BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-104P24
Chromosome9 (Build37)
Map Location 74,242,433 - 74,389,423
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneUnc13c, Wdr72, Nr1h2-ps
Downstream geneLOC100040764, Onecut1, BC031353, Arpp19, LOC100040812, Myo5a, LOC677501, Myo5c, Gnb5, Bcl2l10, LOC384954, Mapk6, Leo1, EG666190, LOC100042070, Tmod3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-104P24.bB6Ng01-104P24.g
ACCDH913138DH913139
length1,061992
definitionDH913138|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104P24, 5' end.DH913139|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-104P24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,388,367 - 74,389,423)(74,242,433 - 74,243,430)
sequence
gaattccacgttacctgttgagaagtatgtgaagtaaacaggtatgtggg
tagactttgaggcagggttaaggtgcaaacatgtaaacacttggggaatt
gtgggtatgcaagtctacagtgtagcaggggtcatttgtattaggttcat
tgtgacccgtagatctcgatatattttgcttgactgctaatcaaatgatt
atacttctttagctggacagtcttgaccgacttcattccaatggtaggac
ttttgtgaagcaaagcaggcacagatggagacaacatcttagtgtgtttc
agtctcagagaagggggtgtctcctgatggcccttatgggatgctatgga
aggaagagaactcatacatgttgttctgatgtcgaggggactctgacaga
gacaatgaaactggacacactacacatgtgatgaagactaaggcaaatgg
cctgggccaggatctgctgactgtacaggtgtactgagctggcagggtac
ttgatactgcagaagcctgagagtaacagagaacaggaaaggctgggaaa
caaatttggagcaggttctggatggccttaaatgtttttcccagttctgt
atactaaccgcagcccccgcacccaccccctcgaggttctttcttgcttt
cagaaagtctgtaccaaatctcaaaatgtaagctgtcaaacatccttgcc
catccttgttgtggtttgaatgtgggatgtccccatagactgagtgtttg
aacacttggtccagctggtgatgctattataggggactatggaacctgtt
ggtcttctccaacctgcggcttgagatagtgatagataagaccaatgcaa
aatagtatatctacttttagacacgaaatgtttgttttatgtgggttcta
cagcatgccttgcagatgtcagtcttgagttgcaatgttaaaaagtcagg
caacacctgcagccctttttgagaaaaggtcactggggaatgaaccctgg
gggttacatccactcatgagctacctcctgttgctggtgtaattatatgc
ccttccccacc
gaattcactttaagggagcaagggggtaggaggacagaaatctcagcagc
aggcagaattgcaccagcctttccccatcacaccataaaaaagatgctag
aagatgccacagacttgacacgaggttcaagctgctcagtgaagtctgcc
atgaggtaaaatctgctctttcccctcccataacaacagaagccctgcac
ccaagaggagccatttccaggaatggtgcttccagattctagagatgaga
aaggcactgttgcgaaatctaccttcctggctcaggtacttctttctaga
atacttacacacattatgcttgccacagatggttccactttgggatggct
ctctcacacctcatccaaattcagcacctaatacttaataaaaagtatca
ctggcctggtataatggtgtatgcctttaatctcagcacggggtgacaga
gacaaatggattgccaagaatttgaggacagtctgtttcaaatagtgagt
tttaggccagcctgaaatattgatatattgggatactgatacacatctct
agatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatagatag
atagatagaagatagatagataggcagacagaaaaatcactgcctaagag
ataaatgaaatgttaaccctgtccacaactcaggaatgtctggattcatg
gatatttcatggtttaattttaaaatgaaaataataaactggagtattca
ccgtgtatctgattaaagggaccattatatcatttgagctgtatataata
aacgactcttaatgtcaggctttggatccataaaataaaacacaagacga
ggttctcacccccagttgtctgaagaatgaattcttcctggtagagatct
tctacctcatgataaattagaaatgaaaaaaaaagcaattctagagtctt
gtttgctttgaactattggcaatgaataatctcaggcttagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_74388367_74389423
seq2: B6Ng01-104P24.b_47_1107 (reverse)

seq1  GGTGGGGAAGG---CATAATTACACCAGCAACAGGAGGTAGCTCATGAGT  47
      |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GGTGGGGAAGGGCATATAATTACACCAGCAACAGGAGGTAGCTCATGAG-  49

seq1  TGGATGTAACCCCCAGGGTTCATTCCCCAGTGACCTTTTCTACAAAAGGG  97
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||
seq2  TGGATGTAACCCCCAGGGTTCATTCCCCAGTGACCTTTTCT-CAAAAAGG  98

