BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-194G10
Chromosome9 (Build37)
Map Location 77,079,342 - 77,187,461
singlet/doubletdoublet
Overlap gene2310046A06Rik
Upstream geneHcrtr2, C530008M07Rik, Tinag, LOC436082
Downstream gene5730403I07Rik, Lrrc1, Klhl31, Gclc, LOC100042212, Elovl5, Gcm1, LOC666353, Fbxo9, Ick, C920006O11Rik, Gsta4, LOC100041074, Gsta1, LOC666367, LOC100042295, LOC666373, LOC100042314, Omt2a, EG666383, Omt2b, Gsta2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-194G10.bB6Ng01-194G10.g
ACCGA017107GA017108
length5701,094
definitionB6Ng01-194G10.b B6Ng01-194G10.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(77,079,342 - 77,079,911)(77,186,350 - 77,187,461)
sequence
gaattcaaagactaaagctcctaacaccaacacacacacaagaaaagata
aattgagagtgaacatcaaatccaaagtagaagggacacttgagcttatt
ttcctcaagtatttgccagaatgaacatataacaataacttaatgagcac
atagccatggtgtggattctcctataatcagtgagctccctttcctggga
aaagtacagagtactttataatccatttgaagtaggcaactgacaacccc
acatcaaaagagaaagaattttaaaatatgaatttattaaagaatatttg
ccatagcctgtcaaaggtagacatagcttgtacttgtattcttgccccac
ttaagtagtccagaatttaaggcaaatgctgaaatcatgccaaagttttt
aaacagagactttaaaattattagtttgattttatcagactataaaataa
aaatatgcacaactagtgaatttgagaaatgagtcaccaaaaaaagtatg
tatgtatgtatgtgtgtgtgtgtgtgtgtacgtatgtgtatatatatata
tatatatatatatatatata
gaattcctgcagactttgtcaggctgtctgctctgctctcctgtaggtac
atccattccattccattccatccatccacccatccatccatccatccatc
catccatccatccatccagatgcatgcaatcattcctcagtctaaatgca
ttcattcatccacaggaatgggcagtctgagttgttcacttcctcacaac
tgctactactaagtctgaggtgcgaaatgaggtgaccccccaagacttcc
acagaaccctcttgtaagctcagcgtcataatgaaggctctgtgggatct
ctctccctgactggggcaccctcgggaattacaaggtgtccattaagggt
ctcttccttcaactcagcttcaccccactgctccattttctttttcccta
gaaaattacagcatgctttttcatactgattctcttctcctaccaggttt
ctcttggttgagagtttaactttgaaacttcttttgagtggccaagagat
acatgcttcatcagacatcttgaaccaagaagatccttaatctctctctc
tctctctctctctctctctctccctgcatgcatgcatgcatgtgtgtgtg
tgcgtgcgtgtatagatgaatacacatgagtgctggtgcctgcagaggcc
agaagagggtatcagttcttctggaactagagagacaggcagtttggtcc
tggtatagtccctgggaaccaaattctggtcctctgcaagagcagcacat
gctgttatccgtgaagccatccgcctacttgctctgatttattttttaaa
gggttctctcaatgttttattcatgttgcatattctttgcaatcaatagc
tgataagtgctagatagcattttaaaattccaattttaggttttgttgtt
tcttgaaagagaatgttgatatgtagttcagctggccttgaacaccttgt
gtatccctggctggcttgactacacatccactgatgccctgtgcctggtt
gtgtaggaatatcacatgtctattagaaatgctatgatcagatctggcct
cttagtcatatgctggaataacatgtgcttctctgaggactggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_77079342_77079911
seq2: B6Ng01-194G10.b_43_612

seq1  GAATTCAAAGACTAAAGCTCCTAACACCAACACACACACAAGAAAAGATA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAAGACTAAAGCTCCTAACACCAACACACACACAAGAAAAGATA  50

seq1  AATTGAGAGTGAACATCAAATCCAAAGTAGAAGGGACACTTGAGCTTATT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGAGAGTGAACATCAAATCCAAAGTAGAAGGGACACTTGAGCTTATT  100

seq1  TTCCTCAAGTATTTGCCAGAATGAACATATAACAATAACTTAATGAGCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTCAAGTATTTGCCAGAATGAACATATAACAATAACTTAATGAGCAC  150

seq1  ATAGCCATGGTGTGGATTCTCCTATAATCAGTGAGCTCCCTTTCCTGGGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGCCATGGTGTGGATTCTCCTATAATCAGTGAGCTCCCTTTCCTGGGA  200

seq1  AAAGTACAGAGTACTTTATAATCCATTTGAAGTAGGCAACTGACAACCCC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTACAGAGTACTTTATAATCCATTTGAAGTAGGCAACTGACAACCCC  250

seq1  ACATCAAAAGAGAAAGAATTTTAAAATATGAATTTATTAAAGAATATTTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAAAAGAGAAAGAATTTTAAAATATGAATTTATTAAAGAATATTTG  300

seq1  CCATAGCCTGTCAAAGGTAGACATAGCTTGTACTTGTATTCTTGCCCCAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATAGCCTGTCAAAGGTAGACATAGCTTGTACTTGTATTCTTGCCCCAC  350

seq1  TTAAGTAGTCCAGAATTTAAGGCAAATGCTGAAATCATGCCAAAGTTTTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGTAGTCCAGAATTTAAGGCAAATGCTGAAATCATGCCAAAGTTTTT  400

seq1  AAACAGAGACTTTAAAATTATTAGTTTGATTTTATCAGACTATAAAATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACAGAGACTTTAAAATTATTAGTTTGATTTTATCAGACTATAAAATAA  450

