BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-466H03.T7 (MSMg01no466_h03.b1) | MSMg01-466H03.TJ (MSMg01no466_h03.g1) |
ACC | AG550390 | AG550391 |
length | 1,507 | 789 |
length of high quality (start - end) | --- | 369 (78 - 446) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_h03.b1 PHD_FILE: MSMg01no466_h03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:56 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_h03.g1 PHD_FILE: MSMg01no466_h03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:56 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AGAGATTAAGTCCTTACAATACTCAATGCGAGNGTNTTATACCCACCAGG
CATCGCTTTCTCTTCCACACTCCACATGACTAGTAACCCGGACGTCCCTC
CTCTCCCCCCCCCTCTTCTCTCATTTCAAGCGATCCCAATATAATAATTA
CCCATCCTCTACCGTCTACGCACCCTCGCCAGACACCGACAACAAGATAT
CTCACCCTCCTCTCCTTCGCCTCCCCATACTCAACCTNATCCTGATCAAA
TCACAACTCATAATCCACGTTCTCATATCTATTATATTTCTCTTATTATA
TAACAATAAATACAGACACTTGCTCCTTGTGCTTATATCTGAATATCTCT
CTTACTCTCGCTACCCTATGTTATGCGGGNAGCACGCCCCTCTCCTCTTT
CCGCTCCTCTATCTCCCTCTCTCACGTCCCTAATCTCGTGCCATATATAT
TNTGTCTCTCTTTCTCTTATCGCATACAATCTCTTTGAGTCATCATTCCT
TAAACAACATAGCTCGTTCATATTTTCAATTGTATTATTATTNTACGATT
ATTACCTCAAGTTATGTATTTATTCCTCTGGAGTTATGTACTTAGTTACT
TATTCTCGCTTTCTGCTTTCTATACCTCATCACTTTACCGTTCCTTATTA
TACCGCACATACTCTATCTCTCTTCTACCCCCTCCCCCTACTCCATTCCA
TCTCTTACCTAACACTCCACATTCTCCTACTATACATCTTATATCTCCTA
CTATCTCGCTATCTCCATCTTACCACAAATAAAATCTCACCTCCAATTAT
CGCCACGATCCAGGTGTGTCCATATATCTCTAGTCAGACTCATGCTATAC
CAATCCACACACTCACTTCATGTGTACCTCCGCACTCTCTAAGCAACTGC
ATAATATATTTCCTACTCTACCCACACACACTTACAATAATATCTTCTTA
CTCGCTCCTTACTCATTTTATCTCTACTATCCAACTATATTTATATCCCG
TCTCACGATCGCGCTCTCCATTCTACAACTCCGGCTTATTCGACCCACTG
TGTATATTCTATGTCCTATACTTTCAACGCTGCAGACCGCACCCGCCACA
ATGTNTGTCTTGTTCTATCGACCTCGACTCTACTATCCATACACTAAATC
TCTAGACTGAAGGACTTATGACTCATGCTAACCNTCGTGAGACATCACGA
TTTGCATCTCATCTGCTCTCTCCGTACATATCTCNATCACCTCGTGATCT
ACGGCTCTCCTCACTTGTTCCGTGCACGTCTCTCTCATCTTCCACGATCA
TCTCACCAATGTACTCACTCCATCTGTATTGTTATACACTACTTCATCGC
TCTATCTCTACATTATACGATGTACATCTATANCTCTCTCCTCACACTCA
TTTCCAGCAACAAATACTAATAATCATCTATCTCAAATCATATCTCGCCA
NTCATAGTATCGACATTCTCGTATATACGANCTCACTCTCTGCTCTCCTA
TTCGCAG
| CTCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTAAACAATAGGAGCTTAATGG
GTTTTCTTATGCACAGTGTCCAACTACATAGTTCACTACAAGATGGCTAT
ATTCTGCACAAAATTTATATTACTTTTGACTCTTCTATTACAAAGAAATA
GCAAACCTTTATTTAAGAACTTAGCCTTTTCAGGATTCTTACTGTTGGGA
TTCAAAGCAAAGTAATTTTGCTACCAAAATGTCTCTTTTATTATCTGTAT
TCTGATCCATCTGGTATAAAGATGGGGGAGTGTTTAGGATTGACCTTTTG
CTTGGCGTATTAAATCATTGGCCATTTTTTCCAATATATTTGCACAAAAA
GGACTAATGGATAGGTTGAGATACATCTTGATATTATCACTTGGATAGTC
AAAGAAGTAATTATAATACCACTGTTGGAAGAAACACAATGTGAGTCACT
GGATAAAAGCGATTTATTTGCTTTTTTTTTTTCCTTATACAGCATATTTT
GGTTGGTCCCATGATTAATTTACCATTTAACCTACATTGCACTCGAGGTA
GTCCCTCTTTTTATTATAGCATTACTTATTTCTACCCGGTGTGATCCCAT
ATTCCCCCCTTCTATACCTATGTGCATTATCCCCTACCTCCCCCTTGTTT
GTACTATTACCTCTTCTGCATATCCCTTTACCTATCTCTTTTCCTTTTAA
ACTTATTCCCTCTCTCCTCTCTTCCGAGCGCTAACTCAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 15 10 9 6 8 6 7 6 6 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 13 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 9
