BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-094G18
Chromosome9 (Build37)
Map Location 80,590,064 - 80,738,070
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneCox7a2, Tmem30a, Filip1, LOC100041218, LOC666490, Senp6, LOC100041249, Myo6, Impg1
Downstream geneEG666534, LOC100039038, Htr1b, LOC671392
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-094G18.bB6Ng01-094G18.g
ACCDH905649DH905650
length1,1021,079
definitionDH905649|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094G18, 5' end.DH905650|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-094G18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(80,590,064 - 80,591,178)(80,736,991 - 80,738,070)
sequence
gaattcattagagttatagattatgttctttacaaattttaaattcaagc
gtgtttgcacaatcagctcataatttgagcccatgcctaggtctttagga
gtgagggaggatcggtgcagaagcattgctgagagcactcacatctgctt
cattacagctgaaatttagactcctgcatctgaactaagcccaaacctcc
aagaaatcacccattctcgttctcagccaccctcctttacctgtcactct
tccaggccacaaacagtttgtggttattaacttttgtgtgcagtgagttt
agcaggtctgttgtacttaggtgtactcatgcaggaatgagcatggacat
atataatggcagggtaggctgcttgatgttgcccacttaaggattcattt
caaaatatggaaacaactcttcaaatgaatgaactgataaactggaaaat
tcatacattttagttaatatgtaaatatttgccctgtatggacacttgcc
ggaccttatgaatagggtacaggcagtgagtgacaagagacatttagtga
tcattaatagatgtaaacacggcttccctctgcacacaacatggagcaca
caccaagctggaatatccaaaacatatacctttcatgaaaaggtaaactt
tacatacttgtgcatttataggaaattgtcaatgtatggttttggtggaa
ataaaatatatttctgagaattcatagctgaacaacatcttgagagagat
ttatagccaggattgatgctagttctatggtttgaagaacaaatcattca
ttcatttaagaggagtctgagttgactttctcagaaactggcaaggcaaa
tacaattacttgtagaagaatctatcttcacacaggctttaagtcatctc
atagcctggcacgatgccacacatctgttatcatagaactatgaatgggg
aggcagagactgtgagttccagccaaccttaagttacccagtgaactgtc
atagtcatatgtattaatagtctccgtattgaaggtacacaaaataacca
cccctcagtagctcttacaaaagaactgatgggtagattgagagaaatca
aa
gaattcactaaagactgagacaatgtattacataaagccccagactcagc
attacaaagtgaggatcggtaatttagaacagaaattcaactattaccag
gcaacagtgtatctttttgactatagaacatcttgatccccacacaacag
ttttacaatttataaagcaatgtcagttatctgccttcaggaatgaggct
atgtcccatttttgcaatgttttcctacaacgaagacacaaatctcaact
gacatttattttgttatttctttacacagagacacacacacacacacaca
cacacacacatatatatatatatatactttttggtcggttttaacttttt
caaatgtggagcccccaagactgatctcaaaatttcaaaactcttgccct
gactcccaagtacaaaggattgcataaaggctggtgccactagatgaaca
tccctttcatctctgaatgacacatcagaggcaagtctaggcaccatcag
tttccctcaagtccaagcactagctcctcataacttccaataactgatgc
accaaattgtaaagctgaccattagaagcaatcctcacataaaactgtaa
aaataaaacgacaatttttattttatttgtttgcacgtaacaaagaagga
aatatgcacagctacagctgtagaatttatctccacagcaaactatccat
ctctagctggtatttgtcatttctcttttctaaagggccacctcccttct
ctttgatgagggccagtgccttcagaattctggaagcatctgaaacctca
gtgtttctgcccacccactttgaagtgatgcaagttgccattgacattca
ttaacagctctagccacccacaagatgtcctgttttctgacagattcaac
atacccaccgtgtagtagcaacacgaattccaatactaacttgaacaaac
acctcaggtgatgtggtaacttcctaaggtagacagctgtcatctcgaat
tccaatggggagtcctaaatgggatgatcatgtatccctgagtggggcgt
ggtttttcttggagaattaggactttcta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_80590064_80591178
seq2: B6Ng01-094G18.b_50_1151

seq1  GAATTCATTAGAGTTATAGATTATGTTCTTTACAAATTTTAAATTCAAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATTAGAGTTATAGATTATGTTCTTTACAAATTTTAAATTCAAGC  50

seq1  GTGTTTGCACAATCAGCTCATAATTTGAGCCCATGCCTAGGTCTTTAGGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTGCACAATCAGCTCATAATTTGAGCCCATGCCTAGGTCTTTAGGA  100

seq1  GTGAGGGAGGATCGGTGCAGAAGCATTGCTGAGAGCACTCACATCTGCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGGAGGATCGGTGCAGAAGCATTGCTGAGAGCACTCACATCTGCTT  150

