BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-151B03
Chromosome9 (Build37)
Map Location 12,032,005 - 12,169,777
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039989
Downstream geneLOC622505, LOC100039680, LOC665285, LOC100039729
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-151B03.bB6Ng01-151B03.g
ACCDH946986DH946987
length1,125721
definitionDH946986|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151B03, 5' end.DH946987|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-151B03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,032,005 - 12,033,147)(12,169,057 - 12,169,777)
sequence
gaattcaaattcacggttatctaagagtgtatgcaggcagcagacagaga
tcatgtaaatatgctttacatggcagatcaatcccccagagctgttataa
taacctccaaaaggcaacctgccctctatgtctgggtgctgggaatcggt
aattaaatattcagtaagggcatgcttgggtgtaactggtaggaagggat
attttcatgtctcctcattttttacggcttaactatagtccttggtattt
tggatgagttttgcacagcctcaatcctgtctctactgcaagtgaacttc
cctctcttgtattttctccttctgatttcccttctcttttaagataggca
tgctgctgaagtcattaccctactgcaaggagcccttcactagattcttt
agttcattgacagctccatttacaaacagcttcgcattctgagctaccat
aggctagagtttcaaggtacaacttatttaacaaagttgaatccataatg
gaaggaatagggtgctgatgaaggaccccagcatcctatagttgccttta
taaagcattttcatgaaaaggtcaatgtactggaaattagatgtaagata
gtacaaattatccctttgaaaagaaactttttatacatgtaaattcctat
gaagatttcctccatgttcataatgcacagatatatttaatatagaagaa
acatgttaataaaaatatattcaatattaactaaactaaataaagtatat
cacagttttattggatacaatgaaagaatttacactattaaaatttaact
tcaaagatgtttaaagataatttctggtggtcttcccactctattgaatt
gtaagcttattcaatccatgaggtccatgggagcacagacatcaaatagg
ggattctgaaaccgggtgagtacttatggtgaataaatcacaccagacct
gcagtccatacacgaatcaactttacttagggtgactgaagcttataagt
tctcaggactgaagcatgacatccagatggcagaggtattggctagggac
ttcagcagctgatgcctcattaacatgagagcattcgaatctcaagtgct
gcttgacaagtttgtcgagaagaaa
gaattcaaagtcagttctgataccattagacactggtttaaaaagcaaaa
cgaaacctcacaaagacaaagtgcaggttagtgagagaggacagttcacc
gtagaagtgcaaggactgcatgtgaatctcaaggatccaggaagaaagct
agcatggccatgcatcctgtaacaatagcactgagagggtgtgtggtggt
catcagggtgggggtgggatggagcagtaggctgatccagagaacttgtc
agatggccaatcctcctatgtgagctttggcttagtaggggggattcaca
tgtgatgtccttccgtcaaatatacactcaaaagacccacaaaaaaaaaa
acataaataaaagcagggaattgcaccttaatttctcttctgatagttgt
ctcagagcccaagggacatacaatttaccatagtgctagttcaaatgctg
atttccaggctacaactctggaaagtctatattcaaggaatcattatgaa
tttctcctttaaaaaatatttatttatttatttatttacatcccaaatgt
tgcctccttcctgttcccgaagctccctttgcctctgagaggtaaaccca
ctacccctgtgtccccaagtgcatgaagtctctacaggattaggcacatc
ctctcccactgagggcagacatggtaggtgacagccctctgctacatacg
tgtgtgttggggggtgggggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_12032005_12033147
seq2: B6Ng01-151B03.b_45_1169

seq1  GAATTCAAATTCACGGTTATCTAAGAGTGTATGCAGGCAGCAGACAGAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAATTCACGGTTATCTAAGAGTGTATGCAGGCAGCAGACAGAGA  50

seq1  TCATGTAAATATGCTTTACATGGCAGATCAATCCCCCAGAGCTGTTATAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGTAAATATGCTTTACATGGCAGATCAATCCCCCAGAGCTGTTATAA  100

seq1  TAACCTCCAAAAGGCAACCTGCCCTCTATGTCTGGGTGCTGGGAATCGGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTCCAAAAGGCAACCTGCCCTCTATGTCTGGGTGCTGGGAATCGGT  150

