BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-169D14
Chromosome9 (Build37)
Map Location 89,298,486 - 89,440,475
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneSnx14, Syncrip, 2810026P18Rik, 4930422I07Rik, EG547109, LOC100039707, LOC100039721, Bcl2a1d, LOC100039674, EG666731, LOC100039741, Bcl2a1a, LOC100039689, EG666747, LOC100039714, 4930579C12Rik, Bcl2a1b, Mthfs
Downstream geneAF529169, Tmed3, B230218L05Rik, Rasgrf1, Ctsh, Morf4l1, LOC621414, Adamts7, Tbc1d2b, LOC100039777
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-169D14.bB6Ng01-169D14.g
ACCDH960259DH960260
length1,1591,158
definitionDH960259|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169D14, 5' end.DH960260|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-169D14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(89,298,486 - 89,299,653)(89,439,301 - 89,440,475)
sequence
gaattcaatattccataatggttttttgtatgtattagatgcttctggca
gttgaagtttatgaacatctcacatgggtggaggtttcaaatgcactatg
aaatacatgggattataaaggaaaccaagagatagttattaaatacatgc
actctctaagtagcaagatatagggggtcagttctcataaacacatacat
ttcaaaaccatatgtggtataaacaatatattgaaatacacacaaaactg
caacgtggtgtgaaaataagcataatttttactagtcaaagcgataggta
attctactaatcctgtggtttcttggtaatttaacaaaaacctaagtttc
tgctggacgttaatggaaataaaaatgtagctttttagcctacttaatag
atagattactgaatatagttaaaaactcttgccagtgattactcgttaaa
taagacaccagtttggaggtgtgttatatgtgttactttgtgatcataat
atgctgctcaattcttattttgttgattgcactgaagatagataatggac
ttctttccattatctacggagatggttttctcattaactctattaacatg
atgaattatattaataggtttccttcctacgaccctttttttcttggttc
tcttagcaatatttaatctccttaccttttactctaagcatttttggcct
agtcagtttgtgctctgctcctgcagaatggcaagtaataaagaccataa
aactattgctgaatgaagagtcttcttttctattgttattgttctgtgct
tcccagatttggggacacaaagctctcactttgagcatgcaaagttcact
ggcacctccccaaatcactaatgcttcttcaataagacattggatatgga
taaaagggtcagacatatgtgttctctcagcagaggattctcttccacgt
gaactgctccttccaaattataacaaatttatagcacttcatgctagaca
ttttagatgtccaggggcagcatgccttctgaatccccactttattcttt
acagcatagcatctccacaacttgtattgtgaattcacaactttgtgttt
ctttcttctcatcgccaaagtcctgggaggaaagagtgaatgctcattta
gaccgatct
gaattcattaagaaggtcttattcatcccttgctccaaaaaccagaaagg
atgtgcattctaactgggcatgtggtaggctatagagcaaccagcagttc
ctgctttggaaaatgattctgagaagtggtcatggttccttgggtccact
cccactggagaatgatggtgtgtgtttatcagcccagctcagacaggaca
ggagattgaattgatggtgagagaaactgagtgagtacatttagcttaaa
ttctaacactattagcccactcatctattaaatcctcccagtaatttgct
acctgagaagaaactaagctatggagtatatggagtatatctccagcacc
atctctaatgtttgtcctacaaggtgaataggcactgagcacaatagcat
atcctgctcacagcagatatgatgctggatttctaccctgtgtgtatagg
tggtgaaggtcatgtaggagcaaatttattcactagagtcagatgtagcc
cagtcattaactcaggggactctcataacaagagaacaaacatagagcca
tacaccatgtaccaaaaatatttaaagattacaaacccagataaaaagtt
aagctcagcgcattccaccctctatctggacaggtaaaccttccaatatg
tttgggagtttgagctcaaatacaaaatttctgaacttcttgcgatgctg
cagtcagggagaagtggcctcactagctaccttttcttctagcccttgac
tctgttccacactaagaatgtgggcaaggggtgtggggcatagatgtaga
aatgcatcctaagtatctgacctttgaccatattctgctctaatgtatgc
cccaagccacttttgggtctaagaagacacacataccttcagagaaggaa
aacagagaagaggctgtgacagacttgtatagaaatacaagttgtttgaa
caggaacctccaggattctaagtttcagacatccttgagtcagataatgg
aaacatgaatatacttcagttccatctcactcagatttctacccacagga
agagcagagtagaaacccataggttgataacagaactttttcttaatcct
gagggtgtcttggtagaaaattatgagggcctctctgtgaatgaaaaact
gtcactga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_89298486_89299653
seq2: B6Ng01-169D14.b_45_1203

