BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-103L08
Chromosome9 (Build37)
Map Location 76,717,357 - 76,842,479
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTinag
Upstream geneBmp5, EG620071, Hmgcll1, Gfral, Hcrtr2, C530008M07Rik
Downstream geneLOC436082, 2310046A06Rik, 5730403I07Rik, Lrrc1, Klhl31, Gclc, LOC100042212, Elovl5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-103L08.bB6Ng01-103L08.g
ACCDH912217DH912218
length1,158595
definitionDH912217|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103L08, 5' end.DH912218|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-103L08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(76,841,312 - 76,842,479)(76,717,357 - 76,717,951)
sequence
gaattccagacatgtatattctgtgttctagcaacatctccctatgcaga
agatggacacttcaaacttaacacttctgaaacagggctctccatcttcc
tatttctcagcagcagcagcagcagcattttctccctgagtcaatgtaaa
ctctcctcccacatggtcttgtgggaaagcttggaattatctcttattca
tttcctcaaaaccctctttgagtatatcacagcatccattgacactatct
tcaaagtcacctactcttcattctctgcattatctctgcctgaatgtcca
ttactcttattttgtatctggattactgattggcattccagataattgta
tttttaatatagaacccagggcttctccgtaaaacattatcagatctagc
tgctcattagcctaggcctagtggtccatgattttcttgcctactaaact
aacacagctaccagctttctaatgtcaaattctactaactttgactctcc
ttccatccaatgtgttcttctaccaaataaccaatcacgttggtgtaaac
accttcatctagtctgctcaaatttaccttatcagtgtggcttctctgaa
tgtcctatggaatctattatttgctctgtcttcccttagttctgcttctc
cttagatgttgctctgtttctctacagttctatatagttataaatttctg
ccttagtgaaatgatttaataattctcttcttgttgatcatgtatcatct
aagttgaagcttcttgagaccagatctctttgcacaatgagtgtatgtta
acaaatcatctaatacaatgttaatgcataataacatttattactgaaca
gtgaccttttaagctcctgttcttagctagttcttaggtgttaccgttca
gctttaaatagggtaagttttagtttaaaataagataaggagaaagtggt
gaaaaaagccaaggtactcatcagctttgatttgatttgtggacatggac
ccatgatcacaggaccctttcatttcttcttctttagtttttctggttct
gatctcagttgcacaagctcttgtgatcctctaatacatcttgcagtttg
atacttgcatggccttctcagccattactctgatggcctgctggggttgg
tagcacaa
gaattcagtagcaacccctacaaatttgggagcagggtgatgtgctgagc
tgtcctcagggatcaataggaacacattgtaggcttgtcttcctccttca
actaccttggagactcaggctatgtttgtatctgtcagtctagatttata
gacagaatcctagcataactgtcttctgagaggctctacccagcagctga
ctgaaacagatgcagagactcacagccaaacattggactgagctcctgag
ctccggaagtcttgtgacagagttgggggaaggattgaggaacttccttc
aagtgtaagaataggactgcacaagaagaatagagttaactaatctcttc
cttgagggttcccagatactgaaccatcaaccttaagaggctggacctag
gctgcaccactcatatgtagcagatgtgtaccttggtctttatgtgggtt
tcccaagagcggggcttactgtgactatgttatctgcctgtggatcctgt
tcccctaactgagctgccttgtctggcttcagaggaaaaggatttgacta
gtcctgcagtcaaaggaggtgccagggtgggttggtacccagggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_76841312_76842479
seq2: B6Ng01-103L08.b_46_1203 (reverse)

seq1  TTGTGCTACCAAAACCCCAGCA-GCCATCCAGAGTAATGGCTGAGAA-GC  48
      ||||||||||  |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||
seq2  TTGTGCTACC--AACCCCAGCAGGCCAT-CAGAGTAATGGCTGAGAAGGC  47

seq1  CATGCAAGTATCAAACACCTGCAAGATGTATTAGAAGGATCAC-AGAGCC  97
      |||||||||||||||   |||||||||||||||| |||||||| |||| |
seq2  CATGCAAGTATCAAA---CTGCAAGATGTATTAG-AGGATCACAAGAG-C  92

