BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-023P10
Chromosome9 (Build37)
Map Location 49,163,104 - 49,249,543
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDrd2, Ankk1, Ttc12
Upstream geneD930028F11Rik, EG640268, EG434401, LOC667933, Rexo2, Rbm7, EG434402, Nnmt, Zbtb16, Htr3a, Htr3b, Usp28, LOC100042785, Zw10, EG629400, Tmprss5, EG235327
Downstream geneNcam1, EG667975, LOC100042806, LOC100043346
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-023P10.bB6Ng01-023P10.g
ACCDH855738DH855739
length1,008411
definitionDH855738|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023P10, 5' end.DH855739|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-023P10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(49,163,104 - 49,164,118)(49,249,127 - 49,249,543)
sequence
gaattcctccagcaaatggttcagtatggaaagatctcagtatgccaagg
gtgtaaatagccttgaggacgtaggccactcttcgcgtgtagatgaaaac
atcattttcacagaagaaagcaatgggactggagtctcataactgctttg
ctgatgaccatatcctgaccctgactttgggcatgccttccacttaggtc
attttaccaaaccagcaccaccatgaaccttgtagcaaaagacaacatac
ttcacactcctgtaagaacaacctctttgtgtttctatttttcagatttg
ccacctatttagctgcatcatctatcttctgagaaatctaggtatgtgaa
acattaggcagaactaggctagcacttagaaatttgggcgcgtttgtggc
atcgtgtcaggactggagagctaccattgtttctgttatctcagaagata
aaaaagcacacaatggacaggttggtgttctgtatagcaagtgatacaag
aagttcattggcaggattggaatgtagcttgattgctggagtctctgcct
agcatgcatgaggacccgagtttgatccctatcatcaaatgtagtggtgc
atgtctgtaatcccagctcataggaggtagagacaggacgatgggggttc
aaagtcatcttcagctacatatcaatctcaaggacaacctgggttatatg
agaccttgtctcaaaacacaaacaaaaaacattccacaactaattagatg
ctgtgttgcatcaagtatggtgatggctcatgtcactaggcagatcttat
ggactgggcaataagagaggacaggtttcatgctctgcacacactcagac
atatgtaaggcatcattagatgtttacatgcatgagcaaatgaaatttct
caaagacagaggctctggggtgggggatgggtagtcttgtgctgactagt
atacatgaagtcctggcttcattcccactcactaaagattgaagaaccca
tggggcag
attaagactgctttagacagttagcctgaagagtgttgatgtcactccat
cataagatagatgtgaaggctacagagttaccacgtgaccaaacactact
ttaattttcccacaatctaacttaaactctaaatccactgtagctcttca
tggggcgttgggaggcaatggtccaagcaggggaagattcctaatgttct
ctatatctcctcctcctcctcctcctcacacactgactgactggatgggg
cccacagaggacaagaactttccatctgaaaagatgcaaacctctcactc
aggcagggaggtgatgtagagtggggggaggggtcttgagaacagacttt
tctgacactccaaaccttttaaaaaacagttagggtttcattgttgtaat
gagacaccatg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_49163104_49164118
seq2: B6Ng01-023P10.b_42_1049

seq1  GAATTCCTCCAGCAAATGGTTCAGTATGGAAAGATCTCAGTATGCCAAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTCCAGCAAATGGTTCAGTATGGAAAGATCTCAGTATGCCAAGG  50

seq1  GTGTAAATAGCCTTGAGGACGTAGGCCACTCTTCGCGTGTAGATGAAAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTAAATAGCCTTGAGGACGTAGGCCACTCTTCGCGTGTAGATGAAAAC  100

seq1  ATCATTTTCACAGAAGAAAGCAATGGGACTGGAGTCTCATAACTGCTTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTTCACAGAAGAAAGCAATGGGACTGGAGTCTCATAACTGCTTTG  150

seq1  CTGATGACCATATCCTGACCCTGACTTTGGGCATGCCTTCCACTTAGGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGACCATATCCTGACCCTGACTTTGGGCATGCCTTCCACTTAGGTC  200

seq1  ATTTTACCAAACCAGCACCACCATGAACCTTGTAGCAAAAGACAACATAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTACCAAACCAGCACCACCATGAACCTTGTAGCAAAAGACAACATAC  250

seq1  TTCACACTCCTGTAAGAACAACCTCTTTGTGTTTCTATTTTTCAGATTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACACTCCTGTAAGAACAACCTCTTTGTGTTTCTATTTTTCAGATTTG  300

seq1  CCACCTATTTAGCTGCATCATCTATCTTCTGAGAAATCTAGGTATGTGAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCTATTTAGCTGCATCATCTATCTTCTGAGAAATCTAGGTATGTGAA  350

seq1  ACATTAGGCAGAACTAGGCTAGCACTTAGAAATTTGGGCGCGTTTGTGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTAGGCAGAACTAGGCTAGCACTTAGAAATTTGGGCGCGTTTGTGGC  400