seq1  GAATTCAATATTCCATAATGGTTTTTTGTATGTATTAGATGCTTCTGGCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATATTCCATAATGGTTTTTTGTATGTATTAGATGCTTCTGGCA  50

seq1  GTTGAAGTTTATGAACATCTCACATGGGTGGAGGTTTCAAATGCACTATG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAAGTTTATGAACATCTCACATGGGTGGAGGTTTCAAATGCACTATG  100

seq1  AAATACATGGGATTATAAAGGAAACCAAGAGATAGTTATTAAATACATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATACATGGGATTATAAAGGAAACCAAGAGATAGTTATTAAATACATGC  150

seq1  ACTCTCTAAGTAGCAAGATATAGGGGGTCAGTTCTCATAAACACATACAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCTAAGTAGCAAGATATAGGGGGTCAGTTCTCATAAACACATACAT  200

seq1  TTCAAAACCATATGTGGTATAAACAATATATTGAAATACACACAAAACTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAACCATATGTGGTATAAACAATATATTGAAATACACACAAAACTG  250

seq1  CAACGTGGTGTGAAAATAAGCATAATTTTTACTAGTCAAAGCGATAGGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACGTGGTGTGAAAATAAGCATAATTTTTACTAGTCAAAGCGATAGGTA  300

seq1  ATTCTACTAATCCTGTGGTTTCTTGGTAATTTAACAAAAACCTAAGTTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCTACTAATCCTGTGGTTTCTTGGTAATTTAACAAAAACCTAAGTTTC  350

seq1  TGCTGGACGTTAATGGAAATAAAAATGTAGCTTTTTAGCCTACTTAATAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTGGACGTTAATGGAAATAAAAATGTAGCTTTTTAGCCTACTTAATAG  400

seq1  ATAGATTACTGAATATAGTTAAAAACTCTTGCCAGTGATTACTCGTTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGATTACTGAATATAGTTAAAAACTCTTGCCAGTGATTACTCGTTAAA  450

seq1  TAAGACACCAGTTTGGAGGTGTGTTATATGTGTTACTTTGTGATCATAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGACACCAGTTTGGAGGTGTGTTATATGTGTTACTTTGTGATCATAAT  500

seq1  ATGCTGCTCAATTCTTATTTTGTTGATTGCACTGAAGATAGATAATGGAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGCTCAATTCTTATTTTGTTGATTGCACTGAAGATAGATAATGGAC  550

seq1  TTCTTTCCATTATCTACGGAGATGGTTTTCTCATTAACTCTATTAACATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCCATTATCTACGGAGATGGTTTTCTCATTAACTCTATTAACATG  600

seq1  ATGAATTATATTAATAGGTTTCCTTCCTACGACCCTTTTTTTCTTGGTTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAATTATATTAATAGGTTTCCTTCCTACGACCCTTTTTTTCTTGGTTC  650

seq1  TCTTAGCAATATTTAATCTCCTTACCTTTTACTCTAAGCATTTTTGGCCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAGCAATATTTAATCTCCTTACCTTTTACTCTAAGCATTTTTGGCCT  700

seq1  AGTCAGTTTGTGCTCTGCTCCTGCAGAATGGCAAGTAATAAAGACCATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGTTTGTGCTCTGCTCCTGCAGAATGGCAAGTAATAAAGACCATAA  750

