| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-507H13.T7 (MSMg01no507_h13.b1) | MSMg01-507H13.TJ (MSMg01no507_h13.g1) |
|---|
| ACC | AG581613 | AG581614 |
|---|
| length | 1,523 | 753 |
|---|
length of high quality
(start - end) | --- | 393 (328 - 720) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no507_h13.b1 PHD_FILE: MSMg01no507_h13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:36:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no507_h13.g1 PHD_FILE: MSMg01no507_h13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:36:02 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | TCCTCTTTTCGTACGCTGCCGNTATCCTTTCATTATGTGTGGAGGATANG
GTTGTCTTTCCCTCACAATTAACGAGGGAGGTGAGACTTCAACTGAAAGT
ACTACTTTCCCACAACAAAGAGGATGTAGTGCGGCTTGTGTATGGAGATG
ACTCGCTACCCGCGCTCTTCTGCTCTTGAACTTTGTTGACATTCTCATAT
CTATAGACGCATACCTTGACTTCAGTGTGAGGTGTGCTTATTCATGAGAT
ATGCAAGAGCGAACGGGAGATGAGCAGACCTGACAGAGCTCATAGGACTC
ATGGTATATGTATTTATCTGTGCGAGCGCATTGTGTGGTGTGGCTACTAC
GTTCTCCACACCTTGCTATTTATCTCATTTATTCTGTTGGCGCGCACTTT
GTCGCTCTGTCGAGCCGCCTTGATCGTATACATTCGCTGCCTCTATTCTT
ATCGCGCCGCTGCCGGCCTCGATGCTGTCGTGTTCGATGGTGCGTCGCGT
CTGCGCACCGTGGGTGGGCGTGGGTGCTCTCTGATACCCGGGCGTGCAGT
CAGTGATGAGCGGGGTGTGAGCGTCGCTGTTGGATAACGCCCGTCTTGGT
GCGTAATGCGCACACGTAAATTGCGACGCACTATGACTATACATGTCACA
GTATCGCCGACGATATGCTGGATCACTAGGTGTCTGTGTACGTATGCAGT
AGTACGTAGATAACGATTATATGCGAGCAGTGTAGATAGTAAATGTAGTT
CCGACCTGCTAGGCACGCACACATGTATACGTTATCGCCTCCTAACTGTG
ATGTGGCGATTGCGTTGGTAACGAGCAAGAAGTCGTAGCAGCGAACCACG
CTCATAGTTATAGTGCTCNCGCAGATCGGTCCGCACGCGCACGCGACGTC
TGAGTGGTGGAGCACGCCGCGCGGTGTAGTATCTCAACTATATCTGTCCG
TTGTCCGCTCAGCGCACGTCGCAGCGCCATATATTCTATACATTATCACT
GCGTTCTCGATGTATCACAAGCGTCGCTCGTACCGCTCGACACTCGNTCG
CTACGTTTATTATGTTGCGATCGATACTAGACAATCGACAGTATCTCGTA
TCTTATACATCGCAACATCGTGATAGCTCTGACTGATCGCGTCTGCGCTG
CGTTCGCTATTATCGTTTAGCGGTACTATATCGCTGTACAGTGGCTTCGA
ATATGTGCGCGTACTCAGCGCGCATATACGAACTAGCTATCCGATATCTC
GCGCACGATACAATCTTGTATGAAACGCGGTCATTAATATATCGCTATGT
ATAAGATGTGGNGTGTTCTGCGTCATCGAGTGTGTGTGATGTGATTAGCN
GCCGCATTGTTCTGTGCATCTATCGAGTTGCTGTGTGTAGGTGTCACGCT
GCTGGCGCGTATGCTGTATCGCTACTAAACTGATAATAGTATATNCAGTG
ATCTGTCGCGGGCGCAGATCTCTACGATTAGTCCTCGGCACGTACTAAGC
GTTTATTCGATCATGCGCGTNCN
| NACATGCAGTGGGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTCCGGAAACCTACAGNGGGTGCTGTGCTTCGGGGAGGGGC
TGGGGAGTTTTCTGACCAAATGCAAAGTAGGTTCTGTCCTGAAGGGGCAG
TAGTGGCTCAGCTCCTGCCAACCAGCACCACTTAGAAAGAGAGCTTAAAT
AAATAGCAAGGGCCGCCGAGTTTTCAAGAAATGCAGGGAACCTGAAGCAT
CTTTCAAAGATATTGATGTCATGAATTTAAAAAAAAAAATGGGCACCAGT
TGGCCTCTCCCCCCCACTTTTATTATTGGTTCAAGCAGACCAGGGGCTGC
CAGTCTGCAAGCCCTGTCCAGAAGCCAGAGCAGAAGCGTTGGGACACATC
CCAGCAAGCAGATGGCAGGAGCTCCAGTCTGCTAATCACCCAATCCACCT
CCCCCTCTGGGCTCTGCCTAGGTGGGGAGATGTCTCAGATGCCAGTCTTA
ACCCAAGAGAGAAGGAGGACTCTCACTTTTAACCCGAGGATACAGCCACC
ATCCCACATCTGTGGTGGCAGAGGAGACGAGCCCTGGAGAATTGTGTTGG
CAGCATCCCTCAGGAGGCCAGATTCTCCAAGGCGTCTGGACACCTTGCTG
ACAGCTAAATGGAAGGAGGGCCCAAGCCTCTGGCTACTTGACTTGATTCT
ACCAGACTGGTCATTGTGATTGGATGACAGACGAATATTTCCCTCTCCTT
TTA
|
|---|
