BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-167L07
Chromosome9 (Build37)
Map Location 33,787,994 - 33,901,130
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042343
Downstream geneKirrel3, St3gal4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-167L07.bB6Ng01-167L07.g
ACCDH959129DH959130
length1,1791,003
definitionDH959129|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167L07, 5' end.DH959130|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-167L07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(33,899,931 - 33,901,130)(33,787,994 - 33,788,836)
sequence
gaattctcatcaatgaagtaggtactttctgctatatctcctagattgta
tatttttactctacttttacaactgagtaatagattcagatttcatcaaa
tgaaacacaccttcctaaaaaaaaatcacattatagaacacagcacacac
cttggttctgagctatagaaaaatactggaaatacatttcctccagtcca
gactctgctgtgcatgagggtgcagagtagtctgttttagaggaaaagac
atcattagtcttagccagtgtgaaccctgtgaaccagaggtccaacttgc
tgggtaagatataacatatacctacctaagaataacaggttgagtgtttt
gggagaaataatctgtcctttgattagtttgatgcttgtttcatggaagg
gagtaaagagaaatgacccatgcttgttaccaaaagcttggctaataagt
caagcctggaaccatgataggaccatgtggagaacttatttctgagtaac
tggaatgaaacagcattaaacttccctttcaatatctatgcttatatcca
ttgtcaaagaggtttctaatcttaatcatagaagcctttttcttacaatg
aatgggaatcactgaagagactcatggctgttcaagattctggtaacaaa
tgatgaatgtgggctcaacactaagcaagacatttacaccaaacttctgt
tttagttaggatttctattgctgtgaatgatagctcttataaaggaaaat
atttaatgggggctgcttacagtttggagggttagtccattattaccatg
gcagtaggaatggtggcatacaagcagacatggtgctggagaggtagttg
agtgttctacatctagatccatagtcagaaggaaaaaaaactgtgagcct
ccgagacctcaaagctcccaccccacccccagcaacccctaccccagtga
cgcatttccaccacaaagctacacctagtccaacaaggccacacctccta
tactgcactcctatggagctatggggtgcatttaatcaacacactgctct
agactcagaaaaaatgacagtatatatatgaagaaatccctccttttaga
tcagtgccatcactgtaaagaactcaaacaacatgggtatcttcatggtc
tactaagagatcagtcatggactggggag
gaattcttatgcaatttggcagggcccaagtcattcacagctctggtcaa
gtgatatagtacctttcaggaaaagatgggatataggtattcctggctac
ccatcatgtcctttccagaggctaaattccaagtatgggttgctaagaaa
gcagccaactccctttcttctacaaatccccaaatatagagctgactttc
cttcctcttgctcacacacaaggaagaggatacatgttggaaacaaaatc
atgagaaaaagctcctccttatgttccaaacatccctgtctacacagcgg
catatcagactttgtaagaagggagtattgttttatgctcatctctattt
tgcccaacaggtcaagtagattatgagaaaatcagactgaaacacttatc
tgtggaagaagcctttatgaaatagagtatatggaccttgaaaccttgag
tataatggagattttgttggtctaaaaatatgatggaagtcttactagag
cataatataaactgtattccaactatttaatcagaaaaaaagtatcatgc
aaagaaagaactgagagattttcttagatcaggaccaaccttgaaatttg
gtttcataaactccccttaacctgggtctcagtcaccttagacttaattg
gataaagttgtgaagcaaatttttctcttctgtgctgtcagaaaacaata
caataatacagccactagggaatgatactgggtgaagtaacaatggatgc
agatggtttaacggggaaaggaaagagaactgaagggagccaggcaaaca
ccaccgtcatggtagcataattgtgtactagatcaagtctgcgatctctg
aaatagtgaatacagaggtttcacacctggtaaacagttcacaatacatt
tcacccaaattgctaggaaaattgtgaaacaaatgaaaacaagaaattta
tggaaggactcaagctgatgaattatctactacatcctatttaacagata
cta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_33899931_33901130
seq2: B6Ng01-167L07.b_45_1223 (reverse)

seq1  CTCCCCCTGTTCCATGACTGACTCT-TTAGTAGGCCCAATGGAGATAACC  49
      ||||||    ||||||||||| ||| ||||||| ||  ||| |||| |||
seq2  CTCCCC--AGTCCATGACTGA-TCTCTTAGTAGACC--ATGAAGAT-ACC  44

seq1  AATGTTGTTTTGAGTTCTTTACAGTGATTGCACTGAATCT-ACAGGAGGG  98
       |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| | |||||||
seq2  CATGTTG-TTTGAGTTCTTTACAGTGATGGCACTG-ATCTAAAAGGAGGG  92