seq1  ATCGTGTCAGGACTGGAGAGCTACCATTGTTTCTGTTATCTCAGAAGATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGTGTCAGGACTGGAGAGCTACCATTGTTTCTGTTATCTCAGAAGATA  450

seq1  AAAAAGCACACAATGGACAGGTTGGTGTTCTGTATAGCAAGTGATACAAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGCACACAATGGACAGGTTGGTGTTCTGTATAGCAAGTGATACAAG  500

seq1  AAGTTCATTGGCAGGATTGGAATGTAGCTTGATTGCTGGAGTCTCTGCCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCATTGGCAGGATTGGAATGTAGCTTGATTGCTGGAGTCTCTGCCT  550

seq1  AGCATGCATGAGGACCCGAGTTTGATCCCTATCATCAAATGTAGTGGTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCATGCATGAGGACCCGAGTTTGATCCCTATCATCAAATGTAGTGGTGC  600

seq1  ATGTCTGTAATCCCAGCTCATAGGAGGTAGAGACAGGACGATGGGGGTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTGTAATCCCAGCTCATAGGAGGTAGAGACAGGACGATGGGGGTTC  650

seq1  AAAGTCATCTTCAGCTACATATCAATCTCAAGGACAACCTGGGTTATATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTCATCTTCAGCTACATATCAATCTCAAGGACAACCTGGGTTATATG  700

seq1  AGACCTTGTCTCAAAACACAAACAAAAAACATTCCACAACTAATTAGATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACCTTGTCTCAAAACACAAACAAAAAACATTCCACAACTAATTAGATG  750

seq1  CTGTGTTGCATCAAGTATGGTGATGGCTCATGTCACTAGGCAGATCTTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTGTTGCATCAAGTATGGTGATGGCTCATGTCACTAGGCAGATCTTAT  800

seq1  GGACTGGGCAATAAGGAGAGGACAGGTTTCATGCTCTGCACACACTCAGA  850
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGGGCAATAA-GAGAGGACAGGTTTCATGCTCTGCACACACTCAGA  849

seq1  CATATGTAAGGCATCATTAGATGTTTACATGCATGAGCAAATGAAATTTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGTAAGGCATCATTAGATGTTTACATGCATGAGCAAATGAAATTTC  899

seq1  TCAAAGACAGAGGGCTCTGGGGGTGGGGGATGGGTAGCCTGGTGCTTGAC  950
      ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| || |||| ||||
seq2  TCAAAGACAGA-GGCTCT-GGGGTGGGGGATGGGTAGTCTTGTGC-TGAC  946

seq1  TAGTATACATGAAGTCCTGGCTTCCATTCCCAACACCACTAAAGATTGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||    ||||||||||||||
seq2  TAGTATACATGAAGTCCTGGCTT-CATTCCCA--CTCACTAAAGATTGAA  993

seq1  GAACACATGGGGCAG  1015
      |||| ||||||||||
seq2  GAACCCATGGGGCAG  1008

seq1: chr9_49249127_49249543
seq2: B6Ng01-023P10.g_67_483 (reverse)

seq1  CATGGTGTCTCTTCACAGCAATGAAACCCTAACTGTTTTTTAAATGGTTT  50
      ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  CATGGTGTCTCATTACAACAATGAAACCCTAACTGTTTTTTAAAAGGTTT  50

seq1  GGAGTGTCAGAAAAGTCTGTTCTCAAGACCCCTCCCCCCACTCTACATCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTGTCAGAAAAGTCTGTTCTCAAGACCCCTCCCCCCACTCTACATCA  100

seq1  CCTCCCTGCCTGAGTGAGAGGTTTGCATCTTTTCAGATGGAAAGTTCTTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCTGCCTGAGTGAGAGGTTTGCATCTTTTCAGATGGAAAGTTCTTG  150

seq1  TCCTCTGTGGGCCCCATCCAGTCAGTCAGTGTGTGAGGAGGAGGAGGAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGTGGGCCCCATCCAGTCAGTCAGTGTGTGAGGAGGAGGAGGAGG  200

seq1  AGGAGATATAGAGAACATTAGGAATCTTCCCCTGCTTGGACCATTGCCTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGATATAGAGAACATTAGGAATCTTCCCCTGCTTGGACCATTGCCTC  250

seq1  CCAACGCCCCATGAAGAGCTACAGTGGATTTAGAGTTTAAGTTAGATTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACGCCCCATGAAGAGCTACAGTGGATTTAGAGTTTAAGTTAGATTGT  300

seq1  GGGAAAATTAAAGTAGTGTTTGGTCACGTGGTAACTCTGTAGCCTTCACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAATTAAAGTAGTGTTTGGTCACGTGGTAACTCTGTAGCCTTCACA  350

seq1  TCTATCTTATGATGGAGTGACATCAACACTCTTCAGGCTAACTGTCTAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCTTATGATGGAGTGACATCAACACTCTTCAGGCTAACTGTCTAAA  400

seq1  GCAGTCTTAATGAATTC  417
      |||||||||||||||||
seq2  GCAGTCTTAATGAATTC  417