BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155P10
Chromosome9 (Build37)
Map Location 75,153,354 - 75,271,815
singlet/doubletdoublet
Overlap geneGnb5, Bcl2l10, LOC384954, Mapk6
Upstream geneNr1h2-ps, LOC100040764, Onecut1, BC031353, Arpp19, LOC100040812, Myo5a, LOC677501, Myo5c
Downstream geneLeo1, EG666190, LOC100042070, Tmod3, Tmod2, Lysmd2, Scg3, LOC100042107, Bmp5, EG620071, Hmgcll1, Gfral, Hcrtr2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155P10.bB6Ng01-155P10.g
ACCDH950596DH950597
length1,1281,053
definitionDH950596|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P10, 5' end.DH950597|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155P10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(75,153,354 - 75,154,494)(75,270,751 - 75,271,815)
sequence
gaattccacaagtcacagtctgtcacctgaggtatggaaaccctgctgac
tgtgtctggggccccctggccccctggcaggatggggttggctgagtttc
tgctccgtgtccactccagtcctccttcaccctgtgaggagtcactatgc
taaggttctggttttctggcttgaattcatgcccactttatagcatttac
ctgggtcgtgcaccagtaaccttggccatcctgtaagttcctagagggct
ggactccatcgtattctacattttatctgtaatgctaggtggtgggatag
aattggccagatcccatggcgatgacaagggttcgagtgtaggagacctt
gtttggagacaggagacttgaggatagcaataagttgatacacagaggag
aaaggagaaggccttactcggggcctaaatcactcatgcctaggttggaa
ggaaggccagcgctgagagatgctctcaccacacagcacaaggatgtcag
gtttgttccatggagtagaggcagatttataaggtcaaatcagattctgt
ctcctgcagagagcaaagaaatgggcccaggaaggggtacatgggagtta
tgaggggtccaaatcatgtagagagacagagtgttctagaagcgagtgtg
tgcttgcaggtagtgagaggccggcagtgagcatgcgtgtgcagatgggg
aggagcaggccctgagctgcaagtccagataaaagggattaggtgaccaa
tggctcaaatcttcacaccaccgcagtaacctccctcgtttctggccagc
caccccaggtgttcattgctctgtaaggtatgtactctttaacctcaggg
aacttgtgctctcaatttttgcatcaatgccttggattcctacagaccgg
gatcatggggatcctgtggtgggtgcacagtggggggtgcttatgttctg
gtctgtgtaaatctattttctctacacctttgcgacttttatctcaaact
ataagggatttttaaacagattagtgtttgcattcagtaacaattaaaca
tctttaaatagcttcattgcttcagaatgggccagctgcatcaaacccca
tgctacagctgatgtagcgtggatgacc
gaattctcttgggcgttctcattagtaagaaaaacacattacaggggcaa
cagggcgtcttcagagctttgactctgcaggaaggagcctctgagtcaga
gcttagcatccaggatgtttatgagggcgtgcctttgaaatggacacctg
tggaagggaagagagggaagcaggcttggggaaggaaacacaagctgtaa
ggaaggccagcagccttagctgacccatgaggctctgaactccactgcct
ctcagcattgccccaaactggactgaggaggctgggcttgtcattgtgtc
gtttgtgtgtgcaagttcgcatgctcatgtgtgcacgtcacatgtaggtt
gggggacctcaggtttgtccttcaggagccattgaccttattgttttgat
ctctgtttttctttggtttttcaagacagggtttcttcttgtagtccagg
ttctcctagaacttgttctgtagaccaggctggcctcagactcagacatc
tctgactgcctctggctcctgagtgctgggattaaaggtgtgggccatca
ccatccagcaaaagttctcaagagacttgttttggcgttttggtttctct
gtgtagaccaggctggccttgagctcaaaaatccacctgtctctgtctcc
caagtgctgggattaaaggcgagtgccactcactcccaccccttagtttt
tgagataggtatctcactggtttggaagtcaccaagtaggataggctggt
tggtcagtgtgtgttgtgagatcatcctgtcttaccattataagcacacg
ctcccacacctgcccttttacatggattctgaggctcaaaaccagaaagc
aagcttgttacctaccaagcctgttccctggtcacaccttaatcagctta
ttgattgtgaagggtcctgaagatgagggtatattcccatgagctgttcc
cttctctctagatacagcacagagatgccaggcgacagctactgttagct
attcaatggacttgtgctgtatcactgatgtgaaaagtgatcatctactt
cag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_75153354_75154494
seq2: B6Ng01-155P10.b_45_1172