seq1  AATTAAATATTCAGTAAGGGCATGCTTGGGTGTAACTGGTAGGAAGGGAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAAATATTCAGTAAGGGCATGCTTGGGTGTAACTGGTAGGAAGGGAT  200

seq1  ATTTTCATGTCTCCTCATTTTTTACGGCTTAACTATAGTCCTTGGTATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCATGTCTCCTCATTTTTTACGGCTTAACTATAGTCCTTGGTATTT  250

seq1  TGGATGAGTTTTGCACAGCCTCAATCCTGTCTCTACTGCAAGTGAACTTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGAGTTTTGCACAGCCTCAATCCTGTCTCTACTGCAAGTGAACTTC  300

seq1  CCTCTCTTGTATTTTCTCCTTCTGATTTCCCTTCTCTTTTAAGATAGGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTTGTATTTTCTCCTTCTGATTTCCCTTCTCTTTTAAGATAGGCA  350

seq1  TGCTGCTGAAGTCATTACCCTACTGCAAGGAGCCCTTCACTAGATTCTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGCTGAAGTCATTACCCTACTGCAAGGAGCCCTTCACTAGATTCTTT  400

seq1  AGTTCATTGACAGCTCCATTTACAAACAGCTTCGCATTCTGAGCTACCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCATTGACAGCTCCATTTACAAACAGCTTCGCATTCTGAGCTACCAT  450

seq1  AGGCTAGAGTTTCAAGGTACAACTTATTTAACAAAGTTGAATCCATAATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTAGAGTTTCAAGGTACAACTTATTTAACAAAGTTGAATCCATAATG  500

seq1  GAAGGAATAGGGTGCTGATGAAGGACCCCAGCATCCTATAGTTGCCTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAATAGGGTGCTGATGAAGGACCCCAGCATCCTATAGTTGCCTTTA  550

seq1  TAAAGCATTTTCATGAAAAGGTCAATGTACTGGAAATTAGATGTAAGATA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGCATTTTCATGAAAAGGTCAATGTACTGGAAATTAGATGTAAGATA  600

seq1  GTACAAATTATCCCTTTGAAAAGAAACTTTTTATACATGTAAATTCCTAT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACAAATTATCCCTTTGAAAAGAAACTTTTTATACATGTAAATTCCTAT  650

seq1  GAAGATTTCCTCCATGTTCATAATGCACAGATATATTTAATATAGAAGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGATTTCCTCCATGTTCATAATGCACAGATATATTTAATATAGAAGAA  700

seq1  ACATGTTAATAAAAATATATTCAATATTAACTAAACTAAATAAAGTATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGTTAATAAAAATATATTCAATATTAACTAAACTAAATAAAGTATAT  750

seq1  CACAGTTTTATTGGATACAATGAAAGAATTTACACTATTAAAATTTAACT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGTTTTATTGGATACAATGAAAGAATTTACACTATTAAAATTTAACT  800

seq1  TCAAAGATGTTTAAAGATAATTTCTGGTGGTCTTCCCACTCTATTGAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGATGTTTAAAGATAATTTCTGGTGGTCTTCCCACTCTATTGAATT  850

seq1  GTAAGCTTATTCAATCCATGAGGGCCATGGGAGCACAGACATCAAATAGG  900
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGCTTATTCAATCCATGAGGTCCATGGGAGCACAGACATCAAATAGG  900

seq1  GGATTCTGAAACCGGGTGAGTACTTATGGTGAATAAATCACACCAGGACC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GGATTCTGAAACCGGGTGAGTACTTATGGTGAATAAATCACACCA-GACC  949

seq1  TGCAGTCCATACACGAATCAACTTTACTTAGGGTGACTGAAGGCTTATAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |
seq2  TGCAGTCCATACACGAATCAACTTTACTTAGGGTGACTGAA-GCTTAT-A  997

seq1  AGTTCTCAGGGACTGAAGGCAAGGACATCCAGGATGGGCAGAGGTAATTG  1050
      |||||||| |||||||||   | |||||||| ||| ||||||||| ||||
seq2  AGTTCTCA-GGACTGAAG--CATGACATCCA-GAT-GGCAGAGGT-ATTG  1041

