BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-101G22
Chromosome9 (Build37)
Map Location 13,823,146 - 13,916,365
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039729, LOC100039758, Maml2, Mtmr2, Cep57, 2810485I05Rik, LOC665329
Downstream geneSesn3, Endod1, LOC665351, EG547035, Jmjd2d, 0610040D20Rik, Amotl1, EG665374, Piwil4, Fut4, 1700012B09Rik, Ankrd49, Mre11a, LOC100040259, Gpr83, Folr4, Panx1, Hephl1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-101G22.bB6Ng01-101G22.g
ACCDH910617DH910618
length8141,092
definitionDH910617|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-101G22, 5' end.DH910618|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-101G22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(13,915,552 - 13,916,365)(13,823,146 - 13,824,242)
sequence
tagtgactggctctgctgtcatggttgctatgacactgtggtgacagatg
gcatttctgttcaggactcatagctctgaggaaggtgtcaatggctcact
gggccctcctaaaccctgagtttggagcttttaaacttgcagtggaggat
gagagcacaggctcaggacctttcaggaaactagatgggctccaaagacc
aagattgtaaaatccgtggtgggaattgttgagaattgtctttcagcaaa
aaattcaaggggactgctttctaagtcccttgctaccacataacattttc
tagattaggcagcacagaaggtatccaactctttgggtttatataaggca
agtaatcgagataaattctggtttaaaatatacacaaaaagcttaattcc
acacaccagcctcctttgctgtgccccccaccccacccgtgctcttcagt
taatccattgtcctccagctgagctttgcatccatcaaatgtgcactcat
tcagttgccatgaggccaaggccctccagtatggtgtttgtgggctcagg
gtggagggagaggttgtgcctggtgctgttgaccacactgagaagaggag
tcagacatctgtaagtgtcacttgaagctacaagaatagtccatggtagc
agaagccttgaatctctgcacagggaaggcagaggaaggtggatgtctat
gagttcaaggcctggtctacttgataagtaccagaacaaccagagctaca
tgatagagacactgtttctcaaaaaaagggggggtgctggtgctggtggt
ggtggtggtggtga
gaattcaaagtttttactcaggaaggctgaagggaaggcaagactggata
gacaaggcttcactgatctggggttactctcttgtgatgtgaaatttaac
attctggtgagaagcccagaagatgtgaatgtcccaagtacagctcttag
acatttgcaaaagaattaaccaatgctggataaagagctggttttgttta
taaggtgggttggttggctttgtttttgttttgtttgtttgtttgtttgt
tttgtttgttttgctagagtagaaggctggagaagggggcagaggacact
ttttttgtgagaccagaagacccaccacaagaggatgcatcacagcagga
gcagaggtaaagccattaggccaccagtacataccagaaatgttggtagg
agactcagggaaagatgtggtccccagataagggccagctacaacaaacc
acctccactttgccataatcatggtgacagacaaagcagtttgacacttg
acagacaaaaacaggacacgtcatcttcagaatacaatgatgaaaagcta
gcaaaggttatccatccataaccaatgggaagaaatgagtggaaaagcaa
gagattgaccaagggcagtcagtcattacaacacaatgttaccaattcaa
aagagccaagtacccaggaacaaagacagacaattctgacccttttgatc
ccccaaaagtgtacttctagaaattacttaggtggttgtaccatgtagaa
attaaaatatttagacataatgaggggttgttggacacagtgtaaaacta
agcttttcactggagacttaaagcatatcatgactatccatgcctatggg
agtcaggtaacacagagttctgggatagaaggtacttcccaggactatct
gtggacttagcaacttacctggtaaacaacacccgattccagagtgggta
ttgaatcatattctttttttttacttttaagtatttattattattatatc
tagttcactgtagctggcttcgatgttaccagagaaggaccgtcgatcct
catacagatggttgtggagcccaccatgtggtggttgggatt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_13915552_13916365
seq2: B6Ng01-101G22.b_57_870 (reverse)

seq1  TCACCACCACCACCACCACCAGCACCAGCACCCCCCCTTTTTTTGAGAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACCACCACCACCACCACCAGCACCAGCACCCCCCCTTTTTTTGAGAAA  50

seq1  CAGTGTCTCTATCATGTAGCTCTGGTTGTTCTGGTACTTATCAAGTAGAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTCTCTATCATGTAGCTCTGGTTGTTCTGGTACTTATCAAGTAGAC  100

