BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-110G20
Chromosome9 (Build37)
Map Location 69,488,321 - 69,581,156
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneRora, 9530091C08Rik, Narg2, EG665815, EG244913, Anxa2
Downstream geneFoxb1, Bnip2, LOC624164, Gtf2a2, Gcnt3, 6430514L14Rik, Myo1e, Ccnb2, Rnf111, Sltm, B230380D07Rik, Adam10, Cycs-ps1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-110G20.bB6Ng01-110G20.g
ACCDH917053DH917054
length9481,056
definitionDH917053|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-110G20, 5' end.DH917054|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-110G20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(69,580,210 - 69,581,156)(69,488,321 - 69,489,400)
sequence
gaattctacattttgatccaaaggcagccgaaggggattgtgtgccacac
tgggcatagcttgaacatgggagacctctaagcctgcccccacaatgaca
cacttgttccaacaaggccacaatgcctatgggacaagcattccaaacca
ggaatctatggagccattcctattcaaactaccatacttgcaaagatgtt
tgttggggatgctccagctaggacaggcaggatcttgagaaggtaacaag
gaagaggctggccacaggctggtgtgaccaagccattgaggaaaggtaga
gacacttagagcaaataatcacagcagaggttagtggaacagcaggctgt
gtgtgatctgctgataggttactttggaaacctcagatttgcaagggggt
gggcgttcttcaaagaccaatataagaaaaccctgctttgcagtgaaggg
gctggacaaaggggaagtcttatttccaagaggtctaggaataagctcat
atgatctgttactcatccaaattcactgacatccctggaggtctgtgtta
tcctcacctcacaaccaagattctgaagctcagtgaaggtaagaaaccag
catgagggagggcagagaaggtggagcatgctcaccctggtctggtgagt
gttacccataagaagtttttgacggtccctctcacccctccttcttcctc
tcctccccacagcttgttatccagaaagaaaatgtagaggctgtgatcta
gaggaatagaatgggtagtgtgactttggactaagcactttgtctctaac
ctttagggctcctgatttgtccaatgtcctggtttacctccaagctctcc
caagtgattatcccagtatgactacatcataaatcagagttccctcctca
gcttagtggaggtttatccttttctttgatttgggggtgcttgagtct
gaattcaaccccagcttggacggtgcctttgtaattctaccatttgtgca
taggcttaggctgggctgtggaaaagctagacaccctagcaaaggaaaat
gatttacacttgaaagccacagccaatatgaaaataaacattgaattggt
ttcttcctttgagtccatgttccattagaataactacagtaggtgacatt
tttcacattttaattggtgttttgctgattttatcagaatttctgctgat
caaagcaaattggctatttatttattttgtaacgaagctaactgttccct
gcaagtttaatgtactgtaatgaattttaaacatcctcctagttagatta
caaagtgtttgaatctaggcatccttgttatacttaaattattaattact
caaatggacataaggtaacattcagagaaaatgtcacattttaagtggat
ctggattagatgaaaatgttgggtcaaccttcaagaagagcatacttccc
tgcttaacccactcctacctgcttggttcttagacatatgataaatacat
tcattattagtttattctcagtagcttacagaacaataagtttttatgtt
atttacactccagtgactttggtttaattggcttcttttatgttatttat
ataaatataaatcatactgggtcttaaagtattaatgatgcattttatgt
tgtagtgctgtttttgttcagaccaacattccataaattcacatcgtccg
tgggcgacagctaagaatgaatgatacagggttctccttccaaagtcgaa
ggaagcgaaatgcctctgagtcttacagaactcagcccgaaatgaagagc
tctgcggaattacatgcacttacagttgagttagcaagttaatttatcag
atatatctggggagcattctcagtcatgcgctgggaaatgacagacattt
tctcccactgaagtttacatgtttgtcgatttgcagatctagatcactcg
agctgatctctgcatggtctgcatgatttctagataggtacgagtagaaa
acccac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_69580210_69581156
seq2: B6Ng01-110G20.b_46_993 (reverse)

seq1  AGACTCAAGCA-CCCCAAATCAAAGAAAA-GATAAACCTCCACTAGGCTG  48
      ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||
seq2  AGACTCAAGCACCCCCAAATCAAAGAAAAGGATAAACCTCCACTAAGCTG  50

seq1  AGGAGGGAACTCTGATTTATGATGTAGTCATACTGGGATAATCACTTGGG  98
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGGAACTCTGATTTATGATGTAGTCATACTGGGATAATCACTTGGG  100