seq1  AATTTCTTCATATAATTATACTGTCATTTTTTTCTGAGTCTTAGAGCAAG  148
       |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||| |||||| ||
seq2  -ATTTCTTCATATA--TATACTGTCA-TTTTTTCTGAGTC-TAGAGC-AG  136

seq1  TGGTTGTTTGAATTAAATTGCACCCCATAGCTCCATAAGGAGTGGCAGTA  198
      ||  ||||   |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||
seq2  TG--TGTT--GATTAAA-TGCACCCCATAGCTCCAT-AGGAGT-GCAGTA  179

seq1  TTAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGACTAGGTGTAGCTTTGTTGGTGGAAATG  248
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  -TAGGAGGTGTGGCCTTGTTGGACTAGGTGTAGCTTTG-TGGTGGAAATG  227

seq1  CGTCACTGGGGTAGGGGTTGCTGGGGGTGGGGTGGGAGCTTTGAGGTCTC  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCACTGGGGTAGGGGTTGCTGGGGGTGGGGTGGGAGCTTTGAGGTCTC  277

seq1  GGAGGCTCACAGTTTTTTTTCCTTCTGACTATGGATCTAGATGTAGAACA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGCTCACAGTTTTTTTTCCTTCTGACTATGGATCTAGATGTAGAACA  327

seq1  CTCAACTACCTCTCCAGCACCATGTCTGCTTGTATGCCACCATTCCTACT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACTACCTCTCCAGCACCATGTCTGCTTGTATGCCACCATTCCTACT  377

seq1  GCCATGGTAATAATGGACTAACCCTCCAAACTGTAAGCAGCCCCCATTAA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATGGTAATAATGGACTAACCCTCCAAACTGTAAGCAGCCCCCATTAA  427

seq1  ATATTTTCCTTTATAAGAGCTATCATTCACAGCAATAGAAATCCTAACTA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTTTCCTTTATAAGAGCTATCATTCACAGCAATAGAAATCCTAACTA  477

seq1  AAACAGAAGTTTGGTGTAAATGTCTTGCTTAGTGTTGAGCCCACATTCAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGAAGTTTGGTGTAAATGTCTTGCTTAGTGTTGAGCCCACATTCAT  527

seq1  CATTTGTTACCAGAATCTTGAACAGCCATGAGTCTCTTCAGTGATTCCCA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGTTACCAGAATCTTGAACAGCCATGAGTCTCTTCAGTGATTCCCA  577

seq1  TTCATTGTAAGAAAAAGGCTTCTATGATTAAGATTAGAAACCTCTTTGAC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATTGTAAGAAAAAGGCTTCTATGATTAAGATTAGAAACCTCTTTGAC  627

seq1  AATGGATATAAGCATAGATATTGAAAGGGAAGTTTAATGCTGTTTCATTC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGATATAAGCATAGATATTGAAAGGGAAGTTTAATGCTGTTTCATTC  677

seq1  CAGTTACTCAGAAATAAGTTCTCCACATGGTCCTATCATGGTTCCAGGCT  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTACTCAGAAATAAGTTCTCCACATGGTCCTATCATGGTTCCAGGCT  727

seq1  TGACTTATTAGCCAAGCTTTTGGTAACAAGCATGGGTCATTTCTCTTTAC  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTTATTAGCCAAGCTTTTGGTAACAAGCATGGGTCATTTCTCTTTAC  777

seq1  TCCCTTCCATGAAACAAGCATCAAACTAATCAAAGGACAGATTATTTCTC  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTCCATGAAACAAGCATCAAACTAATCAAAGGACAGATTATTTCTC  827

seq1  CCAAAACACTCAACCTGTTATTCTTAGGTAGGTATATGTTATATCTTACC  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAACACTCAACCTGTTATTCTTAGGTAGGTATATGTTATATCTTACC  877

seq1  CAGCAAGTTGGACCTCTGGTTCACAGGGTTCACACTGGCTAAGACTAATG  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGTTGGACCTCTGGTTCACAGGGTTCACACTGGCTAAGACTAATG  927

seq1  ATGTCTTTTCCTCTAAAACAGACTACTCTGCACCCTCATGCACAGCAGAG  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCTTTTCCTCTAAAACAGACTACTCTGCACCCTCATGCACAGCAGAG  977

seq1  TCTGGACTGGAGGAAATGTATTTCCAGTATTTTTCTATAGCTCAGAACCA  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGACTGGAGGAAATGTATTTCCAGTATTTTTCTATAGCTCAGAACCA  1027