| quality values | Open.Hide.12 12 12 18 19 18 15 15 11 11 11 17 11 9 9 6 6 8 8 8 3 0 3 8 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 7 7 8 8 8 10 8 8 8 3 0 3
8 9 19 10 6 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 13 13 11 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 7 6 8 6 8 8 6 6 6
8 8 6 6 6 6 11 8 8 8 6 6 6 6 6 8 11 8 8 8 8 12 10 8 8 6 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9
9 9 9 9 10 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 8 10 12 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 10 6 6 8
6 9 10 8 8 11 8 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 7 8 8
10 10 12 10 10 10 11 10 8 8 8 8 6 6 6 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7 6 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 7 7 8 8 12 13 8 10 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8
8 9 11 11 10 12 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 6 6 8 6 7 13 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 7 7 6 6 9 10 11 9 9
9 11 11 6 7 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 7 7 7 9 9 9 12 10 13 13 15 10 10 10 9 9 9 9 11 8 8 6 6 6 6 6 6 6 8 12
10 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 7 7 8 7 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 7 6 6 8 8 8 8 10 8 6 6 9 10 12 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8
8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 7 9 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 10 6 6 6 6 6 6
7 8 9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 13 13 10 6 8 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 10 10 10 12 11 6 6 6 6 8 8 10 9 9 9 13 10 13 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 8 8
8 6 6 8 8 8 7 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 10 13 10 10 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6
10 10 8 8 8 8 8 9 9 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 10 13 10 12 10 7 6 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 11 6 6 6 7 8 8 8 6 6 6
6 6 6 11 10 12 8 8 6 6 8 8 11 9 9 9 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 7 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8
8 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 9 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 6 7 8 8 8 6 6 6 6 10 10 11 10 8 6 6 8 10 8 9 8 8 6 6
6 6 8 6 7 7 10 6 8 8 8 8 9 9 11 6 6 6 6 8 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 6 6 8 8 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 11 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8
8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 12 10 7 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 6 6 3 0 3 10 8
8 8 8 8 8 10 12 10 10 15 10 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 8 9 10 10 8 8
6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 10 16 17 16 8 8 8 8 9 8 8 10 10 10 13 11 8 6 6 6 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 7 7 9 9 11 12 17 13 9
9 9 9 9 10 11 8 8 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 9 7 6 6 6 6 6
