BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-067K05
Chromosome9 (Build37)
Map Location 69,944,522 - 70,073,774
singlet/doubletdoublet
Overlap gene6430514L14Rik, Myo1e
Upstream geneRora, Narg2, EG665815, EG244913, Anxa2, Foxb1, Bnip2, LOC624164, Gtf2a2, Gcnt3
Downstream geneCcnb2, Rnf111, Sltm, B230380D07Rik, Adam10, Cycs-ps1, Lipc, LOC100041622, LOC100041628, Aqp9, 1700020I22Rik, LOC100041660, Aldh1a2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-067K05.bB6Ng01-067K05.g
ACCDH886460DH886461
length1,101530
definitionDH886460|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067K05, 5' end.DH886461|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-067K05, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,944,522 - 69,945,628)(70,073,239 - 70,073,774)
sequence
gaattcatagtagcttaatctacttgatgctttgtctcaaaagaaagcac
ccttacaataatccattcctctagtcccctttccctccagagcccttaaa
ataactatcaatgtatgttccccttaatcaccttcttcttatttgaatta
gcatgtaatgaaactatagaatatatatagttatgtatagaggtgtaata
aacatagaagtacaatttaaataataaaaaaatccattagagtcactgaa
atgtctatttttggttttatatagtgtcacatgtcactggagtacatggc
tgcctagctagagaccacattttctagcctcccttgcagctagatggata
tgatggctaatctcctgggtcatcttgacttgatttggaatcatctggga
gacacaccttgaagcattaagtgagggtgtttccagaggaattgaatgaa
gaggggaggcacactctaaatgtataaaataccatctcatggactggagt
cccatgaattaaaaaaaaaaaaaaggaaggaaggaaggaaggagacagga
taccaagcactcatctttcctctttttttcttttccttttttttttaaag
attattttatttatatgagtacactgtagctatttccagacacaccagaa
gagggcatcagatcccttcacagatggttgtgagccaccatgtggttgct
ggatattgaactcaggacctttggaagagcaggacctttggatggctctt
aactattaagccatcactccagccccggcactcatcttttcaacccctga
ctatagatgcaatgtgactagctctcctgtgctccagctaccacatgttc
atcaccatggtggatggtattccctcaaactgtgagccaaatggccatct
cattacttgagctgcctttgtcaggtcccagcatgagaaacgtaatagtt
acagtgcagcgcaccaatgactcagatgattggcagtacatgaagtacat
acatggctctgattacatcccccagacaagctgtgcctgggttttccctc
tgtgcagctgggaaaagcagactatgaactgtaaagtttccccactgggt
g
aagatgctctctgtagctttcatatgacaggatttctggaaagtacaggt
gacctgaggcagaaatccaccctgcaggggattgaattcagggcctcacc
tatgaagcctgttttctgtccctcagctaagctctatgcttagccctatt
aacacaaggcgtctacctgctagtacaccttgccgggggggggggggcag
tgcatatgtgaacttgggtgtacatgatgtgcatatgtgtgtgtggaagt
cagaggccaacctcaggattcactcctcaggcataaactgctgcccacct
gtctccccctttccggctgggattacaagggctgacaccacagctagctg
tgtttgtgggtttgctttgttttgagacaaagtctcacaatgtagtcctg
gctagcctcgaactctctgaggtcttcctcttgcctctgactatctcact
ggttctagaagttttgatgggctagttcagagccattggtcaaggtacca
aggctggaatctattgcagccacagacagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_69944522_69945628
seq2: B6Ng01-067K05.b_46_1145

seq1  GAATTCATAGTAGCTTAATCTACTTGATGCTTTGTCTCAAAAGAAAGCAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAGTAGCTTAATCTACTTGATGCTTTGTCTCAAAAGAAAGCAC  50

seq1  CCTTACAATAATCCATTCCTCTAGTCCCCTTTCCCTCCAGAGCCCTTAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACAATAATCCATTCCTCTAGTCCCCTTTCCCTCCAGAGCCCTTAAA  100

seq1  ATAACTATCAATGTATGTTCCCCTTAATCACCTTCTTCTTATTTGAATTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACTATCAATGTATGTTCCCCTTAATCACCTTCTTCTTATTTGAATTA  150

seq1  GCATGTAATGAAACTATAGAATATATATAGTTATGTATAGAGGTGTAATA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGTAATGAAACTATAGAATATATATAGTTATGTATAGAGGTGTAATA  200

seq1  AACATAGAAGTACAATTTAAATAATAAAAAAATCCATTAGAGTCACTGAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATAGAAGTACAATTTAAATAATAAAAAAATCCATTAGAGTCACTGAA  250

seq1  ATGTCTATTTTTGGTTTTATATAGTGTCACATGTCACTGGAGTACATGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTATTTTTGGTTTTATATAGTGTCACATGTCACTGGAGTACATGGC  300

seq1  TGCCTAGCTAGAGACCACATTTTCTAGCCTCCCTTGCAGCTAGATGGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTAGCTAGAGACCACATTTTCTAGCCTCCCTTGCAGCTAGATGGATA  350

seq1  TGATGGCTAATCTCCTGGGTCATCTTGACTTGATTTGGAATCATCTGGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGGCTAATCTCCTGGGTCATCTTGACTTGATTTGGAATCATCTGGGA  400

seq1  GACACACCTTGAAGCATTAAGTGAGGGTGTTTCCAGAGGAATTGAATGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACACCTTGAAGCATTAAGTGAGGGTGTTTCCAGAGGAATTGAATGAA  450