seq1  GAATTCCACAAGTCACAGTCTGTCACCTGAGGTATGGAAACCCTGCTGAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAAGTCACAGTCTGTCACCTGAGGTATGGAAACCCTGCTGAC  50

seq1  TGTGTCTGGGGCCCCCTGGCCCCCTGGCAGGATGGGGTTGGCTGAGTTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTGGGGCCCCCTGGCCCCCTGGCAGGATGGGGTTGGCTGAGTTTC  100

seq1  TGCTCCGTGTCCACTCCAGTCCTCCTTCACCCTGTGAGGAGTCACTATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCCGTGTCCACTCCAGTCCTCCTTCACCCTGTGAGGAGTCACTATGC  150

seq1  TAAGGTTCTGGTTTTCTGGCTTGAATTCATGCCCACTTTATAGCATTTAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGTTCTGGTTTTCTGGCTTGAATTCATGCCCACTTTATAGCATTTAC  200

seq1  CTGGGTCGTGCACCAGTAACCTTGGCCATCCTGTAAGTTCCTAGAGGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTCGTGCACCAGTAACCTTGGCCATCCTGTAAGTTCCTAGAGGGCT  250

seq1  GGACTCCATCGTATTCTACATTTTATCTGTAATGCTAGGTGGTGGGATAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTCCATCGTATTCTACATTTTATCTGTAATGCTAGGTGGTGGGATAG  300

seq1  AATTGGCCAGATCCCATGGCGATGACAAGGGTTCGAGTGTAGGAGACCTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGGCCAGATCCCATGGCGATGACAAGGGTTCGAGTGTAGGAGACCTT  350

seq1  GTTTGGAGACAGGAGACTTGAGGATAGCAATAAGTTGATACACAGAGGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGGAGACAGGAGACTTGAGGATAGCAATAAGTTGATACACAGAGGAG  400

seq1  AAAGGAGAAGGCCTTACTCGGGGCCTAAATCACTCATGCCTAGGTTGGAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGAGAAGGCCTTACTCGGGGCCTAAATCACTCATGCCTAGGTTGGAA  450

seq1  GGAAGGCCAGCGCTGAGAGATGCTCTCACCACACAGCACAAGGATGTCAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGGCCAGCGCTGAGAGATGCTCTCACCACACAGCACAAGGATGTCAG  500

seq1  GTTTGTTCCATGGAGTAGAGGCAGATTTATAAGGTCAAATCAGATTCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTGTTCCATGGAGTAGAGGCAGATTTATAAGGTCAAATCAGATTCTGT  550

seq1  CTCCTGCAGAGAGCAAAGAAATGGGCCCAGGAAGGGGTACATGGGAGTTA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCAGAGAGCAAAGAAATGGGCCCAGGAAGGGGTACATGGGAGTTA  600

seq1  TGAGGGGTCCAAATCATGTAGAGAGACAGAGTGTTCTAGAAGCGAGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGGTCCAAATCATGTAGAGAGACAGAGTGTTCTAGAAGCGAGTGTG  650

seq1  TGCTTGCAGGTAGTGAGAGGCCGGCAGTGAGCATGCGTGTGCAGATGGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGCAGGTAGTGAGAGGCCGGCAGTGAGCATGCGTGTGCAGATGGGG  700