seq1  AGGTGTGTGCTGTGTTCTATAATGTGATTTTTTTTTAGGAAGGTGTGTTT  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTGTGCTGTGTTCTATAATGTGATTTTTTTTTAGGAAGGTGTGTTT  1077

seq1  CATTTGATGAAATCTGAATCTATTACTCAGTTGTAAAAGTAGAGTAAAAA  1148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGATGAAATCTGAATCTATTACTCAGTTGTAAAAGTAGAGTAAAAA  1127

seq1  TATACAATCTAGGAGATATAGCAGAAAGTACCTACTTCATTGATGAGAAT  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACAATCTAGGAGATATAGCAGAAAGTACCTACTTCATTGATGAGAAT  1177

seq1  TC  1200
      ||
seq2  TC  1179

seq1: chr9_33787994_33788836
seq2: B6Ng01-167L07.g_66_908

seq1  GAATTCTTATGCAATTTGGCAGGGCCCAAGTCATTCACAGCTCTGGTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTATGCAATTTGGCAGGGCCCAAGTCATTCACAGCTCTGGTCAA  50

seq1  GTGATATAGTACCTTTCAGGAAAAGATGGGATATAGGTATTCCTGGCTAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATATAGTACCTTTCAGGAAAAGATGGGATATAGGTATTCCTGGCTAC  100

seq1  CCATCATGTCCTTTCCAGAGGCTAAATTCCAAGTATGGGTTGCTAAGAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATCATGTCCTTTCCAGAGGCTAAATTCCAAGTATGGGTTGCTAAGAAA  150

seq1  GCAGCCAACTCCCTTTCTTCTACAAATCCCCAAATATAGAGCTGACTTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGCCAACTCCCTTTCTTCTACAAATCCCCAAATATAGAGCTGACTTTC  200

seq1  CTTCCTCTTGCTCACACACAAGGAAGAGGATACATGTTGGAAACAAAATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTCTTGCTCACACACAAGGAAGAGGATACATGTTGGAAACAAAATC  250

seq1  ATGAGAAAAAGCTCCTCCTTATGTTCCAAACATCCCTGTCTACACAGCGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGAAAAAGCTCCTCCTTATGTTCCAAACATCCCTGTCTACACAGCGG  300

seq1  CATATCAGACTTTGTAAGAAGGGAGTATTGTTTTATGCTCATCTCTATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATCAGACTTTGTAAGAAGGGAGTATTGTTTTATGCTCATCTCTATTT  350

seq1  TGCCCAACAGGTCAAGTAGATTATGAGAAAATCAGACTGAAACACTTATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAACAGGTCAAGTAGATTATGAGAAAATCAGACTGAAACACTTATC  400

seq1  TGTGGAAGAAGCCTTTATGAAATAGAGTATATGGACCTTGAAACCTTGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAGAAGCCTTTATGAAATAGAGTATATGGACCTTGAAACCTTGAG  450

seq1  TATAATGGAGATTTTGTTGGTCTAAAAATATGATGGAAGTCTTACTAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAATGGAGATTTTGTTGGTCTAAAAATATGATGGAAGTCTTACTAGAG  500

seq1  CATAATATAAACTGTATTCCAACTATTTAATCAGAAAAAAAGTATCATGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAATATAAACTGTATTCCAACTATTTAATCAGAAAAAAAGTATCATGC  550

seq1  AAAGAAAGAACTGAGAGATTTTCTTAGATCAGGACCAACCTTGAAATTTG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAAAGAACTGAGAGATTTTCTTAGATCAGGACCAACCTTGAAATTTG  600

seq1  GTTTCATAAACTCCCCTTAACCTGGGTCTCAGTCACCTTAGACTTAATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCATAAACTCCCCTTAACCTGGGTCTCAGTCACCTTAGACTTAATTG  650

seq1  GATAAAGTTGTGAAGCAAATTTTTCTCTTCTGTGCTGTCAGAAAACAATA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAAGTTGTGAAGCAAATTTTTCTCTTCTGTGCTGTCAGAAAACAATA  700

seq1  CAATAATACAGCCACTAGGGAATGATACTGGGTGAAGTAACAATGGATGC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAATACAGCCACTAGGGAATGATACTGGGTGAAGTAACAATGGATGC  750

seq1  AGATGGTTTAACGGGGAAAGGAAAGAGAACTGAAGGGAGCCAGGCAAACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGTTTAACGGGGAAAGGAAAGAGAACTGAAGGGAGCCAGGCAAACA  800

seq1  CCACCGTCATGGTAGCATAATTGTGTACTAGATCAAGTCTGCG  843
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCGTCATGGTAGCATAATTGTGTACTAGATCAAGTCTGCG  843