BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-130L07
Chromosome9 (Build37)
Map Location 97,650,103 - 97,783,288
singlet/doubletdoublet
Overlap geneClstn2
Upstream geneLOC100040230, LOC667216, Acpl2, LOC19034, LOC667226, Spsb4, LOC100040254, Slc25a36, EG622727, LOC384971, Trim42
Downstream geneLOC667298, Nmnat3, Rbp1, Rbp2, 4930579K19Rik, Copb2, Mrps22, EG623166, EG623186, 2410012M07Rik, LOC546155
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-130L07.bB6Ng01-130L07.g
ACCDH931954DH931955
length6281,069
definitionDH931954|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130L07, 5' end.DH931955|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-130L07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(97,650,103 - 97,650,730)(97,782,199 - 97,783,288)
sequence
gaattctccacaggaggatggaaattgagtattactagtgttcaaattgt
gtactgcatatctcctcaagaaagatgcccatttgtcaggtggaaatgat
ggaggaggatggctatctaggtattacctggaaaagccaatcagccattc
aagaagagcctttctctgtattgttacataaaggatcagtgaatgacagg
tagaggaggctgtgactcttgtttctgctgcaagtcttgattttatggca
aaggagagcaagttggggcaagtccaaagtagctatgtgggaggattgac
tgggactggcacctgccagaacagaaagcctcccatccagaagggtagga
gaagccgcttctatagctctccttccttgaggtcaggcatagaccgcctg
gcattccttactgtaggcatgatgttattgtacactgtgtaaagattagc
cttgtatttttcaaatgctgatttctgtgtccccatatctggttgcaaaa
cattgctcctcaattatttccagattggtaaataaagaagctgatcaacc
aatgtctgagcagggaagagaatagggctggacttcctccaagccaggag
aggctagggggtggtgggtatgggggtg
gaattcattggtgagattcaatgtcttcttttatccatctgttccatcag
tagctttgctgcttctcatgcctctctccatggctgcccccaggatatga
tacaggtcccacaaaatacatgcagtcagggtaggcctaaagcctgagag
ttggaccctaaagactcctgggatgtgtagctttgtaaggctttcaacta
ggatcaaatgttggatggagttgtatgttttagaattgttatttggctct
tggtgcaagctcatggtcaactttgttgctcaccatcagctaaaatacag
atcacgtgagacaactcagatggacaatctccagatggagatttgactca
ctgctgataagtgtgaagtttttaacagatttatattgaggcttcttatc
tacctaattcataagaatatcacatcccattattatcttatggccatttg
gctatattgtagtgatacaaatagaaaagaggtcttctctgctgtggtaa
tgccaaaagataagtctggaacatcttcatgtctatcttgaaaagaatgt
tgaggctttgtgtctgttctgtgaccatgttaatcagcagtgtctgtgat
gagaaagggataagagcacatggtgctgtgcatagatcagaatttatcaa
gtcaactctacagcttagacttttcatggtggtcccaggaaaaacatttc
agccttctgtgtctctcttcacctttatagtgacagtgtctacccagagt
gctttggtttttatttcctgaaccatccaatgtacattatccacatgaat
agtaccctgcacattggagtgaaatatgagtctcattgcttactgtaatt
aatcattaataccaaacctcttgtctccggccaatgaagtgctaaagctc
catgacatatatctgtcactgtcagtcattggattaccgggttgtctcta
ggtgctgtaaactatctctttaggtgttgctaagttccttgagccctgct
acctaacagatgttattcaggagcccgccttttaatgcttcaaagtattt
tctactgctcttgatcaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_97650103_97650730
seq2: B6Ng01-130L07.b_45_672

seq1  GAATTCTCCACAGGAGGATGGAAATTGAGTATTACTAGTGTTCAAATTGT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCACAGGAGGATGGAAATTGAGTATTACTAGTGTTCAAATTGT  50

seq1  GTACTGCATATCTCCTCAAGAAAGATGCCCATTTGTCAGGTGGAAATGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACTGCATATCTCCTCAAGAAAGATGCCCATTTGTCAGGTGGAAATGAT  100

