BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-129O23
Chromosome9 (Build37)
Map Location 30,609,923 - 30,713,001
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdamts15
Upstream geneHnt, Snx19, LOC666478
Downstream geneAdamts8, Zbtb44, BC038156, St14, Aplp2, EG638580, EG666539, Prdm10, Nfrkb, Tmem45b, LOC666558, EG666576, Barx2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-129O23.bB6Ng01-129O23.g
ACCDH931392DH931393
length793515
definitionDH931392|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129O23, 5' end.DH931393|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-129O23, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,712,209 - 30,713,001)(30,609,923 - 30,610,443)
sequence
gaattctcaaaatgccattatgctcctccttacgtcaaaacacagaaatt
atttgtgccatcattgaatattgtctttttttaaaaacgcattacaaaga
atacatccatcagaagtatgtttcaaagtatatcagtagttgtttaattc
ttgttactttgtgtaaggtgtttaacagtgtaatgagaagagacttaata
ggctgctgaagggcttcatcatccaaaaaaaaaaagaaagaaaatgttca
ggacacctgttagagaggggagttgagactagataactggaggtggagac
atattgcttatggcgcgttccaggctgctttaatcttgggaggtggggga
tgactcccacactgtcatggaggcagaggggctttcagagctgggcatcc
ttgggaggatgctgtcttttgttccttcctgggctcctcttttcagctgt
ctttatgtgctttctccctgtccagcctctggcaagagcttccgggaaga
gcaatgtgaagctttcaatggctacaaccacagcaccaaccggctcactt
tagctgtggcatgggtacccaagtactcaggcgtgtcaccacgtgacaag
tgtaagctcatctgccgagccaatgggactggctacttctatgtactagc
acctaaggtgagtatgcagggataggagacccatagacctgggcagggtc
taggcttcagaggatcctctcactgagctgcctctctcttcttttttggg
gatgctgtaggtggtggatggtaccctgtgtctcctgactcct
agagctactcacgccgacaagccctgagctctactctgcttcttgaggag
ggaagaggttgctctcaggtggcacttgatggctcaagtgcccttgataa
ctacaccacgaggcagtaaggtcagcaagaacatctctcccttacacagg
tgagaagagccactataagtatgctggaaggagatgggcccggaggggca
gggagggaaatggtgcttgctcagtaccacatgagaatgtgcagctaagc
ctgggctgcaaccagctttcctgtgccagaggagtgttatttccattaga
tgcagagtaagagaggcagtggtgactctctccagcccccctagcctacc
aatttcctctctcaccttcccaaggagctagccagcctcctgacaacagg
ctgggaagagaagacctggggtgggaggttggggtgatgacagctgcctg
acatcaggaaggtgactgggtttggtgctgagcctctaccaagctcatcc
ccgtaatgatgaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_30712209_30713001
seq2: B6Ng01-129O23.b_47_838 (reverse)

seq1  GGAGTCAGGAGTACACAGCGTACCATCCACCACCTACAGCATCCCCAAAA  50
      ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGTCAGGAG-ACACAGGGTACCATCCACCACCTACAGCATCCCCAAAA  49

seq1  AAGAAGAGAGAGGCAGCTCAGTGAGAGGATCCTCTGAAGCCTAGACCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAGAGAGGCAGCTCAGTGAGAGGATCCTCTGAAGCCTAGACCCTG  99

seq1  CCCAGGTCTATGGGTCTCCTATCCCTGCATACTCACCTTAGGTGCTAGTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGTCTATGGGTCTCCTATCCCTGCATACTCACCTTAGGTGCTAGTA  149

seq1  CATAGAAGTAGCCAGTCCCATTGGCTCGGCAGATGAGCTTACACTTGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGAAGTAGCCAGTCCCATTGGCTCGGCAGATGAGCTTACACTTGTCA  199

seq1  CGTGGTGACACGCCTGAGTACTTGGGTACCCATGCCACAGCTAAAGTGAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGGTGACACGCCTGAGTACTTGGGTACCCATGCCACAGCTAAAGTGAG  249

seq1  CCGGTTGGTGCTGTGGTTGTAGCCATTGAAAGCTTCACATTGCTCTTCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGTTGGTGCTGTGGTTGTAGCCATTGAAAGCTTCACATTGCTCTTCCC  299

seq1  GGAAGCTCTTGCCAGAGGCTGGACAGGGAGAAAGCACATAAAGACAGCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTCTTGCCAGAGGCTGGACAGGGAGAAAGCACATAAAGACAGCTG  349