seq1  CCTGCAGGTG-TGCCTGACTTTTTAACATTGCAACTCAAGACTGACATCT  146
       ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCAGGTGTTGCCTGACTTTTTAACATTGCAACTCAAGACTGACATCT  148

seq1  GCAAGGCATGCTGTAGAA-CCACATAAAACAAACATTTCGTGTCT-AAAG  194
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCAAGGCATGCTGTAGAACCCACATAAAACAAACATTTCGTGTCTAAAAG  198

seq1  TAGATATACTATTTTGCATTGGTCTTATCTATCACTATCTCAAGCCGCAG  244
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATACTATTTTGCATTGGTCTTATCTATCACTATCTCAAGCCGCAG  248

seq1  GTTGGAGAAGACCAACAGGTTCCATAGTCCCCTATAATAGCATCACCAGC  294
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGGAGAAGACCAACAGGTTCCATAGTCCCCTATAATAGCATCACCAGC  298

seq1  TGGACCAAGTGTTCAAACACTCAGTCTATGGGGACATCCCACATTCAAAC  344
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGACCAAGTGTTCAAACACTCAGTCTATGGGGACATCCCACATTCAAAC  348

seq1  CACAACAAGGATGGGCAAGGATGTTTGACAGCTTACATTTTGAGATTTGG  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACAAGGATGGGCAAGGATGTTTGACAGCTTACATTTTGAGATTTGG  398

seq1  TACAGACTTTCTGAAAGCAAGAAAGAACCTCGAGGGGGTGGGTGCGGGGG  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGACTTTCTGAAAGCAAGAAAGAACCTCGAGGGGGTGGGTGCGGGGG  448

seq1  CTGCGGTTAGTATACAGAACTGGGAAAAACATTTAAGGCCATCCAGAACC  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCGGTTAGTATACAGAACTGGGAAAAACATTTAAGGCCATCCAGAACC  498

seq1  TGCTCCAAATTTGTTTCCCAGCCTTTCCTGTTCTCTGTTACTCTCAGGCT  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCAAATTTGTTTCCCAGCCTTTCCTGTTCTCTGTTACTCTCAGGCT  548

seq1  TCTGCAGTATCAAGTACCCTGCCAGCTCAGTACACCTGTACAGTCAGCAG  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGTATCAAGTACCCTGCCAGCTCAGTACACCTGTACAGTCAGCAG  598

seq1  ATCCTGGCCCAGGCCATTTGCCTTAGTCTTCATCACATGTGTAGTGTGTC  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGCCCAGGCCATTTGCCTTAGTCTTCATCACATGTGTAGTGTGTC  648

seq1  CAGTTTCATTGTCTCTGTCAGAGTCCCCTCGACATCAGAACAACATGTAT  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTTCATTGTCTCTGTCAGAGTCCCCTCGACATCAGAACAACATGTAT  698

seq1  GAGTTCTCTTCCTTCCATAGCATCCCATAAGGGCCATCAGGAGACACCCC  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCTCTTCCTTCCATAGCATCCCATAAGGGCCATCAGGAGACACCCC  748

seq1  CTTCTCTGAGACTGAAACACACTAAGATGTTGTCTCCATCTGTGCCTGCT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTGAGACTGAAACACACTAAGATGTTGTCTCCATCTGTGCCTGCT  798

seq1  TTGCTTCACAAAAGTCCTACCATTGGAATGAAGTCGGTCAAGACTGTCCA  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTTCACAAAAGTCCTACCATTGGAATGAAGTCGGTCAAGACTGTCCA  848

seq1  GCTAAAGAAGTATAATCATTTGATTAGCAGTCAAGCAAAATATATCGAGA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAAAGAAGTATAATCATTTGATTAGCAGTCAAGCAAAATATATCGAGA  898

seq1  TCTACGGGTCACAATGAACCTAATACAAATGACCCCTGCTACACTGTAGA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTACGGGTCACAATGAACCTAATACAAATGACCCCTGCTACACTGTAGA  948

seq1  CTTGCATACCCACAATTCCCCAAGTGTTTACATGTTTGCACCTTAACCCT  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCATACCCACAATTCCCCAAGTGTTTACATGTTTGCACCTTAACCCT  998

seq1  GCCTCAAAGTCTACCCACATACCTGTTTACTTCACATACTTCTCAACAGG  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCAAAGTCTACCCACATACCTGTTTACTTCACATACTTCTCAACAGG  1048

seq1  TAACGTGGAATTC  1057
      |||||||||||||
seq2  TAACGTGGAATTC  1061

seq1: chr9_74242433_74243430
seq2: B6Ng01-104P24.g_67_1058

seq1  GAATTCACTTTAAGGGAGCAAGGGGGTAGGAGGACAGAAATCTCAGCAGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTTAAGGGAGCAAGGGGGTAGGAGGACAGAAATCTCAGCAGC  50

