8 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 9 9 7 7 9 10 10 10
8 8 10 8 8 8 12 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 9 6 6 6
6 6 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 9 11 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 12 11 11 11 11 12 10 10 9 9 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 11 9 9 9 11 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 8 9 11 10 10 12 12 11 11 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 10 10 11 11 10 11 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6
6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8
9 10 8 8 6 6 8 8 9 10 10 8 6 6 6 8 8 13 17 8 8 8 8 7 13 12 9 8 8 8 8 6 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 8 10 8 8 9 10 7 9 9 8 11 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10
8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 13 10 10 8 6 8 6 6 8 8 11 11 11 12 6 6 6 6 6 8 8 8 8
8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 9 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 15 12 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8
7 6 6 8 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 6 8 8 8 11 10 10 13 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 10 10 10 10 8
8 8 10 10 10 8 10 10 8 8 7 6 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 6 7 8 8 11 7 8 7 6 8 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 9 8 10 8 8 8 8 10 10 8 11 9 9 8 10 8 8 8 9 6 8 6 6 10 10 10 15
10 10 10 10 10 9 9 8 8 6 6 8 10 6 6 8 10 9 9 11 10 10 12 13 8 8 8 6 6 8 7 7 9 9 9 12 16 8 9 7 7 8 8 10 10 10 8 8 9 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 8 8 10 10 12 10 10 8 10 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 12 8 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10
10 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 7 12 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 6 8 8 8 8 9 10 10 9 9 9 9
8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 11 11 9 9 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 11 8 8 8 7 7 8 7 7 8 8 10 10 12 9 9 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 11 11 11 8 10 6 6 6 6 10 10 11 11 6 6 10 10 10 10 8 8 8 8 10 8 9 9 6 8
6 6 10 6 8 8 9 10 9 9 9 9 9 9 10 9 12 9 10 10 8 8 11 11 10 10 10 13 11 11 11 8 6 6 6 10 6 6 8 8 13 13 12 8 10 6 6 6 6 6
6 6 6 8 8 9 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 12 14 13 15 12 12 15 8 8 6 6 8 8 8 6 6 6 6 10 9 9 9 9 9 8 9 8 8 6 8 6 6 8
8 11 11 9 9 10 10 10 9 8 10 8 8 8 8 10 9 10 9 9 10 10 10 10 12 10 8 10 6 6 8 8 11 11 11 11 11 11 11 13 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8
8 8 7 7 7 |