seq1  CAGGCCTTGAACTCATAGACATCCACCTTCCTCTGCCTTCCCTGTGCAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGCCTTGAACTCATAGACATCCACCTTCCTCTGCCTTCCCTGTGCAGA  150

seq1  GATTCAAGGCTTCTGCTACCATGGACTATTCTTGTAGCTTCAAGTGACAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCAAGGCTTCTGCTACCATGGACTATTCTTGTAGCTTCAAGTGACAC  200

seq1  TTACAGATGTCTGACTCCTCTTCTCAGTGTGGTCAACAGCACCAGGCACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACAGATGTCTGACTCCTCTTCTCAGTGTGGTCAACAGCACCAGGCACA  250

seq1  ACCTCTCCCTCCACCCTGAGCCCACAAACACCATACTGGAGGGCCTTGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCTCCCTCCACCCTGAGCCCACAAACACCATACTGGAGGGCCTTGGC  300

seq1  CTCATGGCAACTGAATGAGTGCACATTTGATGGATGCAAAGCTCAGCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATGGCAACTGAATGAGTGCACATTTGATGGATGCAAAGCTCAGCTGG  350

seq1  AGGACAATGGATTAACTGAAGAGCACGGGTGGGGTGGGGGGCACAGCAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAATGGATTAACTGAAGAGCACGGGTGGGGTGGGGGGCACAGCAAA  400

seq1  GGAGGCTGGTGTGTGGAATTAAGCTTTTTGTGTATATTTTAAACCAGAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTGGTGTGTGGAATTAAGCTTTTTGTGTATATTTTAAACCAGAAT  450

seq1  TTATCTCGATTACTTGCCTTATATAAACCCAAAGAGTTGGATACCTTCTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTCGATTACTTGCCTTATATAAACCCAAAGAGTTGGATACCTTCTG  500

seq1  TGCTGCCTAATCTAGAAAATGTTATGTGGTAGCAAGGGACTTAGAAAGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCCTAATCTAGAAAATGTTATGTGGTAGCAAGGGACTTAGAAAGCA  550

seq1  GTCCCCTTGAATTTTTTGCTGAAAGACAATTCTCAACAATTCCCACCACG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCCTTGAATTTTTTGCTGAAAGACAATTCTCAACAATTCCCACCACG  600

seq1  GATTTTACAATCTTGGTCTTTGGAGCCCATCTAGTTTCCTGAAAGGTCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTTACAATCTTGGTCTTTGGAGCCCATCTAGTTTCCTGAAAGGTCCT  650

seq1  GAGCCTGTGCTCTCATCCTCCACTGCAAGTTTAAAAGCTCCAAACTCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCTGTGCTCTCATCCTCCACTGCAAGTTTAAAAGCTCCAAACTCAGG  700

seq1  GTTTAGGAGGGCCCAGTGAGCCATTGACACCTTCCTCAGAGCTATGAGTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTAGGAGGGCCCAGTGAGCCATTGACACCTTCCTCAGAGCTATGAGTC  750

seq1  CTGAACAGAAATGCCATCTGTCACCACAGTGTCATAGCAACCATGACAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACAGAAATGCCATCTGTCACCACAGTGTCATAGCAACCATGACAGC  800

seq1  AGAGCCAGTCACTA  814
      ||||||||||||||
seq2  AGAGCCAGTCACTA  814

seq1: chr9_13823146_13824242
seq2: B6Ng01-101G22.g_67_1158

seq1  GAATTCAAAGTTTTTACTCAGGAAGGCTGAAGGGAAGGCAAGACTGGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGTTTTTACTCAGGAAGGCTGAAGGGAAGGCAAGACTGGATA  50

seq1  GACAAGGCTTCACTGATCTGGGGTTACTCTCTTGTGATGTGAAATTTAAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAGGCTTCACTGATCTGGGGTTACTCTCTTGTGATGTGAAATTTAAC  100

seq1  ATTCTGGTGAGAAGCCCAGAAGATGTGAATGTCCCAAGTACAGCTCTTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGGTGAGAAGCCCAGAAGATGTGAATGTCCCAAGTACAGCTCTTAG  150

seq1  ACATTTGCAAAAGAATTAACCAATGCTGGATAAAGAGCTGGTTTTGTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTGCAAAAGAATTAACCAATGCTGGATAAAGAGCTGGTTTTGTTTA  200