seq1  AAAAGAGGAGCCCAGGAAGGAACAAAAGACAGCATCCTCCCAAGGATGCC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGGAGCCCAGGAAGGAACAAAAGACAGCATCCTCCCAAGGATGCC  399

seq1  CAGCTCTGAAAGCCCCTCTGCCTCCATGACAGTGTGGGAGTCATCCCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTCTGAAAGCCCCTCTGCCTCCATGACAGTGTGGGAGTCATCCCCCA  449

seq1  CCTCCCAAGATTAAAGCAGCCTGGAACGCGCCATAAGCAATATGTCTCCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCAAGATTAAAGCAGCCTGGAACGCGCCATAAGCAATATGTCTCCA  499

seq1  CCTCCAGTTATCTAGTCTCAACTCCCCTCTCTAACAGGTGTCCTGAACAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCAGTTATCTAGTCTCAACTCCCCTCTCTAACAGGTGTCCTGAACAT  549

seq1  TTTCTTTCTTTTTTTTTTTGGATGATGAAGCCCTTCAGCAGCCTATTAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTTTCTTTTTTTTTTTGGATGATGAAGCCCTTCAGCAGCCTATTAAG  599

seq1  TCTCTTCTCATTACACTGTTAAACACCTTACACAAAGTAACAAGAATTAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTCTCATTACACTGTTAAACACCTTACACAAAGTAACAAGAATTAA  649

seq1  ACAACTACTGATATACTTTGAAACATACTTCTGATGGATGTATTCTTTGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAACTACTGATATACTTTGAAACATACTTCTGATGGATGTATTCTTTGT  699

seq1  AATGCGTTTTTAAAAAAAGACAATATTCAATGATGGCACAAATAATTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGCGTTTTTAAAAAAAGACAATATTCAATGATGGCACAAATAATTTCT  749

seq1  GTGTTTTGACGTAAGGAGGAGCATAATGGCATTTTGAGAATTC  793
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTTGACGTAAGGAGGAGCATAATGGCATTTTGAGAATTC  792

seq1: chr9_30609923_30610443
seq2: B6Ng01-129O23.g_71_591

seq1  GAATTCAGAGCTACTCACGCCGACAAGCCCTGAGCTCTACTCTGCTTCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGAGCTACTCACGCCGACAAGCCCTGAGCTCTACTCTGCTTCTT  50

seq1  GAGGAGGGAAGAGGTTGCTCTCAGGTGGCACTTGATGGCTCAAGTGCCCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAGGGAAGAGGTTGCTCTCAGGTGGCACTTGATGGCTCAAGTGCCCT  100

seq1  TGATAACTACACCACGAGGCAGTAAGGTCAGCAAGAACATCTCTCCCTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAACTACACCACGAGGCAGTAAGGTCAGCAAGAACATCTCTCCCTTA  150

seq1  CACAGGTGAGAAGAGCCACTATAAGTATGCTGGAAGGAGATGGGCCCGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTGAGAAGAGCCACTATAAGTATGCTGGAAGGAGATGGGCCCGGA  200

seq1  GGGGCAGGGAGGGAAATGGTGCTTGCTCAGTACCACATGAGAATGTGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCAGGGAGGGAAATGGTGCTTGCTCAGTACCACATGAGAATGTGCAG  250

seq1  CTAAGCCTGGGCTGCAACCAGCTTTCCTGTGCCAGAGGAGTGTTATTTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAGCCTGGGCTGCAACCAGCTTTCCTGTGCCAGAGGAGTGTTATTTCC  300

seq1  ATTAGATGCAGAGTAAGAGAGGCAGTGGTGACTCTCTCCAGCCCCCCTAG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGATGCAGAGTAAGAGAGGCAGTGGTGACTCTCTCCAGCCCCCCTAG  350

seq1  CCTACCAATTTCCTCTCTCACCTTCCCAAGGAGCTAGCCAGCCTCCTGAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCAATTTCCTCTCTCACCTTCCCAAGGAGCTAGCCAGCCTCCTGAC  400

seq1  AACAGGCTGGGAAGAGAAGACCTGGGGTGGGAGGTTGGGGTGATGACAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGGCTGGGAAGAGAAGACCTGGGGTGGGAGGTTGGGGTGATGACAGC  450

seq1  TGCCTGACAGCAGGAAGGTGACTGGGTTTGGTGCTGAGCCTCTACCAGGC  500
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  TGCCTGACATCAGGAAGGTGACTGGGTTTGGTGCTGAGCCTCTACCAAGC  500

seq1  TCATCCCCGCAATGATGAAAA  521
      ||||||||| |||||||||||
seq2  TCATCCCCGTAATGATGAAAA  521