BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-186N14
Chromosome9 (Build37)
Map Location 110,264,941 - 110,400,412
singlet/doubletdoublet
Overlap geneScap, Ptpn23, Ngp, Klhl18, Kif9
Upstream geneEG382156, Fbxw16, Fbxw19, LOC635668, Fbxw15, EG382106, E330001B16Rik, C85627, EG382109, 1700124P09Rik, Spink8, 3000002C10Rik, Nme6, Camp, Cdc25a, LOC100043782, Mtap4, LOC100049540, Dhx30, Smarcc1, Rn4.5s-ps2, Cspg5, Tmem103
Downstream geneSetd2, Nradd, Nbeal2, Ccdc12, Pthr1, Myl3, 9430025E04Rik, LOC665549, Tessp2, 1700036D21Rik, Tessp3, BC107230, 1700112C13Rik, Tsp50, Tmie, Als2cl, Gm590, Tdgf1, Lrrc2, Rtp3, ENSMUSG00000057802, Ltf, Ccrl2, LOC100039275, Lrrfip2, Mlh1, Epm2aip1, Lba1, Dclk3
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-186N14.bB6Ng01-186N14.g
ACCGA011586GA011587
length1,1461,025
definitionB6Ng01-186N14.b B6Ng01-186N14.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(110,399,281 - 110,400,412)(110,264,941 - 110,265,967)
sequence
gaattctccagatagctgaagcactccttcagcattcgcaacagtaaagt
agctagggacagttttcctaactgtttatgacaagggtactttagagggg
gaaacccaacctggaacagattcacctgttactgtgttggacacctattc
ctgtctgacattttcaggacacccgtgtcctgccactgcattgtctccct
gagtcccatccatgttcacagctttcccctcttaaaactctaccatgcct
ccatccatgtgcagaacaactaagggctcagcctttccagacacatcaag
gccctgcaattttcttttctttccttcttaagccctccagtagaggggca
agatgttcctggtatgagtcacatactcagttctgtcatcacctctactt
gtaacaactatgcatcctgctgccaatattttaatgccacccagctcagt
acccacccaagttttggggtggggggtcctttcccctccctggccacttc
tgaaggtctcacccacccaggactctgacatgactttggaccagggcttc
tctttctatagggaaggctctgttgtatctcttctgaactattcaactca
cacaagctgcacccctgaaagcatgttctctgtccccacaagactgctct
caccatgcctccttgtataataagcccccaaggttaagtctgtcctacac
ctggccttctttcttaatatggtttattgcttggtgttcgcatcctagtc
tctgtcaccctcagcagttgtggctcatgtttgtccttggggtccctaac
aatgctgtggatagtgccccatgtgagccggtctggatccaaccttatct
atgccccacccccaccctcaccctctgcacccatggggagaaactccagc
ctggttgcactggctgtctctacataccgtttcatccaactgggcagctt
ctccaatagaatgtttgtcacgaggactatattaccagtttccccctgca
gaaagggacacacaagggattccctttaggatcaacagggtcctgttatg
gaactcaaatgcttggtatccccacaaaatgtacaaacctccaaaattcc
aaacacctaaattgaattgtaattttggaatgggagctttggtagt
gaattctccacgcctgtgaagggttactcgcccccgcctgcggactctga
ccacaaacaaggagagcccagcgagcagccagagtgggtaggtgctcggg
ttgttactgaggagagcccaagcagagagctgattggtggaggcagactc
tgcaagtgacagcaagagtggtcagcttcagactagtgacttcacgtgct
caccacttgacaaaggcacccaagtgtctagttgtgcacttaatgagtaa
cttttattgaaagaaaacaatggcgcataagtgtgagcaccctagagaaa
cgaggggtgaccagctggacccagattcatccccagcctactcatacacc
atgtgcagagaccagctgacaggtcgtccagtccttgatcctaggtagtc
aaaacagcagagcatccctggagtgagcctaattttctcagatcagtaag
gaattttttttcaatcttcataatccagtcaggtggttttaaaagtacag
ttgttgttgttgttgttgttttaaactagaagaaaagttggaggccaaag
taattaagttccccagttacttagtttatgaggatcaatacctcctagaa
ctctttgctccctcagccctactggactggactgttgtcagttgatgggc
tctgagctgagcattgatatgagaaagtctagttgaaggcggagacttgg
tatcccactcactgtgacttctgcacttgctatttgaagctcagaagctc
ggccagctcatgtttggatcttacctaccatggaaggaccgtgtgcctat
ccttcatgctggggacagagctcctcttctctatctcccgcaggatagca
cttcttccacttccttttctggttacggccagctaactagtaggcattga
ctctcctgttgctgacttgtaacaccctgcaagacggttctgtggatgaa
aaagacaacacctgtgtgtaccgggtcctctgcctctgaccatcggcatg
aatgtctgtggtcagcaaaagctgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_110399281_110400412
seq2: B6Ng01-186N14.b_47_1192 (reverse)