6 9 15 13 12 12 11 11 11 10 10 10 11 8 10 8 9 10 10 10 10 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 8
10 6 6 6 6 8 8 9 10 9 6 8 8 8 8 8 11 8 8 12 11 13 11 10 8 6 6 6 6 6 6 9 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 15 11 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 12 20 14 11 11 10 10 9 9 10 8 8 8 6 8 6 6 8 3 0
3 8 8 8 6 6 6 7 10 15 9 8 8 8 11 6 7 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8 9 8
8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 6 8 7 7 7 10 8 8 10 8 7 7 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 13 15 15 8 3 0 3 11 9 9 9
9 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 6 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 7
7 7 7 6 10 8 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 7 7 3 0 3 0 | Open.Hide. 0 3 6 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 12 18 3 0 3 12 12 34 34 47 44 27 27 9 9 9 6 7 6 6 6 8 8 8 10 8 10 12 11 11 11 23 25
50 30 30 17 13 16 15 9 11 9 12 12 11 9 12 11 12 12 11 11 9 10 10 10 3 0 3 27 27 28 28 36 36 41 43 43 43 39 48 43 43 39 39 39 39 39 39 43 43 43
43 43 43 43 43 43 43 34 34 28 28 36 42 43 42 31 31 22 20 20 32 32 37 37 37 36 37 43 24 24 13 18 16 36 43 35 35 35 42 44 57 57 44 43 43 44 43 32 32 20
20 20 32 41 35 33 35 27 32 20 20 20 32 32 43 44 44 50 47 47 47 43 43 29 29 23 32 19 20 23 43 27 43 23 23 27 43 38 52 52 52 52 52 52 43 43 35 32 32 32
32 35 43 44 43 43 41 41 43 43 52 52 52 52 59 57 52 43 43 37 37 43 38 28 20 20 32 38 43 43 43 57 43 43 35 32 32 30 30 41 41 57 44 43 43 43 32 32 28 24
36 33 35 28 40 44 48 48 48 48 57 46 47 43 43 44 48 44 29 28 28 37 40 37 43 43 46 46 43 43 43 46 46 48 46 46 39 39 39 39 39 48 43 43 43 43 40 37 28 21
18 11 11 13 23 27 37 37 37 43 39 40 39 25 17 10 10 10 6 7 6 6 6 6 8 13 15 30 24 23 23 28 28 35 33 33 35 39 39 44 43 48 48 59 47 43 43 43 43 43
39 39 30 30 30 39 39 31 28 15 14 18 20 30 30 28 28 28 36 36 37 42 39 43 46 57 46 48 48 44 59 43 39 37 43 43 57 47 54 54 57 57 57 42 42 32 32 33 42 44
44 44 43 46 44 47 47 43 50 43 43 35 43 43 59 59 37 37 37 43 43 52 50 43 38 38 33 33 33 43 35 35 35 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 57
57 57 57 57 52 52 52 52 57 59 59 57 57 43 43 31 31 27 38 38 43 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 43 59 43 43 31 42 43 52 52 52 52 52 43 43 35 43 43 50
50 52 43 43 43 43 52 52 59 52 52 52 38 38 14 16 16 32 32 42 43 42 42 35 50 50 57 57 57 54 50 48 47 47 43 47 47 57 57 39 39 39 42 47 47 59 42 42 33 35
32 43 43 48 57 54 47 47 47 39 41 41 36 44 39 37 37 32 32 37 44 35 32 32 23 23 23 23 23 25 30 28 32 31 32 25 32 32 28 33 33 33 29 24 30 28 28 28 33 33
34 34 28 28 28 37 36 47 41 34 34 28 22 25 34 31 32 29 29 31 31 31 39 39 39 39 34 34 36 31 31 22 28 20 20 20 32 29 37 33 30 30 25 27 32 39 37 37 25 27
12 12 12 18 18 23 28 28 34 41 37 37 41 30 28 17 24 19 31 31 31 29 25 22 22 31 27 31 35 36 35 32 31 32 32 37 31 26 25 39 32 36 36 37 37 30 25 25 30 31
31 30 28 28 31 31 35 32 32 24 31 30 33 31 34 23 14 14 14 14 17 19 23 28 21 21 14 13 13 20 15 18 13 19 11 10 14 19 15 20 25 27 24 28 23 30 18 11 11 12
9 9 9 |
|---|
