BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-092G06
Chromosome9 (Build37)
Map Location 97,525,758 - 97,627,679
singlet/doubletdoublet
Overlap geneClstn2
Upstream geneRasa2, Zbtb38, EG622512, LOC100040230, LOC667216, Acpl2, LOC19034, LOC667226, Spsb4, LOC100040254, Slc25a36, EG622727, LOC384971, Trim42
Downstream geneLOC667298, Nmnat3, Rbp1, Rbp2, 4930579K19Rik, Copb2, Mrps22
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-092G06.bB6Ng01-092G06.g
ACCDH904164DH904165
length1,167806
definitionDH904164|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092G06, 5' end.DH904165|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092G06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,626,483 - 97,627,679)(97,525,758 - 97,526,563)
sequence
gaattcaaacaggtcaggaagcaggagctgatgcagaggccatggaggga
tgttcttactggcttgcttccctggattgctcagcctgctctcttataga
acccaagactaccagcccagagatggtcccacccaccaggggcctttccc
ccttgatcactaattaagaaaatgccttacagctggatctcatggaggca
tttccccaactgaagctcctttctctgtaataactccagcctgtgtcaag
ttgacacacaaaaccagccagtatgcccagcaactacatggtgacttaca
accatctgtaatgggatctgatgccctcttctagtttgcaggtgtacatg
cagatcactcacacataaatcaataaatcttaaaatatatatatgtgaaa
accaaagaatatggaaggaaggcagagttgttccaaggcaagtgaatacg
tgaacacagacccatcttcctgatttaattctgttctctgaggaaagtag
ttcagagacttgagagtacaaaaggcaactgaagaatcttggtgcacacc
attttataaaagccagtgatggcttgatctatatggctgtgtatctctgt
agaaaccaaggaaatagagctaataagttagcatgagacagtcagagacc
cacggcaaggatcagattgcaggggatgtttctagatttcagtgttttag
ccacaaagagagagttagctaggcttaagtaggacagagtggtcaaggtc
agtctgtgagtcgtggttggtcaccgctggttcttctgtgacccccaggg
tgaactatggcagctttctccatccttatgtgccttgttgatggccccaa
ggtctgaattgtgcacttggtgcctaagaaataaaatgggtcctaatttg
tgttgtcagcatctatatttgtttacatgttacataatcaaatttgtata
agtgctctttcatactcactgaaaacaaaacaaaccaaaacaaacactca
tgtagcagagagtatgtgcagaccctccacatccatatccatagccctct
ccaatccaggccttgccagccaccacaagatttatgagtaagacataaca
gaaagaccctgtatcactggcatgattctgacctccactggactagcctg
aagagactcactttatt
gaattcctgtaagggtcttcaactgtaagagatgctggatgactgtaagc
aaatggtgctttccagacacaacagggcagttgcacacacgaactcagag
catttgtggcaatgtttgcacaagactgttcaagcttaagtcagaaaaaa
aatcccagcaagtgggcagggaggtgagcacaaagccctacccttagctg
aggtgctattgggaattgatagctgccagggaaggggaagttagctttct
tttctttataggtaaggtccattatatacatgatgaccgaaatagaatgt
gtgagattctgagagttaatatgtattaaaaggtaaataagagatttaga
aaagtatgagcatgaatatttgtaccctgctcattttttggaagaaagtt
tcttcttttttgcctttaattatgatgttaactatggagttgctctcctt
tctaatcttgttcgttattatagcatagcatattattctgattactgcat
gtgaacccaaattttggctcttaggagaaatcccgcttagtcattgtaca
taactttttaagacttgttataagcagaatggtggtgttcatagtggtgt
atgtctttaattccagcactcaggaggtagtagagtcaagcagatctttg
agattgaggccggcgcggtctacagggcaagttccaggatagccagaggt
acacagagaaaccctgtctcaaaaacaaaagttttgttgtaacttgttaa
tatacatatacatacatacatatatatatatgtatatatgtgtgtgtgtg
tgtgta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_97626483_97627679
seq2: B6Ng01-092G06.b_45_1211 (reverse)

seq1  AATAAAGTTGAGTCTCTTCAAGACCTTAGTTCAGTTGAAGTTCAGGACTC  50
      ||||||| |||||||||||| |    |||| ||| || || ||| || ||
seq2  AATAAAG-TGAGTCTCTTCAGG---CTAGTCCAG-TGGAGGTCA-GAATC  44

