seq1: chr6_86767010_86767078
seq2: B6Ng01-178I15.b_47_129 (reverse)
seq1 CCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTC--------------GTTTTTTGAG 36
|||||||||||||||||||||||||| |||||| |||
seq2 CCTCCTCCTCCTCCTCCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTGGTTTTTCGAG 50
seq1 ACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTG 69
||||||||||||||| ||||||||| |||||||
seq2 ACAGGGTTTCTCTGTATAGCCCTGGATGTCCTG 83
| seq1: chr9_72637996_72639195
seq2: B6Ng01-178I15.g_74_1275 (reverse)
seq1 TTGTACATTTGTACTTTAGCCACATCCCTGTTTAGGCAGAAGTTTTTCAA 50
|||||| |||||| |||||||||||| || || |||| | ||||
seq2 TTGTACCATTGTAC-TTAGCCACATCCGTG----AGCCGAAG--TCTCAA 43
seq1 AGGGAAACTTCAGAAGA--CTCTAGGGATCAAATTTAACAATTAAATAAC 98
|||| || ||||||| ||| ||||||| || |||||| | ||||||
seq2 --GGAAGCTCCAGAAGAGTCTCAAGGGATC-AACTTAACA--TTAATAAC 88
seq1 AGTTGTAAGAAAGTAAGGTAAGAAAGTAAT-TCTATACAGGTAACAACCT 147
|| |||||||||| | ||| ||||||||| | ||||||||||||||||
seq2 AG-TGTAAGAAAGGTAAGTAGGAAAGTAATCTATATACAGGTAACAACCG 137
seq1 TTCTAGCTCTCAATAGTTTTC-TCTGTAAA--TAGAAATTAGAAGCTACG 194
||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||
seq2 TTCTAGCTCTCAATAGTTTTCTTCTGTAAAATAAGAAATTAGAAGCTACG 187
seq1 --ATTTTTCTG--TGGGTAA-GAAT-AAATGAGAGTTTTATTCAT-GGAT 237
|||||||| |||||| |||| |||||||||||| || ||| ||||
seq2 GATTTTTTCTGGTGGGGTAAGGAATAAAATGAGAGTTTAATCCATGGGAT 237
seq1 TGCTTGTTGAATC-AGATTTAAAC-AATTCT-AAAATTCCTACTCAGGGT 284
|||||| |||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||
seq2 TGCTTGGTGAATCAAGATTAAAACAAATTCTAAAAATTCCTACTCAGGGT 287
seq1 CCTTGGTTCTTGTCTATTCAGCACATCCAGAGAGATGTGTGTGGTGCCAG 334
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTTGGTTCTTGTCTATTCAGCACATCCAGAGAGATGTGTGTGGTGCCAG 337
seq1 GAGCATTAACAGGGTCTTCATCTTCTCCTAAAATGGAGGCAGAGGGTGGG 384
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGCATTAACAGGGTCTTCATCTTCTCCTAAAATGGAGGCAGAGGGTGGG 387
seq1 GAGCTAGATGTGCCCCTGGCACATCCTTCTGCTGGTCTCCGGATTCCTCA 434
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2 GAGCTAGATGTGCCCCTGGCACATCC-TCTGCTGGTCTCCGGATTCCTCA 436
seq1 GGGGTGAGGGAATGGAAGACAGGCCATTCTGGGTTTTCATCATTGTAGCC 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GGGGTGAGGGAATGGAAGACAGGCCATTCTGGGTTTTCATCATTGTAGCC 486
seq1 TCCTGTGGGGCGGCAGCACACAAACAACTGTGGTTTTAGCGAGCTGAGGT 534
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCCTGTGGGGCGGCAGCACACAAACAACTGTGGTTTTAGCGAGCTGAGGT 536
seq1 CTCTACAGCCAGGAGCCTGGAAAACATCCCAGTCGAAATTCCAGCAGGCT 584
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCTACAGCCAGGAGCCTGGAAAACATCCCAGTCGAAATTCCAGCAGGCT 586
seq1 TTCCAAAGGGGGAGAGAAAGAGGTAGAAAAAACTAGAAAAGTTTCGAAGT 634
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCCAAAGGGGGAGAGAAAGAGGTAGAAAAAACTAGAAAAGTTTCGAAGT 636
seq1 TTCATCCTGCTGACTTCTTTTCCCAATTGATGGAGGGAGATTAATGAGGA 684
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCATCCTGCTGACTTCTTTTCCCAATTGATGGAGGGAGATTAATGAGGA 686
seq1 AGGAATGTCACCGAGTCAGTTTAGGTATCTGTGGGCAGGGAGCTGGAGCT 734
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGAATGTCACCGAGTCAGTTTAGGTATCTGTGGGCAGGGAGCTGGAGCT 736
seq1 CTGCTCAAAGGCTGTCTGTCAGAAGTGCTTTCAGTGCGCAGAAGAGAACA 784
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGCTCAAAGGCTGTCTGTCAGAAGTGCTTTCAGTGCGCAGAAGAGAACA 786
seq1 TATAGCATAGTTTGTCTCTATAAAACAAAATAAAACAAAACATAGTGCAC 834
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATAGCATAGTTTGTCTCTATAAAACAAAATAAAACAAAACATAGTGCAC 836
seq1 AGTGTGGTAGTGAGGTATCAGGTTCGTCCGAGTACCACGTCACGCATGCC 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTGTGGTAGTGAGGTATCAGGTTCGTCCGAGTACCACGTCACGCATGCC 886
seq1 AGAGAGAACAGATAGAACTACACACTAAGCGCACATGGTGTAGCAGAGCT 934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGAGAGAACAGATAGAACTACACACTAAGCGCACATGGTGTAGCAGAGCT 936
seq1 TAGACACTTAATACTAAACGCTTTTTAAAACACAAACAAACAAACTTTTT 984
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGACACTTAATACTAAACGCTTTTTAAAACACAAACAAACAAACTTTTT 986
seq1 AAAATTGCATTTTATTGTACCGTTTTGTGCATGTGTGTCATATGTGTGTT 1034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAAATTGCATTTTATTGTACCGTTTTGTGCATGTGTGTCATATGTGTGTT 1036
seq1 CACGAGCATAGCCATGGTGCACATCTGGAAGTCAAAGGACTGCTTGTGGG 1084
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CACGAGCATAGCCATGGTGCACATCTGGAAGTCAAAGGACTGCTTGTGGG 1086
seq1 AGTCAGTTCTTTCCTCCCACCATGTAGGTCCCAGGGATCAAACTCAAGTC 1134
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTCAGTTCTTTCCTCCCACCATGTAGGTCCCAGGGATCAAACTCAAGTC 1136
seq1 ATCCGGTTTGGCAGCAACTGCCTTTATCCACTAAGTCATCTCTCTGGCCC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATCCGGTTTGGCAGCAACTGCCTTTATCCACTAAGTCATCTCTCTGGCCC 1186
seq1 CACTCACACTGAATTC 1200
||||||||||||||||
seq2 CACTCACACTGAATTC 1202
|