seq1  AACTATTGCTGAATGAAGAGTCTTCTTTTCTATTGTTATTGTTCTGTGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATTGCTGAATGAAGAGTCTTCTTTTCTATTGTTATTGTTCTGTGCT  800

seq1  TCCCAGATTTGGGGACACAAAGCTCTCACTTTGAGCATGCAAAGTTCACT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCAGATTTGGGGACACAAAGCTCTCACTTTGAGCATGCAAAGTTCACT  850

seq1  GGCACCTCCCCAAATCACTAATGCTTCTTCAATAAGACATTGGATATGGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCACCTCCCCAAATCACTAATGCTTCTTCAATAAGACATTGGATATGGA  900

seq1  TAAAAGGGTCAGACATATGTGTTCTCTCAGCAGAGGATTCTCTTCCACGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGGGTCAGACATATGTGTTCTCTCAGCAGAGGATTCTCTTCCACGT  950

seq1  GAACTGCTCCTTCCAAATTATAACAAATTTAATAGCACTTCATGCTAAGA  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   
seq2  GAACTGCTCCTTCCAAATTATAACAAATTT-ATAGCACTTCATGCTA--G  997

seq1  ACATTTTAGATGTCCCAGGGGCCAGCATGCCCTTCTGAATCCCCACTTTA  1050
      ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ACATTTTAGATGT-CCAGGGG-CAGCATG-CCTTCTGAATCCCCACTTTA  1044

seq1  TTCTTTTACAGCATTAGCATCT-CACACACTGTATTGTGATTTCACAACT  1099
      ||| ||||||||| |||||||| ||||   |||||||||| |||||||||
seq2  TTC-TTTACAGCA-TAGCATCTCCACAACTTGTATTGTGAATTCACAACT  1092

seq1  TTGTGTTTCTTTCTTCCTCCAATCG-CAAAGTCCTGGAGGAAAAGAGTGA  1148
      ||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||  | |||||||||
seq2  TTGTGTTTCTTTCTT-CTC--ATCGCCAAAGTCCTGGGAGGAAAGAGTGA  1139

seq1  TGTCTCA-TTAGACACGATCT  1168
         |||| |||||| ||||||
seq2  ATGCTCATTTAGAC-CGATCT  1159

seq1: chr9_89439301_89440475
seq2: B6Ng01-169D14.g_69_1226 (reverse)

seq1  TCAGTGACAGGTCTTTCAACTCACAGGAGAGCCCCTCATTAATTTTCTTA  50
      ||||||||| || |||| | ||||| ||||| |||||| |||||||||  
seq2  TCAGTGACA-GTTTTTC-ATTCACA-GAGAGGCCCTCA-TAATTTTCT--  44

seq1  ACCAGGACCACCCTCAGATTTAAGAAAGAGTTCTGTTTATCATACCTATT  100
      |||| || |||||||||  |||||||| ||||||| |||||| ||||| |
seq2  ACCAAGA-CACCCTCAGGATTAAGAAAAAGTTCTG-TTATCA-ACCTA-T  90

seq1  GGGTTCCTACTCTGCTCTTCCCTGTGTGTAAGAAATCTGAGTGAGATGGG  150
      ||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| 
seq2  GGGTTTCTACTCTGCTCTT-CCTGTGGGT-AGAAATCTGAGTGAGATGGA  138

seq1  ACTGAAGTTATATTCATGTTTTCCATTAATCTGACTTCAAGATGTTCTGA  200
      ||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||  | |||| |||||
seq2  ACTGAAG-TATATTCATG-TTTCCATT-ATCTGACTCAAGGATG-TCTGA  184

seq1  AACTTAGAATCCTGGAGGTTCCTGTTCAAACAACTTGTATTTCTTATACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  AACTTAGAATCCTGGAGGTTCCTGTTCAAACAACTTGTATTTC-TATACA  233

seq1  AGTCTGTCACAGCCTCTTCTCTGTTTTCCTTCTCTGAAGGTATGTGTGTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCTGTCACAGCCTCTTCTCTGTTTTCCTTCTCTGAAGGTATGTGTGTC  283