seq1  ATGCCAGTGATACAGGGTTCCTTTCTGGTTATGTTCTTAACTCAATATAT  100
      ||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| |||| ||| ||
seq2  ATGCCAGTGATACAGGGT--CTTTCT-GTTATG-TCTT-ACTC-ATAAAT  88

seq1  TCTGTGTGTGGCCTTGGCAAGGCCTGGGATATGGAGAGGGCTATGGGATA  150
        |||| |||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||
seq2  CTTGTG-GTGGC--TGGCAAGGCCT-GGAT-TGGAGAGGGCTAT-GGATA  132

seq1  TGGGATGTGGAGTGTCTGCACATACTCTCCTGCTACATTGAGTTGTTTTG  200
      | |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  
seq2  T-GGATGTGGAGGGTCTGCACATACTCT-CTGCTACA-TGAG-TGTTT--  176

seq1  TTTTTGGTTTTGTTTTTGTTTTTCAAGTGAGTTATGAAAGAGCACTTATA  250
       |||||||||   |||||||||   |||||| ||||||||||||||||||
seq2  GTTTTGGTTT--GTTTTGTTTT--CAGTGAG-TATGAAAGAGCACTTATA  221

seq1  CAAATTTGATTATGTAACATTGTAAACAAATATAGATGCTGACAACACAA  300
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTTGATTATGTAACA-TGTAAACAAATATAGATGCTGACAACACAA  270

seq1  ATTAGGAACCATTTTATTTCTTAGGCACCAAGTGCACAATTCAGACCTTG  350
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGGACCCATTTTATTTCTTAGGCACCAAGTGCACAATTCAGACCTTG  320

seq1  GGGCCATCAACAAGGCACATAAGGATGGAGAAAGCTGCCATAGTTCACCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCATCAACAAGGCACATAAGGATGGAGAAAGCTGCCATAGTTCACCC  370

seq1  TGGGGGTCACAGAAGAACCAGCGGTGACCAACCACGACTCACAGACTGAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGGTCACAGAAGAACCAGCGGTGACCAACCACGACTCACAGACTGAC  420

seq1  CTTGACCACTCTGTCCTACTTAAGCCTAGCTAACTCTCTCTTTGTGGCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGACCACTCTGTCCTACTTAAGCCTAGCTAACTCTCTCTTTGTGGCTA  470

seq1  AAACACTGAAATCTAGAAACATCCCCTGCAATCTGATCCTTGCCGTGGGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACACTGAAATCTAGAAACATCCCCTGCAATCTGATCCTTGCCGTGGGT  520

seq1  CTCTGACTGTCTCATGCTAACTTATTAGCTCTATTTCCTTGGTTTCTACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGACTGTCTCATGCTAACTTATTAGCTCTATTTCCTTGGTTTCTACA  570

seq1  GAGATACACAGCCATATAGATCAAGCCATCACTGGCTTTTATAAAATGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATACACAGCCATATAGATCAAGCCATCACTGGCTTTTATAAAATGGT  620

seq1  GTGCACCAAGATTCTTCAGTTGCCTTTTGTACTCTCAAGTCTCTGAACTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCACCAAGATTCTTCAGTTGCCTTTTGTACTCTCAAGTCTCTGAACTA  670

seq1  CTTTCCTCAGAGAACAGAATTAAATCAGGAAGATGGGTCTGTGTTCACGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCTCAGAGAACAGAATTAAATCAGGAAGATGGGTCTGTGTTCACGT  720

seq1  ATTCACTTGCCTTGGAACAACTCTGCCTTCCTTCCATATTCTTTGGTTTT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACTTGCCTTGGAACAACTCTGCCTTCCTTCCATATTCTTTGGTTTT  770

seq1  CACATATATATATTTTAAGATTTATTGATTTATGTGTGAGTGATCTGCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATATATATATTTTAAGATTTATTGATTTATGTGTGAGTGATCTGCAT  820

seq1  GTACACCTGCAAACTAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACACCTGCAAACTAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTACAGATGGTTGT  870

seq1  AAGTCACCATGTAGTTGCTGGGCATACTGGCTGGTTTTGTGTGTCAACTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTCACCATGTAGTTGCTGGGCATACTGGCTGGTTTTGTGTGTCAACTT  920

seq1  GACACAGGCTGGAGTTATTACAGAGAAAGGAGCTTCAGTTGGGGAAATGC  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACACAGGCTGGAGTTATTACAGAGAAAGGAGCTTCAGTTGGGGAAATGC  970