8 10 12 12 9 8 9 9 9 9 9 7 8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 9 10 10 11 11 11 12 9 9 10 10 8 8 10 11 8 8 6 8 8 8 6 6 7 6 8 8
6 11 11 11 11 10 10 10 12 10 10 10 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6
6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 11 11 11 11 11 11 11 10 13 16 10 10 11 15 10 8 8 8 8 10 8 8 10 8 6 6 6 8 6 6 6 8 8 10
10 10 6 6 6 13 15 8 8 8 8 8 8 8 12 8 6 6 8 8 10 9 9 10 12 9 9 6 8 6 6 8 8 8 8 8 3 0 3 11 11 11 10 9 9 9 9 9 9 9
9 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 11 10 10 9 9 10 13 10 9 9 10 8 8
8 8 8 6 8 8 8 8 8 12 10 17 21 15 8 8 10 12 10 11 8 8 8 9 9 9 12 11 9 9 11 11 16 8 10 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 12 21 21 10
10 11 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 10 10 8 8 14 9 9 11 12 12 11 11 11 6 6 6 6 8 8
19 13 13 10 10 10 15 10 10 10 11 9 7 7 7 6 6 8 8 12 15 15 10 10 10 16 12 8 8 7 7 6 6 8 8 8 9 9 10 9 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6
3 0 3 10 7 8 8 8 8 8 12 12 22 22 22 11 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 7 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 7 9 8 7 9 9 9 9 10 16 10 10 10 10 11 10 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 3 0 3 9 10 13 10 8 8
6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 11 11 11 11 11 9 9 8 8 6 6 7 11
9 12 8 8 8 6 6 6 6 11 19 8 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 7 6 8 7 6 6 6 8 7 7 6 6 8 8 11 6 9 8 8 6 6 6 6 8
8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 9 12 9 8 10 8 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 7 7 6 6 8 8 10 7 6 6 6 8 8 8 8 6 7 7 6 6 6
8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 7 7 7 8 10 9 9 8 8 11 8 8 8 8 6 6 8 7 7 8 8 8 8 8 8 10 8 10 12 10 9 9
9 11 11 16 16 22 11 11 11 11 11 8 10 8 8 8 10 9 10 6 8 6 6 8 6 6 10 7 8 10 8 9 9 11 11 10 16 10 10 10 12 12 13 7 8 6 6 8 8 8
8 8 7 8 8 6 6 6 6 10 6 6 8 8 9 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 6 8 10 13 10 8 8 8 10 8 8 8 6 7 6 6 9 9 8 6 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 7 8 7 8 10 8 8 8 8 6 8 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 10 6 6 6 6
8 8 8 10 10 12 16 17 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 13 8 9 11 11 13 10 10 11 9 8 8 8 6 7 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 6
6 8 8 9 10 8 8 6 6 6 6 8 8 7 6 6 6 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 8 8 8 8 9 9 9 8
8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 10 8 6 6 11 11 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6
6 6 6 10 10 8 8 10 8 8 6 6 6 6 8 8 10 13 8 8 8 8 6 6 6 7 10 6 11 10 10 10 10 11 11 8 8 8 8 8 10 11 8 8 8 8 8 8 12 10
18 12 12 3 0 3 9 9 12 10 8 8 8 10 10 9 7 10 7 7 8 8 10 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 11 11 10 9 10 9 9 10 11 10 9 12 10 9 8 8 8
6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 7 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 18 3 0 3 10 10 9 10 8 8 6 8 8 8 11 12 11 11 10