seq1  CATTACAGCTGAAATTTAGACTCCTGCATCTGAACTAAGCCCAAACCTCC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTACAGCTGAAATTTAGACTCCTGCATCTGAACTAAGCCCAAACCTCC  200

seq1  AAGAAATCACCCATTCTCGTTCTCAGCCACCCTCCTTTACCTGTCACTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAATCACCCATTCTCGTTCTCAGCCACCCTCCTTTACCTGTCACTCT  250

seq1  TCCAGGCCACAAACAGTTTGTGGTTATTAACTTTTGTGTGCAGTGAGTTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAGGCCACAAACAGTTTGTGGTTATTAACTTTTGTGTGCAGTGAGTTT  300

seq1  AGCAGGTCTGTTGTACTTAGGTGTACTCATGCAGGAATGAGCATGGACAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGGTCTGTTGTACTTAGGTGTACTCATGCAGGAATGAGCATGGACAT  350

seq1  ATATAATGGCAGGGTAGGCTGCTTGATGTTGCCCACTTAAGGATTCATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAATGGCAGGGTAGGCTGCTTGATGTTGCCCACTTAAGGATTCATTT  400

seq1  CAAAATATGGAAACAACTCTTCAAATGAATGAACTGATAAACTGGAAAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATATGGAAACAACTCTTCAAATGAATGAACTGATAAACTGGAAAAT  450

seq1  TCATACATTTTAGTTAATATGTAAATATTTGCCCTGTATGGACACTTGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATACATTTTAGTTAATATGTAAATATTTGCCCTGTATGGACACTTGCC  500

seq1  GGACCTTATGAATAGGGTACAGGCAGTGAGTGACAAGAGACATTTAGTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACCTTATGAATAGGGTACAGGCAGTGAGTGACAAGAGACATTTAGTGA  550

seq1  TCATTAATAGATGTAAACACGGCTTCCCTCTGCACACAACATGGAGCACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTAATAGATGTAAACACGGCTTCCCTCTGCACACAACATGGAGCACA  600

seq1  CACCAAGCTGGAATATCCAAAACATATACCTTTCATGAAAAGGTAAACTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAAGCTGGAATATCCAAAACATATACCTTTCATGAAAAGGTAAACTT  650

seq1  TACATACTTGTGCATTTATAGGAAATTGTCAATGTATGGTTTTGGTGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATACTTGTGCATTTATAGGAAATTGTCAATGTATGGTTTTGGTGGAA  700

seq1  ATAAAATATATTTCTGAGAATTCATAGCTGAACAACATCTTGAGAGAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAATATATTTCTGAGAATTCATAGCTGAACAACATCTTGAGAGAGAT  750

seq1  TTATAGCCAGGATTGATGCTAGTTCTATGGTTTGAAGAACAAATCATTCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATAGCCAGGATTGATGCTAGTTCTATGGTTTGAAGAACAAATCATTCA  800

seq1  TTCATTTAAGAGGAGTCTGAGTTGACTTTCTCAGAAACTGGCAAAGGCAA  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  TTCATTTAAGAGGAGTCTGAGTTGACTTTCTCAGAAACTGGC-AAGGCAA  849

seq1  ATACAATTACTTGTAGAAGAATCTATCTTCAACACAGGCTTTAAGTCATC  900
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  ATACAATTACTTGTAGAAGAATCTATCTTC-ACACAGGCTTTAAGTCATC  898

seq1  TCAATAGCCTGGCACGATGCCACACATCTGTTATCATAGAACTATGAATG  950
      || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TC-ATAGCCTGGCACGATGCCACACATCTGTTATCATAGAACTATGAATG  947

seq1  GGGAGGCAGGAGACTGTGAGTTCCAGCCAACCTTAGGTTACACAGTGAAA  1000
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||
seq2  GGGAGGCA-GAGACTGTGAGTTCCAGCCAACCTTAAGTTACCCAGTG-AA  995

seq1  CTGTCATAAGTCATTATGTTAATTAATAGTTCTCCGTATATGAAGTTACA  1050
      ||||||| ||||| |||||  |||||||| ||||||||| ||||| ||||
seq2  CTGTCAT-AGTCA-TATGT--ATTAATAG-TCTCCGTAT-TGAAGGTACA  1039

seq1  CAAAATACACA-CTCTCAGTAGCTCTTTACAAAAGAACTGATAGAGTAGA  1099
      |||||||  || | ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||
seq2  CAAAATAACCACCCCTCAGTAGCTC-TTACAAAAGAACTGAT-GGGTAGA  1087

seq1  ATGAGAGAAAATCAAA  1115
       |||||| ||||||||
seq2  TTGAGAG-AAATCAAA  1102

seq1: chr9_80736991_80738070
seq2: B6Ng01-094G18.g_68_1146 (reverse)

seq1  TAGACAGTCTTAATTCTTCAAGAAAAACACAGCACCACTCAGGGATACAT  50
      |||| |||| ||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGTCCTAATTCTCCAAGAAAAACCACGCCCCACTCAGGGATACAT  50