seq1  CTCCATGAGATCCAGCTGTAAGGCATTTTCTTAATTAGTGATCAAGGGGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATGAGATCCAGCTGTAAGGCATTTTCTTAATTAGTGATCAAGGGGG  1020

seq1  AAAGGCCCCTGGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGCCCCTGGTGGGTGGGACCATCTCTGGGCTGGTAGTCTTGGGTTCT  1070

seq1  ATAAGAGAGCAGGCTGAGCAATCCAGGGAAGCAAGCCAGTAAGAACATCC  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAGAGCAGGCTGAGCAATCCAGGGAAGCAAGCCAGTAAGAACATCC  1120

seq1  CTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCCTGACCTGTTTGAATTC  1197
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCATGGCCTCTGCATCAGCTCCTGCTTCCTGACCTGTTTGAATTC  1167

seq1: chr9_97525758_97526563
seq2: B6Ng01-092G06.g_70_875

seq1  GAATTCCTGTAAGGGTCTTCAACTGTAAGAGATGCTGGATGACTGTAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCTGTAAGGGTCTTCAACTGTAAGAGATGCTGGATGACTGTAAGC  50

seq1  AAATGGTGCTTTCCAGACACAACAGGGCAGTTGCACACACGAACTCAGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGTGCTTTCCAGACACAACAGGGCAGTTGCACACACGAACTCAGAG  100

seq1  CATTTGTGGCAATGTTTGCACAAGACTGTTCAAGCTTAAGTCAGAAAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTGGCAATGTTTGCACAAGACTGTTCAAGCTTAAGTCAGAAAAAA  150

seq1  AATCCCAGCAAGTGGGCAGGGAGGTGAGCACAAAGCCCTACCCTTAGCTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCCAGCAAGTGGGCAGGGAGGTGAGCACAAAGCCCTACCCTTAGCTG  200

seq1  AGGTGCTATTGGGAATTGATAGCTGCCAGGGAAGGGGAAGTTAGCTTTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGCTATTGGGAATTGATAGCTGCCAGGGAAGGGGAAGTTAGCTTTCT  250

seq1  TTTCTTTATAGGTAAGGTCCATTATATACATGATGACCGAAATAGAATGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTATAGGTAAGGTCCATTATATACATGATGACCGAAATAGAATGT  300

seq1  GTGAGATTCTGAGAGTTAATATGTATTAAAAGGTAAATAAGAGATTTAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATTCTGAGAGTTAATATGTATTAAAAGGTAAATAAGAGATTTAGA  350

seq1  AAAGTATGAGCATGAATATTTGTACCCTGCTCATTTTTTGGAAGAAAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTATGAGCATGAATATTTGTACCCTGCTCATTTTTTGGAAGAAAGTT  400

seq1  TCTTCTTTTTTGCCTTTAATTATGATGTTAACTATGGAGTTGCTCTCCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTTTTTTGCCTTTAATTATGATGTTAACTATGGAGTTGCTCTCCTT  450

seq1  TCTAATCTTGTTCGTTATTATAGCATAGCATATTATTCTGATTACTGCAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAATCTTGTTCGTTATTATAGCATAGCATATTATTCTGATTACTGCAT  500

seq1  GTGAACCCAAATTTTGGCTCTTAGGAGAAATCCCGCTTAGTCATTGTACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAACCCAAATTTTGGCTCTTAGGAGAAATCCCGCTTAGTCATTGTACA  550

seq1  TAACTTTTTAAGACTTGTTATAAGCAGAATGGTGGTGTTCATAGTGGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTTTTTAAGACTTGTTATAAGCAGAATGGTGGTGTTCATAGTGGTGT  600

seq1  ATGTCTTTAATTCCAGCACTCAGGAGGTAGTAGAGTCAAGCAGATCTTTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTTTAATTCCAGCACTCAGGAGGTAGTAGAGTCAAGCAGATCTTTG  650

seq1  AGATTGAGGCCGGCGCGGTCTACAGGGCAAGTTCCAGGATAGCCAGAGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGAGGCCGGCGCGGTCTACAGGGCAAGTTCCAGGATAGCCAGAGGT  700

seq1  ACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAACAAAAGTTTTGTTGTAACTTGTTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGAGAAACCCTGTCTCAAAAACAAAAGTTTTGTTGTAACTTGTTAA  750

seq1  TATACATATACATACATACATATATATATATGTATATATGTGTGTGTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACATATACATACATACATATATATATATGTATATATGTGTGTGTGTG  800

seq1  TGTGTA  806
      ||||||
seq2  TGTGTA  806