seq1  AGGAGCAGGCCCTGAGCTGCAAGTCCAGATAAAAGGGATTAGGTGACCAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGCAGGCCCTGAGCTGCAAGTCCAGATAAAAGGGATTAGGTGACCAA  750

seq1  TGGCTCAAATCTTCACACCACCGCAGTAACCTCCCTCGTTTCTGGCCAGC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCAAATCTTCACACCACCGCAGTAACCTCCCTCGTTTCTGGCCAGC  800

seq1  CACCCCAGGTGTTCATTGCTCTGTAAGGTATGTACTCTTTAACCTCAGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCCCAGGTGTTCATTGCTCTGTAAGGTATGTACTCTTTAACCTCAGGG  850

seq1  AACTTGTGCTCTCAA-TTTTGCATCAATGCC-TGGATTCCTACAGACCGG  898
      ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  AACTTGTGCTCTCAATTTTTGCATCAATGCCTTGGATTCCTACAGACCGG  900

seq1  GATCATGGGGATCCTGTGGTGGGTGCACAGTGGGGGGTGCTTATGTTCTG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATGGGGATCCTGTGGTGGGTGCACAGTGGGGGGTGCTTATGTTCTG  950

seq1  GTCTGTGTAAATTCTAATTTCTCTACAACCTTTGCGAC-TTTATCTCAAA  997
      ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||
seq2  GTCTGTGTAAA-TCTATTTTCTCTAC-ACCTTTGCGACTTTTATCTC-AA  997

seq1  ACTATAAAGGGATTTTTTAAAAACAGATTAGTGTTGGCA-TCAGTAAACA  1046
      ||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||| |||||||   
seq2  ACTAT-AAGGGATTTTT---AAACAGATTAGTGTTTGCATTCAGTAA--C  1041

seq1  AATTAAACATCTTTAAAATAGCTTCATTGGTTTTCAGAATTGGCCCAGCT  1096
      |||||||||||||| ||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||
seq2  AATTAAACATCTTT-AAATAGCTTCATTG--CTTCAGAA-TGGGCCAGCT  1087

seq1  GCAATCAAACCCCATGCGTACAGCTGATGGAGCAGATGGATGACC  1141
      || |||||||||||||| ||||||||||| |||   |||||||||
seq2  GC-ATCAAACCCCATGC-TACAGCTGATGTAGC--GTGGATGACC  1128

seq1: chr9_75270751_75271815
seq2: B6Ng01-155P10.g_67_1119 (reverse)

seq1  CTGAAGTGAGATGATCACCTTTTTCACCATCAGGTGATACAGCACAAGTC  50
      ||||||| ||||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||| 
seq2  CTGAAGT-AGATGATCAC--TTTTCA-CATCA-GTGATACAGCACAAGT-  44

seq1  CCATTGAATAGCTAACAGTAGCTGTCGCCTGGGCATTCTCTGTGCCTGTA  100
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||
seq2  CCATTGAATAGCTAACAGTAGCTGTCGCCT-GGCA-TCTCTGTG-CTGTA  91

seq1  TCTAGAGAGAAGGGGAACAGCCTCATGGGGAATATTACCCTCATCTTCAG  150
      ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||
seq2  TCTAGAGAGAA-GGGAACAG-CTCAT-GGGAATA-TACCCTCATCTTCAG  137

seq1  GACCCTTCACATTCAAT-AGCTGATTAAGGTGTGGCCAGGGAACAGGCTT  199
      ||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  GACCCTTCACAATCAATAAGCTGATTAAGGTGTGACCAGGGAACAGGCTT  187

seq1  GGTGGGTAACAAGCTTGCTTTCTGGTTTTGAGCCTCAGAATCCATGTAAA  249
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTAGGTAACAAGCTTGCTTTCTGGTTTTGAGCCTCAGAATCCATGTAAA  237