seq1  TTCTTAGACCCAAAAGTGGCTTGGGGCATACATTAGAGCAGAATATGGTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTAGACCCAAAAGTGGCTTGGGGCATACATTAGAGCAGAATATGGTC  333

seq1  AAAGGTCAGATACTTAGGATGCATTTCTACATCTATGCCCCACACCCCTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGGTCAGATACTTAGGATGCATTTCTACATCTATGCCCCACACCCCTT  383

seq1  GCCCACATTCTTAGTGTGGAACAGAGTCAAGGGCTAGAAGAAAAGGTAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCACATTCTTAGTGTGGAACAGAGTCAAGGGCTAGAAGAAAAGGTAGC  433

seq1  TAGTGAGGCCACTTCTCCCTGACTGCAGCATCGCAAGAAGTTCAGAAATT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGAGGCCACTTCTCCCTGACTGCAGCATCGCAAGAAGTTCAGAAATT  483

seq1  TTGTATTTGAGCTCAAACTCCCAAACATATTGGAAGGTTTACCTGTCCAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTATTTGAGCTCAAACTCCCAAACATATTGGAAGGTTTACCTGTCCAG  533

seq1  ATAGAGGGTGGAATGCGCTGAGCTTAACTTTTTATCTGGGTTTGTAATCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGAGGGTGGAATGCGCTGAGCTTAACTTTTTATCTGGGTTTGTAATCT  583

seq1  TTAAATATTTTTGGTACATGGTGTATGGCTCTATGTTTGTTCTCTTGTTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATATTTTTGGTACATGGTGTATGGCTCTATGTTTGTTCTCTTGTTA  633

seq1  TGAGAGTCCCCTGAGTTAATGACTGGGCTACATCTGACTCTAGTGAATAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAGTCCCCTGAGTTAATGACTGGGCTACATCTGACTCTAGTGAATAA  683

seq1  ATTTGCTCCTACATGACCTTCACCACCTATACACACAGGGTAGAAATCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGCTCCTACATGACCTTCACCACCTATACACACAGGGTAGAAATCCA  733

seq1  GCATCATATCTGCTGTGAGCAGGATATGCTATTGTGCTCAGTGCCTATTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCATATCTGCTGTGAGCAGGATATGCTATTGTGCTCAGTGCCTATTC  783

seq1  ACCTTGTAGGACAAACATTAGAGATGGTGCTGGAGATATACTCCATATAC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCTTGTAGGACAAACATTAGAGATGGTGCTGGAGATATACTCCATATAC  833

seq1  TCCATAGCTTAGTTTCTTCTCAGGTAGCAAATTACTGGGAGGATTTAATA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATAGCTTAGTTTCTTCTCAGGTAGCAAATTACTGGGAGGATTTAATA  883

seq1  GATGAGTGGGCTAATAGTGTTAGAATTTAAGCTAAATGTACTCACTCAGT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTGGGCTAATAGTGTTAGAATTTAAGCTAAATGTACTCACTCAGT  933

seq1  TTCTCTCACCATCAATTCAATCTCCTGTCCTGTCTGAGCTGGGCTGATAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTCACCATCAATTCAATCTCCTGTCCTGTCTGAGCTGGGCTGATAA  983

seq1  ACACACACCATCATTCTCCAGTGGGAGTGGACCCAAGGAACCATGACCAC  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACCATCATTCTCCAGTGGGAGTGGACCCAAGGAACCATGACCAC  1033

seq1  TTCTCAGAATCATTTTCCAAAGCAGGAACTGCTGGTTGCTCTATAGCCTA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAGAATCATTTTCCAAAGCAGGAACTGCTGGTTGCTCTATAGCCTA  1083

seq1  CCACATGCCCAGTTAGAATGCACATCCTTTCTGGTTTTTGGAGCAAGGGA  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATGCCCAGTTAGAATGCACATCCTTTCTGGTTTTTGGAGCAAGGGA  1133

seq1  TGAATAAGACCTTCTTAATGAATTC  1175
      |||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAAGACCTTCTTAATGAATTC  1158