BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056O07
Chromosome9 (Build37)
Map Location 74,758,567 - 74,795,091
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneUnc13c, Wdr72, Nr1h2-ps, LOC100040764, Onecut1
Downstream geneBC031353, Arpp19, LOC100040812, Myo5a, LOC677501, Myo5c, Gnb5, Bcl2l10, LOC384954, Mapk6, Leo1, EG666190, LOC100042070, Tmod3, Tmod2, Lysmd2, Scg3, LOC100042107, Bmp5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056O07.bB6Ng01-056O07.g
ACCDH878916DH878917
length1,033723
definitionDH878916|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056O07, 5' end.DH878917|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056O07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,794,054 - 74,795,091)(74,758,567 - 74,759,289)
sequence
gaattctttcttcattgtgccacatgtcgtttcctcccagtaaattctga
ctcatgtctagctttttctcagaaagcatcaagatgattccaggaagcag
gcctgggcatccatgtcctattcatcaagtgaatgcctcagagtggagac
attttgtgaagatgcggtgtgtaatgaagtcagcatggcttgtttgggtt
attgacatgagcacaaggcggcccccggttatggccataaatagtatgta
gcactcatccatgcaagatgcctcaaaatactgcctggcttgtggctccc
ttcatgccaggattctgatgtccctggccactgggattgatccaaggatc
aatatctaacctgaagcaaccctgtgcaactttggtggcctgcagagtgg
cctgttgctaaagaatggagccagatagaagtgcatcacgctggttaatg
acttgctaatccagattggagtgtgttataccggttagtgacagctaagc
caaagactcatggattatactggttagtgacttgctaaaccagataggga
tatgttacactggttagtatctggctagagacacagaggcatgtgttaca
ctgcttagtgcctgtacattactctaaagaagtactaggtacacacattc
ttcctgatggtggtggtgggagagctgggatgtgctccagatacgcatag
ttagtaccagctcactctctaacacagagccctccctgagagtagccaac
agggtaaggggcaacagcaccttagttctcaaagaataccaagtgatctt
taaagatttttttttattttatatgtacggtgagtacactttcactgtcc
tcagacacaccagaagaggacctttgcatcccattacagatggttgtgag
tcaccatttggttgctgggaattgaactcaggactctgggaagcagtagt
gctcttaatcgttgagcctctctccaccccctacccccaccaaataatct
ttaaggaaaaagtacttgctatcatttttattc
gaattcaaggccagtcttggctacatagtgaactggaggccagcctggcc
tacatgagaccttgtctcaaaaaacagagagtgttggtccagagacatgg
ctcagtggttaagagcactcactggctgctcttctagaggtcctgagttc
aattcccagcaaccacatggtagctcacaaccatctgtaatgggatctga
tgccctcttctggtgtgtctgaagacagctacggtgtactcacatacata
aaataaataaatctaaaaacaaacaaaccacagaaagtgaaagaataatg
acttaacattgtctttttcctttgagacagggtctcactgtgttgcctag
gctggccttgaactcctgaactaagatgctcttcccagccctagcctcca
gagtagctgggattgtaggtgtgacccaccaccctcagatttggtacaaa
aatatcaagcaagtatgctatctccacaaacctccctcagcctgtgtgcg
ggactaggacatcatgctagtttcttcccagttagtggtcattgtattta
cccttaagagaaaagcagggaatggctttggttcaaaagaaataatcata
aaactaattctgattacaacatgatatgaccttttaactcgcagtgctct
ctttctctccctctctctctctctctctctctctctctgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_74794054_74795091
seq2: B6Ng01-056O07.b_45_1077 (reverse)

seq1  GAATAAAAAATGAATAGCAAGTAACTTTTTCCTTTAAAGATTATTTGGTG  50
      |||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
seq2  GAAT-AAAAATG-ATAGCAAGT-ACTTTTTCC-TTAAAGATTATTTGGTG  46

seq1  GGGGTAGGGGGTGGAGAGATGGCTCAACGATTAAGAGCACTGACTGCTTT  100
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||
seq2  GGGGTAGGGGGTGGAGAGA-GGCTCAACGATTAAGAGCACT-ACTGC-TT  93

seq1  TCCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCAAATGGTGACTCACAACC  150
       ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGA-GTCCTGAGTTCAATTCCCAGCAACCAAATGGTGACTCACAACC  142

seq1  ATCTGTAATGGGATGC-AAGGTCCTCTTCTGGTGTGTCTGAGGACAGTGA  199
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGTAATGGGATGCAAAGGTCCTCTTCTGGTGTGTCTGAGGACAGTGA  192

seq1  AAGTGTACTCACCGTACATATAAAAT-AAATAAAATCTTTAAAGATCACT  248
      |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTACTCACCGTACATATAAAATAAAAAAAAATCTTTAAAGATCACT  242

seq1  TGGTATTCTTTGAGAACT-AGGTGCTGTTGCCCCTTACCCTGTTGGCTAC  297
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTATTCTTTGAGAACTAAGGTGCTGTTGCCCCTTACCCTGTTGGCTAC  292

seq1  TCTCAGGGAGGGCTCTGTGTTAGAGAGTGAGCTGGTACTAACTATGCGTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAGGGAGGGCTCTGTGTTAGAGAGTGAGCTGGTACTAACTATGCGTA  342

seq1  TCTGGAGCACATCCCAGCTCTCCCACCACCACCATCAGGAAGAATGTGTG  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAGCACATCCCAGCTCTCCCACCACCACCATCAGGAAGAATGTGTG  392

seq1  TACCTAGTACTTCTTTAGAGTAATGTACAGGCACTAAGCAGTGTAACACA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTAGTACTTCTTTAGAGTAATGTACAGGCACTAAGCAGTGTAACACA  442