10 7 6 7 7 8 11 11 10 6 7 6 6 6 6 12 16 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 8 8 3 0 3 9 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8
10 9 9 9 9 12 11 11 11 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 7 8 7 8 8 8 9 8 8 10 8 9 10 12 12 13 7 9 7 7 6 6 6 6 6 8
8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 9 9 12 8 8 6 6 6 6 6 7 10 9 10 6 6 6 6 6 6 7 8 6 8 6 6 6 6 8 8 17 13 9 8 8 8 6 6 6 10
13 13 9 9 10 16 12 18 10 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 8 10 9 9 11 10 3 0 3 6 8 12 9 9 9 9 13 11 9 9 9 9 9 9 8
8 8 6 6 6 6 6 6 12 10 9 8 8 6 6 6 6 6 6 10 6 6 6 6 8 8 10 10 8 7 8 6 6 6 10 8 8 12 11 9 9 10 9 11 9 8 6 6 6 3
0 3 8 8 8 8 9 12 19 16 14 12 12 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 12 32 16 12 10 9 3 0 3 13 10 12 14 19 17 10 10 6 6 6 8 10 8 8 8 7 7
6 7 6 9 9 10 10 | Open.Hide. 6 6 6 7 11 12 10 10 10 11 23 26 37 37 37 35 29 27 29 29 32 37 37 37 44 44 37 37 43 43 25 23 9 7 7 7 7 7 8 15 10 13 13 29 24 37 32 36 39 39
36 36 33 37 33 33 42 41 33 25 15 9 7 7 7 7 13 13 22 24 29 17 28 24 24 28 28 47 47 47 59 36 37 36 36 36 47 57 57 57 57 57 57 59 44 43 40 40 43 46
48 57 46 46 47 54 54 54 54 48 48 50 48 48 48 39 39 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
57 57 57 57 57 57 47 57 57 68 51 51 50 50 50 50 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
57 59 59 44 43 43 43 52 57 57 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 43 52 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 59 59 57 57 52 59 52 57 52 57 50
50 50 52 52 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 46 48 57 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 47 47 57 59
57 57 57 54 54 54 57 54 48 48 48 47 42 39 39 40 34 28 32 30 30 32 34 34 33 43 43 57 57 57 57 48 59 59 59 59 57 48 48 48 43 43 36 36 36 43 59 46 46 41
59 36 43 31 31 35 37 32 32 32 28 23 20 20 28 23 28 32 23 21 12 12 13 24 30 46 46 39 42 28 28 19 32 29 32 35 36 36 43 43 30 30 14 14 12 22 19 25 30 32
31 37 37 36 36 36 36 28 19 16 14 11 11 15 19 25 32 32 18 18 12 13 13 16 22 23 36 32 30 24 19 19 15 28 18 18 18 20 28 30 24 31 23 28 28 19 15 9 9 9
10 11 17 25 22 15 15 19 21 23 25 29 37 28 22 12 12 12 19 21 25 25 28 33 29 28 20 19 17 19 19 11 11 11 10 10 10 12 14 13 18 21 24 18 18 13 13 13 15 20
15 11 11 11 11 11 15 17 18 18 22 19 23 28 28 23 24 23 23 23 23 24 24 28 30 30 30 32 25 30 25 23 24 12 12 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 10 21 17 16 13
10 10 11 8 8 6 6 8 6 9 9 13 12 12 11 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 16 18 16 9 9 6 6 6 6 8 8 11 13 11
11 10 10 10 13 19 16 15 17 17 17 15 9 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 8 10 10 10 8 8 9 11 10 8 8 8 8 10 10 12 12 9 10 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 11 11 22 15 14 11 11 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 13 9 9 11 12 8 8 8 8 8 8 8 10 17 16 8 8 8 8 8
8 8 8 8 16 16 11 11 11 11 11 11 12 13 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 13 10 10 12 10 8 8 8 8 8 10 11 12 7 7 8 8 8 13 13 14 14 10
10 10 13 10 8 8 8 10 8 8 13 8 6 8 7 7 10 10 12 8 10 8 10 11 11 11 11 10 10 11 11 11 11 11 12 12 12 3 0 |