seq1  GCTAGGGACTTCCAGCAGCTGGAATGCCTCATTAACATGAGGAAGCATTT  1100
      ||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||  |||||| 
seq2  GCTAGGGACTT-CAGCAGCTG--ATGCCTCATTAACATGAG--AGCATT-  1085

seq1  CAGAAATCTCAGGTGCTGGCTGGACAAGTTTTGTC-AGAAGAAA  1143
          ||||||| ||||| ||| |||||| |||||| ||||||||
seq2  --CGAATCTCAAGTGCT-GCTTGACAAG-TTTGTCGAGAAGAAA  1125

seq1: chr9_12169057_12169777
seq2: B6Ng01-151B03.g_70_790 (reverse)

seq1  CCCCCCACCCCCCAACACACACGTATGTAGCAGAGGGCTGTCACCTACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCACCCCCCAACACACACGTATGTAGCAGAGGGCTGTCACCTACCA  50

seq1  TGTCTGCCCTCAGTGGGAGAGGATGTGCCTAATCCTGTAGAGACTTCATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGCCCTCAGTGGGAGAGGATGTGCCTAATCCTGTAGAGACTTCATG  100

seq1  CACTTGGGGACACAGGGGTAGTGGGTTTACCTCTCAGAGGCAAAGGGAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTGGGGACACAGGGGTAGTGGGTTTACCTCTCAGAGGCAAAGGGAGC  150

seq1  TTCGGGAACAGGAAGGAGGCAACATTTGGGATGTAAATAAATAAATAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGGAACAGGAAGGAGGCAACATTTGGGATGTAAATAAATAAATAAAT  200

seq1  AAATATTTTTTAAAGGAGAAATTCATAATGATTCCTTGAATATAGACTTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATTTTTTAAAGGAGAAATTCATAATGATTCCTTGAATATAGACTTT  250

seq1  CCAGAGTTGTAGCCTGGAAATCAGCATTTGAACTAGCACTATGGTAAATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGTTGTAGCCTGGAAATCAGCATTTGAACTAGCACTATGGTAAATT  300

seq1  GTATGTCCCTTGGGCTCTGAGACAACTATCAGAAGAGAAATTAAGGTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTCCCTTGGGCTCTGAGACAACTATCAGAAGAGAAATTAAGGTGCA  350

seq1  ATTCCCTGCTTTTATTTATGTTTTTTTTTTTGTGGGTCTTTTGAGTGTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCCCTGCTTTTATTTATGTTTTTTTTTTTGTGGGTCTTTTGAGTGTAT  400

seq1  ATTTGACGGAAGGACATCACATGTGAATCCCCCCTACTAAGCCAAAGCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGACGGAAGGACATCACATGTGAATCCCCCCTACTAAGCCAAAGCTC  450

seq1  ACATAGGAGGATTGGCCATCTGACAAGTTCTCTGGATCAGCCTACTGCTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAGGAGGATTGGCCATCTGACAAGTTCTCTGGATCAGCCTACTGCTC  500

seq1  CATCCCACCCCCACCCTGATGACCACCACACACCCTCTCAGTGCTATTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCCCACCCCCACCCTGATGACCACCACACACCCTCTCAGTGCTATTGT  550

seq1  TACAGGATGCATGGCCATGCTAGCTTTCTTCCTGGATCCTTGAGATTCAC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGATGCATGGCCATGCTAGCTTTCTTCCTGGATCCTTGAGATTCAC  600

seq1  ATGCAGTCCTTGCACTTCTACGGTGAACTGTCCTCTCTCACTAACCTGCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAGTCCTTGCACTTCTACGGTGAACTGTCCTCTCTCACTAACCTGCA  650

seq1  CTTTGTCTTTGTGAGGTTTCGTTTTGCTTTTTAAACCAGTGTCTAATGGT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTCTTTGTGAGGTTTCGTTTTGCTTTTTAAACCAGTGTCTAATGGT  700

seq1  ATCAGAACTGACTTTGAATTC  721
      |||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGAACTGACTTTGAATTC  721