BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-066G05
Chromosome9 (Build37)
Map Location 15,306,194 - 15,494,536
singlet/doubletdoublet
Overlap geneBC017612, Ccdc67, LOC665461, LOC330891
Upstream gene0610040D20Rik, Amotl1, EG665374, Piwil4, Fut4, 1700012B09Rik, Ankrd49, Mre11a, LOC100040259, Gpr83, Folr4, Panx1, Hephl1, 2200002K05Rik, Crsp6, 4931406C07Rik, Josd3, 5830418K08Rik, LOC100040375, LOC100039955
Downstream geneSlc36a4, Mtnr1b, Fat3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-066G05.bB6Ng01-066G05.g
ACCDH885581DH885582
length742967
definitionDH885581|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-066G05, 5' end.DH885582|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-066G05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(15,493,795 - 15,494,536)(15,306,194 - 15,307,163)
sequence
gaattcatacatgaagtcagcgccaccctgcagagcatgtttccctgtat
tacaggaacttgagggggcagatatcagggctggaggtgacagaggaatg
tcacagctcagctctgtccccagctctgtgactgagaaggaggagtgtgg
ctggatagcagtactttccggtaagggagccttgtacccactgctgtaga
ctgaggagaggtctcgaggtttaaggaatagcttgggacttgagagaagg
ctcagcagctacaagcacttgctgcttcatcagagctctgggttgggttc
tgggcaccacgtggttcgcagccatttgcaacaccagttccaaaggactg
gattcctgtgtgctctttacttatctgttgctcttgttttgtttttgaga
taatatcacatggcctggtctggcctcacactcaccgtgtagttgaagat
gactttgaattcctgtttcctcgccttctaccattcaagtgctggaatta
caggtgtgagataccacacaagattgaggaggctaggaatggaagtcagg
gcttcctgcatgtgcacgaagtactctaccaactaagccatatccccagc
cccaaaataaattcttgaaagagaaaaaaaaattgtccatagactctcaa
gaattgtctgtaatgaaatgaatgactttggctgagaaaaccatgcatag
gtaagaaagaaatgtgatgggttagggaggtgtggggataaa
taggcctgcctgcctatcaagctcatgcgtctacgctcctaacagcagtc
cccaggctgacgtagctcttcattctccccagtcacatgtgttcgttgtg
tttgcaccacactgtgtgtgtgcatgtgcacacacgctgacaagttcatg
caaggcccctaatttgtttgctgattttttttttctttccactggatatc
agaggcctgcagggtgaatgtggaaaaggtggtactcaaggcctgcgtta
caccatgtagctggtgtctacatagggaaatgacagccctgctgaaggcc
atgcttagtgtttgagcacgtggtctggggcctatgaggtcccagtgctc
catgcacagatgcaggagtcctcgggagtaggcagagagtcagtcacaga
gactgtgacttgagtctggacgatgtgtgtgacagttagtgctacaaaag
gagtaaggtgatgcatgcctttaagcccagcactctggaggtagaggcag
gcaagatttctgagttcaaggtcagcctggtcctggtctacagagtgagt
tccatgacggccagggttacaaagagaaacctaccccctcccccaccccc
aaaagccctaaacctgaatggaataatagtggcctgcggcatgagagaga
cttgagagtgatgtgcagtaggtgccaaaggtattgccctaaataatagc
agattcaaggcctcaccttgggtctggcttcttagaacacaaattgaaac
gagccatgactaacctgtagagagcagattggcttttattacacgctgca
tttgacagataaagaccccaggggcaaggtgcctgttcaggtcacagtgt
aatggagaggagagccgagctggatcctgccccctggcccgctgcattca
ttactctggcagccctcctggaggaaggagtggctacctgggggagttgg
ggttgagaatggatgaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_15493795_15494536
seq2: B6Ng01-066G05.b_44_785 (reverse)

seq1  TTTATCCCCACACCTCCCTAACCCATCACATTTCTTTCTTACCTATGCAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCCCCACACCTCCCTAACCCATCACATTTCTTTCTTACCTATGCAT  50

