BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-225G22
Chromosome9 (Build37)
Map Location 66,754,653 - 66,899,589
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRab8b, Rps27l, Lactb, Tpm1
Upstream geneTrip4, Csnk1g1, Ppib, Snx22, Snx1, 5730536A07Rik, Dapk2, Herc1, Fbxl22, Usp3, Car12, Aph1b, LOC623488, Aph1c
Downstream geneTln2, LOC100041390, LOC100040253, EG640799, LOC665794, 3300001A09Rik, EG244911, Vps13c
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-225G22.bB6Ng01-225G22.g
ACCGA039627GA039628
length1,1981,082
definitionB6Ng01-225G22.b B6Ng01-225G22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,754,653 - 66,755,858)(66,898,516 - 66,899,589)
sequence
gaattccagcagtcactctgaaagattcaagtcgctatggacaaagggcc
aagaactcaagtgtgagcctcaggtttaggctccattatctatttacagg
accgacagagtccattctcctccaagtgcattacattcctcacctaggac
atggcagtcctcttctcttcaaatcttctgtgataatgcggaggtttatg
tacaggaatagacacagaaacactcaggcaacagtaaacgtccaggtgga
ggaagaggcaactggaattgctaaccctcagtggctctaccaccccaacc
accccacatccttccacgacccctgctgccctcaggctacagcccagact
aacaaacctaagaataaaaagtttctcctaatctgccctccaacttgacc
ttgggtcacatcctctaccgtccgttggctcaggtgccaaagttcctcca
gggagaaaagtgcctgccatgcaagtgcccgagtttggcttccagagtcc
gcataaaacctgggcatggtggtatgtgctcttaatcccagaactgggca
gacagaggcagagacaggaggatccctgtctcaaaaatcaaggttaatag
caactaatgaacaagaaccgagacccacctctggcctctaaatatgtgtg
cacacacacaggcacactcatgtgtgcgcgcacacacacatacacccaaa
caaatgtggttgacggaacaaatttggagaaaatactgtgcttgacctaa
gtagttgactgactactggattccccgtgcaacttcagaagcaataagat
ctagctcaactcttacccaattccagctgctgctttctaaaacccaaaag
taaatagagagtcagcatatccttggagtccagatctcttgagtttaatc
ccttcctttcttccacaaatgttaaccacatctagatcacatgctaaact
attagtttctttttgaagcaagagcattgaaaggcaaatgagatgtgaaa
gaaaggaaagccaatgctcaggacaggactcaaaagcacatctctcctct
tcagtgctacagacactgcgcagctaacaggagcaacaaggctgctgact
gcttagctactgcttcctcattctgctcacggtcatcaaaccctactggc
ccaaggtggaaagacgcatggtcatagctgagaatgaataagaaaaat
gaattccaagttctttgccatctggcctcaacttgcctttccaatctgtt
gttcaggaaagcctactgtccaaccagtgttaagggcttctcagtccctg
ttgcaacccttctctaaaatctgttgtaaagcttcccgaagaagccttgt
ctgtttgctctaccctggctctttccgtgtcttcctttctgaggtcttac
actgctgttcttcctcagcatctggttgagaaatttgtacgtcacccaat
tttgagttcagagtccagtgctgcctgtcatgcatgtaacaggtatccag
ttgtgggatatttaatggactgtaccattagcttatttaaaatggattta
gtgagtgagtttttcaactatgcccagcacatggagaaagtcagtattta
ctccagtatctacttcattaatagaagagaacggaggctttaagaggttg
caccatggctacggctatattaaaaagaagtatccaagtccattttggat
ctcagcttctaaattccagattccctattcttctcctctgttaaactcca
agctggagtgtcagcttcctatagcccacatatctgaatactgcccatgg
cctggaagggtgtcagcgccctgagccacttggcacgtggcaaggaaggg
ctctggtgaatgttctgtgccacagagtccctgttcatctgttccaatgt
tctggtcactaccagagggtgcgttttccctcctgggcagccagaaacct
gataaaatcctaaagaggaatatgatcattctcttcttgaagggcttagc
aagtcatttggcctgcctaatctactcagacactgtctggggaatatttg
atatccatgtagtacaggctgtaaattattctgtagggactggtcacaag
accctcacaaccctgtctcagctggccatcaggaaaggttctcccctcct
gaagcctcactgaactggaaaagatcaggcatctcctcctccttggggac
tgggcttgaaggtaaactttaagcgaatacgggaggggaacaatcttctt
gtcttcagtgctgagctgcctggcccctttcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_66754653_66755858
seq2: B6Ng01-225G22.b_46_1243

