BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-076J17
Chromosome9 (Build37)
Map Location 77,624,937 - 77,757,846
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGclc, LOC100042212
Upstream geneTinag, LOC436082, 2310046A06Rik, 5730403I07Rik, Lrrc1, Klhl31
Downstream geneElovl5, Gcm1, LOC666353, Fbxo9, Ick, C920006O11Rik, Gsta4, LOC100041074, Gsta1, LOC666367, LOC100042295, LOC666373, LOC100042314, Omt2a, EG666383, Omt2b, Gsta2, Dppa5, 2410146L05Rik, LOC666408, LOC100042356, LOC666419, E330016A19Rik, Mto1, Eef1a1, Slc17a5, Cd109, LOC384957, EG666456
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-076J17.bB6Ng01-076J17.g
ACCDH892825DH892826
length912693
definitionDH892825|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076J17, 5' end.DH892826|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-076J17, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,624,937 - 77,625,852)(77,757,156 - 77,757,846)
sequence
gaattctgctcatcaagctcgtttctctgctatagatgcctgcctgctcc
atcaaagacatgggagaggatccttagccttgaagcactgaacttttgtg
atgctgtttttccttctgagagcacagccattcagtcataccattgatcc
tagaagggcattcttttaagtaggaattagtagcttttaagctccccatt
gtcattcctacatagagtagttaaaaccttcaagtcaattgtcagatatt
tagagtctctgagcaccttttcttttccagacccagagaggctttgcttt
gcagagctgaggagacagcagagatcaatcaaatacctattatataatta
tataatgataaaattaaggagtggcatggggtgtggatatggctatcagt
tctggggtagaggaagacatctccaagggaagatgattggagtgatgtcc
aaaactctaggaagaatttcacaggagagggagcagagcgatattctggg
ggtagaggggtcacatagacagcctggtggggagtagaagaaaggagtta
cccactgtgaccaggaagctagggtgcatgtgacgggaggccgggcaggc
tgttatgaactttgattgttattctgaaagcaatagagactttgggaatc
taggctgggtagatagtatcacatgttggctttgtagccctcatctcggc
tgttggcatgggagcaaatgcatagcaagtgcagggcgtgccaggtaagg
gaaagggtgctccttagcactgtcatggtgacctggttgatggtaggcgg
tgacagtggaaagtgatgggtcataaagtgacagaatcagctagcctgct
gaagaggagggacagatgaaaggacatgctatagtgactgggtgggacct
tgggataatgga
gaattctttaaagtacactgtttccaagccagaacgctcaagggggtggg
aaagttcaagactcttgatgaacgaggtcacttatgggttgatgatgcag
tttgtaaactgccttagggtcaattgcggtgatgaaacgccatgaccagt
aacttggggagggaagggtttattccactcatagttccatacaacaattc
accgttagaagcaaaggcaggagcctggaaggcagagctgatgcagaggc
catgggggattgctgcttattggcttgcttcatagtgcttgctcagcctg
ctttcttacagcctacgggaggctcaaccctgatgggctttgtctgccct
cccacatcaatcgttaattaagaagatgccctacaggcctacagcctgat
cttatggaggcattttcttaatagaggttccctcctctcccatgaatcta
gcttgtgtcaagttgacataaactagccagcacataaccccaacctccca
acctggcatttaaaaaaacgatgtcctattttgttatgaagtattggtag
aatggatgccggggagtggcagggttgaggcttgttcagggacttaaatc
tttatggcaggatcactctctcccactttgtaggagggaaactgtgatca
ttttttttatttattgtgttttagcagatggtgcatgtatgca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_77624937_77625852
seq2: B6Ng01-076J17.b_50_961

seq1  GAATTCTGCTCATCAAGCTCGTTTCTCTGCTATAGATGCCTGCCTGCTCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGCTCATCAAGCTCGTTTCTCTGCTATAGATGCCTGCCTGCTCC  50

seq1  ATCAAAGACATGGGAGAGGATCCTTAGCCTTGAAGCACTGAACTTTTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAAGACATGGGAGAGGATCCTTAGCCTTGAAGCACTGAACTTTTGTG  100

seq1  ATGCTGTTTTTCCTTCTGAGAGCACAGCCATTCAGTCATACCATTGATCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGTTTTTCCTTCTGAGAGCACAGCCATTCAGTCATACCATTGATCC  150

seq1  TAGAAGGGCATTCTTTTAAGTAGGAATTAGTAGCTTTTAAGCTCCCCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGGGCATTCTTTTAAGTAGGAATTAGTAGCTTTTAAGCTCCCCATT  200

seq1  GTCATTCCTACATAGAGTAGTTAAAACCTTCAAGTCAATTGTCAGATATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTCCTACATAGAGTAGTTAAAACCTTCAAGTCAATTGTCAGATATT  250

seq1  TAGAGTCTCTGAGCACCTTTTCTTTTCCAGACCCAGAGAGGCTTTGCTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGTCTCTGAGCACCTTTTCTTTTCCAGACCCAGAGAGGCTTTGCTTT  300

seq1  GCAGAGCTGAGGAGACAGCAGAGATCAATCAAATACCTATTATATAATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCTGAGGAGACAGCAGAGATCAATCAAATACCTATTATATAATTA  350

seq1  TATAATGATAAAATTAAGGAGTGGCATGGGGTGTGGATATGGCTATCAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATGATAAAATTAAGGAGTGGCATGGGGTGTGGATATGGCTATCAGT  400

seq1  TCTGGGGTAGAGGAAGACATCTCCAAGGGAAGATGATTGGAGTGATGTCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGGTAGAGGAAGACATCTCCAAGGGAAGATGATTGGAGTGATGTCC  450