seq1  TAAGGTGGGTTGGTTGGCTTTGTTTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTGGGTTGGTTGGCTTTGTTTTTGTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGT  250

seq1  TTTGTTTGTTTTGCTAGAGTAGAAGGCTGGAGAAGGGGGCAGAGGACACT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTTTGTTTTGCTAGAGTAGAAGGCTGGAGAAGGGGGCAGAGGACACT  300

seq1  TTTTTTGTGAGACCAGAAGACCCACCACAAGAGGATGCATCACAGCAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTGTGAGACCAGAAGACCCACCACAAGAGGATGCATCACAGCAGGA  350

seq1  GCAGAGGTAAAGCCATTAGGCCACCAGTACATACCAGAAATGTTGGTAGG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGGTAAAGCCATTAGGCCACCAGTACATACCAGAAATGTTGGTAGG  400

seq1  AGACTCAGGGAAAGATGTGGTCCCCAGATAAGGGCCAGCTACAACAAACC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCAGGGAAAGATGTGGTCCCCAGATAAGGGCCAGCTACAACAAACC  450

seq1  ACCTCCACTTTGCCATAATCATGGTGACAGACAAAGCAGTTTGACACTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTCCACTTTGCCATAATCATGGTGACAGACAAAGCAGTTTGACACTTG  500

seq1  ACAGACAAAAACAGGACACGTCATCTTCAGAATACAATGATGAAAAGCTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAAAAACAGGACACGTCATCTTCAGAATACAATGATGAAAAGCTA  550

seq1  GCAAAGGTTATCCATCCATAACCAATGGGAAGAAATGAGTGGAAAAGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGGTTATCCATCCATAACCAATGGGAAGAAATGAGTGGAAAAGCAA  600

seq1  GAGATTGACCAAGGGCAGTCAGTCATTACAACACAATGTTACCAATTCAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTGACCAAGGGCAGTCAGTCATTACAACACAATGTTACCAATTCAA  650

seq1  AAGAGCCAAGTACCCAGGAACAAAGACAGACAATTCTGACCC-TTTGATC  699
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  AAGAGCCAAGTACCCAGGAACAAAGACAGACAATTCTGACCCTTTTGATC  700

seq1  CCCCAAAAGTGTACTTCTAGAAATTACTTAGGTGGTTGTACCATGTAGAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAAAAGTGTACTTCTAGAAATTACTTAGGTGGTTGTACCATGTAGAA  750

seq1  ATTAAAATATTTAGACATAATGA-GGGCTGTTGGACACAGTGTAAAACTA  798
      ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAATATTTAGACATAATGAGGGGTTGTTGGACACAGTGTAAAACTA  800

seq1  AGC-TTTCACTGGAGACTCAAAGCATATCATGACCCATCCATGCCTATGG  847
      ||| |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||
seq2  AGCTTTTCACTGGAGACTTAAAGCATATCATGA-CTATCCATGCCTATGG  849

seq1  GAGTCAGGTAACACAGAGTTCT-GGATAGAAGGTACTTCCCAGGACTATC  896
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCAGGTAACACAGAGTTCTGGGATAGAAGGTACTTCCCAGGACTATC  899

seq1  TGTGGACTTAGCAACTTACCTGGTAAACAACAACCCGATTCCAGAGTGGG  946
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TGTGGACTTAGCAACTTACCTGGTAAACAAC-ACCCGATTCCAGAGTGGG  948

seq1  TAATTGAAATCAATATTCTTTTTTTTTTTACTTTTTTAAAGATTTATTTA  996
      | |||| |||| ||||||  |||||||||||  ||||||  ||||| |||
seq2  T-ATTG-AATC-ATATTC--TTTTTTTTTAC--TTTTAAGTATTTA-TTA  990

seq1  TTATTATATCTAAGTACACTGTAGCTGTCTTCAGATG-TACCAGAAGAGG  1045
      ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||| |||||||  |||
seq2  TTATTATATCT-AGTTCACTGTAGCTGGCTTC-GATGTTACCAGAGAAGG  1038

seq1  A-CGTCAGAT-CTCATTACAGATGGTTGT-GAG-CCACCATGTGGTTGTT  1091
      | |||| ||| |||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| |||
seq2  ACCGTC-GATCCTCA-TACAGATGGTTGTGGAGCCCACCATGTGGTGGTT  1086

seq1  GGGATT  1097
      ||||||
seq2  GGGATT  1092