seq1  GAGGGGAGGCACACTCTAAATGTATAAAATACCATCTCATGGACTGGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGGAGGCACACTCTAAATGTATAAAATACCATCTCATGGACTGGAGT  500

seq1  CCCATGAATTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAGACAGGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATGAATTAAAAAAAAAAAAAAGGAAGGAAGGAAGGAAGGAGACAGGA  550

seq1  TACCAAGCACTCATCTTTCCTCTTTTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTAAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAGCACTCATCTTTCCTCTTTTTTTCTTTTCCTTTTTTTTTTAAAG  600

seq1  ATTATTTTATTTATATGAGTACACTGTAGCTATTTCCAGACACACCAGAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTTTATTTATATGAGTACACTGTAGCTATTTCCAGACACACCAGAA  650

seq1  GAGGGCATCAGATCCCTTCACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGCATCAGATCCCTTCACAGATGGTTGTGAGCCACCATGTGGTTGCT  700

seq1  GGATATTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGCAGGACCTTTGGATGGCTCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATATTGAACTCAGGACCTTTGGAAGAGCAGGACCTTTGGATGGCTCTT  750

seq1  AACTATTAAGCCATCACTCCAGCCCCGGCACTCATCTTTTCAACCCCTGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTAAGCCATCACTCCAGCCCCGGCACTCATCTTTTCAACCCCTGA  800

seq1  CTATAGATGCAATGTGACTAGCTCTCCTGTGCTCCAGCTACCACATGTTC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAGATGCAATGTGACTAGCTCTCCTGTGCTCCAGCTACCACATGTTC  850

seq1  ATCACCATGGTGGATGGTATTCCCTCAAACTGTGAGCCAAATGGCCATCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATCACCATGGTGGATGGTATTCCCTCAAACTGTGAGCCAAATGGCCATC-  899

seq1  TCATTACTTGAGCTGCCTTTGTCAGGTCCCAGCAATGAGAAACGTAATAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||
seq2  TCATTACTTGAGCTGCCTTTGTCAGGTCCCAGC-ATGAGAAACGTAATAG  948

seq1  TTACAGTGCAGCGCACCAATGACTCAGATGATTGGCAGTACATGAAGTAC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGTGCAGCGCACCAATGACTCAGATGATTGGCAGTACATGAAGTAC  998

seq1  ATACATGGCTCTGATTACATCCCCCAAGACACAGCTGTTGCCCTGGGTTT  1050
      ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||   |||||||||
seq2  ATACATGGCTCTGATTACATCCCCC-AGACA-AGCTGT--GCCTGGGTTT  1044

seq1  TCCCTCTGTAGCAGCTGGGAAAAGCAGGACTA-GAACTGTAGAGGCTCCA  1099
      ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||| 
seq2  TCCCTCTGT-GCAGCTGGGAAAAGCA-GACTATGAACTGTAAAGTTTCCC  1092

seq1  CACTGGGT  1107
      ||||||||
seq2  CACTGGGT  1100

seq1: chr9_70073239_70073774
seq2: B6Ng01-067K05.g_70_605 (reverse)

seq1  CCTGTCTGTGGCTGCAATTGATTCCAGCCTTGGTACCTTGACCAATGGCT  50
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCTGTGGCTGCAATAGATTCCAGCCTTGGTACCTTGACCAATGGCT  50

seq1  CTGAACTAGCCCATCAAAACTTCTAGAACCAGTGAGATAGTCAGAGGCAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACTAGCCCATCAAAACTTCTAGAACCAGTGAGATAGTCAGAGGCAA  100

seq1  GAGGAAGACCTCAGAGAGTTCGAGGCTAGCCAGGACTACATTGTGAGACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAGACCTCAGAGAGTTCGAGGCTAGCCAGGACTACATTGTGAGACT  150

seq1  TTGTCTCAAAACAAAGCAAACCCACAAACACAGCTAGCTGTGGTGTCAGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTCAAAACAAAGCAAACCCACAAACACAGCTAGCTGTGGTGTCAGC  200

seq1  CCTTGTAATCCCAGCCGGAAAGGGGGAGACAGGTGGGCAGCAGTTTATGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGTAATCCCAGCCGGAAAGGGGGAGACAGGTGGGCAGCAGTTTATGC  250

seq1  CTGAGGAGTGAATCCTGAGGTTGGCCTCTGACTTCCACACACACATATGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGAGTGAATCCTGAGGTTGGCCTCTGACTTCCACACACACATATGC  300

seq1  ACATCATGTACACCCAAGTTCACATATGCACTGCCCCCCCCCCCCCGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCATGTACACCCAAGTTCACATATGCACTGCCCCCCCCCCCCCGGCA  350

seq1  AGGTGTACTAGCAGGTAGACGCCTTGTGTTAATAGGGCTAAGCATAGAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTACTAGCAGGTAGACGCCTTGTGTTAATAGGGCTAAGCATAGAGC  400

seq1  TTAGCTGAGGGACAGAAAACAGGCTTCATAGGTGAGGCCCTGAATTCAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTGAGGGACAGAAAACAGGCTTCATAGGTGAGGCCCTGAATTCAAT  450

seq1  CCCCTGCAGGGTGGATTTCTGCCTCAGGTCACCTGTACTTTCCAGAAATC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCTGCAGGGTGGATTTCTGCCTCAGGTCACCTGTACTTTCCAGAAATC  500

seq1  CTGTCATATGAAAGCTACAGAGAGCATCTTGAATTC  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTCATATGAAAGCTACAGAGAGCATCTTGAATTC  536