seq1  AGAGCCTTGGAGGTAAACCAGGACATTGGACAAATCAGGAGCCCTAAAGG  148
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAG-CTTGGAGGTAAACCAGGACATTGGACAAATCAGGAGCCCTAAAGG  149

seq1  TTAGAGACAAAGTGCTTAGTCCAAAGTCACACTACCCATTCTATTCCTCT  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGAGACAAAGTGCTTAGTCCAAAGTCACACTACCCATTCTATTCCTCT  199

seq1  AGATCACAGCCTCTACATTTTCTTTCTGGATAACAAGCTGTGGGGAGGAG  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCACAGCCTCTACATTTTCTTTCTGGATAACAAGCTGTGGGGAGGAG  249

seq1  AGGAAGAAGGAGGGGTGAGAGGGACCGTCAAAAACTTCTTATGGGTAACA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGAAGGAGGGGTGAGAGGGACCGTCAAAAACTTCTTATGGGTAACA  299

seq1  CTCACCAGACCAGGGTGAGCATGCTCCACCTTCTCTGCCCTCCCTCATGC  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCACCAGACCAGGGTGAGCATGCTCCACCTTCTCTGCCCTCCCTCATGC  349

seq1  TGGTTTCTTACCTTCACTGAGCTTCAGAATCTTGGTTGTGAGGTGAGGAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTCTTACCTTCACTGAGCTTCAGAATCTTGGTTGTGAGGTGAGGAT  399

seq1  AACACAGACCTCCAGGGATGTCAGTGAATTTGGATGAGTAACAGATCATA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGACCTCCAGGGATGTCAGTGAATTTGGATGAGTAACAGATCATA  449

seq1  TGAGCTTATTCCTAGACCTCTTGGAAATAAGACTTCCCCTTTGTCCAGCC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCTTATTCCTAGACCTCTTGGAAATAAGACTTCCCCTTTGTCCAGCC  499

seq1  CCTTCACTGCAAAGCAGGGTTTTCTTATATTGGTCTTTGAAGAACGCCCA  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCACTGCAAAGCAGGGTTTTCTTATATTGGTCTTTGAAGAACGCCCA  549

seq1  CCCCCTTGCAAATCTGAGGTTTCCAAAGTAACCTATCAGCAGATCACACA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCTTGCAAATCTGAGGTTTCCAAAGTAACCTATCAGCAGATCACACA  599

seq1  CAGCCTGCTGTTCCACTAACCTCTGCTGTGATTATTTGCTCTAAGTGTCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTGCTGTTCCACTAACCTCTGCTGTGATTATTTGCTCTAAGTGTCT  649

seq1  CTACCTTTCCTCAATGGCTTGGTCACACCAGCCTGTGGCCAGCCTCTTCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACCTTTCCTCAATGGCTTGGTCACACCAGCCTGTGGCCAGCCTCTTCC  699

seq1  TTGTTACCTTCTCAAGATCCTGCCTGTCCTAGCTGGAGCATCCCCAACAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTACCTTCTCAAGATCCTGCCTGTCCTAGCTGGAGCATCCCCAACAA  749

seq1  ACATCTTTGCAAGTATGGTAGTTTGAATAGGAATGGCTCCATAGATTCCT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTGCAAGTATGGTAGTTTGAATAGGAATGGCTCCATAGATTCCT  799

seq1  GGTTTGGAATGCTTGTCCCATAGGCATTGTGGCCTTGTTGGAACAAGTGT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTTGGAATGCTTGTCCCATAGGCATTGTGGCCTTGTTGGAACAAGTGT  849

seq1  GTCATTGTGGGGGCAGGCTTAGAGGTCTCCCATGTTCAAGCTATGCCCAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTGTGGGGGCAGGCTTAGAGGTCTCCCATGTTCAAGCTATGCCCAG  899

seq1  TGTGGCACACAATCCCCTTCGGCTGCCTTTGGATCAAAATGTAGAATTC  947
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGCACACAATCCCCTTCGGCTGCCTTTGGATCAAAATGTAGAATTC  948

seq1: chr9_69488321_69489400
seq2: B6Ng01-110G20.g_67_1122

seq1  GAATTCAACCCCAGCTTGGACGGTGCCTTTGTAATTCTACCATTTGTGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAACCCCAGCTTGGACGGTGCCTTTGTAATTCTACCATTTGTGCA  50

seq1  TAGGCTTAGGCTGGGCTGTGGAAAAGCTAGACACCCTAGCAAAGGAAAAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGCTTAGGCTGGGCTGTGGAAAAGCTAGACACCCTAGCAAAGGAAAAT  100

seq1  GATTTACACTTGAAAGCCACAGCCAATATGAAAATAAACATTGAATTGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTACACTTGAAAGCCACAGCCAATATGAAAATAAACATTGAATTGGT  150