seq1  TTGTGCAAACTGAGATCAGAACCAGATATACTAAAGAAGAAGAAAATGAA  147
      |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||
seq2  TTGTGC-AACTGAGATCAGAACCAGAAAAACTAAAGAAGAAG-AAATGAA  140

seq1  AGGGTCCTGTGATCATGGGTCCATTGTCCACAAATCAAATCAAAGCTGAT  197
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTCCTGTGATCATGGGTCCA-TGTCCACAAATCAAATCAAAGCTGAT  189

seq1  GAGTACCTTGGCTTTTTTTCACCACTTTCTCCTTATCTTATTTTTAAACT  247
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  GAGTACCTTGGC-TTTTTTCACCACTTTCTCCTTATCTTA-TTTTAAACT  237

seq1  AAAACTTACCCTATTTAAAGCTGAACGGTAACACCTAAGAACTAGCTAAG  297
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTTACCCTATTTAAAGCTGAACGGTAACACCTAAGAACTAGCTAAG  287

seq1  AACAGGAGCTTAAAAGGTCACTGTTCAGTAATAAATGTTATTATGCATTA  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGAGCTTAAAAGGTCACTGTTCAGTAATAAATGTTATTATGCATTA  337

seq1  ACATTGTATTAGATGATTTGTTAACATACACTCATTGTGCAAAGAGATCT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTGTATTAGATGATTTGTTAACATACACTCATTGTGCAAAGAGATCT  387

seq1  GGTCTCAAGAAGCTTCAACTTAGATGATACATGATCAACAAGAAGAGAAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTCAAGAAGCTTCAACTTAGATGATACATGATCAACAAGAAGAGAAT  437

seq1  TATTAAATCATTTCACTAAGGCAGAAATTTATAACTATATAGAACTGTAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTAAATCATTTCACTAAGGCAGAAATTTATAACTATATAGAACTGTAG  487

seq1  AGAAACAGAGCAACATCTAAGGAGAAGCAGAACTAAGGGAAGACAGAGCA  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAACAGAGCAACATCTAAGGAGAAGCAGAACTAAGGGAAGACAGAGCA  537

seq1  AATAATAGATTCCATAGGACATTCAGAGAAGCCACACTGATAAGGTAAAT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAATAGATTCCATAGGACATTCAGAGAAGCCACACTGATAAGGTAAAT  587

seq1  TTGAGCAGACTAGATGAAGGTGTTTACACCAACGTGATTGGTTATTTGGT  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGCAGACTAGATGAAGGTGTTTACACCAACGTGATTGGTTATTTGGT  637

seq1  AGAAGAACACATTGGATGGAAGGAGAGTCAAAGTTAGTAGAATTTGACAT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAACACATTGGATGGAAGGAGAGTCAAAGTTAGTAGAATTTGACAT  687

seq1  TAGAAAGCTGGTAGCTGTGTTAGTTTAGTAGGCAAGAAAATCATGGACCA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAAGCTGGTAGCTGTGTTAGTTTAGTAGGCAAGAAAATCATGGACCA  737

seq1  CTAGGCCTAGGCTAATGAGCAGCTAGATCTGATAATGTTTTACGGAGAAG  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGGCCTAGGCTAATGAGCAGCTAGATCTGATAATGTTTTACGGAGAAG  787

seq1  CCCTGGGTTCTATATTAAAAATACAATTATCTGGAATGCCAATCAGTAAT  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGGTTCTATATTAAAAATACAATTATCTGGAATGCCAATCAGTAAT  837

seq1  CCAGATACAAAATAAGAGTAATGGACATTCAGGCAGAGATAATGCAGAGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGATACAAAATAAGAGTAATGGACATTCAGGCAGAGATAATGCAGAGA  887

seq1  ATGAAGAGTAGGTGACTTTGAAGATAGTGTCAATGGATGCTGTGATATAC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAAGAGTAGGTGACTTTGAAGATAGTGTCAATGGATGCTGTGATATAC  937