seq1  GGAGGAGGATGGCTATCTAGGTATTACCTGGAAAAGCCAATCAGCCATTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGAGGATGGCTATCTAGGTATTACCTGGAAAAGCCAATCAGCCATTC  150

seq1  AAGAAGAGCCTTTCTCTGTATTGTTACATAAAGGATCAGTGAATGACAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAAGAGCCTTTCTCTGTATTGTTACATAAAGGATCAGTGAATGACAGG  200

seq1  TAGAGGAGGCTGTGACTCTTGTTTCTGCTGCAAGTCTTGATTTTATGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAGGAGGCTGTGACTCTTGTTTCTGCTGCAAGTCTTGATTTTATGGCA  250

seq1  AAGGAGAGCAAGTTGGGGCAAGTCCAAAGTAGCTATGTGGGAGGATTGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGAGCAAGTTGGGGCAAGTCCAAAGTAGCTATGTGGGAGGATTGAC  300

seq1  TGGGACTGGCACCTGCCAGAACAGAAAGCCTCCCATCCAGAAGGGTAGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACTGGCACCTGCCAGAACAGAAAGCCTCCCATCCAGAAGGGTAGGA  350

seq1  GAAGCCGCTTCTATAGCTCTCCTTCCTTGAGGTCAGGCATAGACCGCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCGCTTCTATAGCTCTCCTTCCTTGAGGTCAGGCATAGACCGCCTG  400

seq1  GCATTCCTTACTGTAGGCATGATGTTATTGTACACTGTGTAAAGATTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTCCTTACTGTAGGCATGATGTTATTGTACACTGTGTAAAGATTAGC  450

seq1  CTTGTATTTTTCAAATGCTGATTTCTGTGTCCCCATATCTGGTTGCAAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTATTTTTCAAATGCTGATTTCTGTGTCCCCATATCTGGTTGCAAAA  500

seq1  CATTGCTCCTCAATTATTTCCAGATTGGTAAATAAAGAAGCTGATCAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTCCTCAATTATTTCCAGATTGGTAAATAAAGAAGCTGATCAACC  550

seq1  AATGTCTGAGCAGGGAAGAGAATAGGGCTGGACTTCCTCCAAGCCAGGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCTGAGCAGGGAAGAGAATAGGGCTGGACTTCCTCCAAGCCAGGAG  600

seq1  AGGCTAGGGGGTGGTGGGTATGGGGGTG  628
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAGGGGGTGGTGGGTATGGGGGTG  628

seq1: chr9_97782199_97783288
seq2: B6Ng01-130L07.g_69_1137 (reverse)

seq1  TTTGATCAAGGAAGCAGTAGAAACATTAATTTTGAAGCATTTAAAAAGCG  50
      ||||||||||  ||||||||||| ||  | ||||||||| |||||| |||
seq2  TTTGATCAAG--AGCAGTAGAAA-AT--ACTTTGAAGCA-TTAAAAGGCG  44

seq1  CGGCTCCCTGAATACACATCTGTTAAGTTGCAGGGGCTCCAAGGGAAACT  100
       |||| |||||||| |||||||||| || ||| ||||| |||||  ||||
seq2  -GGCT-CCTGAATA-ACATCTGTTAGGTAGCA-GGGCT-CAAGG--AACT  87

seq1  GTAGCAAACACCTTAAAGAGATAGTTTACAGGCACCTAGAGAACAACCCG  150
       |||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||
seq2  -TAGC-AACACC-TAAAGAGATAGTTTACA-GCACCTAGAG-ACAACCCG  132

seq1  GTAATCCCAATGACCTGAACAGTGACAGATATATGTCAT-GAGCTTTAGC  199
      ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTAAT-CCAATGA-CTG-ACAGTGACAGATATATGTCATGGAGCTTTAGC  179