seq1  GAATTCCAGCAGTCACTCTGAAAGATTCAAGTCGCTATGGACAAAGGGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGCAGTCACTCTGAAAGATTCAAGTCGCTATGGACAAAGGGCC  50

seq1  AAGAACTCAAGTGTGAGCCTCAGGTTTAGGCTCCATTATCTATTTACAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAACTCAAGTGTGAGCCTCAGGTTTAGGCTCCATTATCTATTTACAGG  100

seq1  ACCGACAGAGTCCATTCTCCTCCAAGTGCATTACATTCCTCACCTAGGAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGACAGAGTCCATTCTCCTCCAAGTGCATTACATTCCTCACCTAGGAC  150

seq1  ATGGCAGTCCTCTTCTCTTCAAATCTTCTGTGATAATGCGGAGGTTTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCAGTCCTCTTCTCTTCAAATCTTCTGTGATAATGCGGAGGTTTATG  200

seq1  TACAGGAATAGACACAGAAACACTCAGGCAACAGTAAACGTCCAGGTGGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGAATAGACACAGAAACACTCAGGCAACAGTAAACGTCCAGGTGGA  250

seq1  GGAAGAGGCAACTGGAATTGCTAACCCTCAGTGGCTCTACCACCCCAACC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGAGGCAACTGGAATTGCTAACCCTCAGTGGCTCTACCACCCCAACC  300

seq1  ACCCCACATCCTTCCACGACCCCTGCTGCCCTCAGGCTACAGCCCAGACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCCACATCCTTCCACGACCCCTGCTGCCCTCAGGCTACAGCCCAGACT  350

seq1  AACAAACCTAAGAATAAAAAGTTTCTCCTAATCTGCCCTCCAACTTGACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACCTAAGAATAAAAAGTTTCTCCTAATCTGCCCTCCAACTTGACC  400

seq1  TTGGGTCACATCCTCTACCGTCCGTTGGCTCAGGTGCCAAAGTTCCTCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGTCACATCCTCTACCGTCCGTTGGCTCAGGTGCCAAAGTTCCTCCA  450

seq1  GGGAGAAAAGTGCCTGCCATGCAAGTGCCCGAGTTTGGCTTCCAGAGTCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGAAAAGTGCCTGCCATGCAAGTGCCCGAGTTTGGCTTCCAGAGTCC  500

seq1  GCATAAAACCTGGGCATGGTGGTATGTGCTCTTAATCCCAGAACTGGGCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAAAACCTGGGCATGGTGGTATGTGCTCTTAATCCCAGAACTGGGCA  550

seq1  GACAGAGGCAGAGACAGGAGGATCCCTGTCTCAAAAATCAAGGTTAATAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGGCAGAGACAGGAGGATCCCTGTCTCAAAAATCAAGGTTAATAG  600

seq1  CAACTAATGAACAAGAACCGAGACCCACCTCTGGCCTCTAAATATGTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTAATGAACAAGAACCGAGACCCACCTCTGGCCTCTAAATATGTGTG  650

seq1  CACACACACAGGCACACTCATGTGTGCGCGCACACACACATACACCCAAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACAGGCACACTCATGTGTGCGCGCACACACACATACACCCAAA  700

seq1  CAAATGTGGTTGACGGAACAAATTTGGAGAAAATACTGTGCTTGACCTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTGGTTGACGGAACAAATTTGGAGAAAATACTGTGCTTGACCTAA  750

seq1  GTAGTTGACTGACTACTGGATTCCCCGTGCAACTTCAGAAGCAATAAGAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGTTGACTGACTACTGGATTCCCCGTGCAACTTCAGAAGCAATAAGAT  800

seq1  CTAGCTCAACTCTTACCCAATTCCAGCTGCTGCTTTCTAAAACCCAAAAG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGCTCAACTCTTACCCAATTCCAGCTGCTGCTTTCTAAAACCCAAAAG  850

seq1  TAAATAGAGAGTCAGCATATCCTTGGAGTCCAGATCTCTTGAGTTTAATC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATAGAGAGTCAGCATATCCTTGGAGTCCAGATCTCTTGAGTTTAATC  900

seq1  CCTTCCTTTCTTCCACAAATGTTAACCACATCTAGATCACATGCTAAACT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCTTTCTTCCACAAATGTTAACCACATCTAGATCACATGCTAAACT  950

seq1  ATTAGTTTCTTTTTGAAGCAAGAGCATTG-AAGGCAAATGAGATGTGAAA  999
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGTTTCTTTTTGAAGCAAGAGCATTGAAAGGCAAATGAGATGTGAAA  1000

seq1  GAAAGGAAAGCCAATGCTCAAGACAGGACTCAAAAGCACCAATCTCT-CT  1048
      |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||
seq2  GAAAGGAAAGCCAATGCTCAGGACAGGACTCAAAAGCAC--ATCTCTCCT  1048

seq1  CTTCAGTGCTACAGACACTGCGCCAGCCTACAGGAGCAACAGGCTTGCCT  1098
      |||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||| |  || ||
seq2  CTTCAGTGCTACAGACACTGCG-CAGCTAACAGGAGCAACAAGGCTG-CT  1096

seq1  GAACTGCCTAAGGCTACTGCTTCTTCATTCTGCCTTCACGTCAATCAAAC  1148
      | ||||| ||  ||||||||||| |||||||||  |||||   |||||||
seq2  G-ACTGCTTA--GCTACTGCTTCCTCATTCTGC--TCACGGTCATCAAAC  1141

seq1  ACTACTGCCCACAGGTGAGAAGAAGGCATGGTCATTAGCTGAGAATG-AT  1197
       |||||| ||  ||||| |||  | ||||||||| |||||||||||| ||
seq2  CCTACTGGCCCAAGGTG-GAAAGACGCATGGTCA-TAGCTGAGAATGAAT  1189

seq1  AAGAAAAAT  1206
      |||||||||
seq2  AAGAAAAAT  1198

seq1: chr9_66898516_66899589
seq2: B6Ng01-225G22.g_67_1148 (reverse)

seq1  GGAAAGGGGCCAGCCAGCTCAGCACTGAAGACAAGAGGATTGT--CCCT-  47
      ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  |||| 
seq2  GGAAAGGGGCCAGGCAGCTCAGCACTGAAGACAAGAAGATTGTTCCCCTC  50

seq1  CCGTA-TCGCTTTAAGTTTACC-TCAAG-CCAGTCCCCAAGGAGGA-GAG  93
      ||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||
seq2  CCGTATTCGCTTAAAGTTTACCTTCAAGCCCAGTCCCCAAGGAGGAGGAG  100

seq1  ATGCCTGATCTTTTCCAGTTCAGTGAGGCTTCAGGAGGGGAGAACC-TTC  142
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  ATGCCTGATCTTTTCCAGTTCAGTGAGGCTTCAGGAGGGGAGAACCTTTC  150

seq1  CTGATGGCCAGCTGAGACAGGGTTGTGAGGGTCTTGTGACCAGTCCCTAC  192
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGGCCAGCTGAGACAGGGTTGTGAGGGTCTTGTGACCAGTCCCTAC  200

seq1  AGAATAATTTACAGCCTGTACTACATGGATATCAAATATTCCCCAGACAG  242
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAATTTACAGCCTGTACTACATGGATATCAAATATTCCCCAGACAG  250