seq1  AGGCAGAATTGCACCAGCCTTTCCCCATCACACCATAAAAAAGATGCTAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGAATTGCACCAGCCTTTCCCCATCACACCATAAAAAAGATGCTAG  100

seq1  AAGATGCCACAGACTTGACACGAGGTTCAAGCTGCTCAGTGAAGTCTGCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGATGCCACAGACTTGACACGAGGTTCAAGCTGCTCAGTGAAGTCTGCC  150

seq1  ATGAGGTAAAATCTGCTCTTTCCCCTCCCATAACAACAGAAGCCCTGCAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGTAAAATCTGCTCTTTCCCCTCCCATAACAACAGAAGCCCTGCAC  200

seq1  CCAAGAGGAGCCATTTCCAGGAATGGTGCTTCCAGATTCTAGAGATGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGAGGAGCCATTTCCAGGAATGGTGCTTCCAGATTCTAGAGATGAGA  250

seq1  AAGGCACTGTTGCGAAATCTACCTTCCTGGCTCAGGTACTTCTTTCTAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCACTGTTGCGAAATCTACCTTCCTGGCTCAGGTACTTCTTTCTAGA  300

seq1  ATACTTACACACATTATGCTTGCCACAGATGGTTCCACTTTGGGATGGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTTACACACATTATGCTTGCCACAGATGGTTCCACTTTGGGATGGCT  350

seq1  CTCTCACACCTCATCCAAATTCAGCACCTAATACTTAATAAAAAGTATCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCACACCTCATCCAAATTCAGCACCTAATACTTAATAAAAAGTATCA  400

seq1  CTGGCCTGGTATAATGGTGTATGCCTTTAATCTCAGCACGGGGTGACAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGCCTGGTATAATGGTGTATGCCTTTAATCTCAGCACGGGGTGACAGA  450

seq1  GACAAATGGATTGCCAAGAATTTGAGGACAGTCTGTTTCAAATAGTGAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAAATGGATTGCCAAGAATTTGAGGACAGTCTGTTTCAAATAGTGAGT  500

seq1  TTTAGGCCAGCCTGAAATATTGATATATTGGGATACTGATACACATCTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGCCAGCCTGAAATATTGATATATTGGGATACTGATACACATCTCT  550

seq1  AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAG  600

seq1  ATAGATAGAAGATAGATAGATAGGCAGACAGAAAAATCACTGCCTAAGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATAGAAGATAGATAGATAGGCAGACAGAAAAATCACTGCCTAAGAG  650

seq1  ATAAATGAAATGTTAACCCTGTCCACAACTCAGGAATGTCTGGATTCATG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATGAAATGTTAACCCTGTCCACAACTCAGGAATGTCTGGATTCATG  700

seq1  GATATTTCATGGTTTAATTTTAAAATGAAAATAATAAACTGGAGTATTCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATATTTCATGGTTTAATTTTAAAATGAAAATAATAAACTGGAGTATTCA  750

seq1  CCGTGTATCTGATTAAA-GGACCA-TATATCATTTGAGCTGAATAGAATA  798
      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||
seq2  CCGTGTATCTGATTAAAGGGACCATTATATCATTTGAGCTGTATATAATA  800

seq1  AACGACTCTTAATGTCAGGCTTTGGATCCATAAAATAAAACACAAGACGA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACGACTCTTAATGTCAGGCTTTGGATCCATAAAATAAAACACAAGACGA  850

seq1  GGTTCTCA-CCCCAGTTGTCTGAAAGACTGATTTCTT-CTTGTAGAAGAT  896
      |||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||||| || |||| ||||
seq2  GGTTCTCACCCCCAGTTGTCTG-AAGAATGAATTCTTCCTGGTAG-AGAT  898

seq1  CATCAACCTCATGATAAATTAGAAATGAAAAAAAAAAAGCAAATTCTAGA  946
      | || ||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||
seq2  CTTCTACCTCATGATAAATTAGAAATG--AAAAAAAAAGC-AATTCTAGA  945

seq1  GTCTTGTTTTGCTTTTGAACTAGTTTGGCAATAAATTAATCCCAGGCTTA  996
      |||||| ||||| |||||||||  |||||||| || ||||| ||||||||
seq2  GTCTTG-TTTGC-TTTGAACTA--TTGGCAATGAA-TAATCTCAGGCTTA  990

seq1  GG  998
      ||
seq2  GG  992