seq1  GGTTTTCTCAGCCAAAGTCATTCATTTCATTACAGACAATTCTTGAGAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTTCTCAGCCAAAGTCATTCATTTCATTACAGACAATTCTTGAGAGT  100

seq1  CTATGGACAATTTTTTTTTCTCTTTCAAGAATTTATTTTGGGGCTGGGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGGACAATTTTTTTTTCTCTTTCAAGAATTTATTTTGGGGCTGGGGA  150

seq1  TATGGCTTAGTTGGTAGAGTACTTCGTGCACATGCAGGAAGCCCTGACTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGCTTAGTTGGTAGAGTACTTCGTGCACATGCAGGAAGCCCTGACTT  200

seq1  CCATTCCTAGCCTCCTCAATCTTGTGTGGTATCTCACACCTGTAATTCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTCCTAGCCTCCTCAATCTTGTGTGGTATCTCACACCTGTAATTCCA  250

seq1  GCACTTGAATGGTAGAAGGCGAGGAAACAGGAATTCAAAGTCATCTTCAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTTGAATGGTAGAAGGCGAGGAAACAGGAATTCAAAGTCATCTTCAA  300

seq1  CTACACGGTGAGTGTGAGGCCAGACCAGGCCATGTGATATTATCTCAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACACGGTGAGTGTGAGGCCAGACCAGGCCATGTGATATTATCTCAAAA  350

seq1  ACAAAACAAGAGCAACAGATAAGTAAAGAGCACACAGGAATCCAGTCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAACAAGAGCAACAGATAAGTAAAGAGCACACAGGAATCCAGTCCTT  400

seq1  TGGAACTGGTGTTGCAAATGGCTGCGAACCACGTGGTGCCCAGAACCCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAACTGGTGTTGCAAATGGCTGCGAACCACGTGGTGCCCAGAACCCAA  450

seq1  CCCAGAGCTCTGATGAAGCAGCAAGTGCTTGTAGCTGCTGAGCCTTCTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGAGCTCTGATGAAGCAGCAAGTGCTTGTAGCTGCTGAGCCTTCTCT  500

seq1  CAAGTCCCAAGCTATTCCTTAAACCTCGAGACCTCTCCTCAGTCTACAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTCCCAAGCTATTCCTTAAACCTCGAGACCTCTCCTCAGTCTACAGC  550

seq1  AGTGGGTACAAGGCTCCCTTACCGGAAAGTACTGCTATCCAGCCACACTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGGTACAAGGCTCCCTTACCGGAAAGTACTGCTATCCAGCCACACTC  600

seq1  CTCCTTCTCAGTCACAGAGCTGGGGACAGAGCTGAGCTGTGACATTCCTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTCTCAGTCACAGAGCTGGGGACAGAGCTGAGCTGTGACATTCCTC  650

seq1  TGTCACCTCCAGCCCTGATATCTGCCCCCTCAAGTTCCTGTAATACAGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCACCTCCAGCCCTGATATCTGCCCCCTCAAGTTCCTGTAATACAGGG  700

seq1  AAACATGCTCTGCAGGGTGGCGCTGACTTCATGTATGAATTC  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATGCTCTGCAGGGTGGCGCTGACTTCATGTATGAATTC  742

seq1: chr9_15306194_15307163
seq2: B6Ng01-066G05.g_82_1047

seq1  AGGCCTGCCTGCCTATCAAGCTCATGCGTCTACGCTCCTAACAGCAGTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTGCCTGCCTATCAAGCTCATGCGTCTACGCTCCTAACAGCAGTCC  50

seq1  CCAGGCTGACGTAGCTCTTCATTCTCCCCAGTCACATGTGTTCGTTGTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTGACGTAGCTCTTCATTCTCCCCAGTCACATGTGTTCGTTGTGT  100

seq1  TTGCACCACACTGTGTGTGTGCATGTGCACACACGCTGACAAGTTCATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACCACACTGTGTGTGTGCATGTGCACACACGCTGACAAGTTCATGC  150

seq1  AAGGCCCCTAATTTGTTTGCTGATTTTTTTTTTCTTTCCACTGGATATCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCCCCTAATTTGTTTGCTGATTTTTTTTTTCTTTCCACTGGATATCA  200

seq1  GAGGCCTGCAGGGTGAATGTGGAAAAGGTGGTACTCAAGGCCTGCGTTAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGCCTGCAGGGTGAATGTGGAAAAGGTGGTACTCAAGGCCTGCGTTAC  250

seq1  ACCATGTAGCTGGTGTCTACATAGGGAAATGACAGCCCTGCTGAAGGCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCATGTAGCTGGTGTCTACATAGGGAAATGACAGCCCTGCTGAAGGCCA  300

seq1  TGCTTAGTGTTTGAGCACGTGGTCTGGGGCCTATGAGGTCCCAGTGCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAGTGTTTGAGCACGTGGTCTGGGGCCTATGAGGTCCCAGTGCTCC  350

seq1  ATGCACAGATGCAGGAGTCCTCGGGAGTAGGCAGAGAGTCAGTCACAGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCACAGATGCAGGAGTCCTCGGGAGTAGGCAGAGAGTCAGTCACAGAG  400

seq1  ACTGTGACTTGAGTCTGGACGATGTGTGTGACAGTTAGTGCTACAAAAGG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTGACTTGAGTCTGGACGATGTGTGTGACAGTTAGTGCTACAAAAGG  450

seq1  AGTAAGGTGATGCATGCCTTTAAGCCCAGCACTCTGGAGGTAGAGGCAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAGGTGATGCATGCCTTTAAGCCCAGCACTCTGGAGGTAGAGGCAGG  500

seq1  CAAGATTTCTGAGTTCAAGGTCAGCCTGGTCCTGGTCTACAGAGTGAGTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATTTCTGAGTTCAAGGTCAGCCTGGTCCTGGTCTACAGAGTGAGTT  550

seq1  CCATGACGGCCAGGGTTACAAAGAGAAACCTACCCCCTCCCCCACCCCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGACGGCCAGGGTTACAAAGAGAAACCTACCCCCTCCCCCACCCCCA  600

seq1  AAAGCCCTAAACCTGAATGGAATAATAGTGGCCTGCGGCATGAGAGAGAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCCCTAAACCTGAATGGAATAATAGTGGCCTGCGGCATGAGAGAGAC  650

seq1  TTGAGAGTGATGTGCAGTAGGTGCCAAAGGTATTGCCCTAAATAATAGCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGTGATGTGCAGTAGGTGCCAAAGGTATTGCCCTAAATAATAGCA  700

seq1  GATTCAAGGCCTCACCTTGGGTCTGGCTTCTTAGAACACAAATTGAAACG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAAGGCCTCACCTTGGGTCTGGCTTCTTAGAACACAAATTGAAACG  750

seq1  AGCCATGACTAACCTGTAGAGAGCAGATTGGCTTTTATTACACGCTGCAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCATGACTAACCTGTAGAGAGCAGATTGGCTTTTATTACACGCTGCAT  800

seq1  TTGACAGATAAAGACCCCAGGGGCAAGGTGCCTGTTCAAGGTCACAGTGT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TTGACAGATAAAGACCCCAGGGGCAAGGTGCCTGTTC-AGGTCACAGTGT  849

seq1  AATGGAGAGGAGAGCCGAGCTGGATCCTGCCCCCTGGCCCGCTGCAGTCA  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AATGGAGAGGAGAGCCGAGCTGGATCCTGCCCCCTGGCCCGCTGCATTCA  899

seq1  TTACTCTGGCAGCCCTCCTGGAGGAAGGAGCTGGCTACCTGGGGGAAGTT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  TTACTCTGGCAGCCCTCCTGGAGGAAGGAG-TGGCTACCTGGGGG-AGTT  947

seq1  GGTGTTGTGAATTGGATGAA  970
      || |||| ||| ||||||||
seq2  GGGGTTGAGAA-TGGATGAA  966