seq1  TGCCTCTGTGTCTCTAGCCAGATACTAACCAGTGTAACATATCCCTATCT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTGTGTCTCTAGCCAGATACTAACCAGTGTAACATATCCCTATCT  492

seq1  GGTTTAGCAAGTCACTAACCAGTATAATCCATGAGTCTTTGGCTTAGCTG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTAGCAAGTCACTAACCAGTATAATCCATGAGTCTTTGGCTTAGCTG  542

seq1  TCACTAACCGGTATAACACACTCCAATCTGGATTAGCAAGTCATTAACCA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTAACCGGTATAACACACTCCAATCTGGATTAGCAAGTCATTAACCA  592

seq1  GCGTGATGCACTTCTATCTGGCTCCATTCTTTAGCAACAGGCCACTCTGC  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGTGATGCACTTCTATCTGGCTCCATTCTTTAGCAACAGGCCACTCTGC  642

seq1  AGGCCACCAAAGTTGCACAGGGTTGCTTCAGGTTAGATATTGATCCTTGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCACCAAAGTTGCACAGGGTTGCTTCAGGTTAGATATTGATCCTTGG  692

seq1  ATCAATCCCAGTGGCCAGGGACATCAGAATCCTGGCATGAAGGGAGCCAC  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAATCCCAGTGGCCAGGGACATCAGAATCCTGGCATGAAGGGAGCCAC  742

seq1  AAGCCAGGCAGTATTTTGAGGCATCTTGCATGGATGAGTGCTACATACTA  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGGCAGTATTTTGAGGCATCTTGCATGGATGAGTGCTACATACTA  792

seq1  TTTATGGCCATAACCGGGGGCCGCCTTGTGCTCATGTCAATAACCCAAAC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGGCCATAACCGGGGGCCGCCTTGTGCTCATGTCAATAACCCAAAC  842

seq1  AAGCCATGCTGACTTCATTACACACCGCATCTTCACAAAATGTCTCCACT  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCATGCTGACTTCATTACACACCGCATCTTCACAAAATGTCTCCACT  892

seq1  CTGAGGCATTCACTTGATGAATAGGACATGGATGCCCAGGCCTGCTTCCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGCATTCACTTGATGAATAGGACATGGATGCCCAGGCCTGCTTCCT  942

seq1  GGAATCATCTTGATGCTTTCTGAGAAAAAGCTAGACATGAGTCAGAATTT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCATCTTGATGCTTTCTGAGAAAAAGCTAGACATGAGTCAGAATTT  992

seq1  ACTGGGAGGAAACGACATGTGGCACAATGAAGAAAGAATTC  1038
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGGGAGGAAACGACATGTGGCACAATGAAGAAAGAATTC  1033

seq1: chr9_74758567_74759289
seq2: B6Ng01-056O07.g_68_790

seq1  GAATTCAAGGCCAGTCTTGGCTACATAGTGAACTGGAGGCCAGCCTGGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCCAGTCTTGGCTACATAGTGAACTGGAGGCCAGCCTGGCC  50

seq1  TACATGAGACCTTGTCTCAAAAAACAGAGAGTGTTGGTCCAGAGACATGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGAGACCTTGTCTCAAAAAACAGAGAGTGTTGGTCCAGAGACATGG  100

seq1  CTCAGTGGTTAAGAGCACTCACTGGCTGCTCTTCTAGAGGTCCTGAGTTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTGGTTAAGAGCACTCACTGGCTGCTCTTCTAGAGGTCCTGAGTTC  150

seq1  AATTCCCAGCAACCACATGGTAGCTCACAACCATCTGTAATGGGATCTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCCAGCAACCACATGGTAGCTCACAACCATCTGTAATGGGATCTGA  200

seq1  TGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACGGTGTACTCACATACATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTTCTGGTGTGTCTGAAGACAGCTACGGTGTACTCACATACATA  250

seq1  AAATAAATAAATCTAAAAACAAACAAACCACAGAAAGTGAAAGAATAATG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATAAATCTAAAAACAAACAAACCACAGAAAGTGAAAGAATAATG  300

seq1  ACTTAACATTGTCTTTTTCCTTTGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAACATTGTCTTTTTCCTTTGAGACAGGGTCTCACTGTGTTGCCTAG  350

seq1  GCTGGCCTTGAACTCCTGAACTAAGATGCTCTTCCCAGCCCTAGCCTCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGCCTTGAACTCCTGAACTAAGATGCTCTTCCCAGCCCTAGCCTCCA  400

seq1  GAGTAGCTGGGATTGTAGGTGTGACCCACCACCCTCAGATTTGGTACAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTAGCTGGGATTGTAGGTGTGACCCACCACCCTCAGATTTGGTACAAA  450

seq1  AATATCAAGCAAGTATGCTATCTCCACAAACCTCCCTCAGCCTGTGTGCG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCAAGCAAGTATGCTATCTCCACAAACCTCCCTCAGCCTGTGTGCG  500

seq1  GGACTAGGACATCATGCTAGTTTCTTCCCAGTTAGTGGTCATTGTATTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTAGGACATCATGCTAGTTTCTTCCCAGTTAGTGGTCATTGTATTTA  550

seq1  CCCTTAAGAGAAAAGCAGGGAATGGCTTTGGTTCAAAAGAAATAATCATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTTAAGAGAAAAGCAGGGAATGGCTTTGGTTCAAAAGAAATAATCATA  600

seq1  AAACTAATTCTGATTACAACATGATATGACCTTTTAACTCGCAGTGCTCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTAATTCTGATTACAACATGATATGACCTTTTAACTCGCAGTGCTCT  650

seq1  CTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGTGTGTGTGTGT  700

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  723
      |||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  723