seq1  AAATATGCACAACTAGTGAATTTGAGAAATGAGTCACCAAAAAAAGTATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATGCACAACTAGTGAATTTGAGAAATGAGTCACCAAAAAAAGTATG  500

seq1  TATGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGTATGTGTATATATATATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTATGTATGTGTGTGTGTGTGTGTGTACGTATGTGTATATATATATA  550

seq1  TATATATATATATATATATA  570
      ||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATATA  570

seq1: chr9_77186350_77187461
seq2: B6Ng01-194G10.g_63_1156 (reverse)

seq1  CCCAGTCCTCAGGAGAAGCACATTGGTTTATTTCAGCATATGAACTAAGA  50
      ||||||||||| |||||||||||    ||||| ||||||||| |||||||
seq2  CCCAGTCCTCA-GAGAAGCACAT---GTTATTCCAGCATATG-ACTAAGA  45

seq1  GGGCAGATTCTGATCATAGCATTTTCTAATAGACAATGTGAATATCCTAC  100
      || |||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||   ||||||
seq2  GGCCAGA-TCTGATCATAGCA-TTTCTAATAGAC-ATGTGATATTCCTAC  92

seq1  AACAACCCAGGCACAGGGGCAATCAAGTGGATGTTGTAGTCAAAGCCAGC  150
       |||| ||||||||||||   ||| |||||||| ||||||| ||||||||
seq2  -ACAA-CCAGGCACAGGG--CATC-AGTGGATG-TGTAGTC-AAGCCAGC  135

seq1  CAGGGATACACAAGGTGTTCAAGGCCAGCCTGAACTACATATCAACATTC  200
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGATACACAAGGTGTTCAAGGCCAG-CTGAACTACATATCAACATTC  184

seq1  TCTTTCAAGAAACAAACAAAAACCTAAAATTGGAATTTTAAAATGCTATC  250
      |||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTCAAGAAACAA--CAAAACCTAAAATTGGAATTTTAAAATGCTATC  232

seq1  TAGCACTTATCAGCTATTGATTGCAAAGAATATGCAACATGAATAAAACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCACTTATCAGCTATTGATTGCAAAGAATATGCAACATGAATAAAACA  282

seq1  TTGAGAGAACCCTTTAAAAAATAAATCAGAGCAAGTAGGCGGATGGCTTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAGAGAACCCTTTAAAAAATAAATCAGAGCAAGTAGGCGGATGGCTTC  332

seq1  ACGGATAACAGCATGTGCTGCTCTTGCAGAGGACCAGAATTTGGTTCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGGATAACAGCATGTGCTGCTCTTGCAGAGGACCAGAATTTGGTTCCCA  382

seq1  GGGACTATACCAGGACCAAACTGCCTGTCTCTCTAGTTCCAGAAGAACTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACTATACCAGGACCAAACTGCCTGTCTCTCTAGTTCCAGAAGAACTG  432

seq1  ATACCCTCTTCTGGCCTCTGCAGGCACCAGCACTCATGTGTATTCATCTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCCTCTTCTGGCCTCTGCAGGCACCAGCACTCATGTGTATTCATCTA  482

seq1  TACACGCACGCACACACACACATGCATGCATGCATGCAGGGAGAGAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACGCACGCACACACACACATGCATGCATGCATGCAGGGAGAGAGAGA  532

seq1  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTAAGGATCTTCTTGGTTCAAGATGTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGATTAAGGATCTTCTTGGTTCAAGATGTCT  582

seq1  GATGAAGCATGTATCTCTTGGCCACTCAAAAGAAGTTTCAAAGTTAAACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAAGCATGTATCTCTTGGCCACTCAAAAGAAGTTTCAAAGTTAAACT  632

seq1  CTCAACCAAGAGAAACCTGGTAGGAGAAGAGAATCAGTATGAAAAAGCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACCAAGAGAAACCTGGTAGGAGAAGAGAATCAGTATGAAAAAGCAT  682

seq1  GCTGTAATTTTCTAGGGAAAAAGAAAATGGAGCAGTGGGGTGAAGCTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTAATTTTCTAGGGAAAAAGAAAATGGAGCAGTGGGGTGAAGCTGAG  732

seq1  TTGAAGGAAGAGACCCTTAATGGACACCTTGTAATTCCCGAGGGTGCCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGGAAGAGACCCTTAATGGACACCTTGTAATTCCCGAGGGTGCCCC  782

seq1  AGTCAGGGAGAGAGATCCCACAGAGCCTTCATTATGACGCTGAGCTTACA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCAGGGAGAGAGATCCCACAGAGCCTTCATTATGACGCTGAGCTTACA  832

seq1  AGAGGGTTCTGTGGAAGTCTTGGGGGGTCACCTCATTTCGCACCTCAGAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGGTTCTGTGGAAGTCTTGGGGGGTCACCTCATTTCGCACCTCAGAC  882

seq1  TTAGTAGTAGCAGTTGTGAGGAAGTGAACAACTCAGACTGCCCATTCCTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTAGTAGCAGTTGTGAGGAAGTGAACAACTCAGACTGCCCATTCCTG  932

seq1  TGGATGAATGAATGCATTTAGACTGAGGAATGATTGCATGCATCTGGATG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATGAATGAATGCATTTAGACTGAGGAATGATTGCATGCATCTGGATG  982

seq1  GATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGAATGG  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGAATGG  1032

seq1  AATGGAATGGATGTACCTACAGGAGAGCAGAGCAGACAGCCTGACAAAGT  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGAATGGATGTACCTACAGGAGAGCAGAGCAGACAGCCTGACAAAGT  1082

seq1  CTGCAGGAATTC  1112
      ||||||||||||
seq2  CTGCAGGAATTC  1094