seq1  GATCATCCCATTTAGGACTCCCATTTGAAAATCGAGATGACAGCTGTCTA  100
      ||||||||||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||||||
seq2  GATCATCCCATTTAGGACTCCCCATTGGAATTCGAGATGACAGCTGTCTA  100

seq1  CCTTAGGAAGTTACCACATCACCTGAGGTGTTTGTTTCAAGTTAGTATTG  150
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  CCTTAGGAAGTTACCACATCACCTGAGGTGTTTG-TTCAAGTTAGTATTG  149

seq1  GAATTCGTGTTGCTACTACACGGTGGGTATGTTGAATCTTGTCAGAAAAC  200
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  GAATTCGTGTTGCTACTACACGGTGGGTATGTTGAATC-TGTCAGAAAAC  198

seq1  AGGACATCTTGTGGGTGGCTAGAGCTGTTAATGAATGTCAATGGCAACTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACATCTTGTGGGTGGCTAGAGCTGTTAATGAATGTCAATGGCAACTT  248

seq1  GCATCACTTCAAAGTGGGTGGGCAGAAACACTGAGGTTTCAGATGCTTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCACTTCAAAGTGGGTGGGCAGAAACACTGAGGTTTCAGATGCTTCC  298

seq1  AGAATTCTGAAGGCACTGGCCCTCATCAAAGAGAAGGGAGGTGG-CCTTT  349
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  AGAATTCTGAAGGCACTGGCCCTCATCAAAGAGAAGGGAGGTGGCCCTTT  348

seq1  AGAAAAGAGAAATGACAAATACCAGCTAGAGATGGATAGTTTGCTGTGGA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAGAGAAATGACAAATACCAGCTAGAGATGGATAGTTTGCTGTGGA  398

seq1  GATAAATTCTACAGCTGTAGCTGTGCATATTTCCTTCTTTGTTACGTGCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAATTCTACAGCTGTAGCTGTGCATATTTCCTTCTTTGTTACGTGCA  448

seq1  AACAAATAAAATAAAAATTGTCGTTTTATTTTTACAGTTTTATGTGAGGA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAATAAAATAAAAATTGTCGTTTTATTTTTACAGTTTTATGTGAGGA  498

seq1  TTGCTTCTAATGGTCAGCTTTACAATTTGGTGCATCAGTTATTGGAAGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTCTAATGGTCAGCTTTACAATTTGGTGCATCAGTTATTGGAAGTT  548

seq1  ATGAGGAGCTAGTGCTTGGACTTGAGGGAAACTGATGGTGCCTAGACTTG  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGAGCTAGTGCTTGGACTTGAGGGAAACTGATGGTGCCTAGACTTG  598

seq1  CCTCTGATGTGTCATTCAGAGATGAAAGGGATGTTCATCTAGTGGCACCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGATGTGTCATTCAGAGATGAAAGGGATGTTCATCTAGTGGCACCA  648

seq1  GCCTTTATGCAATCCTTTGTACTTGGGAGTCAGGGCAAGAGTTTTGAAAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTTTATGCAATCCTTTGTACTTGGGAGTCAGGGCAAGAGTTTTGAAAT  698

seq1  TTTGAGATCAGTCTTGGGGGCTCCACATTTGAAAAAGTTAAAACCGACCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGATCAGTCTTGGGGGCTCCACATTTGAAAAAGTTAAAACCGACCA  748

seq1  AAAAGTATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGTATATATATATATATATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  798

seq1  CTCTGTGTAAAGAAATAACAAAATAAATGTCAGTTGAGATTTGTGTCTTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGTGTAAAGAAATAACAAAATAAATGTCAGTTGAGATTTGTGTCTTC  848

seq1  GTTGTAGGAAAACATTGCAAAAATGGGACATAGCCTCATTCCTGAAGGCA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTAGGAAAACATTGCAAAAATGGGACATAGCCTCATTCCTGAAGGCA  898

seq1  GATAACTGACATTGCTTTATAAATTGTAAAACTGTTGTGTGGGGATCAAG  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAACTGACATTGCTTTATAAATTGTAAAACTGTTGTGTGGGGATCAAG  948

seq1  ATGTTCTATAGTCAAAAAGATACACTGTTGCCTGGTAATAGTTGAATTTC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTCTATAGTCAAAAAGATACACTGTTGCCTGGTAATAGTTGAATTTC  998

seq1  TGTTCTAAATTACCGATCCTCACTTTGTAATGCTGAGTCTGGGGCTTTAT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTAAATTACCGATCCTCACTTTGTAATGCTGAGTCTGGGGCTTTAT  1048

seq1  GTAATACATTGTCTCAGTCTTTAGTGAATTC  1080
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATACATTGTCTCAGTCTTTAGTGAATTC  1079