seq1  TTCTTCCTTTGAGTCCATGTTCCATTAGAATAACTACAGTAGGTGACATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTCCTTTGAGTCCATGTTCCATTAGAATAACTACAGTAGGTGACATT  200

seq1  TTTCACATTTTAATTGGTGTTTTGCTGATTTTATCAGAATTTCTGCTGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCACATTTTAATTGGTGTTTTGCTGATTTTATCAGAATTTCTGCTGAT  250

seq1  CAAAGCAAATTGGCTATTTATTTATTTTGTAACGAAGCTAACTGTTCCCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCAAATTGGCTATTTATTTATTTTGTAACGAAGCTAACTGTTCCCT  300

seq1  GCAAGTTTAATGTACTGTAATGAATTTTAAACATCCTCCTAGTTAGATTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGTTTAATGTACTGTAATGAATTTTAAACATCCTCCTAGTTAGATTA  350

seq1  CAAAGTGTTTGAATCTAGGCATCCTTGTTATACTTAAATTATTAATTACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTGTTTGAATCTAGGCATCCTTGTTATACTTAAATTATTAATTACT  400

seq1  CAAATGGACATAAGGTAACATTCAGAGAAAATGTCACATTTTAAGTGGAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGGACATAAGGTAACATTCAGAGAAAATGTCACATTTTAAGTGGAT  450

seq1  CTGGATTAGATGAAAATGTTGGGTCAACCTTCAAGAAGAGCATACTTCCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTAGATGAAAATGTTGGGTCAACCTTCAAGAAGAGCATACTTCCC  500

seq1  TGCTTAACCCACTCCTACCTGCTTGGTTCTTAGACATATGATAAATACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAACCCACTCCTACCTGCTTGGTTCTTAGACATATGATAAATACAT  550

seq1  TCATTATTAGTTTATTCTCAGTAGCTTACAGAACAATAAGTTTTTATGTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATTATTAGTTTATTCTCAGTAGCTTACAGAACAATAAGTTTTTATGTT  600

seq1  ATTTACACTCCAGTGACTTTGGTTTAATTGGCTTCTTTTATGTTATTTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTACACTCCAGTGACTTTGGTTTAATTGGCTTCTTTTATGTTATTTAT  650

seq1  ATAAATATAAATCATACTGGGTCTTAAAGTATTAATGATGCATTTTATGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATATAAATCATACTGGGTCTTAAAGTATTAATGATGCATTTTATGT  700

seq1  TGTAGTGCTGTTTTTGTTCAGACCAACATTCCATAAATTCACATCGTCCG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAGTGCTGTTTTTGTTCAGACCAACATTCCATAAATTCACATCGTCCG  750

seq1  TGGGCGACAGCTAAGGAATGAATGATACAGGG-TCTCCTTCCAAAGTCGA  799
      |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TGGGCGACAGCTAA-GAATGAATGATACAGGGTTCTCCTTCCAAAGTCGA  799

seq1  AGGAAGCG-AATGCCTCTGAGTCTTACAGAACTCAGGCCCGAAATGAAGA  848
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AGGAAGCGAAATGCCTCTGAGTCTTACAGAACTCA-GCCCGAAATGAAGA  848

seq1  GCTCTGCGGAATTACAATGCACTTACAGTTGAGTTAGCAAGTTAATTTAT  898
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCTCTGCGGAATTAC-ATGCACTTACAGTTGAGTTAGCAAGTTAATTTA-  896

seq1  TCAGATATATCTGGGGAGCAATTCTTCAGTCCATGCGCTTGGGAAATGAC  948
      ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||||
seq2  TCAGATATATCTGGGGAGC-ATTC-TCAGT-CATGCGC-TGGGAAATGAC  942

seq1  AGACATTTTCTCCCACTGAAGGTTTACATGTTTTGTCGATTTGGCAAGAT  998
      |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||   ||||
seq2  AGACATTTTCTCCCACTGAA-GTTTACATG-TTTGTCGATTTG--CAGAT  988

seq1  CTAGAATCACCTCGGAGCTGAATCTCTGCATGTGTCTGCGATGGATTTTC  1048
      |||| |||| ||| |||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||
seq2  CTAG-ATCA-CTC-GAGCTG-ATCTCTGCATG-GTCTGC-ATG--ATTTC  1030

seq1  TAGATTAGGTAAACCGAGGTAGGAAAACCCAC  1080
      |||| ||||||   ||| ||| ||||||||||
seq2  TAGA-TAGGTA---CGA-GTA-GAAAACCCAC  1056