seq1  AGGGCAGGTGTGGGAGCGTGTGCTTATAATGGTAAGACAGGATGATCTCA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCAGGTGTGGGAGCGTGTGCTTATAATGGTAAGACAGGATGATCTCA  287

seq1  CAACACACACTGACCAACCAGCCTATCCTACTTGGTGACTTCCAAACCAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACACACTGACCAACCAGCCTATCCTACTTGGTGACTTCCAAACCAG  337

seq1  TGAGATACCTATCTCAAAAACTAAGGGGTGGGAGTGAGTGGCACTCGCCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGATACCTATCTCAAAAACTAAGGGGTGGGAGTGAGTGGCACTCGCCT  387

seq1  TTAATCCCAGCACTTGGGAGACAGAGACAGGTGGATTTTTGAGCTCAAGG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCCCAGCACTTGGGAGACAGAGACAGGTGGATTTTTGAGCTCAAGG  437

seq1  CCAGCCTGGTCTACACAGAGAAACCAAAACGCCAAAACAAGTCTCTTGAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTGGTCTACACAGAGAAACCAAAACGCCAAAACAAGTCTCTTGAG  487

seq1  AACTTTTGCTGGATGGTGATGGCCCACACCTTTAATCCCAGCACTCAGGA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTTTGCTGGATGGTGATGGCCCACACCTTTAATCCCAGCACTCAGGA  537

seq1  GCCAGAGGCAGTCAGAGATGTCTGAGTCTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGAGGCAGTCAGAGATGTCTGAGTCTGAGGCCAGCCTGGTCTACAGA  587

seq1  ACAAGTTCTAGGAGAACCTGGACTACAAGAAGAAACCCTGTCTTGAAAAA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTTCTAGGAGAACCTGGACTACAAGAAGAAACCCTGTCTTGAAAAA  637

seq1  CCAAAGAAAAACAGAGATCAAAACAATAAGGTCAATGGCTCCTGAAGGAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGAAAAACAGAGATCAAAACAATAAGGTCAATGGCTCCTGAAGGAC  687

seq1  AAACCTGAGGTCCCCCAACCTACATGTGACGTGCACACATGAGCATGCGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGAGGTCCCCCAACCTACATGTGACGTGCACACATGAGCATGCGA  737

seq1  ACTTGCACACACAAACGACACAATGACAAGCCCAGCCTCCTCAGTCCAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTGCACACACAAACGACACAATGACAAGCCCAGCCTCCTCAGTCCAGT  787

seq1  TTGGGGCAATGCTGAGAGGCAGTGGAGTTCAGAGCCTCATGGGTCAGCTA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGCAATGCTGAGAGGCAGTGGAGTTCAGAGCCTCATGGGTCAGCTA  837

seq1  AGGCTGCTGGCCTTCCTTACAGCTTGTGTTTCCTTCCCCAAGCCTGCTTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGCTGGCCTTCCTTACAGCTTGTGTTTCCTTCCCCAAGCCTGCTTC  887

seq1  CCTCTCTTCCCTTCCACAGGTGTCCATTTCAAAGGCACGCCCTCATAAAC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTCTTCCCTTCCACAGGTGTCCATTTCAAAGGCACGCCCTCATAAAC  937

seq1  ATCCTGGATGCTAAGCTCTGACTCAGAGGCTCCTTCCTGCAGAGTCAAAG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGGATGCTAAGCTCTGACTCAGAGGCTCCTTCCTGCAGAGTCAAAG  987

seq1  CTCTGAAGACGCCCTGTTGCCCCTGTAATGTGTTTTTCTTACTAATGAGA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAAGACGCCCTGTTGCCCCTGTAATGTGTTTTTCTTACTAATGAGA  1037

seq1  ACGCCCAAGAGAATTC  1065
      ||||||||||||||||
seq2  ACGCCCAAGAGAATTC  1053