seq1  AAAACTCTAGGAAGAATTTCACAGGAGAGGGAGCAGAGCGATATTCTGGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTCTAGGAAGAATTTCACAGGAGAGGGAGCAGAGCGATATTCTGGG  500

seq1  GGTAGAGGGGTCACATAGACAGCCTGGTGGGGAGTAGAAGAAAGGAGTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGAGGGGTCACATAGACAGCCTGGTGGGGAGTAGAAGAAAGGAGTTA  550

seq1  CCCACTGTGACCAGGAAGCTAGGGTGCATGTGACGGGAGGCCGGGCAGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACTGTGACCAGGAAGCTAGGGTGCATGTGACGGGAGGCCGGGCAGGC  600

seq1  TGTTATGAACTTTGATTGTTATTCTGAAAGCAATAGAGACTTTGGGAATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATGAACTTTGATTGTTATTCTGAAAGCAATAGAGACTTTGGGAATC  650

seq1  TAGGCTGGGTAGATAGTATCACATGTTGGCTTTGTAGCCCTCATCTCGGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTGGGTAGATAGTATCACATGTTGGCTTTGTAGCCCTCATCTCGGC  700

seq1  TGTTGGCATGGGAGCAAATGCATAGCAAGTGCAGGGCGTGCCAGGTAAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGGCATGGGAGCAAATGCATAGCAAGTGCAGGGCGTGCCAGGTAAGG  750

seq1  GAAAGGGTGCTCCTTAGGCACTGTCATGGTGACCTGGTTGATGGTAGGCG  800
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGTGCTCCTTA-GCACTGTCATGGTGACCTGGTTGATGGTAGGCG  799

seq1  GTGACAGTGGAAAAGTGATGGGTCATAAAGTGACAGAATCAGCTAGCCTG  850
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACAGTGG-AAAGTGATGGGTCATAAAGTGACAGAATCAGCTAGCCTG  848

seq1  CTGAAGAGGAGGGGACAGATG-AAGGACAGTGCTATAGGTGACTGGGTGG  899
      |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||
seq2  CTGAAGAGGA-GGGACAGATGAAAGGACA-TGCTATA-GTGACTGGGTGG  895

seq1  GACCTTGGGATAATGGA  916
      |||||||||||||||||
seq2  GACCTTGGGATAATGGA  912

seq1: chr9_77757156_77757846
seq2: B6Ng01-076J17.g_68_760 (reverse)

seq1  TGCATACATGCACCATCTGCTAAAACACATTACTT--AAAGTCTGATCAC  48
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||  |  |||   |||||||
seq2  TGCATACATGCACCATCTGCTAAAACACAATAAATAAAAAAAATGATCAC  50

seq1  AGTTTCCCTCCTACAAAGTGGGAGAGAGTGATCCTGCCATAAAGATTTAA  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCCCTCCTACAAAGTGGGAGAGAGTGATCCTGCCATAAAGATTTAA  100

seq1  GTCCCTGAACAAGCCTCAACCCTGCCACTCCCCGGCATCCATTCTACCAA  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCTGAACAAGCCTCAACCCTGCCACTCCCCGGCATCCATTCTACCAA  150

seq1  TACTTCATAACAAAATAGGACATCGTTTTTTTAAATGCCAGGTTGGGAGG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCATAACAAAATAGGACATCGTTTTTTTAAATGCCAGGTTGGGAGG  200

seq1  TTGGGGTTATGTGCTGGCTAGTTTATGTCAACTTGACACAAGCTAGATTC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGTTATGTGCTGGCTAGTTTATGTCAACTTGACACAAGCTAGATTC  250

seq1  ATGGGAGAGGAGGGAACCTCTATTAAGAAAATGCCTCCATAAGATCAGGC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGGAGAGGAGGGAACCTCTATTAAGAAAATGCCTCCATAAGATCAGGC  300

seq1  TGTAGGCCTGTAGGGCATCTTCTTAATTAACGATTGATGTGGGAGGGCAG  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGGCCTGTAGGGCATCTTCTTAATTAACGATTGATGTGGGAGGGCAG  350

seq1  ACAAAGCCCATCAGGGTTGAGCCTCCCGTAGGCTGTAAGAAAGCAGGCTG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAGCCCATCAGGGTTGAGCCTCCCGTAGGCTGTAAGAAAGCAGGCTG  400

seq1  AGCAAGCACTATGAAGCAAGCCAATAAGCAGCAATCCCCCATGGCCTCTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGCACTATGAAGCAAGCCAATAAGCAGCAATCCCCCATGGCCTCTG  450

seq1  CATCAGCTCTGCCTTCCAGGCTCCTGCCTTTGCTTCTAACGGTGAATTGT  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCAGCTCTGCCTTCCAGGCTCCTGCCTTTGCTTCTAACGGTGAATTGT  500

seq1  TGTATGGAACTATGAGTGGAATAAACCCTTCCCTCCCCAAGTTACTGGTC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGGAACTATGAGTGGAATAAACCCTTCCCTCCCCAAGTTACTGGTC  550

seq1  ATGGCGTTTCATCACCGCAATTGACCCTAAGGCAGTTTACAAACTGCATC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCGTTTCATCACCGCAATTGACCCTAAGGCAGTTTACAAACTGCATC  600

seq1  ATCAACCCATAAGTGACCTCGTTCATCAAGAGTCTTGAACTTTCCCACCC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAACCCATAAGTGACCTCGTTCATCAAGAGTCTTGAACTTTCCCACCC  650

seq1  CCTTGAGCGTTCTGGCTTGGAAACAGTGTACTTTAAAGAATTC  691
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGAGCGTTCTGGCTTGGAAACAGTGTACTTTAAAGAATTC  693