seq1  AACTTCATTGGCCGGAAGACAAGAGGTAT-GTATTAATGATTAATTACAG  248
       |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||
seq2  -ACTTCATTGGCCGG-AGACAAGAGGTTTGGTATTAATGATTAATTACAG  227

seq1  T-AGCAATGAGACTTCATATTTCACTCCAATGTGCAGGGTACTATTCATG  297
      | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCAATGAGAC-TCATATTTCACTCCAATGTGCAGGGTACTATTCATG  276

seq1  TGGATAATGTACATTGGATGGTTCAGGAAATAAAAACCAAAGCACTCTGG  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATAATGTACATTGGATGGTTCAGGAAATAAAAACCAAAGCACTCTGG  326

seq1  GTAGACACTGTCACTATAAAGGTGAAGAGAGACACAGAAGGCTGAAATGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACACTGTCACTATAAAGGTGAAGAGAGACACAGAAGGCTGAAATGT  376

seq1  TTTTCCTGGGACCACCATGAAAAGTCTAAGCTGTAGAGTTGACTTGATAA  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCCTGGGACCACCATGAAAAGTCTAAGCTGTAGAGTTGACTTGATAA  426

seq1  ATTCTGATCTATGCACAGCACCATGTGCTCTTATCCCTTTCTCATCACAG  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTGATCTATGCACAGCACCATGTGCTCTTATCCCTTTCTCATCACAG  476

seq1  ACACTGCTGATTAACATGGTCACAGAACAGACACAAAGCCTCAACATTCT  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGCTGATTAACATGGTCACAGAACAGACACAAAGCCTCAACATTCT  526

seq1  TTTCAAGATAGACATGAAGATGTTCCAGACTTATCTTTTGGCATTACCAC  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAAGATAGACATGAAGATGTTCCAGACTTATCTTTTGGCATTACCAC  576

seq1  AGCAGAGAAGACCTCTTTTCTATTTGTATCACTACAATATAGCCAAATGG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGAGAAGACCTCTTTTCTATTTGTATCACTACAATATAGCCAAATGG  626

seq1  CCATAAGATAATAATGGGATGTGATATTCTTATGAATTAGGTAGATAAGA  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAAGATAATAATGGGATGTGATATTCTTATGAATTAGGTAGATAAGA  676

seq1  AGCCTCAATATAAATCTGTTAAAAACTTCACACTTATCAGCAGTGAGTCA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCAATATAAATCTGTTAAAAACTTCACACTTATCAGCAGTGAGTCA  726

seq1  AATCTCCATCTGGAGATTGTCCATCTGAGTTGTCTCACGTGATCTGTATT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTCCATCTGGAGATTGTCCATCTGAGTTGTCTCACGTGATCTGTATT  776

seq1  TTAGCTGATGGTGAGCAACAAAGTTGACCATGAGCTTGCACCAAGAGCCA  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGCTGATGGTGAGCAACAAAGTTGACCATGAGCTTGCACCAAGAGCCA  826

seq1  AATAACAATTCTAAAACATACAACTCCATCCAACATTTGATCCTAGTTGA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAACAATTCTAAAACATACAACTCCATCCAACATTTGATCCTAGTTGA  876

seq1  AAGCCTTACAAAGCTACACATCCCAGGAGTCTTTAGGGTCCAACTCTCAG  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTTACAAAGCTACACATCCCAGGAGTCTTTAGGGTCCAACTCTCAG  926

seq1  GCTTTAGGCCTACCCTGACTGCATGTATTTTGTGGGACCTGTATCATATC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTAGGCCTACCCTGACTGCATGTATTTTGTGGGACCTGTATCATATC  976

seq1  CTGGGGGCAGCCATGGAGAGAGGCATGAGAAGCAGCAAAGCTACTGATGG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGGGCAGCCATGGAGAGAGGCATGAGAAGCAGCAAAGCTACTGATGG  1026

seq1  AACAGATGGATAAAAGAAGACATTGAATCTCACCAATGAATTC  1090
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAGATGGATAAAAGAAGACATTGAATCTCACCAATGAATTC  1069