seq1  ACTACCAAAGGCTCCATTCCAAA--TACA--TCAGACTAGGTGTTTGGGA  46
      ||||||||||   ||||||||||  ||||  |||   ||||||||||| |
seq2  ACTACCAAAGCTCCCATTCCAAAATTACAATTCAATTTAGGTGTTTGGAA  50

seq1  TTTTGGAGG-TTGTACATTTTGTGGGGATA-CAAGCA-TTGAG-TCCATA  92
      ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||
seq2  TTTTGGAGGTTTGTACATTTTGTGGGGATACCAAGCATTTGAGTTCCATA  100

seq1  ACAGAACCCTGTTGATCCTAAA-GGAATCCCT--TGTGTCCCTTTCTGCA  139
      |||| ||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||
seq2  ACAGGACCCTGTTGATCCTAAAGGGAATCCCTTGTGTGTCCCTTTCTGCA  150

seq1  GGGGGAAACT-GTAATATGGTCCTCGTGACAAACA-TCTA-TGGAGAAGC  186
      |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||
seq2  GGGGGAAACTGGTAATATAGTCCTCGTGACAAACATTCTATTGGAGAAGC  200

seq1  TGCCCAGTTGGATGAAACGGTATGTAGAGACAGCCAGTGCAACCAGGCTG  236
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCAGTTGGATGAAACGGTATGTAGAGACAGCCAGTGCAACCAGGCTG  250

seq1  GAGTTTCTCCCCATGGGTGCAGAGGGTGAGGGTGGGGGTGGGGCATAGAT  286
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTCTCCCCATGGGTGCAGAGGGTGAGGGTGGGGGTGGGGCATAGAT  300

seq1  AAGGTTGGATCCAGACCGGCTCACATGGGGCACTATCCACAGCATTGTTA  336
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTTGGATCCAGACCGGCTCACATGGGGCACTATCCACAGCATTGTTA  350

seq1  GGGACCCCAAGGACAAACCTGAGCCACAACTGCTGAGGGTGACAGAGACT  386
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCCCAAGGACAAACATGAGCCACAACTGCTGAGGGTGACAGAGACT  400

seq1  AGGATGCGAACACCAAGCAATAAACCATATTAAGAAAGAAGGCCAGGTGT  436
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATGCGAACACCAAGCAATAAACCATATTAAGAAAGAAGGCCAGGTGT  450

seq1  AGGACAGACTTAACCTTGGGGGCTTATTATACAAGGAGGCATGGTGAGAG  486
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACAGACTTAACCTTGGGGGCTTATTATACAAGGAGGCATGGTGAGAG  500

seq1  CAGTCTTGTGGGGACAGAGAACATGCTTTCAGGGGTGCAGCTTGTGTGAG  536
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCTTGTGGGGACAGAGAACATGCTTTCAGGGGTGCAGCTTGTGTGAG  550