seq1  TCAAAGAGGGTTTTGAGGAAATGAATAAGAGATAATTCCAAGCTTTCCCA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGAGGGTTTTGAGGAAATGAATAAGAGATAATTCCAAGCTTTCCCA  987

seq1  CAAGACCATGTGGGAGGAGAGTTTACATTGACTCAGGGAGAAAATGCTGC  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGACCATGTGGGAGGAGAGTTTACATTGACTCAGGGAGAAAATGCTGC  1037

seq1  TGCTGCTGCTGCTGAGAAATAGGAAGATGGAGAGCCCTGTTTCAGAAGTG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTGCTGCTGAGAAATAGGAAGATGGAGAGCCCTGTTTCAGAAGTG  1087

seq1  TTAAGTTTGAAGTGTCCATCTTCTGCATAGGGAGATGTTGCTAGAACACA  1147
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTTTGAAGTGTCCATCTTCTGCATAGGGAGATGTTGCTAGAACACA  1137

seq1  GAATATACATGTCTGGAATTC  1168
      |||||||||||||||||||||
seq2  GAATATACATGTCTGGAATTC  1158

seq1: chr9_76717357_76717951
seq2: B6Ng01-103L08.g_69_663

seq1  GAATTCAGTAGCAACCCCTACAAATTTGGGAGCAGGGTGATGTGCTGAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGTAGCAACCCCTACAAATTTGGGAGCAGGGTGATGTGCTGAGC  50

seq1  TGTCCTCAGGGATCAATAGGAACACATTGTAGGCTTGTCTTCCTCCTTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCTCAGGGATCAATAGGAACACATTGTAGGCTTGTCTTCCTCCTTCA  100

seq1  ACTACCTTGGAGACTCAGGCTATGTTTGTATCTGTCAGTCTAGATTTATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTACCTTGGAGACTCAGGCTATGTTTGTATCTGTCAGTCTAGATTTATA  150

seq1  GACAGAATCCTAGCATAACTGTCTTCTGAGAGGCTCTACCCAGCAGCTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAATCCTAGCATAACTGTCTTCTGAGAGGCTCTACCCAGCAGCTGA  200

seq1  CTGAAACAGATGCAGAGACTCACAGCCAAACATTGGACTGAGCTCCTGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAAACAGATGCAGAGACTCACAGCCAAACATTGGACTGAGCTCCTGAG  250

seq1  CTCCGGAAGTCTTGTGACAGAGTTGGGGGAAGGATTGAGGAACTTCCTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCGGAAGTCTTGTGACAGAGTTGGGGGAAGGATTGAGGAACTTCCTTC  300

seq1  AAGTGTAAGAATAGGACTGCACAAGAAGAATAGAGTTAACTAATCTCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTAAGAATAGGACTGCACAAGAAGAATAGAGTTAACTAATCTCTTC  350

seq1  CTTGAGGGTTCCCAGATACTGAACCATCAACCTTAAGAGGCTGGACCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAGGGTTCCCAGATACTGAACCATCAACCTTAAGAGGCTGGACCTAG  400

seq1  GCTGCACCACTCATATGTAGCAGATGTGTACCTTGGTCTTTATGTGGGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCACCACTCATATGTAGCAGATGTGTACCTTGGTCTTTATGTGGGTT  450

seq1  TCCCAAGAGCGGGGCTTACTGTGACTATGTTATCTGCCTGTGGATCCTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAAGAGCGGGGCTTACTGTGACTATGTTATCTGCCTGTGGATCCTGT  500

seq1  TCCCCTAACTGAGCTGCCTTGTCTGGCTTCAGAGGAAAAGGATTTGACTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCCTAACTGAGCTGCCTTGTCTGGCTTCAGAGGAAAAGGATTTGACTA  550

seq1  GTCCTGCAGTCAAAGGAGGTGCCAGGGTGGGTTGGTACCCAGGGG  595
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCTGCAGTCAAAGGAGGTGCCAGGGTGGGTTGGTACCCAGGGG  595