seq1  TGTCTGAGTAGATTAGGCAGGCCAAATGACTTGCTAAGCCCTTCAAGAAG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTGAGTAGATTAGGCAGGCCAAATGACTTGCTAAGCCCTTCAAGAAG  300

seq1  AGAATGATCATATTCCTCTTTAGGATTTTATCAGGTTTCTGGCTGCCCAG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGATCATATTCCTCTTTAGGATTTTATCAGGTTTCTGGCTGCCCAG  350

seq1  GAGGGAAAACGCACCCTCTGGTAGTGACCAGAACATTGGAACAGATGAAC  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGGAAAACGCACCCTCTGGTAGTGACCAGAACATTGGAACAGATGAAC  400

seq1  AGGGACTCTGTGGCACAGAACATTCACCAGAGCCCTTCCTTGCCACGTGC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGACTCTGTGGCACAGAACATTCACCAGAGCCCTTCCTTGCCACGTGC  450

seq1  CAAGTGGCTCAGGGCGCTGACACCCTTCCAGGCCATGGGCAGTATTCAGA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGTGGCTCAGGGCGCTGACACCCTTCCAGGCCATGGGCAGTATTCAGA  500

seq1  TATGTGGGCTATAGGAAGCTGACACTCCAGCTTGGAGTTTAACAGAGGAG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTGGGCTATAGGAAGCTGACACTCCAGCTTGGAGTTTAACAGAGGAG  550

seq1  AAGAATAGGGAATCTGGAATTTAGAAGCTGAGATCCAAAATGGACTTGGA  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAATAGGGAATCTGGAATTTAGAAGCTGAGATCCAAAATGGACTTGGA  600

seq1  TACTTCTTTTTAATATAGCCGTAGCCATGGTGCAACCTCTTAAAGCCTCC  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCTTTTTAATATAGCCGTAGCCATGGTGCAACCTCTTAAAGCCTCC  650

seq1  GTTCTCTTCTATTAATGAAGTAGATACTGGAGTAAATACTGACTTTCTCC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCTCTTCTATTAATGAAGTAGATACTGGAGTAAATACTGACTTTCTCC  700

seq1  ATGTGCTGGGCATAGTTGAAAAACTCACTCACTAAATCCATTTTAAATAA  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGCTGGGCATAGTTGAAAAACTCACTCACTAAATCCATTTTAAATAA  750

seq1  GCTAATGGTACAGTCCATTAAATATCCCACAACTGGATACCTGTTACATG  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAATGGTACAGTCCATTAAATATCCCACAACTGGATACCTGTTACATG  800

seq1  CATGACAGGCAGCACTGGACTCTGAACTCAAAATTGGGTGACGTACAAAT  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGACAGGCAGCACTGGACTCTGAACTCAAAATTGGGTGACGTACAAAT  850

seq1  TTCTCAACCAGATGCTGAGGAAGAACAGCAGTGTAAGACCTCAGAAAGGA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCAACCAGATGCTGAGGAAGAACAGCAGTGTAAGACCTCAGAAAGGA  900

seq1  AGACACGGAAAGAGCCAGGGTAGAGCAAACAGACAAGGCTTCTTCGGGAA  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACACGGAAAGAGCCAGGGTAGAGCAAACAGACAAGGCTTCTTCGGGAA  950

seq1  GCTTTACAACAGATTTTAGAGAAGGGTTGCAACAGGGACTGAGAAGCCCT  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTTACAACAGATTTTAGAGAAGGGTTGCAACAGGGACTGAGAAGCCCT  1000

seq1  TAACACTGGTTGGACAGTAGGCTTTCCTGAACAACAGATTGGAAAGGCAA  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACTGGTTGGACAGTAGGCTTTCCTGAACAACAGATTGGAAAGGCAA  1050

seq1  GTTGAGGCCAGATGGCAAAGAACTTGGAATTC  1074
      ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGGCCAGATGGCAAAGAACTTGGAATTC  1082