seq1  TTGAATAGTTCAGAAGAGATACAACAGAGCCTTCCCTATAGAAAGAGAAG  586
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATAGTTCAGAAGAGATACAACAGAGCCTTCCCTATAGAAAGAGAAG  600

seq1  CCCTGGTCCAAAGTCATGTCAGAGTCCTGGGTGGGTGAGACCTTCAGAAG  636
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTGGTCCAAAGTCATGTCAGAGTCCTGGGTGGGTGAGACCTTCAGAAG  650

seq1  TGGCCAGGGAGGGGAAAGGACCCCCCACCCCAAAACTTGGGTGGGTACTG  686
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCAGGGAGGGGAAAGGACCCCCCACCCCAAAACTTGGGTGGGTACTG  700

seq1  AGCTGGGTGGCATTAAAATATTGGCAGCAGGATGCATAGTTGTTACAAGT  736
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGTGGCATTAAAATATTGGCAGCAGGATGCATAGTTGTTACAAGT  750

seq1  AGAGGTGATGACAGAACTGAGTATGTGACTCATACCAGGAACATCTTGCC  786
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTGATGACAGAACTGAGTATGTGACTCATACCAGGAACATCTTGCC  800

seq1  CCTCTACTGGAGGGCTTAAGAAGGAAAGAAAAGAAAATTGCAGGGCCTTG  836
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTACTGGAGGGCTTAAGAAGGAAAGAAAAGAAAATTGCAGGGCCTTG  850

seq1  ATGTGTCTGGAAAGGCTGAGCCCTTAGTTGTTCTGCACATGGATGGAGGC  886
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGTCTGGAAAGGCTGAGCCCTTAGTTGTTCTGCACATGGATGGAGGC  900

seq1  ATGGTAGAGTTTTAAGAGGGGAAAGCTGTGAACATGGATGGGACTCAGGG  936
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGTAGAGTTTTAAGAGGGGAAAGCTGTGAACATGGATGGGACTCAGGG  950

seq1  AGACAATGCAGTGGCAGGACACGGGTGTCCTGAAAATGTCAGACAGGAAT  986
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACAATGCAGTGGCAGGACACGGGTGTCCTGAAAATGTCAGACAGGAAT  1000

seq1  AGGTGTCCAACACAGTAACAGGTGAATCTGTTCCAGGTTGGGTTTCCCCC  1036
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTCCAACACAGTAACAGGTGAATCTGTTCCAGGTTGGGTTTCCCCC  1050

seq1  TCTAAAGTACCCTTGTCATAAACAGTTAGGAAAACTGTCCCTAGCTACTT  1086
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAAGTACCCTTGTCATAAACAGTTAGGAAAACTGTCCCTAGCTACTT  1100

seq1  TACTGTTGCGAATGCTGAAGGAGTGCTTCAGCTATCTGGAGAATTC  1132
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTTGCGAATGCTGAAGGAGTGCTTCAGCTATCTGGAGAATTC  1146

seq1: chr9_110264941_110265967
seq2: B6Ng01-186N14.g_71_1095

seq1  GAATTCTCCACGCCTGTGAAGGGTTACTCGCCCCCGCCTGCGGACTCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCACGCCTGTGAAGGGTTACTCGCCCCCGCCTGCGGACTCTGA  50

seq1  CCACAAACAAGGAGAGCCCAGCGAGCAGCCAGAGTGGGTAGGTGCTCGGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAAACAAGGAGAGCCCAGCGAGCAGCCAGAGTGGGTAGGTGCTCGGG  100

seq1  TTGTTACTGAGGAGAGCCCAAGCAGAGAGCTGATTGGTGGAGGCAGACTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTACTGAGGAGAGCCCAAGCAGAGAGCTGATTGGTGGAGGCAGACTC  150

seq1  TGCAAGTGACAGCAAGAGTGGTCAGCTTCAGACTAGTGACTTCACGTGCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAGTGACAGCAAGAGTGGTCAGCTTCAGACTAGTGACTTCACGTGCT  200

seq1  CACCACTTGACAAAGGCACCCAAGTGTCTAGTTGTGCACTTAATGAGTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACTTGACAAAGGCACCCAAGTGTCTAGTTGTGCACTTAATGAGTAA  250

seq1  CTTTTATTGAAAGAAAACAATGGCGCATAAGTGTGAGCACCCTAGAGAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTATTGAAAGAAAACAATGGCGCATAAGTGTGAGCACCCTAGAGAAA  300

seq1  CGAGGGGTGACCAGCTGGACCCAGATTCATCCCCAGCCTACTCATACACC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGGGTGACCAGCTGGACCCAGATTCATCCCCAGCCTACTCATACACC  350

seq1  ATGTGCAGAGACCAGCTGACAGGTCGTCCAGTCCTTGATCCTAGGTAGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCAGAGACCAGCTGACAGGTCGTCCAGTCCTTGATCCTAGGTAGTC  400

seq1  AAAACAGCAGAGCATCCCTGGAGTGAGCCTAATTTTCTCAGATCAGTAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACAGCAGAGCATCCCTGGAGTGAGCCTAATTTTCTCAGATCAGTAAG  450

seq1  GAATTTTTTTTCAATCTTCATAATCCAGTCAGGTGGTTTTAAAAGTACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTTTTTTCAATCTTCATAATCCAGTCAGGTGGTTTTAAAAGTACAG  500

seq1  TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTAAACTAGAAGAAAAGTTGGAGGCCAAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTTTAAACTAGAAGAAAAGTTGGAGGCCAAAG  550

seq1  TAATTAAGTTCCCCAGTTACTTAGTTTATGAGGATCAATACCTCCTAGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAAGTTCCCCAGTTACTTAGTTTATGAGGATCAATACCTCCTAGAA  600

seq1  CTCTTTGCTCCCTCAGCCCTACTGGACTGGACTGTTGTCAGTTGATGGGC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTGCTCCCTCAGCCCTACTGGACTGGACTGTTGTCAGTTGATGGGC  650

seq1  TCTGAGCTGAGCATTGATATGAGAAAGTCTAGTTGAAGGCGGAGACTTGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGCTGAGCATTGATATGAGAAAGTCTAGTTGAAGGCGGAGACTTGG  700

seq1  TATCCCACTCACTGTGACTTCTGCACTTGCTATTTGAAGCTCAGAAGCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCACTCACTGTGACTTCTGCACTTGCTATTTGAAGCTCAGAAGCTC  750

seq1  GGCCAGCTCATGTTTGGATCTTACCTACCATGGAAGGACCGTGTGCCTAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCAGCTCATGTTTGGATCTTACCTACCATGGAAGGACCGTGTGCCTAT  800

seq1  CCTTCATGCTGGGGACAGAGCTCCTCTTCTCTATCTCCCGCAGGATAGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCATGCTGGGGACAGAGCTCCTCTTCTCTATCTCCCGCAGGATAGCA  850

seq1  CCTTCTTTCCACTTCC-TTTCTGGTTACGGCCAGCTAACTAGTTAGGCAT  899
       |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| 
seq2  -CTTC-TTCCACTTCCTTTTCTGGTTACGGCCAGCTAACTAG-TAGGCA-  896

seq1  TTGACTCTCCTGTTGCTGACTTGTAACACCCTGGCAAGACGGTTCTGTGG  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TTGACTCTCCTGTTGCTGACTTGTAACACCCT-GCAAGACGGTTCTGTGG  945

seq1  ATGAGAAAGAC-ACACCTGTGTGTACCGG--CCTCTGCCTCTGACCATCG  996
      |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||
seq2  ATGAAAAAGACAACACCTGTGTGTACCGGGTCCTCTGCCTCTGACCATCG  995

seq1  GCATGAGTGGTCTGTGGCCAGCAGAAGCTGC  1027
      |||||| | |||||||| ||||| |||||||
seq2  GCATGAAT-GTCTGTGGTCAGCAAAAGCTGC  1025